Candidatus Nanogingivalaceae bacterium JCVI_28_bin.11: HXK95_002095
Help
Entry
HXK95_002095 CDS
T09858
Name
(GenBank) penicillin-binding protein
Organism
nbj
Candidatus Nanogingivalaceae bacterium JCVI_28_bin.11
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transgly
Transpeptidase
DUF2606
CUB_M02D8_5_5th
DUF1481
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QWB91355
LinkDB
All DBs
Position
complement(429252..432005)
Genome browser
AA seq
917 aa
AA seq
DB search
MDRRNRLNKEKSSTKKRTSLKKGSALKRQNNLGLYTNLAHRMKEKKDSRARERAEYLASL
PKDPVKRFFYRLHPKRVLKYWFSKQGLFMGLKILGAIIILSGIAIAAAFAYVSKDLNQIK
PEELAKRVQTTVSKYYDRNGELLWEDKGSGDYKLVVENSEISDYVKKATVAIEDRDFYKH
KGVDLTAIVRAFVNNFKGGATQGGSTLTQQLIKQVYFSNESNERGLSGIPRKIKEMILAV
QVEQMYNKDQILSLYLNESPYGGRRNGVESGARTYFGKSSKDLTLAEAALLASIPNNPAI
YNPYNREFNKSLVERQHKVLNDMVSCGFITEKEAKEAKDFDILATIKPERDQYANIKAPH
FVQEVKKKLEEKLGVKVVGAGGLTVKTTVDLKAQSLAESAVNAGSKTLYISGADNIAMTS
VDVTTGQVIAQVGSVDYNKEGYGQTNAATSSLDPGSSIKPVVDYAALFNKKDTVYTPGTI
LKDENIDSQYCAGTYGSCQLRNASKQFYGSVPIRFSLGNSLNIAAVKSLAIVGVNDGVSV
AQQLGDKSYCKNSNAGLSAAIGGGCSVHQDEHTNAYASIARGGVYKELTYFTEVKNSSNQ
KIYEWKDESKQVIDQQAAYELTDILSDASARTTTFGGQSRSYGFVVPGVWTASKTGTTDN
GKGAAKDSWMMSYSSVVATGVWSGNHDGRALRSSDNSAVRRVVNDYMSSVHKQVYAANGK
WKPGDKIDKPAGIRSCTINGRTDICPSWWDKNKTGSTSREVEFDSISKKKATKCTPDSTR
IKLTVFEVTDPISKKKSVTVPDGYNINEEDDIHKCSDSQPSISGVSYSRHPNSNTYRINV
NINKGNFDISSVVVKVDGATISTAVPTGNTLSTDYTFSKAGQNITVEVSDSGGYKISKSY
TGPSSISSNSSSSDSGN
NT seq
2754 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatagaagaaataggcttaataaagaaaagagttctaccaaaaaacgtacatccttg
aagaaaggtagtgcactcaaaaggcagaataatctaggtttatatacaaatttagcgcat
agaatgaaagagaaaaaagattctagggctcgcgaaagggcggaataccttgcaagcttg
ccaaaagatccagtgaagagattcttttataggttgcatccaaaacgagttttgaaatat
tggtttagtaaacaaggtttgtttatgggcctaaaaattttaggcgcaataattattctt
agcggaattgctattgctgctgcttttgcttacgtctcaaaagacctaaatcagatcaaa
cctgaagaattggcgaaacgagttcagacgactgtttctaagtattacgaccgtaacggt
gagcttttatgggaagataaaggttctggagattataagctagttgttgagaattctgag
atatccgactatgttaaaaaagctacagtcgctattgaagacagggatttctataaacat
aaaggcgttgatttgacggctatcgttcgagcttttgttaataattttaagggtggtgct
actcagggtggttcaacattaactcagcaattaatcaagcaggtttatttttcgaacgag
tcaaatgagcgtggtttaagtggaataccgcgaaaaattaaagaaatgattttggcggtt
caagttgaacaaatgtataataaagatcagattttgtcactctatctaaatgagtctcct
tatggtggacgaagaaacggagttgaatctggtgctcgaacatacttcggaaaaagttct
aaagatctaactttagctgaagcggccctattggcttctattcctaataaccccgcaatt
tacaatccctacaatagagaatttaacaagagtctagttgagcgtcaacacaaagtatta
aacgatatggtttcttgtggatttatcactgaaaaagaagctaaggaagctaaggatttt
gatattttggcgactattaaaccagagagagatcaatatgcaaacatcaaagcaccacac
tttgtacaggaagttaaaaagaaacttgaagaaaagcttggtgtgaaagttgtcggtgcc
ggaggtcttaccgtaaaaacaacagtagatcttaaagctcaatcacttgctgaatcggct
gttaatgcaggttctaaaacactgtatattagcggtgccgacaatatagctatgacatca
gtggatgttactactggacaagttattgcccaggttggatcagttgactataataaagaa
ggttatggtcaaacgaatgctgcgacttcttctctagatcctgggtcaagtattaagccg
gtagttgattacgctgctttattcaataaaaaagatacagtttataccccaggtactatt
ctaaaggatgaaaatattgattctcaatattgtgcagggacttacggttcttgtcaactc
agaaatgcatctaaacagttttatggaagtgttcctatacgatttagcttgggtaactct
ttaaatattgctgcggttaaatctttagcgatagttggagttaacgatggtgttagtgtt
gcacagcaacttggcgataagtcttactgtaagaatagtaatgctggtctttctgccgct
attggtggtggatgttcggttcatcaagatgagcatacaaatgcttatgcttctatcgct
cgcggaggtgtatacaaagagctaacttactttactgaggttaaaaattcttcgaatcaa
aaaatttatgaatggaaagatgaatctaagcaggttattgaccagcaggcagcgtacgaa
ttgacggatatcctttctgatgctagtgctcgaacgacaacctttggaggtcagagtcga
agttatggatttgttgttccaggggtttggacggcttcaaaaacaggaacaactgacaac
ggtaagggagccgcaaaagattcgtggatgatgagctattcgtctgttgtagctactggt
gtttggagtggtaatcatgatggacgagctctaaggtcttccgataacagtgctgtgcgc
cgagtagtgaatgactatatgagttccgtgcataaacaggtttatgccgcaaacggaaaa
tggaaacctggcgataagatagataaacccgcgggtattagaagctgtactataaatgga
agaactgatatttgtccttcttggtgggataaaaacaaaaccggttcaacatctagagaa
gtcgaatttgatagtatttcgaaaaagaaagctacaaaatgtacacccgactcaacccgt
attaagttaactgtatttgaagtaacagaccctatctcgaagaagaaatcggttacagtt
ccagatggatataacatcaatgaagaggacgatatacacaagtgctctgatagccaacca
agcatatcaggtgtttcttactcaagacatccgaattcgaatacatatagaataaatgtc
aatattaataaaggtaattttgacataagttctgttgtagtgaaagttgatggtgctact
attagtaccgccgtcccaactggaaatactttatctacagactacacattcagtaaagct
ggccagaatataaccgttgaagtttctgattctggcggttataaaatttcaaagagttat
acagggccgtcttcgataagttcgaacagcagttctagcgattctggaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system