Nasibacterium caprae: LU301_00850
Help
Entry
LU301_00850 CDS
T12040
Name
(GenBank) UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase
Organism
ncap Nasibacterium caprae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Mur_ligase_M
Mur_ligase_C
Mur_ligase
DUF3910
MoCF_biosynth
Flavodoxin_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WLF84094
LinkDB
All DBs
Position
171265..172839
Genome browser
AA seq
524 aa
AA seq
DB search
MTTFNQILKTLSLDIHSSAPSHTADWQVQAFTGFVLDSRKVEKGQIFIALKGTNSTAEQM
AQYINKALENGALAVVTEFSEFAYSDECAEKFPELKNKNILYFKYLRQYLGEIQQAYLQV
QQAQDLARVVAVTGTNGKTTVSRLIAELLTLLQQPTAVMGTTGNGILPNLVPSTHTTLDA
LQLQSSYYQYSQQGAKFLSLEASSHGLEQGRLAGLPIEVASFSNLSRDHLDYHGTLQQYA
QAKAELFSFTSLKYAIIHQDDDYADLMLEKAKNNSAQPHIIRFSMKDNTADYYTSDVLFS
LNGANFNLHSPSGTFAVCSPLLGKFNVANVLQAIISVEKLGFNLQDIIQLVPQLKGASGR
MQTISDTQHQRLFIVDYAHTPDALQQVLMSLRHHVDGKLWAVFGCGGDRDRGKRPMMTQV
AMDYADKIILTSDNPRTEDPAQIMADMMAVDGLAQADVQSILDRREAIKYAVKHAQQGDI
VVVAGKGHENYQEIDGVRHWFDDVVEVQSAVDSLGCALPNTVEA
NT seq
1575 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaacatttaatcaaatattaaaaacattatctcttgatatccattcatcagcacca
agtcatacagcggactggcaggtacaagcatttacgggctttgtattggatagccgtaag
gtcgagaaaggacagatttttatcgcattaaaagggacaaattccactgccgaacagatg
gcacaatatatcaataaagccttggaaaatggagctttagcggtagtaacagagtttagt
gaatttgcttatagtgatgaatgtgcggaaaaatttccagaattgaaaaataaaaatatt
ttatattttaaatacttgcgacaatatctaggggaaatacaacaagcatatttacaagtt
caacaagcacaagatttagctcgtgtggtggcagttacaggtactaatgggaaaacgact
gtttcacgacttattgctgaattattaaccttattacaacagccaactgcagtgatggga
accacgggtaatggtattttgccaaatttagtcccatcaacacataccacattggacgca
ttacaattacaatcatcatattatcaatatagccaacaaggagcgaaatttttgtcgctc
gaagctagctcgcatggattagaacaagggcgtttagcaggtttgccgattgaagtggca
agttttagtaatttaagccgagaccatttggactatcatggtacgttgcaacaatatgcc
caagccaaagctgaattatttagttttacatcattaaaatatgcgattattcatcaagat
gatgattatgctgatttaatgttggaaaaagcaaagaataattcagctcaaccacatatt
atccgtttttctatgaaagataatacggctgattattatactagtgatgtgttattcagc
ttgaatggtgcaaattttaatctacattcaccaagtggaacttttgcggtatgtagtcca
ttattgggtaaatttaacgttgctaatgtattacaagccattattagtgtagaaaaatta
ggttttaatttacaagatattatccaacttgtaccacaattaaaaggggcaagtgggcgt
atgcaaaccattagtgatacgcaacaccagcgtttatttattgttgattatgcccatacg
ccagatgcgttgcaacaagtcttgatgagtttacgccatcatgttgatgggaaattgtgg
gcagtttttggttgtggcggcgaccgtgatagaggaaaacgcccgatgatgacccaagtc
gcgatggattatgctgataaaatcattttaacgtctgataatccacgcactgaagaccct
gcacaaattatggcagatatgatggcggttgatggtttagctcaagccgatgttcaatcg
attcttgaccgccgtgaagcgattaaatatgctgtgaaacacgctcaacaaggtgatatt
gtggtggttgcaggcaaagggcatgaaaattatcaagagattgatggtgtgcgtcattgg
tttgatgatgtggtcgaagtacaatcagcggtcgatagtttgggttgtgccttgccaaat
acggtggaagcctaa
DBGET
integrated database retrieval system