Natranaerofaba carboxydovora: ACONDI_02309
Help
Entry
ACONDI_02309 CDS
T07970
Symbol
inlA_6
Name
(GenBank) Internalin-A
Organism
ncd
Natranaerofaba carboxydovora
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
Cu_amine_oxidN1
LRR_8
LRR_9
LRR_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UMZ74709
LinkDB
All DBs
Position
complement(2441809..2443728)
Genome browser
AA seq
639 aa
AA seq
DB search
MLNMVSKCLKAITLKIYFLTIFFLSVFLFLHGSATATTADEDVEIYYETIKDEIREQIDA
DEKENITIEDMKNIKELDLSVLGILEEPEDIKDLSCLEYAKNLKKLEAPGYSIEDITPLQ
NLDNLKKLNLKNNKLNDLSPLKELDNLEVLKLRGNEIKDLSPLAELNNLRKLNINSNKIE
DIGPLKNLSKLEELKLNDNNVKNLEPLRDLVNIKNLRFGGNEVSDIEPLKELTNIKELNF
VLNEVNNLDALENMEKLEILLINSNEIIDVCPLGGEIEQNLEPLRGLKELRRINMRANLI
SNLSPLQELNNLEELNFDLNHVSDISPLKNLESLEVLTFEENYVDNISPLTNLQNLNRLN
FCKNNVSDISPVEELTELDTLAFRNNKVTDISPVKSLEGLNNALNFKGNKVKDISPVENL
EKVSYLKFNDNLVTDITPLKDLDNLRMLKLKKNYIDISMGSNNSSIIENFENDGVTVKYE
PQNNKEDLDIEEKDMDRINRRLEDIEEIKNNPERIEQIRQKPLEDKVFVKGKQIDFDQPP
VIEDGRTLIPVRAVSEELGAKVDYIGEENAILIEKKDVKIEMTLGEKEIYVNNSIKDLDV
PAREQNGRTLVPLRFVSDMLKKPVKYHENTSEIDIGLDV
NT seq
1920 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttaaacatggtaagcaaatgtcttaaagcaataactttaaagatttattttttgaca
atattttttttaagtgtttttttatttttacacggttctgctactgccaccacagcagat
gaagatgttgaaatttactacgagactataaaagatgaaatccgagagcaaattgatgca
gatgaaaaagaaaacattactatagaagatatgaaaaacattaaggagttagatttaagt
gtccttggtatattagaagaaccagaggatattaaagatttatcctgtcttgagtatgcc
aaaaatttaaaaaagttagaggcacctgggtattctatagaagatataactcctttacaa
aatttagataatttaaaaaaattgaatcttaaaaacaataagttaaatgatttaagtcct
ctaaaagaactagacaatttagaagttttgaaattaagaggaaatgaaataaaagattta
agccctctggcagaattaaataatcttagaaaattaaatattaattcaaacaaaatagaa
gatattgggcctttaaaaaatttaagtaaattagaggaattaaaactaaatgacaataat
gttaaaaatctagagcctttgcgggacttagtaaacattaagaatttaagatttggtggt
aatgaggtatctgacatagaaccattaaaagaattaacaaatataaaagagctaaatttt
gttttaaatgaagtcaataatttggatgcgcttgaaaacatggaaaaattagagatacta
ttaattaattccaacgaaattatcgacgtatgcccattaggaggtgaaatagaacaaaac
ttagaacctttaagggggcttaaagagctgagaagaattaatatgagagctaatcttata
agtaatctaagccctttacaagaattgaacaatcttgaggaacttaattttgatctaaat
catgtaagtgatatttctcctttaaaaaacctggaaagtcttgaagtgctaacatttgaa
gaaaattatgtagataatataagccctctaacgaacctccaaaatctgaatagacttaat
ttttgcaaaaacaatgtttcagatattagtcctgtagaagaactaacagaattagataca
ttagcatttagaaacaataaggtcactgatatatccccggtaaaatctttagaagggtta
aacaatgctttgaattttaaaggcaataaggtgaaagatataagtcctgtagaaaatcta
gaaaaagtaagttacttaaagtttaatgacaaccttgtaacagatattacccctttaaaa
gatttagataatcttagaatgctgaagttaaagaaaaattacatcgatataagcatggga
tctaataatagctcaataattgaaaattttgagaatgacggtgttacagttaaatatgaa
cctcaaaataacaaagaagatctagacatagaagaaaaagacatggacagaattaacagg
cgccttgaagatatagaagaaattaaaaataatcctgaaaggatagaacagattagacaa
aagcctttagaagataaagtttttgtaaaaggaaagcagatagatttcgatcaaccacct
gttattgaagatggaagaactttaattcctgttagggctgtttcagaagaactaggagcc
aaagtagattacataggcgaggagaacgcgatcctaattgaaaaaaaagatgtaaaaatt
gaaatgacccttggtgaaaaagaaatttacgttaataacagtattaaagacctggatgta
cctgctagagaacaaaatggaagaaccctggtgcctttgagattcgttagtgatatgctg
aaaaaacctgtaaaatatcatgaaaatactagtgaaattgatattggtttggatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
