Vairimorpha ceranae: NCER_101253
Help
Entry
NCER_101253 CDS
T01614
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K15201
general transcription factor 3C polypeptide 3 (transcription factor C subunit 4)
Organism
nce
Vairimorpha ceranae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nce00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
nce03021
]
NCER_101253
Transcription machinery [BR:
nce03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
Basal transcription factors
TFIIIC
NCER_101253
TFIIIC, fungi type
NCER_101253
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_8
TPR_2
TPR_1
ARM_TT21_5th
TPR_17
HcgB
TPR_CcmH_CycH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EEQ82093
UniProt:
C4V9K4
LinkDB
All DBs
AA seq
836 aa
AA seq
DB search
MSYQEQDSTDKESTNPRKNQSFEDCNKREIFTNDKELLFDSIETKGVELTKKEKKEKIRE
IRQMMISANKFFVKNDNNSCISVLKEILIKSPKNANAYFMIGLVFEEMKDLMKAYNFFLI
ASQLMKTNYLLWEKLYELSTTLNLLSDKIYFIQILQRRQNTKELVEEKLQLYTILKSKYK
ILETKIELFYFKGVDFNIFNIIRNETKHKFMTARCALYLIKYFEKYPANCGLDFLQNIIR
LQYDTGYLFKTRNLIEKYLLGKVILPRDIRIIYIMCVLVNNDPPEKIESSFTDYNIDDIE
FREALFEAKESVLKNLNCKDEIFDIYENNNEECSKTLEINSLLSSTDLYEKYSDIDIFIR
DLSQWENFTEIEYIKGLLEIFLKLNMDDKYLEVLNILENKIDTLKEYVYNSYGDFYFTKK
DFINALFYYQETLKINPDNNLIKSKLYEIYKIMGNIDLANKFRTISSLINFVNDIQNDDK
FKFMSSIEKCNENRNIYSKSRLLFRENFYEYNYVVRPLINDFLENRFFFTKIKKVKLDKD
DVDPNEEICEANTRLLSLHGLNIDEWSAILLEFIIYNITQSNLKDASHLLKKSLDCNIFK
KKYEIFLQFVFLTIKHAIFCNDLNLLSNCFKKVFRVFRDYSWANFYFYLLNFFPDYIFKN
SYGSVVRNIRRTFKRNHVLISGIKKKYSSVYESLDLNLLLGTFFIQNIAKKSYKIINNII
LDGSVRDRMTYYIILIITYKSRRNDIKNEMLKKGIEGLKALTSMCNHEELCNLSYNIGVT
YHLFGYIGFAEKYYLEALKSRNNELRRMARLSLIIIYKKSNQYLLEKLYAEDEMPI
NT seq
2511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttatcaagaacaagattctactgacaaagaatcaactaatccaagaaaaaatcaa
agttttgaagattgtaataaaagagaaatttttacaaatgacaaagaattattatttgat
agtattgaaacaaaaggtgttgaattaacgaaaaaagaaaaaaaggagaaaattagagaa
attagacaaatgatgatcagtgcaaacaaattctttgtaaaaaatgataataattcatgc
atatcagtacttaaagaaattttaataaaatcaccaaaaaatgcaaatgcatattttatg
ataggattggtatttgaagaaatgaaagatttaatgaaagcatataatttctttcttatt
gcttcacagcttatgaaaaccaattatttgctatgggagaaattatacgagttaagtaca
acattaaacctgttgtctgataaaatctattttattcagatattgcaacgtagacaaaat
acaaaagaattggttgaagaaaaattacaactgtatacaattctcaaatcaaagtataaa
attttagaaacaaaaatagagcttttttattttaaaggtgtagattttaacatttttaat
attatacgaaatgaaactaagcataaatttatgactgcaagatgtgcattgtatcttata
aaatattttgaaaaatatcctgcgaattgtggactagactttttacaaaatataattaga
ttgcaatatgacacaggatatttatttaaaactagaaatcttatagaaaaatatttatta
ggaaaggttattttaccaagggatattagaataatttatattatgtgtgttttagtaaac
aatgacccaccagaaaaaattgagtcaagttttactgattataatattgatgatatagaa
tttagagaagcactttttgaggctaaagaatccgttttaaaaaatcttaattgtaaagat
gagatatttgatatttatgaaaacaataatgaagagtgtagtaaaactttagagataaat
agtttactatcatctacagatttatatgaaaaatattcagatattgatatattcattagg
gatttatcacagtgggaaaattttactgaaatcgaatacataaaaggacttttagaaata
tttcttaagttaaatatggatgataagtatcttgaagttttaaatatcttggaaaataaa
atagacacactaaaagaatatgtatacaatagttatggtgacttttattttacaaaaaaa
gattttataaatgcacttttttattatcaagagactctaaaaatcaatccagataataat
ttaattaaaagtaaactatacgaaatatataaaattatggggaatattgatctggctaac
aaatttcgtacaatttcatctttgattaattttgttaatgatattcaaaatgatgataaa
tttaagtttatgtcatctattgaaaaatgtaatgaaaataggaatatttattctaaatct
aggttactttttagagaaaatttttatgaatataattatgttgtacgcccacttataaat
gactttttagaaaatagatttttttttacaaaaattaagaaggtaaaacttgacaaggac
gatgtcgacccaaatgaagaaatttgtgaagccaatacacgcctgttaagtcttcacgga
ttaaatatcgatgaatggtctgccattcttttggaatttataatttataatattactcaa
agtaatttaaaagatgcttctcatctcttaaaaaaatctcttgattgtaatatttttaag
aaaaaatatgaaatttttttgcaatttgtttttttaactataaaacacgcaattttttgt
aatgaccttaatcttctttctaattgttttaaaaaagtattcagagtgtttagggattac
agctgggcaaatttttatttttatcttctgaacttcttcccagattacatttttaaaaac
agctatggaagtgttgttagaaatattagaaggacattcaaaagaaatcatgttttaatt
tctggaattaaaaaaaagtattcctctgtttatgaatcattagatttaaatttactatta
ggcaccttttttattcaaaatattgctaaaaagtcatataaaattattaataatattatt
cttgatggaagtgttagagacagaatgacttattatattattttaattataacttataaa
agtagaaggaatgatataaaaaatgaaatgttaaaaaaaggtatagaaggattaaaggca
ttgacatctatgtgtaatcatgaagagttatgtaatttatcgtataatattggagtaaca
tatcacttatttggatatattggatttgccgaaaagtattatctagaggctttaaagtct
agaaataatgagttacgaaggatggctagattaagtcttataattatttataaaaaaagt
aatcaatatttactggaaaaattatacgctgaagatgagatgcctatataa
DBGET
integrated database retrieval system
