Vairimorpha ceranae: NCER_101770 Help Entry NCER_101770       CDS       T01614                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K08737   DNA mismatch repair protein MSH6 Organism nce  Vairimorpha ceranae Pathway nce03430   Mismatch repair Brite KEGG Orthology (KO) [BR:nce00001]  09120 Genetic Information Processing   09124 Replication and repair    03430 Mismatch repair     NCER_101770  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:nce03400]     NCER_101770 DNA repair and recombination proteins [BR:nce03400]  Eukaryotic type   SSBR (single strand breaks repair)    MMR (mismatch excision repair)     Mismatch and loop recognition factors      NCER_101770 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  MutS_V MutS_I MutS_III MutS_IV Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  EEQ81696 UniProt:  C4VAQ4 LinkDB All DBs AA seq 920 aa AA seqDB search MQKNNLEDIIKKNKNNLNGGSKKSNNCNNMLMTDSCENLLTTCSTQPDTINSSHSDLRER IYESPKKIHKSTLSFSDFQISKSSDIEDNSDIHNNTKIKDTRYEFLLNIRDKEGRHVNDA DYDNTTLYISDHDFYKMTPFEKQFWEIKKDYWDTIVFFKKGKFYELYEKDADIASSLFNF RLTERVNMRMAGFPESSLDDWICKFLEAGFKVARVDQSENMIAKKIREKGAVKDKIIRRE LKEVITQGTIYDNNHLKTPYAVYTLVIRENQICENANCTFSLHFSILLFDAATLQIFYKT FCDDSNYNNLKNICVKYIVKEYLSQKKYPFISNYVKPDDKIFNKNLEFLNESENICYGFL YNYMKYLNRENFLKNCRFFKFECLESIMILDSCSIINLDLLSDKHNKTLFNVINNCSTPF GQRKLQSWMLSPLSDGNSIRKRQCLINYFANINLSPIIEIFKSLGDFERLFSKLQSGHSK FRDLRTFMEKLNLVVKIYQIIELQICNKNGPAPNTIKINCFVDLYDHNNLSVSYAPLHDL KKFIQNYQLKYYINREEIEPGKENSEEIASLINRKEELHAKLEEYLNNVKSNLQCEDINY KNIGKEIYQLEVPKHIKVPDEFFIVSATKSFNRYYTLNLKNLITDYIELEEKIFQCHGSL FFQAVNCLLESESLFFNIISDLSTIDCLISLAIFNHSIKGCLPVEFNKIEVRGLGNPIYK EYVKNDYIEDQRILILTGSNMAGKSTFMRTFCLNTILFHMGCNVFASEFKCPVFDRLYSR MGASDNLVRGESTFMVELLETSNILRNATSKSLVIMDELGRGTSTKDGKSIAKAVLSYLQ NINCRVFFSTHYQNLVSLNNGFSTGFMNICIKNNIVIFLYKLVNGICEDSNGIHVAKLAG VPEEILLQAEKYKQEFKSYK NT seq 2763 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgcaaaaaaataatttagaagacattattaaaaaaaataaaaataatttaaatggaggc agtaaaaaatctaataattgtaataacatgttgatgactgattcttgtgagaatttacta actacgtgtagcacacagcctgataccataaattcttctcactctgatttaagagaaaga atttatgagagtcctaaaaaaatacataaatctactttatcattttctgattttcaaatt agcaaatcaagtgacattgaagataattcagatatacacaacaatacaaaaattaaagac acacgctatgaatttttactgaatattagagataaagaaggtaggcatgttaatgatgct gactatgataatacaacactttacatatcagatcacgatttttacaaaatgacaccattt gaaaagcaattttgggagataaaaaaagattattgggatacaatagtattttttaaaaag ggaaaattttatgaattatatgaaaaggatgctgatattgcttctagtcttttcaacttt agattgacagaaagggtaaatatgcgcatggcaggttttccagaaagctcgttggatgat tggatctgtaaatttttagaagcggggtttaaggtagcaagagtcgatcagtcagaaaat atgattgcgaaaaaaattagagaaaagggtgctgtaaaagataaaattattagaagagag ttaaaagaagttattacacaaggtaccatttatgataataatcatctcaagacaccttat gcagtttacactcttgtaattagagaaaatcaaatatgtgaaaatgctaattgtacattt tcattacatttttcgattttactttttgatgctgctacattacaaatattttataaaact ttttgcgacgattcaaattacaataatctgaaaaatatttgtgttaaatatattgttaaa gaatatttgtcgcagaaaaagtatccttttatttcaaattacgttaaaccggatgataag atttttaacaaaaatttagaatttcttaatgaatctgaaaatatatgttacggatttttg tacaattatatgaaatatttaaatcgagaaaattttttaaaaaattgtcgattttttaaa tttgagtgtcttgaatctataatgatattagattcctgttctattattaatttagattta ttaagtgataagcacaataaaacgttatttaacgtaataaataattgtagtacaccattt ggacaaagaaagcttcagtcatggatgctctcacccttgtctgatggaaattcaattaga aagagacagtgtttaattaattatttcgcaaatattaatttatctcctattatagagatt tttaaaagtcttggagattttgaaagattattttctaaattgcaatcaggtcattctaaa ttccgggatttacgcacatttatggaaaaattgaatcttgtagtaaaaatttatcagata attgaattacaaatttgtaataaaaatggaccagcaccaaatacaataaaaattaattgt tttgtggatttatatgatcataacaatttaagtgttagttatgcacctttacacgacctg aagaaatttattcaaaattaccaattaaaatattatattaatagggaagaaattgaacct gggaaagaaaattctgaagagattgccagtcttataaacagaaaagaagagttacatgca aaattagaagaatatcttaataacgttaagagtaatttacaatgtgaagatataaattac aaaaatattggcaaagaaatatatcaattagaagtaccaaaacatattaaagttcctgat gaattttttatagttagtgctactaagtcatttaatagatattatactttaaatttaaaa aatttaattactgattatattgaattagaagagaaaatttttcagtgccatggatcatta ttttttcaggcagtaaattgtcttttagaatccgaatcattatttttcaatattatatca gatttatctacaattgattgtttaatatctttagctatttttaatcactcgattaaaggt tgtttaccagtagaatttaataaaatagaagttcgaggattaggcaacccaatttataaa gaatatgttaaaaatgattatatagaagatcaaagaattttgattcttactggatctaat atggcaggtaaatctacttttatgagaactttttgtttgaatactattttatttcacatg ggttgtaatgtttttgcatcagaatttaaatgtcctgtttttgacaggttatacagtcga atgggtgcttctgataatttagtcaggggagaatctacatttatggttgaattgcttgaa accagtaatattttacgaaatgcgacaagtaaatcgcttgtaattatggatgaacttgga agaggaacatctaccaaagatggaaaaagtattgctaaggcagttttatcttatttacaa aatattaattgtcgagtatttttttctacgcactatcaaaatcttgttagtttaaacaat ggattttctactgggtttatgaatatttgtataaaaaataatattgtaatatttttatat aaacttgttaatggcatctgtgaagattcaaatggtatccacgttgctaaacttgctggt gttcctgaagaaattttattacaagctgagaagtataaacaagaatttaaaagttataaa taa

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