Nostoc cf. commune: ANSO36C_32260
Help
Entry
ANSO36C_32260 CDS
T10378
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ncf Nostoc cf. commune
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Cadherin_4
Cadherin_5
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDI17424
LinkDB
All DBs
Position
3540783..3546794
Genome browser
AA seq
2003 aa
AA seq
DB search
MTEFKVNTTVIGNQSNSTVAIDQNGNFVICWTSFDENGVGGIYAQRYNNDGAPQGNQFKV
NTLTTDNQSIPTAAMDANGNFIISWTNFAENGSSTGIYAQRYNSAGMPQGGEFKVNTDID
SILDSTVAIAMNANGAFAISWSKLEVDGSDFEVYARLYDSTGMPQDVQFKVNKTFEDKQY
YPTVAMNVDGGFIISWTSNLQDDSGNGIYAQRYDNTGMPQGEEFRVNATIINNQTNPTVA
IDATGNFVISWQSENQDGDGYGIYAQRYNSAGEAQGNEFRVNTKIVNDQINPKVAMDARG
NFVISWQSNVQDNSGYGIYAQRYDSAGNAQGEEFQVNAYTSNDQSIPTVAMNGKGDFVIS
WTSYGQDRLVPQDEDINSNGGIYAQLYKSGVPPIITSVSTSALEYTENANTIIDSGITVS
DKDSDNLASATVSITSGFISAQDTLAFTSENGITGSYNSSTGVLTLTGSSSVANYQTALR
SVTYSNRSDNPSLTPRTVRFIVNDGSTNSTAITRNINITAVNDAPVAAATNSVLLYTENT
TTAIDSGITVSDVDSPTLTSATVSITSGFISAQDTLAFATQNGITGSYDSSTGVLTLNGS
ATVANYQTALRSVTYTNSSDNPSLTPRTVSFLVNDGSTNSTAITRNINITAVNDAPVAAA
TNSVLLYTENTTTAIDSGITVSDVDSPTLTSATVSITSGFISAQDTLAFATQNGITGSYD
SSTGVLTLNGSATVANYQTALRSVTYTNSSDNPSLTPRTVSFLVNDGTANSTAVTHDINI
TGVNDAPVAAATNSVLAYIENATTAIDSGITVSDIDSPTLTSATVSITSGFISAQDTLAF
TSKNGITGSYDSSTGVLTLTGSSSVANYQAALRSITYSNSSDNPSLTPRTVSFIVNDGTA
NSTAVTRDINITGVNDAPVAAATNSALAYIENATTAIDSDITVSDVDSDNLASATIRITS
GFISAQDTLAFTNQNGITGSYNSSTGVLTLTGSSSVANYQTALGSVTYSNSSNKPTLTPR
TVSFLVNDGTANSTAVTHDINITGVNDAPVAAATNSVLAYIENATTAIDSGITVSDTDSP
TLTSATVSITSGFISAQDTLAFTSKNGITGSYDSSTGVLTLTGSSSVANYQAALRSVTYS
NSSNKPTLTPRTVSFLVNDGTANSTAVTRDINITGVNDAPVAAATNSALAYIENATTAID
SDITVSDVDSDNLASATIRITSGFISAQDTLAFTNQNGITGSYNSSTGVLTLTGSSSVAN
YQTALRSVTYSNSSNKPTLTPRTVSFIVNDGTANSTAVTRNINITAVNDAPVAVNDSITT
NKDTPIIISATTLLSNDTDADISDVLSITDFTQPIQGTLVNNNNGTYTYTPVQNYYGSDG
FTYTMSDGQGGSSTATVNLTINEITPPINGTLVADKLTGTEKSDIISGLQGNDTLQGLGD
NDTLNGGDGNDSLDGGAGADSLIGGKGNDIYIVDNLNDSITEGLNAGTDLVKSSVTWVLG
ANLENLTLTGSEAINGTGNSFNNILIGNAAANFLSGENGNDSLTGDVGDDTLVGSVGNDT
LDGGLGADSLIGGAGNDIYIVDNLSDSITEGLNAGTDLVKSSVIWVLEANLENLTLTGSE
AINGTGNNLKNILIGNTGANILSGEDGNDSLIGGVGNDTLFGGVGDDTLDGGLGSDSLIG
GAGNDIYIVDNVNDSIIEGLDAGIDLVNSSVNWVLVDNLEKLTLTGSGAISGTGNSLNNI
LTGNSGANTLRGEDGNDSLIGGSGNDTLLGGVGDDTLNGGAGVDSLDGGVGNDIYTVDNV
NDSIIEGLDAGTDLVNSSITWVLGNNLENLTLTGSKLINGTGNSLNNTLTGNTGANTLIG
GDGNDSLSGNSGNDTLLGGLGDDLLAGGVGLDVLTGGIGQDSFNLTGSRTGGYDTIADFT
LGDDTILVSKAEFKLVQSQNTTLDSGLFLLGTSAIAGGDRFIYDQTTGNLFFDADGIGKT
AQIKIAHFSNQVALTSANITVIA
NT seq
6012 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgaattcaaagtaaatactactgttatcggtaatcaatctaactccacagtagcg
atagatcaaaatgggaactttgtcatttgctggactagttttgatgagaacggggttggt
gggatatatgcccaacgatacaacaatgatggggcacctcaagggaatcaatttaaggtc
aataccctgaccacagacaatcaaagtatccccacagcagcgatggatgcaaacgggaac
tttatcatttcctggactaattttgctgagaacgggtctagcactgggatatatgcccaa
cgctacaacagtgcagggatgcctcaaggaggtgaatttaaagtcaataccgacatcgac
agcattttggactccactgtagcgatagcgatgaatgcaaatggggcctttgccatttcc
tggagtaaattggaggtggatggatctgactttgaggtatatgcccgactctacgacagt
actgggatgcctcaagatgtccaatttaaggtcaataaaacctttgaagacaaacaatat
taccccacagtcgcaatgaatgtagatgggggctttatcatttcctggactagcaatctt
caagatgattctggcaatgggatatatgcccaacgctacgacaatactgggatgcctcaa
ggagaggaatttcgggttaatgccaccatcatcaacaatcaaactaaccccacagttgcg
atagatgcgacaggaaactttgttatttcttggcaaagcgagaaccaggacggagatggc
tatgggatatatgcccaacgctacaacagtgcaggggaggctcaagggaacgaatttcgg
gtcaataccaaaatcgttaacgatcaaattaaccccaaggtagcgatggatgcaagggga
aactttgtcatttcttggcaaagcaatgttcaagacaattctggctatgggatatatgcc
caacgctacgacagtgcagggaatgctcaaggggaagaatttcaagtcaatgcttatact
tccaacgaccaaagtatccccacagtagcgatgaatggaaagggagactttgtaatttcc
tggactagttatggtcaagataggctagtaccgcaggatgaggacataaattctaatggg
gggatatatgcccaactatacaaaagtggggttcctccgataattacctctgtttctaca
tctgccctagaatacactgagaacgccaatacaatcatcgactcaggcatcaccgttagc
gacaaagattcagataacttagctagtgccaccgttagcattactagtggttttatttct
gctcaagataccctcgccttcaccagcgaaaatgggattacgggcagctacaacagtagc
acaggtgttttaaccttaactggcagttccagcgttgctaattatcaaaccgcactacgt
tccgttacttatagcaacaggagtgataaccccagtctcacacctcgtaccgtcagattt
atagttaatgatgggtctactaatagcactgccattacccgcaacattaatattacggca
gtgaatgatgcacctgttgctgctgccaccaactctgtcctgctatacactgagaatacc
actacagccatcgactcaggcatcaccgttagcgatgtagactctcctaccctaactagt
gccaccgtcagcattaccagtggctttatttctgctcaagataccctcgccttcgccacc
caaaatgggattacaggcagctacgacagcagcacaggtgtcttaacgttaaatggcagt
gccacagttgctaattatcaaaccgcactgcgttccgttacttataccaacagcagtgac
aaccccagtctcacacctcgtactgtcagctttctagttaatgatgggtctactaatagc
actgccattacccgcaacattaatattacggcagtgaatgatgcacctgttgctgctgcc
accaactctgtcctgctatacactgagaataccactacagccatcgactcaggcatcacc
gttagcgatgtagactctcctaccctaactagtgccaccgtcagcattaccagtggcttt
atttctgctcaagataccctcgccttcgccacccaaaatgggattacaggcagctacgac
agcagcacaggtgtcttaacgttaaatggcagtgccacagttgctaattatcaaaccgca
ctgcgttccgttacttataccaacagcagtgacaaccccagtctcacacctcgtactgtc
agctttctagttaatgatgggactgctaatagtactgccgttacccacgatattaatatt
acaggagtgaatgatgcacctgttgctgctgccaccaactctgtcctggcatacattgag
aacgccactacagccatcgactcaggtatcaccgttagcgacatagactctcctacccta
actagtgctaccgtcagcattaccagtggctttatttctgctcaagacaccctcgccttc
accagcaaaaatgggattacgggcagctacgacagcagcacaggtgttttaaccttaact
ggcagttccagtgttgctaattatcaagccgcactacgttccattacttatagcaacagc
agtgacaaccccagtctcacacctcgtactgtcagctttatagttaatgatgggactgct
aatagtactgccgttacccgcgatattaatattacaggagtgaatgatgcacctgttgct
gctgctacgaactctgccctggcatacattgagaacgccactacagccattgactcagac
atcaccgttagcgacgtagactcagataatcttgctagtgccaccattagaattaccagt
ggctttatttctgctcaagacaccctcgcttttaccaaccaaaatgggattacgggcagc
tacaatagcagcacaggtgttttaaccttaactggcagttccagcgttgctaattatcaa
actgcactgggttcagttacttatagcaacagtagtaataagcccaccctcacacctcgt
actgtcagctttctagttaatgatgggactgctaatagtactgccgttacccacgatatt
aatattacaggagtgaatgatgcacctgttgctgctgccaccaactctgtcctggcatac
attgagaacgccactacagccatcgactcaggtatcaccgttagcgacacagactctcct
accctaactagtgctaccgtcagcattaccagtggctttatttctgctcaagataccctc
gccttcaccagtaaaaatgggattacgggcagctacgacagcagcacaggtgttttaacc
ttaactggcagttccagtgttgctaattatcaagccgcactacgttcagttacttatagc
aacagtagtaataagcccaccctcacacctcgtactgtcagctttctagttaatgatggg
actgctaatagtactgccgttacccgcgatattaatattacaggagtgaatgatgcacct
gttgctgctgctacaaactctgccctggcatacattgagaacgccactacagccattgac
tcagacatcaccgttagcgacgtagactcagataatcttgctagtgccaccattagaatt
accagtggctttatttctgctcaagacaccctcgcttttaccaaccaaaatgggattacg
ggcagctacaatagcagcacaggtgttttaaccttaactggcagttccagcgttgctaat
tatcaaactgcactacgttcagtgacttatagcaacagtagtaataagcccaccctcaca
cctcgtactgtcagctttatagttaatgatgggactgctaatagtactgccgttacccgc
aatattaatattacggcagtgaatgatgcacccgttgctgttaacgatagcattaccaca
aacaaagacacacctattatcattagtgctactactctgttaagcaatgatacagatgct
gatattagtgatgtattgagcattactgacttcacccaacctattcaaggaactttagtt
aacaacaacaacggtacttacacttatacacctgtccaaaactattatggctccgacggc
ttcacttacaccatgagtgatgggcagggaggcagtagtactgctacggtcaacttgacc
attaatgaaatcacccctccaattaatggcactttagttgcagacaagctgactggtacg
gagaagagtgatatcatctcaggattgcagggcaatgataccctccaaggactaggtgat
aacgacactcttaatggcggcgatggaaatgattctttagatggtggtgcaggggctgac
agcctcatcggtggtaaaggcaatgatatttacatcgtagacaacctgaacgattcgatt
actgaaggcttaaatgcaggtacagatttagttaagtcttcggtaacttgggtgttggga
gctaacttggaaaacttgaccctgactggaagtgaagcaatcaatggtactggtaacagc
tttaataatatcctgattggaaatgctgccgctaacttcttgagtggagaaaatggcaat
gatagcttgactggtgatgtaggtgatgacaccttagtgggcagtgtaggcaatgacacc
ttagatggaggtttgggagctgatagtctcattggtggagctggcaatgacatttacatc
gtagacaatctgagcgattcgattactgaaggcttaaatgcaggtacagatttagttaag
tcttcggtaatttgggtgttggaagctaacttggagaacttgaccctgactggaagtgaa
gcaatcaatggtactggcaacaatcttaagaatatcctgattggaaatactggcgctaac
atcttgagtggagaagatgggaacgatagcctgattggtggtgtaggcaatgataccttg
ttcggcggtgtaggcgatgacaccttagatggaggtttaggatctgatagtctcattggt
ggagctggcaatgacatctacatcgtagataacgtgaacgattcgattattgaaggctta
gatgcaggtatagatttagtcaattcttcggtgaattgggtgttggtagataacctggag
aagctgactctgactggaagtggggcaataagtggtactggtaacagccttaataacatc
ttgaccggaaatagtggcgctaacacgttgagaggagaagatggcaatgatagcctgatt
ggtggttctgggaatgacactttgttgggcggtgtaggcgatgacaccttaaatggaggt
gcaggagttgacagtcttgatgggggagttggtaatgacatttacactgtagacaacgtg
aacgactctattattgaaggcttagatgcaggtacagatttagtcaattcttcgataact
tgggtgttaggcaataacctggagaacttgaccctgactggaagcaagctaattaatggt
actggtaacagcctcaataacaccctgacgggaaatactggcgctaacactttaatagga
ggagatggtaatgatagcctctctggaaactcaggcaatgacaccttgctcggtggtcta
ggtgatgatttactagctggtggagttggtctagatgtgctgactggtggaattgggcaa
gacagtttcaacctaactggtagccgtactggaggctatgatacgatcgctgattttact
cttggagatgatactatcttggtttccaaggctgaatttaaactagttcaatctcagaat
actacgctcgattcgggcttgtttctacttggtactagtgcgatcgcaggaggcgatcgc
ttcatctatgatcaaactacggggaacctattctttgacgcagatgggattggtaagact
gcacaaattaaaattgcccacttctcgaatcaggtagcgcttactagtgcaaatattact
gtaattgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
