Nymphaea colorata (blue-petal water lily): 116267554
Help
Entry
116267554 CDS
T07418
Name
(RefSeq) ABC transporter C family member 2-like
Organism
ncol
Nymphaea colorata (blue-petal water lily)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
MMR_HSR1
DUF87
AAA_16
RsgA_GTPase
Dynamin_N
TrwB_AAD_bind
AAA_29
AAA_23
nSTAND1
TMD0_ABC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116267554
NCBI-ProteinID:
XP_031505206
LinkDB
All DBs
Position
14:5646122..5739480
Genome browser
AA seq
1626 aa
AA seq
DB search
MGFKPLDWYCRPVANGVWTKDLENAFGAYTPCGVDTLVLCISHLAMMGVCIGRVWRLSKD
RSLKRYRLRSPYYNYTLSALAAYAAAEPLYRLVMGLSIMNLDGQTSFAPFEVVSLLVEAF
SWCCMLAMLVIETKIYICELRWYVRFGVLYVLVGDVVMFNLLVPLRGYVSNLAFSLYCSE
VVCQLLYGILLLVYVPNLDPYLGYAVVQSEVPTSTEYEELPGGEQICPERHVNIISKIYF
RWMSPLMQLGYKKPITEKDVWKLDSWDQTEVLYNNFHRSWLEETVTPKPWLLRALHRCLG
ARFWLGGVFKIGNDASQFVGPIILSSLLESMQRGDPAWVGYVYAFTIFMGVSLGVLSEAQ
YFQNVMRTGFRLRSTLVAAVFRKSLRLTHEERKKYSTGKITNLMTTDAEALQMVCQQLHS
LWSAPFRIILSVVLLYRQLGVASLAGALMLVLLFPVQTYVIKKMRDLTKEGLQRTDKRIG
LMNEILAAMDTVKCYAWEKSFQDKVQGVRNDELSWFRKSQLLAACNSFILNSIPVVVTVV
SFGMYTLLGGELTPSKAFTSLSLFAVLRFPLFMLPNLITQVVNCNVSLKRLEELFLAEER
ILLPNPPLEPGLPAISIKNGYFSWDTKMDKPTLSNINLEIPVGSLVAVVGSTGQGKTSLV
SAMLGEIPSMSTTNVVIRGTVAFVPQVSWIFNATVRDNILFGSTFQAERYHKAIEVTALE
HDLQLLPGGDLTEIGERGVNISGGQKQRVSMARAVYSNSDVYIFDDPLSALDAHVGRQVF
DKCIKNELEGKTRVLVTNQLHFLPYVDRIVLVHEGTVKEEGSFEELTNNSVLFQKLMENA
GKMEDTMEEKVENTDSGQMLQNPTSNGEPDKESKVQGGFLKVNKPAKEEGKSVLIKQEER
ETGVVGWNVLMRYASALGGWGVVMTIFTCYISIEVLRVSSSTWLSLWTNQSSPKRHDPGF
YNMIYAFLSFGQVLVTLINSYSLIISSLFAAKRLHDAMLNSILRAPMVFFHTNPIGRIIN
RFAKDLADIDRNIAFFVNMFLGQIFQLLSTFVLIGIVSTISLWAIMPLLILFYSAYLYYQ
STAREVKRLDSITRSPVYAQFGEALNGLSTIRAYKAYDRMAKINGKSMDNNVRFTLVNMS
ANRWVSIRLETLGGLMIWLTATFAVMQNQRASNQQAFASSMGLLLTYALNITSLLTSVLR
LASMAENSLNAVERVGTYIDLPSEAPSVVESNRPPPGWPALGTIKFEDVVLRYRPELPPV
LHGLSFTVLQSEKVGIVGRTGAGKSSMLNALFRIVELEQGRIYIDDYDVAKFGLEDLRKT
LGIIPQSPVLFSGTVRFNLDPFNEHNDADLWESLERAHLKDVIRRNPLGLDAEVSEAGEN
FSVGQRQLLSLARALLRRSKILVLDEATAAVDVGTDALIQKTIREEFRSCTMLIIAHRLN
TIIDCDRVLLLNAGQVLEFDTPENLLSNENSAFSKMVQSTGAANAQYLKSIVLGDPENRS
GGTKQLDKKRRWMASSRWAAAAQYALSISLTSSHNDLQQMLEIEEEDSIVRRTRDAVITL
QRVLQGKHDSDIEETLNQYQVPRDRWWSTLYKVVEGLAVMSRLSRSRVLQPDDFDDQNIN
WDHLEM
NT seq
4881 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtttcaagcctttggattggtactgcaggcctgtggccaacggtgtgtggacgaag
gacttggagaacgcctttggtgcttacactccatgtggtgttgacaccttggtgttgtgt
atctcccatttggcgatgatgggcgtatgcatcggcagggtttggaggctgagcaaggac
aggagcttgaagaggtatcgactgaggtccccgtactacaattatacgctgagcgctttg
gctgcttatgctgctgctgagcctctctacagattggtcatgggcttgtccatcatgaat
cttgacggacagacatcttttgctccttttgaggtggtttccctgcttgttgaggctttt
tcttggtgctgtatgctggctatgcttgttattgaaaccaaaatctacatttgtgagctt
cgctggtatgttcgcttcggggttctctatgtgttggtcggagatgttgtgatgttcaac
cttcttgttccactcagaggatatgttagcaaccttgcattctccttgtactgcagtgaa
gttgtatgccagctactatatgggattttattgcttgtatatgtcccaaatttggaccca
tacttgggctatgctgtggttcagtcggaggttcctacttcaacagaatatgaagaactg
ccgggaggcgaacagatctgcccagaaagacatgttaatataatctccaaaatatatttc
agatggatgtctcctctcatgcaactgggctataaaaagcccatcactgagaaggatgtt
tggaaactggattcatgggatcaaactgaggtgttatataacaatttccatcggtcttgg
cttgaagaaacagttacaccaaaaccgtggttgttgagggcactgcatcgttgtcttggt
gcaagattttggttgggaggggttttcaagattggtaatgatgcttcacagtttgtaggc
cccattattttgagctcacttctggagtctatgcaaagaggagatcctgcttgggttgga
tatgtctatgccttcacaattttcatgggagtgtcactaggcgttctgtctgaagcacag
tatttccagaatgtcatgcgaacaggtttccgtcttaggtcaactttggtagctgctgtt
tttcgtaaatcattgagacttacacatgaagaacgtaagaaatactccactggaaaaata
accaacttgatgacaacagatgctgaagccctacagatggtatgccagcagcttcacagc
ttatggtcggctccattccggatcatcctttcagtggttcttctgtacaggcagctaggt
gttgcttcacttgctggtgcactaatgctagttttgctgtttcctgtacagacatatgtg
attaagaaaatgagggacttgactaaggagggactgcaacgcactgacaagcgaattggc
cttatgaatgaaatcttagctgctatggatactgtaaaatgctatgcatgggagaaaagt
ttccaagacaaggtgcaaggtgttcgcaatgatgaactatcatggtttcggaagtcgcaa
ctattagcagcgtgcaacagttttatcttaaacagcattccagttgtggtgactgtagtt
tcatttggaatgtacacgctgttaggaggggaactgacaccttcaaaggctttcacatct
ctctccctatttgctgtcttgcgttttcctctgtttatgcttcccaatttgataactcag
gttgtaaattgtaacgtgtcattgaaacgactggaggagctttttcttgctgaagaaaga
attctcttaccaaatcctcctcttgagccagggcttcctgccatctcaatcaagaatggt
tacttttcatgggatacaaagatggataagcccacactgtccaacatcaatttagagatt
ccagttggtagccttgttgctgtggttggaagtactggtcaagggaaaacgtctctggta
tcagcaatgcttggggagataccttctatgtcaactacgaatgttgttataaggggaact
gttgcttttgttccacaagtctcctggatattcaatgcaacagttcgtgataatatcttg
tttggatctactttccaagctgaacggtatcacaaagcgattgaagttactgcattagag
catgacctgcagttgctacctgggggtgaccttactgaaattggagaaagaggagttaat
attagcggtggacagaagcaaagagtttcgatggcaagggctgtatattccaattcagat
gtatatatatttgatgacccactaagcgcgttagatgctcatgttgggcgccaggttttt
gataaatgtatcaagaatgaactggaaggaaaaaccagagtcctagttaccaatcagctc
cattttctcccttatgtggacagaattgttcttgttcatgaaggcactgtcaaggaggaa
ggatcctttgaagagctaactaacaatagtgtcttattccaaaagctaatggaaaatgct
gggaaaatggaagataccatggaagagaaagtggaaaacactgatagcggtcaaatgctt
cagaatcctacttcaaatggggaaccagataaggaatcaaaggtacaaggtggtttccta
aaagtaaataaacctgctaaggaggaagggaaatctgttcttatcaagcaagaggagcgt
gaaacaggagttgtcggttggaatgtcctcatgaggtatgcgagtgcattgggggggtgg
ggggtggttatgaccatttttacttgttatatctcaattgaggtcctccgagtttctagc
agcacatggttgagtttgtggaccaatcaaagctccccaaagaggcatgatccaggattt
tacaatatgatatatgcttttctatcttttggtcaggtgctggtaaccttgatcaattcg
tattcgttgattatttccagtctttttgctgccaagaggcttcatgatgctatgttgaat
tccatactaagagctcctatggtgttcttccacacgaatccaattggtcggattattaac
aggtttgcaaaggacttagcagatatagaccgaaatattgctttctttgtcaacatgttc
ttgggccagatattccagctcctatcgacatttgttcttatcggaatcgttagcaccata
tcattatgggctatcatgccacttctgatcctgttctattcagcttatttatactaccag
agcactgcacgtgaagtaaagcgtctggactccataaccagatctcctgtctatgctcaa
tttggagaagcattgaatggcttgtcgacaatacgtgcatacaaggcatatgacaggatg
gctaagataaatgggaaatcgatggacaacaatgtgagatttacacttgttaacatgagt
gcaaacagatgggtttcaattcggttggaaacattgggaggacttatgatatggttaact
gcaacttttgcagtcatgcaaaaccaacgtgcaagcaatcagcaggcatttgcatcaagc
atgggtctgcttcttacttatgctttaaacataacaagcttgttaacatcagttctgaga
ttggcgagtatggcagagaacagtttaaatgctgttgagagggttggaacatatatagac
ttgccttcagaagctccttctgttgttgaaagcaaccgtcctccacctggctggcctgca
ttaggaactataaagtttgaggatgttgtcctgagatacagacctgagcttccacctgtt
ttgcatggcttatcatttacagttctacagagtgagaaagtcggaattgttggaagaact
ggagcaggaaaatctagcatgctaaatgctctatttcgtattgtagagctggagcaaggg
agaatctatattgatgactatgatgttgctaaatttggcctggaagacctaaggaagacc
cttggaataataccccagtcgcctgttcttttctcaggaacggttaggttcaaccttgac
ccttttaatgagcacaatgatgctgatctttgggagtccttagagagagcacacttgaag
gatgtaatcagaagaaaccctttgggccttgatgctgaggtttctgaggcgggggaaaac
tttagcgtgggccaaaggcaattgcttagtcttgcacgagcgctgctgagaagatcaaag
attcttgttcttgatgaggcaacagcagcagttgatgttggaactgatgctttgattcag
aaaactatcagggaagaatttagatcttgcacaatgctcatcattgcacatcgtttgaat
acgattattgactgtgatcgtgttcttctgcttaatgctggccaggttttggagtttgac
acacctgagaatcttttatctaatgaaaacagtgccttttccaagatggttcaaagcact
ggagctgcaaatgcacaatatttgaagagtattgttttgggtgatcctgaaaatagatca
ggaggtaccaagcaattggataagaagagaagatggatggcctcttcacgttgggcagct
gctgcacaatatgctctttctatcagcctcacttcttcacataatgatctccaacagatg
ctggagattgaggaagaagatagcatcgtcaggaggaccagggatgctgtaattactttg
caacgtgttctgcaagggaagcatgatagtgacatcgaggagacattaaaccaatatcag
gtcccaagagatagatggtggtccacattatacaaagtagttgaaggtttggcagtgatg
agtcgcttgtctcgaagccgggttctgcagcctgatgattttgacgaccaaaacatcaat
tgggatcatcttgagatgtga
DBGET
integrated database retrieval system
