Candidatus Nitrosocaldus cavascurensis: NCAV_0140
Help
Entry
NCAV_0140 CDS
T05329
Name
(GenBank) putative surface-associated Ca2+-binding protein, Haemolysin-type
Organism
ncv
Candidatus Nitrosocaldus cavascurensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SPC33340
UniProt:
A0A2K5ANX0
LinkDB
All DBs
Position
NCAV:127370..129184
Genome browser
AA seq
604 aa
AA seq
DB search
MYSRGLRAGVLLITLLSPLLSTLLPELAYAQELSCPQNLTPTKQGTDGDDVINGTNGDDI
IFAGNGNDVVYGNGGNDIICGNGGNDKIYGGDGNDQLYGGYGNDVIHGGLGDDFIQGGPN
NDLLYGNDGRDTLLGSDGNDMLNGGNDDDTIRGGNGNDMLHGGDGNDVMYGEEGNDRING
NDGNDQLYGNDGNDRIDGGLHNDTIYAGSGNDFLNGYDGDDKIYGEDGDDRVHAGTGNDY
LDGGIGNDYLYANEGDDELHGGDGHDQLYGVTGNDVLYGELGNDWLSGGFGGETDDGIDT
LYGGDGRDWLEGGNNDDTLYGGNGNDHLFGNDGNDKLIDDDGADFLVGGNGDDRIEAGIG
DDMLFGSDGNDTLVGGMGMDMLFAGNGDDILQGNDGDDWLAGDDGNDKIYGGNGVDHLMG
GLGNDILYGNAGNDHLEGGGGDDLADGGEGDDWIFGNDGNDQLYGNDGDDVRIDGGSGMD
KVYGGNGNDWLTGGRDDDELHGDDGDDRVEDYFGNDTLYGNAGNDIIVGGIDNDTLYGGD
GNDTLDAGNGNDMLQGGHGDDYMSGGDGDDRLDSRDGIADNDFIDGGNGNDACLSDPDTS
VLCE
NT seq
1815 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacagcagaggtctaagagcaggtgtattgctgataacactcttatcgccattgcta
tccacactgcttccagagttagcatatgcacaagagctctcatgccctcagaatcttact
ccaactaagcagggtactgatggtgatgatgtaatcaatgggacaaatggcgatgacata
atatttgctggcaatggtaatgatgttgtatatggtaatggaggcaatgacataatatgt
ggtaatggaggcaatgataagatctatggaggagatggtaatgatcaactctatggtggt
tatggtaatgatgttatacatggaggtttaggagacgattttattcaaggaggacctaac
aacgatctactctatggcaatgatggtagagatacactgcttggtagtgatggcaatgat
atgcttaatggaggtaatgatgatgatacaattcgtggaggtaatggcaatgatatgctt
catggaggagatggcaatgatgtgatgtatggggaggaagggaatgatagaattaatggc
aatgatggcaatgatcaactctatggtaatgatggtaacgataggatagatggtggattg
cataatgatacaatctatgctggttcaggtaatgatttcctgaatggctatgatggtgat
gataagatctatggagaggatggggatgatagagtacatgctggaactggtaatgattat
cttgatggaggaattggtaatgactacctctatgcaaatgaaggtgatgatgaactacat
ggaggagatggtcatgaccaactctatggcgtaacaggtaatgatgtattgtatggagaa
ttagggaatgactggcttagtggtggatttggaggggagactgatgatggtattgatact
ctttatggaggggatggaagggattggcttgaaggaggcaacaatgatgatacactatat
ggtggtaatgggaatgaccatctatttggtaatgatggtaatgataaactaattgatgat
gatggtgcagactttttagttggaggcaatggagatgatagaatagaagcagggataggg
gatgatatgctatttggtagtgatggcaatgatacactagtaggaggaatgggtatggat
atgttgtttgctggtaatggtgatgatatacttcaagggaatgatggggatgattggcta
gctggtgatgatggcaatgacaagatctatggaggcaatggtgttgatcatctgatggga
ggcttggggaatgatatactctatggtaatgctggtaacgaccatcttgagggaggaggt
ggggatgatttggcagatggaggagagggagatgattggatatttggcaatgatggtaat
gatcaactctatggcaatgatggtgatgatgtaagaatagatggaggttctggtatggat
aaggtgtatggaggtaatggcaatgactggctcacaggaggtagagatgatgatgagttg
catggagatgatggtgatgatagggtagaagattactttggtaatgatacactctatggc
aatgctggcaatgatataattgtaggaggtatagataatgatacgctctatggaggcgat
gggaatgatacacttgatgctggtaatggcaatgatatgttgcaaggagggcatggagat
gattacatgagtggtggagatggggatgataggcttgatagcagagatggtattgctgat
aacgacttcatagatggtggcaatggcaatgatgcatgcctaagcgatccagatacatca
gtcctatgcgaatga
DBGET
integrated database retrieval system
