KEGG   Candidatus Nitrosocaldus cavascurensis: NCAV_0966
Entry
NCAV_0966         CDS       T05329                                 
Name
(GenBank) Uncharacterized ATP-dependent helicase MTH_1802
  KO
K03724  ATP-dependent helicase Lhr and Lhr-like helicase [EC:5.6.2.6 5.6.2.4]
Organism
ncv  Candidatus Nitrosocaldus cavascurensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ncv00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ncv03400]
    NCAV_0966
Enzymes [BR:ncv01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     NCAV_0966
    5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase
     NCAV_0966
DNA repair and recombination proteins [BR:ncv03400]
 Prokaryotic type
  Other factors with a suspected DNA repair function
   DNA helicases
    NCAV_0966
SSDB
Motif
Pfam: DEAD_assoc DEAD Lhr_WH Helicase_C ResIII DIL DUF4130 BTAD
Other DBs
NCBI-ProteinID: SPC34143
UniProt: A0A2K5AR62
LinkDB
Position
NCAV:complement(833920..836682)
AA seq 920 aa
MVCVMIRHADELYTYRDEDVIGMLDNVVGEWVRKRFRSLTPPQRYSIPSILQGNNTLVAS
PTGSGKTLSAFLSIISELVSLARRDMLEDKVYCIYVSPLRSLNNDIAKNLREPLEELSAI
DASVSNIRVGVRTGDTLQSERARMLRKPPHILITTPESIAIVLCAPKFRERLKDARWVII
DEIHELCSSKRGVHLSLSLERLQELCTNRLVRIGLSATLHPLEEVARFLVGYEDDGEERD
CVIVDARFVKPMSIITISPVRDIVHAKADELNRRMYALIKDVIRRNKTTLIFTNTRSGAE
RVVYHLSKMNVVDADDELAAHHSSLSREIRLDVEDRLKNGKMRAVVTSTSLELGIDIGSI
DAVVQIGSPKSIARCIQRIGRSGHSLELESKGYLIAMDNDDLVEDAVMCMNAMRGKIDSV
HIPRNCLDVLAQHVVGLAIERRWRVDDAYRLVRRSYCYRDLSMDSFKRVLRYLAGMYKSL
EGHKVYGKIWYDEATGEFGKRGSTARMIYATNIGTIPDEVAVKVYTRDGKWVGSIEEEFL
ERLSPGDIFVLGGKTYEFISSKGLTAVVRSAEGMRPTIPSWFSEMLPLSFDLGEEIGRLR
GEIFSMLEEGIKAGEMGEGGSGSGGSSNKEKKRRKGKGRGSSARDVERLKDRIARMLMER
LYTDENASHAIVEYMYAQYRFLRVLGIKDDPSDRNLLVEHYIDEQGKHNLIFHCVFGRRV
NDALARAYAYVARVMMRRNVAVTVSDSAFMLTLGEYGENGEDIISIAERIIASVNSSNIR
SLLLNAIKSTEMVRTRFRHCATRSLMVLRNYKGYEVTVARQQTNAEILMRLCEKLDGFPV
LEETYREVMEDLMDVNRAAQVLKDVEEGRRRFIIFNARDVPSPFSHMLIVSGYSDVVLME
DRKEMLEALHEMVMRRISAC
NT seq 2763 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtatgtgtaatgataaggcatgctgatgagctctacacctacagggatgaggatgtt
ataggtatgcttgataatgttgttggggagtgggttaggaagaggttcagatcgttaacc
cctccacaaaggtactctataccaagcatactacaagggaacaacacccttgttgcaagc
ccaacaggctctggcaagacgctcagtgcattcctaagcataataagcgagcttgtaagc
cttgcaaggagggatatgcttgaggataaagtctactgtatatacgtaagcccactacgc
tcacttaacaacgatatagcaaagaaccttagggagcctctggaggagttatctgcaata
gatgcatctgtaagcaatataagggtaggggttaggactggggatacgctacagagtgag
agggcaaggatgctcaggaagcctccccacatcctcataacaacgccagagagcatagca
atagtgctatgtgcaccaaagttcagggagaggctcaaggatgcgagatgggttataata
gatgagatacatgagttatgctcatcaaagagaggtgtgcatctaagccttagccttgag
aggttacaagagttatgcactaacaggcttgtaaggatagggttgagtgcaacactccat
ccattggaagaggttgctaggttccttgttggatatgaggatgatggagaagagagggac
tgtgttatagttgatgctaggtttgtgaagcccatgagcataataacgatctctcctgta
agggatatagtacatgcaaaggcagatgaactgaacaggaggatgtatgctctcatcaag
gatgtgataaggaggaacaagaccacgctcatattcacaaacaccagatctggggcagag
agggttgtataccatctctcgaagatgaatgttgttgatgctgatgatgagcttgctgca
caccacagttcactctcaagggagataaggcttgatgttgaggataggcttaagaatggg
aagatgcgtgcagttgttacaagcacaagcctagaactaggaatagatatagggagcata
gatgctgttgtgcagataggctcaccaaagtcaatagcaagatgcatacagaggatagga
agatcaggacactccctagagttggagtcaaagggctaccttattgcaatggataatgat
gatctagtagaggatgctgttatgtgcatgaatgctatgcgtggcaagatagatagtgtg
catataccaaggaactgccttgatgttcttgcacagcatgtagtaggtttggcaatagag
aggagatggagggttgatgatgcttataggcttgtgaggaggagttactgctacagagat
ctcagcatggatagtttcaagagagtgctaaggtaccttgctgggatgtacaagagcctt
gaagggcacaaggtgtatggcaagatatggtacgatgaggctactggcgagtttgggaag
aggggctctacagcaaggatgatctatgctaccaatataggcactataccagatgaggtt
gctgtcaaggtctatacaagggatgggaagtgggtagggagcatagaggaggagttcctt
gagcgcttgagcccaggggatatattcgtgcttggaggcaagacatacgagttcatatca
agcaaaggtttaacagcagtagtgaggagtgctgaagggatgaggccaaccatacctagt
tggttcagcgagatgctaccattgagctttgaccttggggaggagatagggaggcttaga
ggtgagatattctcaatgctggaggaggggataaaggctggagagatgggtgagggtggt
agtggtagtggtggtagtagtaataaggagaagaagagaaggaagggtaagggtaggggt
agtagtgctagggatgtagagaggttgaaggataggatagcaaggatgttgatggagagg
ctatacaccgatgagaatgcttcacatgcaatagttgagtacatgtatgcacagtacagg
ttcctaagggtgttgggtataaaggatgatccaagcgataggaacctattggtagagcat
tacatagatgagcagggtaagcacaacctgatattccactgtgtatttgggaggagggtt
aatgatgctcttgcaagagcatatgcatacgttgctagggttatgatgaggaggaatgtt
gctgtaacagttagcgatagtgcattcatgctaacccttggggagtatggtgagaatggt
gaagatatcatatcaatagcagaaaggataatagcatctgtcaactcatcaaacataaga
tccctcctactcaatgctataaagagtacagagatggtaaggacaaggttcagacactgt
gcaacaagatcactcatggtacttaggaactacaagggttatgaggttacagttgccagg
cagcagaccaatgctgagatactgatgaggttatgtgagaagcttgatggcttccctgtc
ctagaagagacttacagggaggttatggaggatcttatggatgttaatagggcagcacaa
gtgctcaaggatgttgaggagggtaggaggaggttcataatcttcaatgctagagatgtg
ccatcaccattcagccacatgctcatagtctctggctatagcgatgttgtgctcatggag
gataggaaggagatgcttgaagcactccatgagatggtgatgaggaggataagtgcttgc
tag

DBGET integrated database retrieval system