Candidatus Nitrosocaldus cavascurensis: NCAV_1594
Help
Entry
NCAV_1594 CDS
T05329
Name
(GenBank) hypothetical protein with metallophosphoesterase and concanavalin A-like lectin/glucanase domain
Organism
ncv
Candidatus Nitrosocaldus cavascurensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
Metallophos
Metallophos_2
Laminin_G_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SPC34758
UniProt:
A0A2K5ASY1
LinkDB
All DBs
Position
NCAV:complement(1398619..1400580)
Genome browser
AA seq
653 aa
AA seq
DB search
MFAALLTSPTLVVIDVHASIYAWYHASATIPELQERGTANIMNVVVPNDAYGKVLKYVAL
KSSDDVAEGVDGVPKKIKLAAVGDISCNNRLYNRLADAIKQYNPDKVLLLGDYSYRLDDA
RCFTDAFSFPPDKVIAVHGNHDNHYWDSRYRPTYGMMMDIRGAYNIPASGSYYMKYHNIA
FIGIDNSLAKSPRGLASIDEHSATYALARYNLSMAKMDESIDWRIVLMHISLNVGASDAV
AKVREPYVAMMDDAGVDIVLSGDTHHYTRTYPLKGINSVASKDKSSYDLSKEHGRIQYIV
GTGGADQSNADEVKGIVAESIGRERLKNSPAYLQIEITNDDKSTRMKTRLVDINGNIYDE
VSISKEKRGASKNVRVEEVYLYVDDGRVKMHDGKLFDGSNGKMAMIKHDDRMNSKRMSIA
LWFLSETKGSSRPVVLIEKGDPLTKSNISFMLGIDSDGSIVYGWDDRDGVHHSLVSSDGK
DYADGRWHHLAVVRDDGGAGVVMYIDGIPVARKEVRAMPVSNGYDVYINAMPDYSYTARA
MVYAVGIWDRALSAEEVLALYHGNGEAMVDAIVHEFYGEPNYNNDDKKKHVFTVDAGESL
SIRWYCCVDGRDTVVVLSNGIYMQPWQSVSILPTKHGAYGAMYHEVFFGSKGL
NT seq
1962 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtttgctgcactgcttacatccccaactctagtagtcattgatgtgcatgctagcatc
tatgcttggtatcatgctagtgctactattccagaactgcaggagagaggtactgcaaat
ataatgaatgtggttgtgcctaatgatgcatatggcaaggtgttgaagtacgtagcatta
aagagtagcgatgatgtagcagaaggtgtagatggggtaccaaagaagatcaagttagct
gcagttggagatatatcatgtaataacagattatataatagacttgcagatgccataaag
cagtacaatccagataaggtgctcttgcttggagactactcatataggttggatgatgct
agatgcttcacagatgcattctcattcccaccagataaggttatcgctgtacatggtaac
catgacaaccattattgggattctaggtatagaccaacatatgggatgatgatggatata
aggggagcatacaacatccctgcgtctggttcctattacatgaagtatcataacatagca
ttcataggcatagataactcattggcaaagagcccaagaggtttagcaagcatagatgag
catagcgcaacgtacgcattggcaaggtacaatctaagcatggcaaagatggatgagagc
atagactggaggatagtactcatgcacatctctctaaacgttggagcaagtgatgctgta
gcaaaggtaagggagccatatgtagcaatgatggatgatgctggtgttgatatagtgcta
tctggggatacgcatcattacacaaggacttatcccctcaagggtataaactcagtagca
agcaaggataagagcagttatgatctaagcaaggagcatggaaggatacagtacatagtt
ggtactggaggtgcagatcagagcaatgcagatgaggttaaagggatagttgcagagagc
ataggaagggagaggcttaagaacagtccagcatacttgcagatagagataactaatgat
gataagagcactagaatgaagactagactagtagacatcaatggtaacatctatgatgag
gtaagcataagcaaggagaagaggggtgcaagtaagaatgtaagagtagaggaggtttac
ctatacgttgatgatggaagggttaagatgcatgatggtaaactctttgatggctctaat
ggtaagatggcaatgataaagcatgatgataggatgaatagcaagaggatgagtatagca
ttatggttcttgagcgagacaaagggttcaagtagaccagtagttctgatagagaagggg
gatccattaaccaaatcaaatatctcattcatgttaggcatagattcagatggctccata
gtatatgggtgggatgatagagatggagtgcatcattctctagttagtagtgatgggaag
gattatgcagatggaagatggcatcatcttgcagtagttagggatgatggtggtgcaggt
gtagttatgtatattgatggtatacctgttgcaagaaaagaggttagagctatgccagtg
agtaatggatacgatgtttacatcaatgcaatgccagattacagctacacagcaagggcc
atggtatatgcagttggtatatgggatagagcgttatctgctgaagaggtacttgcacta
taccatggtaatggtgaagcaatggtggatgctatagtgcatgagttctatggagaacct
aattataataatgatgataagaagaagcatgtattcactgtagatgctggagagagtcta
tcgataagatggtattgttgtgtagatggaagggataccgtagtagttctctccaatggt
atctatatgcaaccatggcagagcgtatctatcttacccaccaagcatggtgcatatggt
gcaatgtatcacgaggtattctttggctccaagggtctatga
DBGET
integrated database retrieval system
