Nostoc carneum: NIES2107_06040
Help
Entry
NIES2107_06040 CDS
T10358
Name
(GenBank) hemolysin-type calcium-binding region protein
Organism
ncw Nostoc carneum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY28772
LinkDB
All DBs
Position
complement(744789..751874)
Genome browser
AA seq
2361 aa
AA seq
DB search
MADTQIFGTSGNDAIYGTSGNDVIIALEGKDMVIGGAGNDVISGGGGNDYWLDGGNGNDT
MAGESGNDTLSGSNGNDLMYGDSADRLWTVDENGNYKYTGLIDETGAGFANPSTVDTNTN
NDFVTGGEGNDVLLGQLGKDVLEGGGGNDILNGGAGDDIIQGDYWPGKDGNPVPGKDGYG
NDTLNGDDGNDNLYGNAGNDVINGGTGNDQLMGGAGLDTLRGGSGNDYLDGGDDNDLVDG
GAGDDYLKGGKGDDKLLGGYGNDVLEGEDGNDLLIGGFGNDSWISGGSGNDTLAGESGND
ILDGGVGDDLLYGGDDNDTLLGNVGNDTLMGGAGADILDGGAGNDVLAGGLGNDILKGSD
GNDTLTGYSGNDILDGGAGDDLLAGGDDDDILKGSDGSDRLDGGLGNDTLDGGTGSDLIT
GGEGNDNIHGGADNDVIWGEAGADALFGDAGNDTMGGGTGNDYLDGGAGNDVLYGNGDVD
VIDGGLGNDLIYGGEGDDKFLFGNEGADKIYGEAGNDTMDGGAGDDLLDGGDGNDILKGS
DGNDILDGAAGNDILDGGVGNDILDGGTGDDILKGSEGSDRLYGGLGNDTLDGGADNDTL
AGGDGNDNIYGGTGNDLIWGEAGQDALYGDAGNDFIEGGDGNDYLSGGEGNDSLYGNADV
DVIDGGVGNDLIYGGEGDDKFLFGGDGLDTIYGEAGNDTIDGGADNDLLDGGDGNDILKG
SEGNDTLYGAAGNDILDGGTGDDSVLGGLGDDILKGSEGNDILYGEVGNDILDGGIGNDI
LDGGFGNDLLKGFDGNDTLYGDLGNDTLDGGIGNDSLFGGEGNDNISGGADDDLIWGEAG
ADALFGDAGNDVIEGGLGNDYLDGGEGNDSLYGNADADIIDGGLGNDLIYGGEGDDKSLS
GGDGLDTIYGEAGNDTIDGGTGDDILDGGIGDDILKGSDGNDILVGGLGNDILDGGAGND
LIYGGEGDDKALSGGDGNDKIYGEAGNDTLIGGAGDDILDGGAGTDYLDGGLGNDTLYGY
GEADVMDGGAGNDLIYGSDGNDKALFGGDGLDTIYGEVGNDTLDGGADHDILDGGYGDDL
LKGSDGNDTLYGDMGNDSLDGGIGNDSLFGGEGSDNIRGGADNDLIWGEAGADALFGDAG
NDVIEGGLGNDYLDGGEGNDSLYGNADADIIDGGLGNDLIYGGEGDDKSLSGGDGLDTIY
GEAGNDTIDGGTGDDILDGGIGDDILKGSDGNDILVGGLGNDILDGGAGNDLIYGGEGDD
KALSGGDGNDKIYGEAGNDTLIGGAGDDILDGGAGTDYLDGGLGNDTLYGYGEADVMDGG
AGNDLIYGSDGNDKALFGGDGLDTIYGEVGNDTLDGGADHDILDGGYGDDLLKGSDGNDT
LYGDMGNDSLDGGIGNDSLFGGEGSDNIRGGADNDLIWGEAGADALFGDAGNDVIEGGLG
NDYLDGGEGNDSLYGNADADIIDGGLGNDLIYGGEGDDKSLSGGDGLDTIYGEAGNDTID
GGAGDDILDGGIGDDILKGSDGNDTLYGDIGNDILDGGAGNDLLYGGDGDDKSLFGGDGN
DNIYGGAGNDTLDGGTGDDILDGGIGDDLLKGSDGNDFLYGDSGNDSLDGGISNDSLFGG
EGNDNIHGGADNDLIWGEAGADALFGDAGNDVIEGGLGNDYLDGGLGDDSLYGNADVDVI
DGGAGNDLIYGGDGDDKSLSGSDGNDVIYGEAGNDTLDGGLGNDILDGGIGNDLLKGSDG
NDTLYGDMGNDILDGGADDDRLDGGAGNDTLLGGLGNDYLDGDLGDDSLTGGAGNDSLFG
GAGIGILDGGDGNDYLETSDSNDTLKGGTGNDTLDSGSGNDYLEGGTGDDLMYGVVGNDT
LYGGDGNDAVYGGDGNDTVYGEAGNDTLFGGNGTDKLDGGEGNDTIYAEAGDDSLFGGNG
NDELVGGIGINLMFGGYGNDILKGGDGNDTLYGEAGDDTLYGGTGNDKLYGADGNNKLYG
EAGDDTLVGGAFNDSLDGGLGNDSLDGGLGDDYLDGGVGNDTLLGGAGNDTIFGGVGISI
FDGGDGNDYLESSDSNDTLKGGAGNDILNSGSGNDYLEGGLGDDLLYGGAGDDTLTAGDG
YDKLYGGDGNDILYGEAGDDTLFGGNGNDKLYGGDGNDTVYAEVGDDTLFGGNGDDALMG
SDGSNQLFGGNGNDSLYGGAGNDILYAEVGDDSLFGDIGNDLLYGSAGNDTIFGEVGDDN
LYGGIGNDQLDGGAGNDYLLGVDNVTEFGVGTIDVFTGGLGKDKFVLGEKQAFYNDGDNN
TAGLQDYALITDFNSAEDIIQLSGNANSYVLGTTVDKLAGVGIYLDTNSDKLFNSSDELI
AVVQGTTTNVSLTSSSFVYVS
NT seq
7086 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgatactcaaatctttggcacatctggtaacgacgctatttatggcacttctggc
aatgatgtgatcattgccttagaaggcaaagatatggtcattggtggtgctggaaatgat
gtgattagtggcggtggtggtaatgactactggctagatggcggtaatggtaacgatact
atggctggtgaaagtggcaatgacacactttctggtagtaacggcaatgatttgatgtat
ggcgatagtgccgatcgcctttggacagttgatgaaaatggcaactataaatatacaggg
ttaattgatgaaactggagcaggctttgccaatccatcaactgttgatactaataccaat
aatgatttcgtcactggtggcgaaggtaatgatgttctgttgggacagttaggcaaggat
gttcttgagggtggtggtggtaatgacatcctcaacggcggtgctggtgatgatatcatc
cagggcgactattggccaggtaaggatggtaatcctgttcctggtaaagacggttatggt
aatgacaccctcaatggagatgatggcaacgacaacctatatggcaatgctggcaatgat
gtcatcaatggcggtactggtaacgatcagctaatgggtggtgctggccttgatactctc
cgtggcggttctggtaatgactaccttgatggtggtgacgacaatgaccttgtagatggt
ggtgctggtgacgactatctcaaaggaggcaaaggcgatgacaagttactgggtggttac
ggtaacgatgttctagaaggtgaagacggaaacgatctactcattggtggatttggtaac
gattcctggatcagtggcggtagcggtaacgatactctggctggggaaagcggtaatgat
atcctcgatggtggcgttggtgatgacctcctctacggtggcgatgacaacgatacctta
ttgggtaatgtcggtaacgataccctgatgggtggagccggagccgatatcctcgatggc
ggtgccggaaatgatgttttagcaggtggtctcggtaacgatattctcaaaggcagtgat
ggcaacgataccctgactggatatagcggcaacgatatccttgatggcggtgcaggtgat
gacctattggctggtggtgatgatgatgacatcctcaaaggcagtgatggtagtgatcgc
ctcgatggtggtttaggtaatgatactctcgatggcggcaccggcagtgacctgattaca
ggtggtgaaggcaacgataatatccacggtggtgcagataacgatgtcatttggggtgaa
gccggtgcagatgccttatttggtgatgccggtaatgacactatgggtggtggtactggt
aacgattatcttgatggtggcgcaggcaatgatgtcctgtatggcaatggcgatgtcgat
gtcatcgatggcggtctgggcaacgacttaatttatggtggtgaaggtgacgataaattc
ttatttggtaacgaaggtgcagacaaaatctatggtgaagctggcaatgacactatggat
ggtggcgctggcgatgacctcttagatggcggtgatggcaatgatatcctcaaaggcagc
gatggcaatgacatcctagatggtgctgctggcaatgatatcctcgatggtggagttggt
aatgacatcctcgatggcggtactggtgatgacattcttaaaggtagtgaaggaagcgat
cgcctttatggtgggctaggtaatgatactttagatggtggtgctgataatgacaccctt
gctggtggcgacggcaacgataacatctatggtggcactggtaatgacctaatttggggt
gaagctggccaagatgcattatatggtgatgctggtaatgacttcatcgaaggtggcgac
ggcaatgattacctcagtggtggcgaaggtaatgatagtctctatggcaacgccgatgtt
gatgtcatcgatggcggtgttggcaacgacttaatttatggtggtgaaggcgacgataaa
ttcttatttggtggcgatggtttagacaccatttacggcgaagctggcaatgacaccatt
gatggcggtgctgacaatgacttattagatggtggcgacggtaacgacatcctcaaaggt
agtgaaggcaacgataccctttatggtgctgctggtaatgatatcctcgatggcggcact
ggcgatgatagcgtactcggtggtcttggcgatgacatcctcaaaggtagtgaaggcaac
gatatcctttacggtgaagtcgggaatgacatccttgatggtggcattggtaatgacatc
ttagatggtggttttggtaatgacctcctcaaaggctttgatggcaacgataccctttac
ggagatctgggcaatgacaccctagatggtggcattggtaatgacagcctattcggtggt
gaaggcaacgataacatctctggtggtgctgatgatgacctaatttggggtgaagctggt
gcagatgccttgtttggtgatgctggcaatgacgtaatcgaaggtggtctaggtaatgat
tatcttgatggcggcgaaggtaatgacagcctgtatggtaacgctgatgcggatatcatc
gatggcggtctgggcaacgacttgatttatggtggtgaaggcgacgataaatccttgtct
ggtggtgatggtttagacaccatttatggcgaagctggcaatgacaccatcgatggcggc
actggtgatgacatcttagatggcggcattggcgatgacatcctcaaaggcagcgatggc
aacgatatcctagtgggtggacttggcaatgacatcctcgatggtggcgctggtaacgac
ctaatttatggtggtgaaggcgacgataaagccttatccggtggcgatggcaatgacaaa
atctatggtgaagctggcaatgacaccctcattggcggcgctggtgatgacatcttagat
ggtggtgctggtaccgattatcttgatggtggtctaggtaatgataccctttacggctat
ggtgaagccgatgtcatggatggtggtgctggtaacgacctgatttatggtagtgacggc
aacgacaaagccttattcggtggcgatggtttagacacaatttacggtgaagttggcaat
gacacccttgatggcggcgctgatcatgacattttagatggtggttatggtgatgacctc
ctcaaaggcagtgatggcaatgataccctttatggggatatgggcaatgacagcctagat
ggtggcattggtaatgacagcctattcggtggcgaaggcagcgataacatccgcggtggc
gctgacaatgacttaatttggggtgaagccggtgcagatgccttgtttggtgatgctggc
aatgacgtaatcgaaggtggtttaggtaatgattatctcgatggcggcgaaggtaatgac
agcctgtatggtaacgctgatgccgatatcatcgatggcggtctgggcaacgacttgatt
tatggtggtgaaggcgacgataaatccttgtctggtggtgatggtttagacaccatttat
ggcgaagctggcaatgacaccattgatggcggcactggtgatgacatcttagatggcggc
attggcgatgacatcctcaaaggcagcgatggcaacgatatcctagtgggtggacttggc
aatgacatcctcgatggtggcgctggtaacgacctaatttatggtggtgaaggcgacgat
aaagccttatccggtggcgatggcaatgacaaaatctatggtgaagctggcaatgacacc
ctcattggcggcgctggtgatgacatcttagatggtggtgctggtaccgattatcttgat
ggtggtctaggtaatgataccctttacggctatggtgaagccgatgtcatggatggtggt
gctggtaacgacctgatttatggtagtgacggcaacgacaaagccttattcggtggcgat
ggtttagacacaatttacggtgaagttggcaatgacacccttgatggcggcgctgatcat
gacattttagatggtggttatggtgatgacctcctcaaaggcagtgatggcaatgatacc
ctttatggggatatgggcaatgacagcctagatggtggcattggtaatgacagcctattc
ggtggcgaaggcagcgataacatccgcggtggcgctgacaatgacttaatttggggtgaa
gccggtgcagatgccttgtttggtgatgctggcaatgacgtaatcgaaggtggtttaggt
aatgattatctcgatggcggcgaaggtaatgacagcctgtatggtaacgctgatgccgat
atcatcgatggcggtctgggcaacgacttgatttatggtggtgaaggcgacgataaatcc
ttgtctggtggtgatggtttagacaccatttatggcgaagctggcaatgacaccattgat
ggcggtgctggtgacgatatcttagatggtggcattggtgatgacatcctcaaaggcagc
gatggcaatgacaccctttacggggacattggcaatgacatcctcgatggtggcgctggc
aacgacttgctttatggtggcgatggcgacgataaatccttattcggtggcgatggcaat
gacaatatctatggtggagccggcaatgatacccttgatggtggtacaggcgatgacatc
ttagatggtggcatcggtgatgatctcctcaaaggcagtgatggcaacgatttcctatat
ggagacagtggcaatgacagcttagatggtggcattagtaatgacagcctcttcggtggt
gaaggcaacgataacatccacggtggcgctgacaatgacctaatttggggtgaagccggt
gcagatgccttgtttggcgatgctggcaatgacgtaatcgaaggtggtttaggtaatgac
tatcttgatggcggcctaggcgatgatagcctttatggtaacgctgatgtcgatgttatt
gatggcggcgctggtaatgacttaatttatggtggcgacggcgacgataaatccttgtct
ggtagcgatggcaatgacgtgatttatggcgaagctggaaatgacaccttagatggcggc
ctgggtaatgacatccttgatggtggtattgggaatgatctgctcaagggtagtgatggc
aatgataccctttatggcgacatgggcaatgacatccttgatggcggtgccgatgatgat
aggcttgatggcggtgctggtaacgacaccttacttggtggtctaggtaatgactactta
gatggcgatctcggagatgacagcctcacaggcggtgctggtaatgatagtctattcggt
ggtgctggtatcggtattcttgacggtggcgatggcaatgactacttagaaactagcgac
agcaacgacactctcaaaggcggtactggtaacgatactctcgatagtggtagcggtaac
gactacttagaaggtggcactggcgacgatctcatgtacggcgtagtcggaaatgacact
ttatatggcggtgacggcaacgacgcagtatatggtggtgacggcaacgatacagtatat
ggcgaagcaggtaatgataccttatttggtggcaatggtactgataagctcgatggtggt
gaaggcaacgataccatatatgcagaagctggcgatgacagcttgtttggcggcaatggt
aatgacgaattagttggtggcattggcattaacctgatgtttggaggttacggtaatgac
atcctcaaaggtggcgacggcaacgacacactatatggtgaagctggcgatgacacctta
tatggtggtactggcaatgacaaactctatggtgctgacggcaacaacaaactatacggt
gaagctggcgatgataccttagtcggtggtgcctttaatgacagcctagatgggggtctg
ggtaatgacagtttagatggcggtctgggtgatgactacttagatggtggtgttggtaac
gatactctattaggtggtgctggtaacgatactatctttggtggcgttggcatcagtatt
tttgacggtggtgatggcaatgactacttagaaagtagcgacagtaatgataccctcaaa
ggtggcgctggcaacgatatactcaatagcggtagcggtaacgactacctagaaggtggt
cttggcgacgatctgttgtacggtggtgctggtgatgacaccttaactgctggcgacggc
tacgataagctatacggtggtgatggcaacgacatcctatatggtgaagctggcgatgac
accttatttggtggcaatggcaatgacaagctgtatggtggtgacggtaacgacacagta
tatgcggaagttggtgatgacaccttgtttggtggcaatggcgatgacgcactcatgggt
agcgatggcagtaaccaactgtttggcggtaatggcaacgactccctgtatggcggtgca
ggtaatgatatcttatacgcggaagtcggcgatgacagcctatttggcgacattggtaat
gacttgctgtatggtagtgcaggaaatgacacaatatttggggaagtcggcgatgacaac
ctttatggtggcatcggcaatgaccaactcgatggtggcgctggtaatgattacttactt
ggtgtagataacgttactgagtttggtgtaggtactattgatgtcttcacaggcggtctg
ggcaaggataaatttgttttaggcgaaaaacaagccttctacaatgacggtgataataac
actgctggattgcaagattatgccttgattacagatttcaatagtgcagaagacatcatt
cagttaagcggtaatgccaattcttatgtgctaggtaccactgttgataaacttgcaggt
gttggcatttacttagataccaatagcgataaactgtttaactctagtgatgagttgatt
gcagttgtgcagggaactactaccaacgtgagcctcacaagctcttcttttgtttacgtc
tcataa
DBGET
integrated database retrieval system
