Nostoc carneum: NIES2107_34370
Help
Entry
NIES2107_34370 CDS
T10358
Name
(GenBank) type I secretion target repeat protein
Organism
ncw Nostoc carneum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
Glyco_hydro_16
SKN1_KRE6_Sbg1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY31576
LinkDB
All DBs
Position
4247693..4252465
Genome browser
AA seq
1590 aa
AA seq
DB search
MVKKTVFLTSNADVWGGWENGIEYEVSAFEGNDKLYGYIGNDTLDGGDGDDQIYSGAGDD
ILIGGLGNDLLDGGDGNDILDGGLGDDTLIGGNGDDIVFGGDGNDQISGGAGNDILNGDN
GNDVINGGAGYDIITGGMGNDVIDGGDGNDTIYGGDGDDGWIFGGLGNDSIDGGTGNDTI
DGGDGNDTLTGGDGIDLLMGNNGNDSISGGAGNDNIDGGAGNDTISGGEGDDRINGGADN
DTIWGDIGNDYIIGGLGFDTIAGGMGNDTIDGGDGNDVIAGGDGDDSWLFGGLGNDSIDG
GAGNDTLDGGDGDDTLRGGDGIDVLTGNNGNDAISGGEGDDKIYGGADNDIIWGDAGNDY
ISGGTGNDTIYGGIGNDVIDGGDGNDVIAAGDGDDGWLFGGLGNDNIDGGTGNDTLDGGE
GDDTLTGGDGIDLLMGNNGNDSISGGAGNDNIDGGAGNDVISGGEGDDKINGGADNDTIW
GDLGNDYLSGGLGFDTIYGGIGNDTIDGGDGNDVIAGGDGDDSWLFGGLGNDSIDGGLGN
DTLDGGDGDDTLTGGDGIDVLTGNNGNDFIAGGEGDDKIYGGADNDTIWGDAGNDYISGG
TGNDTIYGGIGNDVIDGGDGNDVIAGGDGDDSWLFGGLGADNIDGGVGNDTLDGGEGDDT
LTGGDGNDLLMGNNGNDLLSGGTGNDTIYGGDGNDTIWADAGNDVIAGGAGNDTIGGGAG
IDNIDGGDGNDFIYGGDGDDVWLFGGLGADRIDGGAGNDTLDGGEGDDTLTGGDDNDVLR
GGNGNDALYGEAGNDNIEGGFGLDTIGGGDGDDKINGGADDDTIWGDAGNDYISGGTGND
NISGGTGNDTISGGDGDDKINGGADDDTIWGDAGNDYINGGTGNDILAGGAGNDIIDGGD
GNDVINGGEGDDSWLFGGLGNDKIDGDLGNDTIDGGEGDDTLLGGDGNDILTGGNGNDSL
IGGAGINVLDGGEGDDTLIGGDSTDVIKAGNGNDIIDGGAGNDIINGGAGNDYLKGGNGS
DTLDGAGAAILSINSIDTLVGGLNADIFILGDSLKSYYDDEDATTNGVKDYAIIDDFNRF
EDVIRLHGSLGEYVVGGISDQLTTVFNTSNASGIYVDTDKNGSWNDTDELIAVVKNLTPG
KLVLSGDYFQYTDTPNATAWHPSKDAGWELVFSDEFNGTSLSLDKWNTRYTLQNLYGGRN
NPWNQELQYYVGDNEVINGTVYDGFEFKNGTVSIVGKKVSTPITAAIGEFALGFDEVKTF
NYTSGMLNTENKEAFTYGYMEIRAKAPSGQGLWPAFWMLPSSGKWPPEIDVMETVGQKTD
TVINSFHSLGADGLNNDTASQNFTGVDFSQDFHTYGVKWETDKLTWYIDQHAVFETKNNI
PDVPMYLLANLAIGGKFPGSPDASTPAINNYDIDYVRVYQDASGSLYGGSNDDVLEKQLG
SIFGLSGNDVIKGGIGNNTLDGGDGNDILIGVNTTVAQPGAGEVDTLIGGAGQDKFVLGD
STKFYYDDRNNLVTGLGGYAVIKDFNAAQDVIQLNGKASDYVLGAVSSLNGTGIYRDING
DRTLGSTDELIAVVQGDTGLNLTQNSFLYV
NT seq
4773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgaagaaaacagtttttttaacaagcaatgctgatgtttggggaggctgggaaaac
ggtattgaatatgaggtttccgccttcgagggtaacgataaactgtacggctatattggc
aatgacactctagatggtggcgatggtgacgaccaaatttatagcggtgctggagatgat
attttaatcggtggattaggcaacgatttattagatggtggcgatggcaatgacatttta
gatggtggattaggtgacgatacactgattggtggcaacggggatgatatcgtttttggc
ggtgatggtaacgatcagattagcggtggtgctgggaatgatatcctcaacggggacaac
ggtaatgatgtaattaatggtggtgcaggatacgacatcatcactggcggtatgggtaat
gacgtgattgatggcggcgatggcaatgataccatctatggtggtgatggggatgatggc
tggatatttggtggtttagggaatgacagcattgatggcggaacgggaaatgacaccata
gatggtggcgatggtaatgataccctcacaggtggcgatggtattgacctactcatgggt
aataatggcaatgattccatctctggtggtgctgggaatgacaacatcgatggtggagca
ggcaatgataccatctctggtggtgaaggcgacgatagaattaatggcggcgctgacaat
gacaccatctggggcgatataggcaatgactacattatcggtggactaggctttgacacc
attgctggcggtatgggtaatgacaccattgatggtggtgatggtaatgatgtgattgct
ggtggcgatggtgatgacagctggttattcggtggtttagggaatgacagcattgatggt
ggtgcagggaacgacaccctagatggtggcgatggcgatgataccttgagaggcggtgat
gggattgatgtcctcacaggtaataatggcaatgatgccatttctggtggagaaggcgac
gataaaatttatggcggcgcagataatgacattatctggggcgatgctggtaatgattac
attagcggtggtacagggaatgacactatctatggcggtatcggcaatgatgtgattgat
ggtggtgatggcaatgacgtgattgcggctggtgatggcgatgatggctggttatttggc
ggtttagggaatgacaacattgatggtggtacaggtaatgacaccttagatggtggcgaa
ggtgatgatacccttacaggtggtgatggtattgacctactcatgggtaataatggcaat
gattccatctccggtggtgctggcaatgacaacattgatggtggagcaggtaatgatgtc
atctctggtggtgaaggcgacgataaaattaatggcggcgctgataatgacaccatttgg
ggtgatcttggtaatgattacctcagcggtggtttaggttttgacaccatttatggcggt
atcggcaatgacactattgatggtggcgatggcaatgatgtgattgctggtggcgatggt
gatgacagctggttattcggtggtttagggaatgacagcattgatggtggtttaggaaat
gacaccctagatggtggcgatggcgatgataccttgacaggcggtgatgggattgatgtc
ctcacaggtaataatggcaatgatttcattgctggtggagaaggcgacgataaaatttat
ggcggcgctgacaacgataccatctggggcgatgctggcaatgattacattagcggtggt
acagggaatgacaccatatatggtggcatcggtaatgacgtgattgatggtggtgatggc
aatgatgtgattgctggtggtgatggtgatgatagctggttgttcggtggtttaggtgca
gacaacatcgatggtggtgtagggaacgataccctagatggcggcgaaggtgatgatacc
ctcacaggcggtgatggtaatgatctactcatgggcaataatggcaacgatctcctctct
ggtggtactggcaatgacaccatctatggaggagacgggaatgataccatttgggctgat
gctggcaatgatgtgattgctggtggtgccggaaatgacaccattggtggtggtgctgga
attgacaacattgatggtggcgatggtaatgatttcatttatggtggtgacggtgatgat
gtttggttatttggtggtttaggcgcagacaggatagatggtggtgcagggaacgatacc
ctagatggtggagaaggtgatgatactctcacaggtggtgatgataatgatgttctccgg
ggtggaaatggtaatgatgccctttatggtgaagctggaaatgacaacattgaaggtggt
tttgggctagataccattggtggtggtgacggcgacgataaaatcaatggcggcgctgat
gacgataccatctggggcgatgctggtaatgattacattagtggtggaacaggtaatgac
aacattagtggtggaacaggtaatgacaccattagtggcggtgacggcgatgataaaatc
aatggtggcgctgatgacgataccatctggggcgatgctggcaatgattacattaacggc
ggtactggtaatgacattcttgctggaggtgcaggtaatgacatcatcgatggtggtgat
ggtaatgatgtaattaatggtggcgaaggtgatgatagttggttattcggtggtttaggt
aatgacaaaatagatggcgacttggggaatgacaccattgatggtggagaaggtgatgat
acgctcctcggtggtgatggtaatgatatcctcactggtggcaatggtaatgattccctc
attggtggtgctgggattaacgtccttgatgggggtgaaggcgatgataccctcatcggt
ggtgacagtactgatgtgatcaaagctgggaatggtaatgacatcattgatggtggcgct
ggtaatgacatcattaatggtggtgctggcaatgattaccttaagggtggtaatggtagt
gatacccttgatggcgctggcgcagccatcttgagcattaactcaatagatactctagta
ggtgggttaaatgctgatatctttatcttgggtgacagcctcaagagttactacgatgat
gaagacgctaccactaacggcgtaaaagattacgctatcatcgacgatttcaatcgtttt
gaagatgtaattcgcctgcatggttcactcggtgaatatgttgttggtggcatttcggat
caattgacaactgtatttaatactagtaatgcatcaggtatttatgtagataccgacaaa
aatggaagctggaatgatacagacgaattaatcgcagtggtgaagaatttaactcccggt
aaattagtgctgagtggcgattattttcaatacaccgatacaccaaatgcaactgcttgg
catcccagtaaagatgctggctgggaactagtatttagcgatgaatttaacggtacaagc
ctatctttagataagtggaatacacgctatactctgcaaaatttatatggcggtagaaac
aatccctggaatcaggaattgcaatactacgttggtgataatgaagtcatcaatggcaca
gtttatgacgggtttgaatttaagaatggcactgtcagcattgttggcaaaaaagttagc
acacccattaccgctgcaattggtgaatttgcccttggttttgatgaggtgaaaacattc
aattacacctccggaatgcttaacactgaaaataaagaagcattcacctatggctatatg
gaaattcgcgctaaagcacctagtggacaaggactttggcctgccttttggatgttacct
tcttcaggaaaatggcccccagaaattgatgtcatggagacagtggggcaaaaaacagac
actgtaattaactcgttccattctttgggtgctgacggtttaaataacgatacagcatct
caaaatttcactggagttgatttctctcaagatttccatacctatggagttaaatgggaa
acagacaaattaacttggtacatcgatcaacacgctgtatttgaaactaaaaataatatt
cctgatgtaccaatgtacttgttagctaatctggcaattggtggtaaattccccggttct
ccagatgcaagtactcccgcaatcaacaattatgatatagattacgttcgtgtttaccaa
gatgcatcgggtagcctttacggtggctctaacgatgatgtattagaaaaacaattgggc
agcatttttgggttatcagggaatgatgtgatcaaaggcggaattggcaataacacccta
gatggtggcgatggcaatgatatcttaattggcgtaaatactacagttgctcaacctggt
gctggtgaagtagatacgttaataggtggtgcaggtcaagataaattcgtcttaggcgac
agtaccaagttctattatgacgatcgcaataatttagtgactggtttaggcggctatgct
gtgatcaaagatttcaatgcagcccaagatgtcatccagttaaatggtaaagctagtgac
tatgtacttggcgcagtatcttctctcaatggtacgggaatttatcgcgatattaacggc
gatcgcactctcggttccacagatgagttaattgcagtcgtccaaggagatacaggattg
aatttgacgcagaattctttcttgtacgtttag
DBGET
integrated database retrieval system
