Nostoc carneum: NIES2107_67690
Help
Entry
NIES2107_67690 CDS
T10358
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ncw Nostoc carneum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7619
DUF7507
DUF11
Alpha_adaptinC2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY34859
LinkDB
All DBs
Position
8286735..8290817
Genome browser
AA seq
1360 aa
AA seq
DB search
MSTSFLRASTRLFLTTAIICGSFLPLLKTVLADSTPPGTTIDNSATGSFEGETSGTTNTV
TSNTVSVTVLEVAGITINSSSVPTEAPSNVTNAGTYQGIAGINTGDVVYFDFTITNTGND
PTQFFIPGTATITGGTLEGIQIIAVDPDGIGTASTTTVAVNVPSGGDNTINLLGTTNGYI
PVNGTVKVRVAVKVTETVVNNSITVNLGNTPVPPNPSSQNQPYIANGNLDVYTVDLPNGT
TIPSSYASIPTVSQVAEASGNPANGDSTNHRQEASANQSIALAATPNTSGYKSVQLTTDN
DSTNSVTSGDKLTWRVTYANTGSVDISNFQITDALPAGVTLSTALAAANITVNATQATAP
SANTSYNGTGNNNLFAAGVTFKAGGVITIDIPVNVNAALPNGTILSNQPTANGSNLLTVG
VKTDNIDNNTTGLPTGVTPLTNSILQTQNSSIDPTTVIVGTPTVVGYKSVKLTTDQGATG
LDPGDTVTWTVIYKNTGTVDVPNFQITDTLPSGVTKSGTPTLVTASGGGQTSPTINSSYD
GISNTNLFASGITLKAGGTIVVNIPVTINSGVSGTKSNQATGKGNNLITAGINTDNVDSD
TGITEVPAASIKQTQTGTIDPTVINIPATTPAPSLSGYKSVKLTNDLDSSSSITVGDTIT
WSVTYINTGTVDVSNFQITDILPSGLTKSGSINITTNNTQGTAPTANSSYDGTGNNSLLQ
TPITFKAGGIITVTIPVTINAGASGTKSNQATANGGNISATNTDNVDSTTTGLPTGISIP
SGSVTQTQNPSIDPTTFTIIAPQVSGYKSVKLTTDADTSNSVTSGDTVTWTIIYKNSGTA
SVPNFQIADALPTGVTKTGTPTVSVSGVGQTTPTVDTNYNGNGNNNLFSTTVPLVAGGVI
AVKIPVTINANQVGDKVNQAVGTGTGITAVNTDNVDSTSTLPSDVLAQIETGSIAQTQLA
SVDATKISIPEVQGFKSVKLTNDVDANNLVTAGDELTWTIVYKNTSTVPISNFQITDVLD
TNLTRSGANPISVNVKIAGVSQTAPTINSAYTGSNPNANLIDASTPYTLPANAVITINVP
VKIISATPANTVLSNQSIATASNLPSIGVKTDNVDSNPTTTLPADVTIPSNSIDQTENAG
TIDPTTVTTTVPVSSGVPNLILVKRITAINGVNITGFVDDTTSAQASDDDHANWPTPKNT
YLPGAINLSNIKPGDQLEYTIYYLSTGTQDATNVTICDLIPSNTTFLGTAFNGLTADTGG
LPQADMGIAFANSNTSLPTVPTVYMTNVADGDRGVFYAPGTTPPAICKKPVSFTTMTAAD
NTNGLVVVNVVKSPATLPKATGSGNPTNSFGYIRFKVKVN
NT seq
4083 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaacctcctttcttcgagcatcgactcgcttatttttaaccactgccataatttgt
ggcagtttcttacctttactcaaaacagttttggctgattccactcctccggggactact
atcgacaatagcgccacgggcagttttgaaggagagacatcaggcactactaataccgtg
acttctaacactgtcagcgtcacagttttagaagtggcaggaattacgattaattcaagt
agtgtacccacagaagcccctagtaatgtgactaatgcgggcacatatcaaggaattgcg
gggattaatacaggtgatgtggtctattttgacttcaccattactaacactggcaatgat
ccgacgcaattttttatccctggtacagccacaattacaggtggaacattagaaggtatt
cagattattgcggttgatcctgatggtatcggtacggcttcaacaaccacagttgccgtc
aatgttcccagtggcggcgataatacgatcaatttgttaggtacaactaatggttatatc
cctgtcaatggcaccgtaaaagtgcgagtagctgtcaaagttacagaaacagtggtgaat
aattctattactgtaaatttaggaaatacacctgttccgcccaatcccagcagccaaaac
caaccttatatagccaatggcaatcttgatgtctatacagtagatttgcccaatgggaca
actattcctagtagctatgccagcattcctacagtcagtcaagttgcagaagctagcggc
aatcctgctaatggcgattctaccaatcatcgccaagaagcaagcgcaaatcaatctatt
gcattagcagctacaccaaatacttctggttataaatcagtacaattaaccaccgataat
gatagtactaatagcgttacttctggtgacaaacttacctggagagtgacctatgctaat
actggttctgtagatattagcaactttcaaattactgatgctttaccagcaggagtcacg
ctatccacagcattagctgctgcgaatattactgtcaatgctacacaagcaacagcacca
tctgctaatactagttataacggtacaggtaataataatctctttgctgctggcgtaaca
ttcaaagcaggtggagtgattacaattgatattcctgtgaatgtgaatgcagcattacct
aatggcacaattctcagcaatcaacctactgctaatggctcaaatttactaacagtgggc
gtaaaaacagacaatattgataataatacgacaggtttacctacaggagttacaccctta
actaacagtattctgcaaactcaaaattctagtattgaccccacaactgtaattgtcgga
actcccactgtagtaggttataaatcagttaaattaacaaccgatcaaggtgcaacaggt
cttgaccctggagacactgtaacatggacagtaatttataaaaataccggaacagttgat
gttcctaattttcaaattactgatacattaccatcaggggtgactaaatcaggaacacct
actcttgtaactgcaagtggtggggggcaaacttctccgacaattaatagtagttatgat
ggaattagtaatactaacctctttgcttctggaattacattaaaagcaggaggcacaata
gttgttaatattcctgtaacgattaatagcggagtatcaggcacaaaatccaaccaagct
acaggcaaaggtaataacttaataaccgcaggcatcaatacagataacgttgacagtgac
acaggaataacagaagttcctgcagctagtattaagcaaactcaaacaggaacaattgac
cccactgtaattaatattcctgctactacaccagcgcctagcctatcaggttataaatct
gtaaaactaacaaatgatttagatagtagtagtagcattactgtgggagatacaattaca
tggtcagttacttacatcaatacaggtacagttgatgttagtaacttccaaataactgat
atattgccatcaggattaacaaaatcaggcagtattaatattacgactaataatactcaa
ggtacagcaccaactgccaatagcagttatgatggtactggcaataatagtcttttacaa
accccaattacttttaaagctgggggtattattacagtcacaattcctgtgactattaac
gctggagcatcaggtacaaaatcgaatcaagcaacagctaatggtgggaatatctcagct
acaaatacagataatgttgatagtactactaccggattacctacaggtataagcatacct
agtggcagcgttacgcaaacacaaaatcccagtattgatccaactacattcacgattatt
gcgcctcaagtatcaggttacaaatctgtgaaattaaccacagatgcagatacaagtaat
agcgttacttccggagatacagtcacatggacaattatttataaaaactcaggaacagcg
agtgttcccaattttcaaatagcagatgctttaccaactggagttacaaaaaccggaaca
ccaactgtcagcgtcagtggagtagggcaaacaactcctaccgttgatactaactacaat
ggtaacggcaataataatcttttcagtactacagtgcctttagttgctgggggtgtaata
gctgttaaaattcctgtgacaattaacgctaatcaagtaggagataaagttaaccaagct
gtaggtacaggcacaggaatcaccgcagttaatacagataatgtagatagtacctccaca
ttacctagtgatgtattagcgcaaattgaaacaggcagtatagcacaaactcaactagca
tctgttgacgctactaaaatcagcattcccgaagtgcaaggatttaaatctgtcaaatta
actaatgatgtagatgctaataatttagttacggctggtgatgaactaacttggacaatt
gtttataaaaatactagtaccgtaccaattagtaatttccaaattacagatgttttagat
actaatttgactagaagcggagcaaatccgatttctgtgaatgtgaaaattgctggagta
agtcaaacagcccctactattaattcagcttacacaggttccaatcctaatgctaattta
attgatgcctctactccctatacattacctgctaatgctgttattactatcaatgttcct
gtaaaaattatcagtgctactccggcaaatacagttttaagtaatcaaagtatagccact
gctagtaacttgcctagtattggtgtcaaaacagataacgttgatagtaaccccaccact
actttaccagcagatgtcactatacctagtaatagtatcgatcaaacagaaaatgcggga
acaattgacccaactactgtaactacaactgttccagttagtagtggtgtgcctaattta
attttggtaaaaagaattactgcaattaatggtgtgaatattacagggtttgtagatgat
actacaagtgctcaagctagcgatgatgatcatgctaactggcctactcctaaaaatact
tacttacctggagctataaatctcagcaatattaaaccaggcgatcaactagagtatacg
atttattatctttctactggtactcaggatgcaaccaatgtcacaatttgcgatttaatt
cctagtaatactacctttttggggacagcatttaatggactgactgctgatacaggtggt
ttaccacaagcagatatggggatagcatttgccaatagcaacactagtttacctactgtg
ccaacagtttatatgactaatgttgctgatggcgatcgcggtgttttctatgcgcctggt
accactcctccagcaatttgtaaaaagccagtgagttttaccacgatgacagccgcagat
aatactaatggtttagtggtggttaatgtagtgaaaagtcctgctactttacccaaagca
actggatctgggaatccgactaattcttttggatatatcaggttcaaagttaaggtgaat
tga
DBGET
integrated database retrieval system
