Nostoc carneum: NIES2107_73890
Help
Entry
NIES2107_73890 CDS
T10358
Name
(GenBank) heavy metal efflux pump, CzcA family protein
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
ncw Nostoc carneum
Brite
Transporters [BR:
ncw02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
NIES2107_73890
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY35477
LinkDB
All DBs
Position
plasmid2:183880..187005
Genome browser
AA seq
1041 aa
AA seq
DB search
MLSAIIKWAIARRWLVILGTIILTIWIFRTIIQMPLDVFPSFAPPQVEIQTEAPGLAPEE
LESLVTLPIESAINGTPGVTAVRSSSAAGISVVKVIFDWNTDIYQARQLVTERLQQAQSK
LPSGVETPQISPTSSPIGTVLQYAFTSQSTPLMEVRRIVDWQVTNRLLAVPGVSQVVAYG
GDVRQYQVLVDPAKLRAFNVTLEDVEQAASAANINAPGGYLITPDREKLIRGIGRIESIE
ELQQSVITARNGTPVKISDVADVQIGAAIKRGDGSFNGQKAIIVMINKQPQADTPTVTRA
IEQAMSEIQAGLPKDIKVTPTFRQENYIDSSIENVREALIEGSIIVALILIPFLMNWRNL
AICLTALPLSLLLGVLLLNWLGQGLNTMTLGGLAVAIGSAVDDAIVDAENVYRNLRENKY
SPNPRPVLDVVFDGCQEVRDSVFGATIITIVVFSPVFALAGVEGSIFIPMGLGYMAAVIA
SSITALTITPALCAILLPYGRLPETEPWVARFFKGLYRPLLTFSLRRSGIIIGAAIASLV
AATVIVPSFGRIFLPEFQEQTLVNTLTLYPGVSLEATNAAGETLQHALKGDSRFPYVQLR
SGRAPGDGDAAGVNLAHLDIELSEAGMKDREGTIEKLRQEFAKLPGVAPNIGGFISHRMD
EVLSGVRSAIAVKIFGSDLEQLRIIGQQVDNVMKTVNGIVDLQLEPQIPIEQIQIKFNRI
AASRYGLTVGKLSEIIETALNGRVVSQVLEKQQTFDLAVWLKPDARQNLDTIRNLLIDTP
DGQKIPLAQVAAIENGTGPNTINRENVSRLIVVSANANGRDLRSIVNEIQTKVKQQVQIP
AGYYIQYAGQFEAEERATQNILISSAIAFVAITVIMYLSVKSIPYTAMIMINLPLALVGG
VFSVALTGGVLSIASLVGFVTLFGVATRNGLLLVDNYNTKFAEGIPLKEVLIRGSMERLN
AILMTAFTSALGLAPLVIESGPGKEILQPLSIVVLGGLFTSTALTLVVLPALYAKFGKFL
LPKRTISVVEDVKVPKAVFEQ
NT seq
3126 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcagtgcaattattaaatgggcgatcgctcgccgttggttagttatcctgggtaca
attatcctgacaatttggatatttcggacgattatccaaatgcctttggatgttttccct
agctttgcaccgccccaagtcgaaatccaaactgaagcaccaggactcgcccctgaagaa
ttagaatccctggtaactttaccaattgaaagtgcaattaacggtactcctggagttaca
gcagtacgctcatcttcagcggcgggaatttctgttgtcaaagtcatttttgactggaac
actgatatttatcaagctcgccagttggtgacagagcgattacaacaagctcaaagtaag
ctgccatcaggggtagaaactccgcaaatttctcctacaagctctcctatcggcactgta
ttacaatatgccttcacctcccaaagcactccattaatggaagtgcggcgaattgttgat
tggcaagtgacaaatcgtctgttagctgtgcctggtgtcagtcaagttgtggcgtatggt
ggcgatgttcgccaatatcaagtattagtcgatccagcgaaactcagagcctttaatgtc
actttagaagatgtagaacaagctgcctctgctgctaatattaatgctcctggtggctat
ttaattactcctgaccgagaaaagttaattcgagggattggaagaattgaatctattgaa
gaattacagcaatcagtaattactgctcgcaatggtacgcctgtcaaaatttctgatgta
gctgatgtgcaaattggtgcagctattaaacggggtgatggtagttttaacggacaaaag
gcaattattgtgatgattaataaacagcctcaagccgatactcctactgtgactcgtgct
atagagcaggcaatgtcagagattcaagcaggattgcccaaagatatcaaagttacacct
acttttcgtcaagaaaactatattgattcttctattgaaaatgttcgagaagctttaatt
gaaggcagtatcattgttgctttaattctgattccttttttaatgaattggcggaatcta
gctatttgtttgactgcccttcctttatctttattattaggagtgctactactaaattgg
cttgggcaaggtttaaataccatgaccttgggagggttagcagtagcaattggttcagcg
gttgatgatgcgattgtagatgctgaaaacgtctatcggaatctgcgagaaaataaatat
tctcccaaccctcgcccggttttagatgttgtatttgacggttgtcaagaggtacgtgat
tcggtatttggagctaccatcattaccatagttgtgttctcgccagtatttgctttggct
ggtgtagaaggtagcatttttatccctatgggattagggtatatggcagcagtgatcgcc
tcaagtatcacggcattgactataactccagctttatgtgctatcttgctgccttatggt
cgcttgccagagacagaaccttgggtggcgagattttttaaggggctgtatcgtcctcta
ctaacattttctctgcggcgttctggaattattataggtgctgcgatcgctagtttggtg
gctgcgactgtaattgttccctccttcggcagaatatttttaccagagtttcaagagcaa
actttggtgaatacactcactctttatcctggggtttctctggaagctactaatgcagct
ggtgaaacactccagcacgcacttaagggagactctagatttccctacgtgcaattgcgt
tctggacgtgcgccgggagatggagacgcagccggagtgaatttggcacatttggatatt
gagttaagcgaagcagggatgaaagacagggaagggacaattgaaaaattacgccaagaa
ttcgctaaattaccaggggtagcaccaaacattggtggttttatttcccaccgcatggat
gaggtgttgtctggagttaggagtgcgatcgctgtcaaaattttcggttctgatttagaa
caactccgtatcattgggcaacaagttgataatgtaatgaaaaccgtgaatgggattgta
gatttacagctagaaccccaaataccgatcgaacaaatacaaattaagttcaaccgaata
gctgcttcacgatatggtttgacagtaggcaaactttcagaaattattgaaactgctctt
aatggacgagtagtatctcaagttttagagaaacaacaaacttttgatttagctgtgtgg
ttaaagccagatgcacgacaaaacttagatacaattcgcaatttattaattgatactcct
gacggtcaaaaaattcctttggcacaggttgctgcaattgaaaatggcactgggcctaat
actataaatagagaaaatgtatcccgtttgattgttgtttctgcaaatgctaatggcaga
gatttacgctctatcgttaatgagattcaaactaaagttaaacagcaagttcagatacct
gctggttattatattcaatatgcagggcaatttgaggcggaagaaagagcaactcaaaat
atcttaatttcgagtgctatagcttttgtagccattacagtcatcatgtatctgtcagtg
aaatctattccttatactgccatgattatgattaatttgcctttagcattagtaggagga
gtattttcagtagctttgacaggtggagttttatctattgcttctttagttggttttgtg
actttatttggagttgctacccgcaatggtttgttacttgtagataattacaataccaag
tttgctgaaggtatcccactgaaagaagttttgattagagggtcaatggaacgcctaaat
gcaattttgatgacagcttttacctctgctttaggattagcaccgttagtaattgagagt
ggacccggaaaagaaatcttacaaccactttcgatagtggtgttaggtggtttatttact
tctacggcattaactctagtcgttctaccagctttatatgctaagtttggtaagttctta
ttgcctaaacgtactatctcagttgtagaggatgtcaaagtaccaaaagcagtttttgag
caatga
DBGET
integrated database retrieval system