Neisseria cinerea: NCTC10294_00690
Help
Entry
NCTC10294_00690 CDS
T06828
Name
(GenBank) surface fibril protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
ncz
Neisseria cinerea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ncz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ncz02000
]
NCTC10294_00690
Transporters [BR:
ncz02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NCTC10294_00690
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
Trp_ring
YadA_anchor
TAA-Trp-ring
ESPR
Hia_Tpr_ring_dom
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SQF83253
LinkDB
All DBs
Position
1:672774..678431
Genome browser
AA seq
1885 aa
AA seq
DB search
MNKIFRVVWSHAAQSWVAVSELTSAKGKTKSKTISKLAALSLVAGTALSMDAMAASSPIT
AVSKTDGNLAILTNNRDSIVARTTGEATPKNVIYIGNGSVPSSIGDEFVAIGNDMTGSST
GYAGDTLIGNRVRSGGGGQDSFATAVGYAAQVSGPSVSIGVGTSSDIGSDRGWEAVKDSG
VAIGAFSRVSGTANGGVAMGAISFADQTGSVAIGQLSGAASLLYDREVAGKGNGGKLYKT
AEATGGNLVSIGAEAGARSKSSVAIGTQSTTSLGNDSIAMGTNSAAIKDNSIAIGHAAIA
GGHTQADIDALNKKKTFLKEEKVKADERLLEKTAAVAAEPTAENKFQLSAAKAAVERLDL
AIKRIDADLQRLSSVTTRNATNAIAIGNQAKATDESALAFGDTANATGKASIAQGKNTQA
TAENAIAVGTSSNVSGANSVALGANITKLTTENSVVLGANSTEVVGTTGASHAVQTVNDA
TVRTIAGPNFTYSGFVGKPADAGHYVSIGQAGKERQIKNLAAGAVTPTSTDAINGSQLYA
LMDRVENKQEPVVYTNKDGDKLVKVGDNFYKTTDLDDKGQPKTGVQPVAAGDVIASMNNA
GNNTTTPMALANIAGNLPGAKNGSTAPTTSGTLPEGADAPNTSNAATVGDVLNAGWNLTE
KGVARDFVKPYDTVDFIDGKGTSVNVTTDTDGKVSHIKYDVKAADDSITVGDDGIKVNTG
VITPVTKDDGDKKSGQVAPNKGDENKVASVGDVANAINNAFWKVTGAEDGGKFADGNTTT
EEQVKAGDKVTFKAGKNIKLKQDGKNFTYSLNPELTDITSIGGNGTTMTFKPEGVDLGGK
KITNIAPGTDGTDAVNKSQLDAAVNGMTTKPLSFSGDNKEAGKFDRTLGTEVKVVGGADA
SKLSDNNIGVIGDKTDTLTVKLAKSLKGLSDVEVKDDAGNTTNITPNGITISQPAKDGKK
PDNVSLTKDGLNNGGQNITNVAGNLPGAKKDTTAPTTSSEGPSATDLPNITNNAATVGDV
LNAGWNLQNNGEAKDFVKPYDTVNFIDGEGTTAVVETKDNKVSTVKYDVKLGAGLKKDDK
GNITVDAGNITNENGAPKVADADKDKVATAGNVADAINNSYWTASAEKDGKVIGKDDNIK
PSGKVTFDAGKNIEIDHSTPNKFTFKTVDNPEFKTLDLNDGAGNKVNLAPTADGLKLGKG
DKNEPANITNVTSGLKPYGDAKPDAKDLVNLDTPNVSDNTAATVGDLRNMGWVVGTPENG
YVDTVKNANKVDFKAGAGVSVTGETKDGVREITIAVKDGEVVKPNQFTAKVNGTDTPVTK
VGDQYYNTADIDPKTGEPNAKANPVTPDAGTTPTNSGDGYVTGNKVATAIQKSGFVVGKQ
TEKLSAADFKDEDEKVNPDDELRFADGNNTKVKLATKESVDKDGNKVTTTTVKVDVTGLP
VQYTDKNGTPVTKVGDKYFTVDKDGNPTTTEVAPENLTTNMVNPAAKPNEIGAPTTLGNM
KSNLPSVNDADKNAKDVAGNPIAGKDNKSAPIDAAKAADIAKNAGNNAATVSDVLNAGWN
LQNNGEAKDFVKPYDTVNFVDGKGTKAVVETTSNGTTSNVKFDVDTGTVTSNKDGSVSGP
VTPEMQKALDDAKKALADATTPEAKKAAQDKVDAAQANINNAGNQIATAQGVADAINKSG
FTLATSANGGEKISGTPEMINPGKKVEMVAGKNMTVKQESNGKVTYATASNVTFDSVQFG
DNGPKITNNGGNINVGTATGAPTKITGVAPGEISSTSTDAINGSQLHSVASDINNRIGSL
DNKIDMADKNLRGGVAQAIAAAGLVQAYLPGKSLLAIGGGVYRGEAGYAIGYSSISDNGN
WIIKGTASGNSRGHFGASTSVGYQW
NT seq
5658 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaatcttccgtgttgtatggagccatgctgcgcaatcttgggttgctgtttct
gagcttacttcagcaaaaggcaaaactaaatcaaaaacaatttcaaaattagccgcactt
tctttagttgcagggacagctctttcaatggatgctatggctgcatcttcacctattacc
gcagtaagcaaaacagatggtaatcttgcaattttaacgaataatcgagatagtattgtt
gcccgaactacaggcgaagctacacctaaaaacgttatttatattggtaatggcagtgtt
ccgtcatcaattggtgatgagtttgtcgctattggtaatgatatgaccggtagttcaact
ggttatgctggtgatacgttaatcggaaaccgagttagaagtggcggcggaggccaagat
tcttttgctactgctgttggttatgctgcacaagtttctggcccgtcagtgtctattggt
gtagggaccagttctgatattggctctgacaggggatgggaagctgttaaagatagcggt
gttgctatcggggcattttcacgagtgagtggcactgcaaatggtggcgttgctatgggg
gctatttctttcgccgatcaaactggttctgtagcaattggtcaattatctggagctgca
tcattattatatgatcgcgaggttgctggcaaaggtaatggcggtaagctgtataagaca
gctgaagcaactggaggaaatttagtttctattggcgctgaggctggcgcgcgttcaaaa
agtagtgttgctattggtacacaatcaacaacatctctaggaaacgattctattgcaatg
ggtaccaattcagcggcgattaaagataacagtattgcaattggtcatgcagctattgca
ggtggtcatactcaagcagacatagatgctttaaataagaaaaaaacattccttaaagaa
gaaaaagtgaaggctgacgaacgcttactggagaaaacagctgcagtagcggctgagcct
accgcggaaaataaatttcaattatctgctgcaaaagcagctgtagagcgtttggattta
gcgattaaacgtatcgatgctgatcttcagcgtttatcttctgttactacacgtaatgca
acaaatgcgatagctattggtaatcaagcaaaagcaacagacgaaagtgcgcttgctttt
ggtgatacagcgaatgcgacaggtaaggcatctattgcacaaggtaaaaatacacaagca
acggctgaaaacgctatcgcagtgggtactagctcaaatgtaagcggtgcaaactccgta
gcattgggtgcgaatattactaaattaacaacagaaaattcagttgtattgggtgctaac
tcaacagaagttgttggaacaacaggtgcatctcatgcagttcaaactgtaaatgatgca
acagttcgtactattgctggtcctaactttacttattctggttttgttgggaaacctgct
gatgctggtcactatgtaagtattggtcaagctggtaaagagcgccaaattaaaaactta
gccgcaggtgcagttaccccaacttctacagatgcaatcaatggttctcagttatatgca
ttgatggatcgtgttgaaaataaacaagagcctgtagtgtataccaataaagatggtgac
aagttggttaaagttggcgataacttctataaaacaactgacttagatgataaaggtcaa
ccaaaaacaggagttcaacctgtagcagccggtgatgtaattgcctcaatgaataatgct
ggtaataacactacaacccctatggcattggctaatatcgcaggtaacttacctggtgca
aaaaatggctctacagcccctacaacttcaggtacattaccagagggagctgatgcgcct
aatacctcaaatgcggcaactgtgggcgacgtgttgaatgctggttggaatttaacagaa
aaaggtgtagcacgtgattttgttaaaccttatgacactgttgattttattgatggtaaa
ggcactagcgttaatgtcactacagatactgatggtaaagtaagccatattaaatatgac
gttaaagcagctgacgatagtattactgttggtgacgatggcattaaagtaaatactggt
gttataacccccgtaaccaaagatgatggtgataaaaagtctggtcaggtagcccctaat
aaaggtgatgaaaataaagtcgccagcgtaggagatgtagctaatgcaattaataatgct
ttctggaaagtaactggcgctgaagatggtggtaaatttgctgacggcaatacaacaaca
gaagaacaagtaaaagctggtgataaagtaacatttaaagctggtaaaaacatcaagtta
aaacaagatggtaaaaactttacttattctttaaatcctgagctaaccgatattacaagt
attggtggaaatggaactacgatgacctttaagcctgagggtgttgatttgggtggtaaa
aaaatcaccaatattgccccgggcacagatggtacggatgccgtgaataaatcgcaatta
gatgcggctgtaaatggtatgacaacgaaaccattgtcattttccggtgataataaagaa
gctggaaaatttgaccgcactttgggtactgaggttaaagttgttggtggtgcagatgca
tctaaattatccgataacaacattggtgtgattggggataaaaccgatactttaacggtt
aaattggcgaagtcgttaaaaggcttgagtgatgttgaagtaaaagatgatgctggtaat
accacgaatattactccgaatgggatcactatttcacaaccagcaaaagatggtaagaaa
cctgacaatgtatctttgacaaaagacggtttaaataatggtggtcaaaacatcactaat
gtagcgggcaacttgccgggtgcgaaaaaagatacaactgcaccaactacatcttctgaa
ggtccgtctgcaacagacttgccgaatattacaaataatgcagccactgtaggtgatgtg
ttaaatgcaggttggaatttacaaaataatggtgaagcgaaggattttgtaaaaccatat
gacactgtaaactttattgatggcgaaggtactacagctgtagtagagacaaaagataat
aaagtatctactgtgaaatacgatgtaaaacttggcgcaggtcttaaaaaagacgataaa
ggtaatatcactgtagatgcaggtaatattactaatgaaaatggtgcgccaaaagtagca
gatgcagataaagataaagtagccactgcaggtaatgtagcagatgctattaataactct
tactggacagcatctgcggaaaaagatggcaaagtaatcggtaaagacgataacattaaa
cctagcggtaaagttacgtttgatgctggtaaaaacattgaaattgatcacagcacgcca
aataaatttactttcaaaacagtagataacccagagtttaaaactcttgatttaaatgat
ggcgctggaaataaagttaacttagctccaacagcagatggactaaaattaggtaaaggt
gataagaatgagcctgctaatattacgaatgtaacatctggcttgaaaccatatggagat
gcgaagccagatgctaaagatttggttaatttagatactccaaatgtatctgataacaca
gctgctacagtaggtgatctacgtaacatgggttgggtggttggcacacctgaaaatggt
tatgtagatacagtgaaaaatgctaataaagtagatttcaaggctggggctggagtttct
gtaactggtgaaactaaagacggtgttcgtgaaattactatcgcagttaaagatggtgag
gtagtcaaaccgaatcaatttacggctaaagtcaatggaacggatactccggtaaccaaa
gtaggagaccaatattacaatacagcagatattgatccaaaaaccggcgagccaaacgcc
aaggcaaatccagtaactcctgacgcgggtacaaccccgactaattcgggtgacggctat
gtaacaggtaataaagttgcaacagcgattcaaaaatctggttttgttgtaggtaagcaa
acagaaaaattatctgctgcagacttcaaagatgaagatgaaaaagtgaatcctgatgat
gaacttcgttttgcagatggtaacaacacgaaagtgaagttagcaacgaaagaatctgtt
gataaagatggcaataaagtaactaccacgacagtaaaagtggatgtaacaggcttacca
gttcaatatactgataagaatggcacgccagtgactaaagttggtgataaatactttact
gttgataaggatggtaatcctacaacaacggaagttgcacctgagaacttaaccactaac
atggttaatccagcggcaaaaccgaatgaaattggtgcaccaacgacattaggtaatatg
aaatctaatcttccgtccgtaaatgacgcagataagaatgccaaagatgttgcgggcaat
ccgattgccggtaaagacaataaatctgctccaattgatgcggcaaaagcagcggatatt
gcaaaaaatgcaggcaataatgcagcgaccgtatctgatgtgttgaatgcaggttggaat
ttacaaaataatggtgaagcgaaggattttgtaaaaccttatgacaccgtaaactttgta
gatggtaaaggcactaaagctgtcgttgaaaccacgtcaaacggcacaacaagtaacgtg
aagtttgatgttgatacaggcactgttacaagtaataaagatggttctgtttcaggtcca
gttacgcctgaaatgcagaaagccttagatgatgctaaaaaagcattagcagatgcaacc
acgcctgaagcgaagaaggctgctcaagataaggttgatgctgcacaggctaatatcaat
aacgctggtaaccaaattgcaactgctcaaggtgttgcggatgcaattaacaagtcaggc
tttacattagccacttcagcaaatggcggtgagaaaatttcaggtactccagaaatgatc
aatccaggcaaaaaagttgaaatggttgcaggtaaaaatatgaccgtgaaacaagagtct
aacggtaaagtgacttacgcaactgcttctaatgtaacctttgacagtgttcaattcggt
gataatggtcctaagattactaacaatggtggaaatatcaatgttggtacagcgacaggc
gcaccaactaagattacaggcgtagcaccaggtgaaatttcatcaacttctaccgatgca
atcaacggcagccagttgcacagtgtggcatcagatattaacaaccgtataggttcgctg
gacaataagattgatatggcagataaaaatcttcgcggaggtgttgcccaagcgattgca
gccgcaggtttggttcaggcttatttaccaggcaagagcctgctggcaatcggtggtggt
gtgtatcgcggtgaagccggttatgccattggttactccagtatttctgataatggaaat
tggattatcaaaggtacggcatccggtaattcacgcggtcattttggtgcttccacatct
gtcggctatcagtggtga
DBGET
integrated database retrieval system
