Naumovozyma dairenensis: NDAI_0E04120
Help
Entry
NDAI_0E04120 CDS
T02234
Symbol
NDAI0E04120
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14312
nuclear pore complex protein Nup155
Organism
ndi
Naumovozyma dairenensis
Pathway
ndi03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ndi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
NDAI_0E04120 (NDAI0E04120)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ndi03019
]
NDAI_0E04120 (NDAI0E04120)
Messenger RNA biogenesis [BR:
ndi03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
NDAI_0E04120 (NDAI0E04120)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin_C
Nucleoporin_N
TMEM145_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11498978
NCBI-ProteinID:
XP_003670472
UniProt:
G0WBV9
LinkDB
All DBs
Position
5:925680..930419
Genome browser
AA seq
1579 aa
AA seq
DB search
MFSTPLKVTPNDYNINNNQSFSSGYPIPNNIISSSTTTNADPQFHDRNHHTSVQQSNAPI
MALTNMSTDLSNNSNSLTSTNTSTTTTTGAATTTTAATSNNGISNYNLKIQGFGSKKPLE
LASLYINHLYNQDENTPILDQISYYNNGVSYNFNKEIGGLGAFTPLERTKIINLPDELLQ
ETSKASIKTDMGIFPQLDRTWIIIDNKLILWNHNDPTDYQSIDEIKHTILKVALVKPKPN
TFINEINHLLLIATPFDIYILAVSYNGKNSNELSVFNTGMSVSVNGLAVNDIVSYEKTGQ
IFFSGRSNGLNIWELQYTGSDDWFNSKSNKICLTQSSWANLLPSNVISKIQIPGSELISS
FFQNNTTSTTTTNKNANATDSIDGSDNLDINDNNNPHNKRKYTRETVIQLNVDQSRGVIY
SLSSNSIIRAYLIKNNNTLSDPVTIHPSYISRIITTTMAKGAAVLGKNYLQIVKIVPVSQ
QQNNNLFFVAITVTGVRLYFNGSININSIEAICLESIKFPPSSATPEKIRLELEKQQNND
QQKRRTAPFFSSFNYSSESIQLKLQKKSAVLLTTTDASTIVSPGIFVASVIKKSKIPPSS
SSPSHQDQTTTPPPTTTTTKAKPHYHYDRKLFVTLPDYGVLKYHGKYIENATFLDTTAHV
KQIIPLTPTFNATEKPIGYANQFATQYNSENLQIAVVTDTSIEIYKYRNPDEIFESLIDN
PLPFIANYGIIEACSSALYVTCKFNKPALLRSNALTFLTVGIPGIIDIKPKYNRYVSSSF
PNTNTNTNTNINTTTTITTKESSMIMKPFTSQDLNLDDVILSPRFYGIALLITRLLRNIW
NQKVFITSKPVATTPIKSNTMDNKKSQIDIIGISISKNEIQYYLSSIMILNEFFISYSDS
ITIFAAPTLSTSSATNTTTTTTTNNNNPNTLSSVSKDKYEEVSNQAENIAINSIIKLTES
IKESLSFLNVLYEESELDGIDNRSNSFKDIINFLNVENQSNLIDLNFKHLFAPNDQTKSL
IKDILSSIINRNISRGASIEYMATTLQDRCGSFCSAKDILGFRAIEHLRKAKEIGLNKDN
DNLHYHLDNAMKLFENIVDDISQEKLDEAVQIMVSLDYFPKTIEFLLNIASLIDRGNLAY
QYLDNGSMEYDERKIYYDKRINIYDLVFRVLTTIDERSSIVSTTTTITTPTTSSKKNPIE
IETPTNTVITRYSGNTNFNKLREESYNIALRCNDKLFHYHLYDWLVSTDNQDKLLQLDTS
FILPYLIEKSTNSLKISNLLWVYQSKKHNFFEAAEILYSLSISKFELKLNERISFLSRAN
GFCNSVCPPNQKQRMVQLASTIQELFEVAAIQDDILTLVKTDPRLDMQIKSDLINQLDGE
ILPLTSLFNDYADPLGYYEICLNIFKVSDFRNSEEILSKWNELFESLKLELKKTNDVDYL
QDSKTFINLLSSVITKVGKQVHSSELVFPISKLFPIISDLFYKNLPNNQVKEGSIISIFI
SIPIPYSKLYYILKDLIETTTTTNPNNLLFKKEMTYLIKDWYQSDRKLRDIIPYNEIESL
KDYNIDPIENYTTRTGNGI
NT seq
4740 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttccactccattgaaagtaaccccaaatgattataatataaataataaccaatca
ttttcatcaggttacccaatcccaaataatatcatatcctcttcaactactaccaatgct
gaccctcaattccatgacaggaatcatcatacatctgttcaacaatctaatgcgcccata
atggcactaaccaatatgtcaacagacttatccaacaacagtaatagtcttacatccaca
aatacttcaaccacaactactactggtgctgcaacaactactactgcagctacctctaat
aacggaatctcaaattataatttgaaaatacaaggttttggttccaaaaaaccattagaa
ttggcaagtctttatataaaccatttatataatcaagatgaaaatactcccatcttagat
caaatatcctattataataatggtgtttcatacaattttaataaagaaattggtggtctc
ggtgcattcactccccttgaaagaacaaaaataattaatttacctgatgaattattacaa
gaaacatctaaggcatccattaagactgatatgggtatattccctcaattagatcgaact
tggatcataattgataataaattaatcctatggaatcataatgatccaacagattatcaa
tccattgatgaaattaaacataccattttgaaagttgccttagtcaaaccaaaaccaaac
acttttattaatgaaattaatcatttattattgattgccactccctttgatatttatata
ttggctgtatcatacaatgggaaaaactctaatgaattgagtgtattcaacacagggatg
tccgtatcagttaatgggttagcggtaaatgatatagtttcatatgaaaagactggtcaa
atcttcttttcaggtagatctaatgggttaaatatttgggaattacaatatacaggttca
gatgattggttcaatagtaaatcaaataaaatttgtttgactcagtcttcttgggcaaat
ttattaccttccaatgtaatctccaaaatacaaatacctggttctgaattaatttcttca
ttcttccaaaataatacaacatcaactactaccacaaataaaaatgcaaatgctactgat
agtattgatggttcagacaatttagatataaatgataataacaatccacacaacaagagg
aaatatacaagagaaactgttattcaattgaacgtagatcaatcaagaggggtcatttat
tctttatcttcaaattcaatcattagagcatatctaattaaaaataataatactttatca
gatccagtgaccattcatccatcatacattagtagaattataacaacaacaatggctaaa
ggtgctgctgtattaggtaaaaattatttacaaatcgttaaaattgttcccgtatcacaa
caacaaaataataatctatttttcgtcgctataacagtcactggggtacgtttatatttt
aatggttcaattaatatcaattctattgaagcaatatgtttagaatcaataaaattccca
ccttcatcagcaactcctgaaaagattcgtttagaattggaaaaacaacaaaataatgat
caacaaaagagaagaacagctccatttttttcaagttttaattattcttcagaatcaatt
caattaaagttacaaaaaaaatctgctgtattattaacaacaactgatgcttccactatt
gtatcaccaggtatatttgtcgcttcagtaattaaaaagagtaaaataccaccatcatca
tcatcaccatctcatcaagatcaaacaacaacaccaccaccaacaacaacaacaacaaag
gctaaacctcattaccattatgatcgtaaattattcgttacattacctgattatggtgtc
ttaaaatatcatggtaaatatattgaaaatgctactttcttagatacaacagctcatgtt
aaacaaattataccattaactccaacttttaacgccactgaaaaaccaattggttatgca
aatcaatttgcaactcaatataattctgaaaatttacaaattgctgtagtaactgatact
tctattgaaatttataaatatcgtaacccagatgaaattttcgaaagtttaatcgataat
ccattaccattcattgctaattatggtatcattgaagcttgttcttcagcattatacgtt
acttgtaaatttaacaaacctgctttattaagatcaaatgcattaactttcttaacagtg
gggataccaggtatcatcgatataaaaccaaaatataatcgttacgtttcatcatcattc
ccaaatacaaataccaatacaaacacaaatataaacacaacaacaacaattactactaag
gaaagttcaatgataatgaaaccattcacttcacaagatttgaatttagatgacgtcatt
ttatctccaagattttatggtattgctcttttaattacaagattattaagaaatatttgg
aatcaaaaggttttcataacttcaaaacccgtagcaacaactcctattaaatcaaacacc
atggacaacaaaaaatcacaaatagatatcattggtatatctatttctaaaaatgaaatt
caatattatttatcatcaattatgatcttaaatgaattctttatttcatatagcgattcc
attaccattttcgctgctccaacattgtcaacctcatcagcaacaaatactaccactact
actactactaataataataatccaaatacactatcctctgttagtaaagacaaatatgaa
gaagtttccaatcaagctgaaaatattgccataaattcaataatcaaattaacagaatcc
attaaggaatcattatcgttcttaaatgtcttatacgaagaaagtgaacttgatggtatc
gataatcgttccaattcattcaaagatataataaatttcttgaatgtggaaaatcaatcc
aatttaattgatttaaattttaaacatcttttcgctccaaatgatcaaactaaatcatta
attaaagacatcttatcatcaatcattaatagaaacatttcaagaggtgcatcaatcgaa
tatatggccactacattacaagatcgttgtggttccttctgttcagctaaggatatattg
ggtttcagagccattgaacatttaagaaaggcaaaagaaattggattaaataaagataat
gataatttacattatcatttagataatgcaatgaaattatttgaaaatatcgttgatgat
atttcacaagaaaaattagatgaagcggtccaaattatggtatcattagattatttcccc
aagacaattgaattcttattgaatattgcaagtttgatcgatagagggaacttagcttat
caatatttagataatggatccatggaatatgatgaaaggaaaatttattacgataaacgt
attaatatttatgatttggttttcagagtactaactacaatcgatgaaaggtcgtctata
gtttctactactactactattactactcctactactagtagtaagaaaaatccaatagaa
atagaaactccaacaaacactgtcattactagatacagtggtaacacaaatttcaataaa
ttaagggaggaaagttacaatattgcattacgttgtaatgataaattattccattatcat
ttatatgattggttagtctcaacagataatcaagataaattattacaactggatacatca
ttcatcttaccatatttgattgaaaaatcaaccaattcattgaaaatttcaaatcttctt
tgggtttatcaatctaagaaacataatttctttgaagctgctgaaatactatactcttta
tccatttctaaatttgaattaaaattaaatgaaagaatttcatttttgtctcgtgctaat
gggttttgtaatagtgtttgtccaccaaatcaaaagcaaagaatggtacaattagcctcc
acaattcaagaattgtttgaagtggcggcaatacaagatgatatattaactttagtaaag
acagatccaagacttgacatgcaaatcaaatcagatttaattaatcaattagatggtgaa
atattaccattaacttcattatttaatgattatgctgatccattgggttattatgaaatt
tgtttgaatattttcaaagtatcagattttagaaattctgaagaaattttatcaaaatgg
aatgaattatttgaatcattgaaacttgaattgaaaaagacaaatgatgtagattattta
caggattcaaaaacattcattaatttattatcaagtgtcattactaaagttgggaaacaa
gttcattcttctgaattagtcttcccaatttcaaaattattcccaataatttctgatcta
ttttacaaaaatttaccaaataatcaagttaaagaaggttcaataatttcaattttcata
tccatccccatcccatatagtaaactatattatatcttaaaggatttaatagagaccacc
acaacgacaaatcctaacaatttattatttaagaaggaaatgacatacttaattaaagat
tggtatcaatctgataggaagttaagagatatcataccttataatgaaatcgaatcattg
aaagattataatattgatccaattgaaaattacacaacaagaacgggtaatgggatatag
DBGET
integrated database retrieval system