Nonlabens dokdonensis: DDD_0336
Help
Entry
DDD_0336 CDS
T02441
Name
(GenBank) sensor protein
Organism
ndo
Nonlabens dokdonensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
Response_reg
HATPase_c
HTH_18
HisKA
HTH_AraC
Y_Y_Y
WD40_CDC20-Fz
Beta-prop_RIG_2nd
HATPase_c_5
HATPase_c_2
PDE8A_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGC75463
UniProt:
L7W9B0
LinkDB
All DBs
Position
complement(386698..390705)
Genome browser
AA seq
1335 aa
AA seq
DB search
MYRILFLLLSLISITSYAQVNSYQFQHLSTAHGLSQSSAIAIEQDELGQMWIGTRDGLNV
YDGHKITVFKSDGDNDNSLSSSDILSLEKDNNGQLWIGTYNGLNTYNPKTNTFKRYLKTG
DKNSLASNIVQEVYATSDGNMWIGTSKGLSIYNPEQETFYNGIFEDMNYDVVVYSVMELS
ETFYLIGTNFGLWSAKKQTDGTYEVKQYDTYNNDSILDIVPAGKDRYFMGTTASGVLVYD
AVSNSIDSFKVNDTFIIKDIRKLRLDKYDRLWIGSYDGVYIYDKGQVTHLTNNINDPYSL
AKNSVKALYEDVSGSIWVGTYYGGANIWNEANSNFQNYVQNGTNKGLNYPVVSSLQANQN
KLYIGTEQGGINILDLTTKNFDYLTTENSTLVEDNIKSLYLDNNQLHIGTFSNGVSIYDL
EKERFVGSALNSQLSDVGVYSIIKTGNYIYYGTFGKGVLSQNSLKEISQWNREKGLTSNL
VRSLIIDNEGILWVGTQNGLNSIEDDNVRNFLFNKEQDAGYDVLHLFQDSQETIWAGTKS
QGVYRRVNGEFEKVPLNWANKEISTIHAIIEDANGMLWMSSNQGILKLDKESLQILSLNQ
QKDGLVGNEFSDNAVLRLPQDQLVFGGVSGVSAFNTTKLRTDTYAPDVLISSFKTSGEEL
DKYNEEDNEVENIAFAKAVKINHNQRNFTIEFTMPSYHNLTSKTYEYRLNGLESGWNSTV
ENKASYAIQNAGNYEFEVRGVNGDGIKSEITTLSIMAAPAPWYSWWAFLAYGLIFIITSY
FLLRILNSRTLLQEELKFEQIQQQRNSELNEAKLQFFTNISHEFRTPLTLILGPLQQILS
DYKGTNTMYKKLLVIESNGKQLLNLINRLMDFRKLEKNQFEIQAAQGNLVKFIKEIYLSF
EEHAKIGDYSYDFRTTDDEILVYYDRQKLERVFFNLISNAFKFTPKGGDIKVRISKDDAH
IFIEVKDSGIGIATDKQNKVFDRFYEVDANQERPSAYNQGTGIGLNIVKNIVDLHHGSIE
VNSQLEKGSSFKVALRLGKEHLQSNQIIDDFKFSDDLSHYTNLTEQAISNNAIDNLDFVN
NDEKSTVLIVEDNHSLRSFMAQLLKQHYNVLEADNGEEAFKIAVNNHPDIIVSDVVMPKM
VGTELCSKIKEDVRTSHIPVVLLTSRSSLIYKLEGLESGADDYLSKPFDVNELQLRVKNL
LSYKERLKEKFSAKDLFTPEEVSVSSVEDELMKKAIQIVEDNIPNDQFDIPTFCSELGVS
RTMLFIKIKAWTNFTPNDFIQHFRMKRAAQLLELGTLNISEVSYKVGFRNPKYFSKCFQK
AYGETPSVYAKKFSE
NT seq
4008 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacagaattctattcttacttcttagtttaatatctattacgagctatgctcaggta
aatagttatcaatttcaacatttgtcaaccgctcatggattgtctcaaagcagcgcaatt
gcaatagagcaagatgagctaggtcaaatgtggataggaacaagagatggattaaatgtc
tatgatggtcataaaattaccgtatttaaatctgacggtgataatgataactcacttagt
agtagtgacattttatctttagaaaaagataataacggtcagttatggatagggacctat
aatgggctcaacacctataacccaaagacgaatacttttaagagatacttaaaaactggc
gataaaaactccctagccagcaatattgttcaagaagtttatgcaactagcgatggtaat
atgtggataggaacttctaaaggcttatcgatttataatccggagcaagaaacattctat
aacgggatttttgaagatatgaactatgatgttgtggtgtatagtgtcatggagctctcg
gagaccttttatttgatagggactaattttggattatggtcggcaaaaaaacaaacggat
gggacctatgaagtgaaacaatatgatacttataacaatgattctatcttagatatagta
cctgctggaaaggatcgttattttatgggaactaccgcttcaggggtcttagtttatgac
gctgtttctaactctatagattcttttaaagtaaatgatacttttataataaaggacata
cgcaaattaagattagataaatatgacaggctttggataggtagctatgacggtgtttac
atttatgataaaggacaagtaacgcatttaactaataatattaacgacccatatagtctt
gcaaaaaactctgtcaaagcactttatgaagatgtgagtggttcgatttgggtagggact
tattatggaggagcaaacatctggaacgaagccaatagtaattttcaaaattatgttcaa
aacggcacaaacaaaggtttgaattatcctgtagtaagctctttacaggcaaatcaaaat
aaactatatataggtacagagcaaggcggaattaatattctagaccttacaaccaaaaac
tttgattacctcacaactgagaatagcacgcttgtagaagataatataaaatcactttat
ttagataacaatcaattgcatataggtactttcagtaatggagtttctatttatgatttg
gaaaaagaacgctttgtaggaagcgcgctcaacagtcaattaagtgatgtaggagtgtac
tcgattattaaaacagggaactatatatattatgggacctttggtaaaggtgtgctctca
cagaattctctaaaagaaatatctcaatggaatagggaaaaagggttaaccagtaattta
gttcgatccttgattattgataatgaaggaattttatgggtaggaactcagaatggatta
aatagtattgaagacgacaatgtccgtaattttcttttcaacaaagaacaggacgcaggc
tacgatgttctacacctttttcaggatagtcaagaaaccatttgggctggtacaaaatct
caaggtgtttatagaagagtgaacggtgaatttgaaaaagtacctttaaattgggcaaat
aaagaaatatctaccatacatgccattatagaagatgcaaatggaatgttatggatgagt
agcaatcaaggaattttaaaattggataaagaatctttacaaattttgtctttaaatcaa
caaaaagacggtttagtggggaacgaatttagtgataatgcagtgctaagattacctcaa
gatcagttggtttttggaggagtttctggagtttctgctttcaatacaaccaaattaagg
actgatacttatgctccagatgtcttgatctctagttttaaaaccagtggtgaagaactc
gacaaatataatgaggaagataatgaggtggagaatatcgctttcgcgaaagcggtaaaa
atcaatcacaaccagcgcaatttcaccattgagtttaccatgcctagttatcataatttg
actagtaaaacctatgaatatagattaaacggtctagaatcaggttggaattctacggtt
gaaaataaggcttcctatgctattcaaaatgctggtaattatgaatttgaggtgagagga
gttaatggcgacgggattaagagcgagattaccacattatcaattatggcagcaccagca
ccttggtacagttggtgggcttttctagcttatgggcttatttttattattacctcttat
tttctactcagaattttaaattcaaggacgctattgcaagaagaacttaaatttgaacaa
atacaacagcaacgcaatagtgaattgaatgaagctaagctgcagttttttaccaacata
tcccacgagtttagaacaccacttactcttattctaggccctttgcagcaaattctttct
gattataaaggcactaataccatgtataaaaaacttttagttatagaaagtaatggtaag
cagttgctcaatctcatcaatcgattgatggatttcagaaaactagaaaagaatcagttc
gagatacaagctgctcaaggtaacctagtgaaatttatcaaagaaatttatttaagtttt
gaagagcatgcaaaaataggagactatagttatgattttagaactactgacgatgagatt
cttgtttattatgaccgtcagaagttagaaagagttttttttaacctcatatcaaatgct
tttaaattcacgcctaaaggtggtgatataaaggtaagaatttctaaagatgatgctcac
atattcattgaggttaaggattctggaatcggaatagcaaccgacaaacaaaataaagtc
tttgatagattttatgaagtagatgcaaatcaagaaaggcctagtgcatataatcaaggt
actggtataggcttaaatattgttaaaaacatagtagatcttcatcatggttcgattgaa
gttaatagtcaactagaaaagggttcatctttcaaagtcgctttaagactaggaaaggag
cacttgcaaagcaatcaaataattgatgactttaaatttagcgatgatttatctcattat
acaaacttaacggagcaagctatctcaaacaatgcaatagataatttagattttgtaaat
aatgatgaaaagtctactgttttaattgtagaggataatcactccttaaggtctttcatg
gcacaattattaaaacagcattataatgtattagaggcagacaacggtgaagaagcgttc
aaaatagctgttaataatcatcctgacatcatagttagtgatgtagttatgcctaaaatg
gtgggaactgaattgtgctcaaaaataaaggaagatgtccgtaccagtcatatccctgta
gtactgcttacttctcgttcttcattaatttacaagcttgaaggtctagaaagtggtgca
gatgactacttgagcaagccgtttgacgtgaatgaactgcagcttagagttaaaaactta
ctttcttacaaggagcgattgaaggagaagtttagtgctaaagatctattcactcctgaa
gaggtaagcgtatcttctgtagaagatgagcttatgaagaaagctattcaaatagtggaa
gataatattcctaatgatcaatttgatattcctactttttgctctgaactaggagttagt
agaaccatgctttttataaagattaaagcatggactaattttactcctaatgattttatt
caacattttagaatgaaacgagctgcacaacttttagaattaggcactttaaatatctct
gaagtgagttataaagttggctttagaaaccctaaatattttagtaaatgtttccaaaaa
gcgtatggagaaactccatcagtttacgcaaagaaattttctgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
