Nonlabens dokdonensis: DDD_1484
Help
Entry
DDD_1484 CDS
T02441
Name
(GenBank) putative hemagluttinin family protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
ndo
Nonlabens dokdonensis
Pathway
ndo02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ndo00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
DDD_1484
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MAM
fn3
Pur_ac_phosph_N
Por_Secre_tail
CHU_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGC76611
UniProt:
L7W9U2
LinkDB
All DBs
Position
1587333..1594514
Genome browser
AA seq
2393 aa
AA seq
DB search
MKLKLLLLSLLYTFTCLITTAQPPNDTFAGAIPIVIPTQGAASPQFTLPFSSDGTTDSGL
DNAGCSNSGNDQFFTWTATSLSLTFNSLSPGNPGVAVYDGSMTLISCTDTFVSGQTVSGW
ALNDNVVIKIFDFQGSNADVAFDLFTIPCPAPDNLDVTPSITSADVTWTNNSTSTETILE
YGISGFTAGSGTTINISGGLTTATIPSLMANTEYDYILTQDCSATGDGTSTEATGSFTTL
CNPITPDYLADMSLNVPDCWAEANSGNAASGPSDLGAGLWSASNHNGTPSNRINLFSNTR
SDWIISPVFDLSTAAPSELNIYVALTESSTSGTGADLGSDDRVSLLMTTDNGATWTEMQA
WVQGTVPTDIGESITYDLSSITGSVQFAFLGDEGSVNDLEDVYFHVSTFQVRETPTCPDT
INLTLLSFTDVDATINFDSGNVSSLGNYEYSLTTVSGATPAVSGSWTDVAGANPNVTYTI
SGLSPETEYFVHVREVCAVGNEGPWSITPVTFTTACSPIAAPYLEDFEMFTTSTSAFTSG
NCWSGTGGSYFWETAPGTDTSSTGTGPAPSITTGNYFFTEATSGSMGDTTDLISPLVDLT
ALTAPALSFNYHMFGEDMGTLDVLVNGTTNVWTLSGEQQMSDTDPWRLAVVDLSAFAGQT
ISVTFRGTKGVDFESDMAIDNVDFGEAPSCFPPINIAVVATTFDGATIDFTNSNASTNSN
FEYGAPGFTQGTGIILPQTTSTFTVTGLMSATTYDFYLQSDCGMGDVTTWEGPFSFTTDC
NSFTDFNENFDGVSTPDLPVCWTSFVTTPAGTTAAVVQTNTAADNSPSNGVRLYSGSLTG
NIGSGTTDEGETVLISPQLSNLAAGTHRIKFFADAGTATSTLEVGTMTDPTDPATFTLLG
SFAPTTTHAEYIQNFDTYTGTDEYIAFRHIFAGTFDTMYLDDIVWEPIPSCVAPTDLALV
SATDTQVTIGWTNNAGAAASSVIYGAPGFDPLVAGTTVAGTGDMATITGLAAETAYDFYV
IQDCSATGDGQSSTSGPLSITTPCAAIPAPYFVDFENFSAATSGFVNDQCWNEISSTIYD
WAIDASGGTTSSDTGPSGAFSGSTFMFVESSNGADGDIATVLSPAIDLTALTVPSLSFYY
HMYGSQITSLEVGVSTDNGATFTNELTITGQQQMDSTDPWLQSIIDLSAYANQTVIVSFT
TTKGTGTLAFEGDVSIDDVNFDELPVCNDVTAVTIDSVTSDSVTVSWTENSIPASTAWEV
IAVPAGDPAPAVGTSNATTNPFTISSLMGITSYDVYVRADCSTAFVGPVAATTDCPVFVP
DTFEAFTTFVPDCWDVADGGDLTTGPTNLGTSQWFAEEFAHVGSGNGAVNINLYRAVVSD
WILSPIYDLSAGGYELNLDVALTDFNSTAAGVMGSDDLVALAYTTDGTTWTALQTWDLNN
QPATAGETYNDALTGINSTTVQFGIYATDGAVDDVGIDYDFHIDNFQVRTPPTCPDTSNL
TLVSNTDVTATINFDSGNATSNGDYEYSLTTVAGAAPAVTGAWSDVAGATPNVTYTIMGL
TAETEYFVHVREVCAVGDESAWTFVPINFTTACAPVAAPYTEDFEMFTTATSAFASENCW
SGTGGAYFWEAAPGTDTGSGGTGPNPSITTGNYFYTEASSGVTGDTTDLVSPLVDLTALT
APALSFNYHMFGAEIGTLDVLVNGSVNVWTLSGQQQAADTDPFELAVVDLAAYAGQTISI
TFRATSAGIFEGDIAIDNVSFDEAPACVNVNGVTVDSVTSDSATISWLENNIPPGTAWEV
VTVPAGDPAPAVGTSNATTNPFTIPALMANTSYDVYVRADCSTSFAAPVNFTTLCNTFTA
PYTEDFENAGATPDCWTLGGDEDWLFNLSGPNQVGNGGTLSGATASGGYYAVVDDSTPDA
SNAQMDSPFVDISTLASPELSFYLISDNTSDTRPVPVNATLTVSVWDGAAWNVAGTYNTD
TVGWELRTIDLSAFTFTGPAQARFSVADSGSFYDDIAIDDVTFDEALTCINVSAITVDST
TADSITVSWTENNVPAATAWEVVAVPAGDPAPAVGTSNATTNPFTIPALMANTSYDIYVR
TDCSTTFAAAITVTTDCTVNSVYPYVTDFTNNVPNACWDEAGSGEITDGPMTVGASEWRA
NRSYEDFAGNVTPSNAMNLYRNSDREWLLSEQYDMTGTSNDVLSIEVAVTDWTNTGASDA
TDTDTMGSDDQVDLLITTDGGTTWTSLMTWNAANQPAVDGTREDIDLSAYTGTVQFAFFA
TDGTVDDTEDYDFHVGMFIIDGTAGNNDVFENSLSLYPNPVNGDTVTISMSNTNNASVQI
AIFNTLGQQVLTRSYPQATNEIRIDNLSRLSKGMYLIKVTDGKQESTLKFIKE
NT seq
7182 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaaaattacttttattgagtcttttatacacttttacgtgtttaataactact
gctcaacctcctaacgacacttttgctggagctattccgattgtgatacctactcaagga
gcagcttcaccgcaattcacattacctttttcatcagatgggaccactgatagtggacta
gataatgctggttgttctaactctggtaatgatcagttttttacttggacggctactagt
ctttctttaacatttaattcattgtcaccaggtaatccaggtgttgcagtttatgatgga
tccatgacattaatttcatgtactgatacatttgtgtctggtcaaacagtttcaggatgg
gcgcttaatgataatgtagtaattaagatatttgattttcaaggttccaatgcggatgtt
gcatttgacctattcacaattccttgtccagctcctgataatctagatgtgactccatca
attacctctgccgacgtcacttggactaataattctacttctacagaaacaatattagag
tatggaattagtggctttaccgcaggttctggaactactataaacatatctggtggactt
acaacagcaacgatccctagtttaatggcaaatacagaatatgattatatactaactcag
gattgttctgctacgggagatggtacttccacggaagcaactggaagttttacaacatta
tgtaacccaataaccccagattatctggctgatatgtctttaaatgttcccgattgttgg
gctgaagcaaatagcggtaacgctgctagcgggccttcggatttaggcgcaggtttatgg
agtgcttcaaatcataatggaacgccgagtaatagaatcaatttattctctaatactaga
agcgactggattatatctccagtttttgatttatccacagctgctccaagtgaacttaat
atttatgtagcactaacagaatcttctacaagtggaacaggagctgatttaggctctgat
gatagagttagcctgttgatgactaccgacaatggtgcgacatggacagaaatgcaagct
tgggtacaaggtactgttccaacggacattggtgaatctataacgtatgacttatcaagt
attactggtagtgttcaatttgcttttcttggtgatgaaggaagtgtaaacgatcttgaa
gacgtttactttcacgtaagtacatttcaagttagggaaacaccaacttgtccagatact
ataaatctgactttattaagttttactgatgtagatgctactataaattttgatagtggt
aatgtttcaagtttaggaaattacgagtattcgttaaccacagtttcaggagctactcca
gcagtttcaggttcatggacagacgttgctggagcaaatcctaacgttacttatacaatt
tcaggtttgagcccagaaactgaatactttgttcatgttagggaggtttgtgctgttggt
aatgaaggtccttggtctattactcctgtaacttttacaacagcttgttctcctatcgca
gctccatatttagaagattttgaaatgttcacaacttcaacatctgcatttacatcagga
aattgctggtcaggaacgggaggatcttatttttgggaaactgctcctggaactgatact
agttctacgggaacaggtcctgcaccatctattactaccggaaattatttctttacagaa
gcaacatcaggttcaatgggagatacaacagacttaatctctccattagtagatttaaca
gcacttactgctcctgcactttctttcaattaccacatgtttggtgaagacatgggaact
ttagatgtattagttaatggaacaacaaatgtttggacattaagtggtgagcaacaaatg
agcgatactgatccttggagattagcagttgtagatttatctgcttttgcaggtcaaacg
atatctgttaccttcagaggaactaaaggcgtagactttgaaagtgatatggccattgat
aatgtagattttggcgaggcaccttcttgttttcctcctattaatattgcggttgtagca
acaacttttgatggtgcaactattgactttacaaacagcaatgcttcaacaaattcaaac
tttgaatatggtgctcctggatttactcaaggaacgggaattattttaccacaaaccact
agtacttttacagtaactggattgatgagcgctaccacttatgatttctatctacaaagt
gattgtggaatgggtgatgtaacaacttgggaagggccttttagcttcacgacagactgt
aattcatttaccgactttaatgaaaattttgatggagtatctacacctgatcttccagtt
tgctggacttcttttgttactactcctgcaggtactactgctgctgtagttcaaacaaat
acagctgcagataatagtccatctaatggtgtaagactatatagcggtagtttaacaggt
aatataggtagtggaactactgatgaaggagagactgtattgatttctccacaacttagt
aaccttgctgctggaacgcatagaattaaattctttgctgatgcaggaacggctacgagc
accttagaagtaggaacaatgactgatccaactgatccagcaacatttaccttacttggt
tcttttgcacctacaactactcatgctgagtatatacagaattttgatacctatacagga
acagacgagtacatagcattcagacatatttttgctggtacttttgacacgatgtattta
gatgatattgtttgggagccaattccttcatgtgtagctcccactgatcttgctttagtt
tctgctacagatactcaggtgactattggatggactaacaatgcaggtgctgctgcatct
tcagtgatttatggtgcacctggatttgaccctttagtagctggtactacggtagctggt
acgggagacatggcaactatcacaggtctggctgctgagacagcttatgatttttacgta
attcaagactgtagtgctacaggagacggtcagtcaagcacttctggtccattaagtatc
acaacaccttgcgcagcaattccagcaccgtattttgtagattttgagaatttctcagca
gcaacatctggttttgtaaatgaccaatgctggaatgaaataagttctaccatttatgat
tgggcaattgatgcttctggcgggactacctctagcgatactggaccatcaggtgcattt
agtggttctacttttatgtttgttgaatcaagtaacggagcagatggagatattgcaacg
gtactttcaccagctatagatctaactgctttgacagtaccatctttatcattttattat
catatgtatggtagtcaaatcactagtcttgaagtaggagtatcaacagataatggagca
acttttacgaatgaattaaccattactggtcaacaacaaatggatagtacagatccttgg
ttacaatctataattgatcttagcgcttatgcaaatcaaacggtgattgtaagctttacc
actacaaaaggaactggaactcttgcttttgaaggagatgtttccattgatgatgtgaac
tttgatgagttacctgtatgtaatgacgttactgctgtaacgattgattctgttacctcc
gattcggttacggtaagttggacagaaaatagtattccagcatctacagcttgggaagta
attgcagtgccagcaggtgatcctgctccagcggtaggaacaagtaacgcaactaccaac
ccttttacaatttcttctttgatgggtattacctcttatgatgtttatgtaagagcagat
tgtagtacggcatttgtggggccagttgcagctacgactgattgtcctgtttttgttccg
gatacttttgaggcatttaccacctttgttccagattgttgggatgttgcagatggtgga
gatctcactacgggacctactaatcttggaacatcacaatggtttgcagaagaatttgca
catgtaggttcaggtaatggagctgtaaatattaatttatatcgagcagtagtatctgac
tggatattatctcctatatatgacctttctgcaggtggctatgagttgaatttagacgtt
gcattgacagattttaacagcacagctgctggtgtaatgggatctgatgatttagttgct
ttagcctatactacagatggtacaacttggaccgcattgcaaacatgggatcttaacaat
caaccagcaacagcaggtgagacgtataacgacgctctaacaggtataaatagcacaact
gttcaattcggtatttatgcaactgacggtgcggttgacgatgttggtatcgattatgat
ttccatatcgataattttcaagtgagaactccacctacttgtccagatacttctaaccta
actttagttagcaatacagatgtaacagctaccataaattttgatagtggtaacgcaaca
agtaatggagactatgaatattctttaacaactgttgcaggtgctgcaccagctgtaacg
ggagcatggtctgatgtagcaggtgcaacaccgaatgtaacttatacgattatgggtctt
actgccgaaacagaatattttgtgcatgtaagagaagtctgtgctgtaggtgatgaaagt
gcttggacttttgtaccaattaatttcacaacagcttgcgcaccagtagctgctccatat
accgaagactttgaaatgttcacaacagctacttctgcatttgcatcagagaactgttgg
tcaggaactggcggagcatacttctgggaagcagctcctggaacagatacaggatcaggt
ggtactggaccaaacccttctataacaacaggaaattatttttacacagaggcatcaagt
ggtgttacaggcgatacaactgaccttgtatctccattagttgacttaacagcattaaca
gctccagcattatcattcaattaccacatgtttggtgctgagataggaactctagatgtt
ctagttaacggtagcgtaaatgtttggacattaagcggtcagcaacaagctgctgataca
gatccttttgaacttgctgtagttgatttagcagcttacgctggtcagaccatatcaatt
acatttagagccacaagcgcaggaatatttgaaggagatatagctatcgataatgtaagc
tttgacgaggctcctgcttgtgtaaatgtaaatggtgttactgttgattcggttacatct
gactctgcaacaataagctggttagaaaataatattccaccaggaacagcttgggaagta
gtgacagtgccagcaggagatcctgcaccagccgtaggaacaagtaatgctacaacaaat
ccattcaccattcctgcacttatggcaaatacttcttatgatgtttatgtaagagcagat
tgtagtactagttttgctgcaccagttaatttcacaacgctttgtaatacgtttacagcg
ccttacactgaagattttgaaaacgcaggagcaactcctgattgttggactcttggtggt
gatgaagactggttgttcaatttatcaggacctaatcaagtaggtaatggaggaacttta
tctggcgcaaccgcttctggtggttattatgccgtagtagatgactctacacctgatgct
agtaatgctcaaatggattctccatttgtagatatctctacattagcatctccagaatta
agtttttatttaatcagtgataatacaagcgatacacgtcctgttcctgttaacgcaact
cttacggtaagtgtttgggatggtgctgcatggaatgtagcaggtacttataatacggat
acagtaggttgggaattaagaacaatagatcttagtgccttcacttttactggaccagcc
caagcccgtttttctgttgcagactctggatcgttctatgatgatatcgcaattgatgac
gttacttttgatgaggcacttacttgtatcaatgtgtcagctataacagtagattctacg
acagcagactctattacggtaagttggacagaaaataatgtgccagcagcaactgcttgg
gaagtagtagcagtgccagcgggagatcctgcaccagctgtaggaacaagtaatgcgaca
acaaatccatttactattcctgcactcatggcaaacacttcttatgatatttatgtaaga
acagattgtagtacgacatttgcagcagcgataactgttactacagattgtacagtaaac
tcggtttacccttatgtaactgatttcactaacaacgtacctaatgcatgttgggacgag
gctggatctggagagattaccgatggtcctatgacagtaggtgcttctgaatggagagca
aatagatcttatgaagactttgcaggaaatgtaactcctagtaacgcgatgaacttatat
cgtaactcagatcgtgagtggttgctttctgagcaatatgatatgacaggtacatcaaat
gatgttctttctattgaagttgctgttacagattggactaatactggtgcatctgatgct
actgatacggacactatggggtcagacgatcaagtagatttattaattactacagatggt
ggtaccacatggacttctttaatgacctggaatgcagcaaatcaacctgctgtagatgga
actagagaagacatcgatttaagtgcctatacaggtacggttcaatttgcattctttgct
accgatggaaccgtagatgatacagaagactatgacttccatgtaggaatgtttatcata
gatggtaccgcaggtaataatgatgtatttgaaaactctttaagcttatatccaaatcct
gtaaatggtgatactgttactattagtatgagtaatacaaataacgcaagtgttcaaata
gcaatatttaatactttaggtcaacaagtattgacgagatcttatcctcaagcaacaaat
gaaatacgtattgataatctatctagattatcaaaaggtatgtacctcattaaagttacc
gatggaaaacaagagtccacccttaaatttattaaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system