Nonlabens dokdonensis: DDD_1532
Help
Entry
DDD_1532 CDS
T02441
Name
(GenBank) putative outer membrane protein probably involved in nutrient binding protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
ndo
Nonlabens dokdonensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ndo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ndo02000
]
DDD_1532
Transporters [BR:
ndo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
DDD_1532
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
TTR_TEN1-4
Ala_racemase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGC76659
UniProt:
L7W916
LinkDB
All DBs
Position
1645838..1648864
Genome browser
AA seq
1008 aa
AA seq
DB search
MNKFTLLLFYFVAFIGYAQQGIVTGKVLEASTGETLLGVTVQNVNAKTATTTDFDGAFSI
AASTGDVLRFSFIGTVTQDYTVVDFEPITITMQEDVAALDEVVVVGYGTQAVREVTGAVS
VVKSEVIENLKPSRVEEALQGQVPGVNVTSSSGSPGAGLNIRIRGIGTNGDNRPLILVDG
NIIEDLSVINPGDIESISVLKDATAGIYGVRGSNGVIIVTTKNGRKNQPLTVEYNSWGGF
QETSRKLPTLNSQQYALIKNEAFANNGEAIPFTNISDLTNTNYQDEVFENGFILNNDISL
RGGTEKSLYKLGVAVFNQDGIVGASKSDYDRFVMSGNFDHKWTKNLEMKTGFIYSYTSNR
NINDGGLGSVLFNAVNMAPTIPVRDAAGEFSLAEGLGNEVINPEAQLANTFNKNKVGKIS
GNFGLTYSFLDHFEATARIQANYSEAYGNNFNPRAFYGSGKVFNLTENVYSEYENFFSDY
TYDAFLKYKNTFAEKHNLQAMVGMSAFRTRGDFNDITGFGNVSNNYNEVSIAGADRTIDG
DLNGARRFDQRLLSHFLRVQYDYQGKYLFSGVIRRDGSTTFGPENKFGVFPSASVGWVAS
DEDFLKDNNFIDFLKIRASTGLIGNDRIGAFRFASLLTGEGQYVFNGQIINGTAIGALSN
PEIKWEEQFTSNVGVDMQFLSNKLNVSVDYFNRQTQDLLIAPDVSGILGSGAPGSAAPFI
NGGDIRNRGLEFSIGYSDQITDDFSFNVNYNLATLENEVLAVNNDNGFIEAGGFGVGQPP
ITRMQEGFTIGYFYGFQTDGIFQNAAEVAAHPSQIELGAEAQPGDFRYRDVNEDGMINLE
DRVELGDPLPDVTMGLNFSFNYKNWDFQSFFFASIGNDMVRNYERNQPLTNLTTNILNRW
TGEGSTNSFPRVTTGATANQVFSDFYVEDASFLRAQNLQIGYTLNESALNNVKLSKLRIY
SAVRNAFTLTKYQGFDPSASSGDPLASGIDNGFYPVARTFLIGINAKF
NT seq
3027 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaatttactttactccttttttattttgtggcttttataggttatgcacaacaa
ggtattgtaacaggaaaggttcttgaagcgtccacaggtgaaacattattaggtgttacc
gtacaaaatgtgaatgcaaaaactgccaccaccacagattttgacggtgctttctccata
gctgcatctactggagatgtgttacgattttcttttattggaactgtgactcaagattac
acagtggtagattttgagccaattacaattaccatgcaggaagatgttgctgctttagat
gaagtagttgttgtaggatatggtacacaagcagtgcgagaggttacaggtgcagtgagt
gtcgttaaaagcgaagtaattgagaatttaaaacctagtagggtagaagaagcacttcaa
ggtcaggttccaggtgtaaatgttacttcttcatctggatcgcccggtgctggtttaaac
atcagaattagaggaatcggaactaatggcgataatagacccttaatattagtagatgga
aatatcatcgaagatctaagcgttatcaacccaggtgatattgaaagtatatcggttctt
aaggatgctactgcagggatctatggggtaagaggttctaatggtgttatcattgttact
actaaaaatggaaggaagaatcaacctttaactgttgagtataactcatggggcggtttt
caagaaacttctagaaagttacctacattaaattcacagcaatatgcgctcattaaaaac
gaagcgtttgctaataatggagaggctattccttttacaaatatttccgacttgacgaat
actaattatcaagatgaagtttttgaaaatggtttcattcttaataatgatatttctttg
cgtggaggaacagaaaaatctttgtacaagttaggtgttgctgtttttaatcaagatggt
attgtaggagcaagcaaatcagattatgatcgatttgtaatgagtggtaattttgatcat
aaatggacaaagaatcttgaaatgaagacaggatttatctactcttacactagtaatcgt
aatataaatgatggtggtttaggttccgttttgtttaatgcggtgaacatggcgcctacc
attcctgtaagggatgctgctggtgagttttctctagcagaaggattgggtaatgaggta
atcaaccctgaagcacaactagctaatacgttcaacaaaaataaagtaggtaaaatcagc
ggaaattttggattaacctattcatttctagatcactttgaggctactgctcgtattcaa
gcaaattattctgaagcttatgggaataactttaatcctagagcattttatggttctggt
aaagtttttaatctcactgaaaatgtatacagtgaatacgaaaacttctttagtgattat
acttatgatgctttcttgaaatacaaaaacacttttgctgaaaaacataaccttcaggca
atggtaggtatgagtgcatttagaactcgaggagattttaatgacattacaggatttggt
aatgttagtaacaattataatgaagttagtatcgctggagcagatagaacaatagatgga
gatttaaacggcgctagacgttttgaccagcgtttactttcccattttttaagagttcaa
tacgattatcaaggaaagtatttattctctggtgtcatacgtagagatggtagtacaact
tttggtcctgaaaacaagtttggtgtttttccatcagcaagcgttggatgggtagcgtct
gatgaggattttttaaaggataataattttatagattttcttaagattagagcttctact
ggtctcataggtaatgatagaattggagcatttcgttttgcttctttattaacaggtgaa
ggacaatatgtttttaatggtcaaattattaatggtacagctattggcgctttgagtaat
ccagaaattaaatgggaagaacaattcactagcaatgtaggtgttgatatgcagttttta
tctaacaaattgaatgtttctgttgattatttcaataggcagactcaagatttattgata
gctcctgatgtatctggaattttaggatcaggtgctccaggatctgctgcgccatttatt
aatggtggtgatatccgtaatagaggattagaattctctataggttactcagatcaaatc
acagacgattttagttttaatgtaaattacaatttagcaactttagaaaatgaagttctt
gctgtaaataacgataatggttttattgaagctggtggttttggagtaggacaaccgcct
attactagaatgcaagaaggttttaccataggttatttctacggatttcaaactgatgga
atttttcaaaatgccgcagaagtggcggctcatccatcgcaaattgagttaggagctgag
gcacagcctggtgattttagatacagagatgttaatgaggatggaatgatcaatctggag
gatcgtgttgaattaggagatccattaccagatgttacaatgggcctcaacttcagtttc
aactataagaattgggattttcaaagtttcttttttgcttctataggtaatgatatggtt
cgtaattatgaacgcaatcaaccacttactaatttaactacaaatatcttaaatagatgg
actggtgaaggctctactaattcttttccaagagtaactactggggcaaccgcaaatcag
gtgttttcagacttttatgttgaagacgcttcatttttaagagcacaaaacttacaaata
gggtatacattaaacgaaagcgctttaaataatgtcaaattaagtaagctaagaatttat
tcagctgttagaaatgcatttacattgacaaagtatcaagggtttgatccaagtgctagt
tctggagaccctttagcaagtggtattgataatggtttctatccagtagcaagaacattt
ttaattggaattaacgcaaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
