Nonlabens dokdonensis: DDD_3138
Help
Entry
DDD_3138 CDS
T02441
Name
(GenBank) putative hemagglutinin/hemolysin-related protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
ndo
Nonlabens dokdonensis
Pathway
ndo02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ndo00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
DDD_3138
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
CHU_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGC78265
UniProt:
L7W977
LinkDB
All DBs
Position
3380122..3385806
Genome browser
AA seq
1894 aa
AA seq
DB search
MSQIVHAQCPTIPVGTQIICDAAGLDFNDLDAFATPASGSDVRWYLNPTGGSPLPDIQLV
REGTYYAGDSSGSCGTRPALVIDFEVDRTLQSLDAIFCSNENPTIQSYIDEALAVSIPSG
GSVQIYSDFLLTTQLNPSMMLSGNANYFIVFIDSSGCRSQIQTGSTAVFPSPAVPMPPLV
QQFCSDTNPVVNDLNPGTTDNFSWFSSVDGSNNPIPPAFAGTEALIDGATYYVQADNFFC
DSDPVAIVVEIDDPANAGMSNTEEYCENNVPTTDIDLFPLLGPLADNGGAWTGPLPTANG
DQGTINLTGQGIGVYNFVYTVAGQGACPDETATISIEILQILSSGVASAASPVSFCVAQL
PSSYDLTLLLDNEDAGGTWTQGTTSAAPIVASSIDLTSFMPGVYDFTYVQNALPNPCPEN
TTTVQVIVLEDPNAGMAVTTQFCENDLAASSPFDLFNSLDGSQDNNLGIWTDASSATISN
TIDITNFNVLDSPYTFTYTIDNGSCQDSESISIEILEAPESGNYIGTPFTVCEDQTAANS
PYDLFNLLDGTQDTNGTWFEGATSTGTAVTNPIDLTTLGTGTFDFTYSVPAIGTCTDNDV
TVTLVINPLPNTGTPTPLVVCENDLAANSPVDLFNQLSGQDAGGMWSDDDGTGALAGSNV
DITGFTIGSFNFSYSITDANGCMNSSTVVITIEPAPESGNYVGTPFTVCEDQTAANSPYD
LFNLLDGTQDTNGTWFEGATSTGTAVTNPIDLTTLGTGTFDFTYSVPAIGTCTDNDVTVT
LVINPLPNTGTPTPLVVCENDLAANSPVDLFNQLSGQDAGGMWSDDDGTGALAGSNVDIT
GFTIGSFNFSYSITDANGCMNSSTVVITIEPAPESGNYVGTPFTVCEDQTAANSPYDLFN
LLDGTQDTNGTWFEGTTSTGTAITNPIDLTTLGAGSFDFTYSVPAIGTCTDNDVTVTVVI
NPLPNTGTPTSLVVCENDLAANSPVDLFNQLSGQDAGGMWSDEDATGALNGSIVDITMLS
VGTFDFSYSITDSIGCSSFTIVTITVEPAPESGNYIGTPFTVCEDQTAANSPYDLFNLLD
GTQDTNGTWFEGATSTGTAVTNPIDLTTLGTGTFDFTYSVPAIGTCTDNDVTVTVVIDAF
VSAGTDIPYVVCENELINNSPLDLFNQLAGQVSGGSWSDDDNTGLLTGNNVDLTGLAIGD
YNFTYTVSNGSCSDSETVLVSVIPAPDAGTATNFGICLSDVTTNQTIDLFSQLVGNDLGG
IWSDDDTTGELNGSVVNLSNLNAGVFNFTYTVLPSANCSSDAETVQVIINDITPPTTTPD
QIFCDQATVSDLVATGNSITWYSDASLTMPLGLGDSLIDGEDYFATQIDPITNCESSLSS
STLVTINISPNSGNEIPTTVCNDQNMVDLFLSLDGTQDSGGIWVDTDNTGALINSIFDAS
SVADGTYNFEYLVAGIAPCNDASTLISLTVQSPVNAGNDAVLDTCSDATAIDLFTLLGTS
VTTGGIWSPAMTSGTGLFDPSVDPSGSYTYTVSNTCNVSTAMVDVTVTEAPDAGNDNLIS
LCVIDGTLDLLTQLGGTPDANGVWSPLLNSGTNIFDPVLDGSGTYTYTVTATAACVNDAS
ATLTISVGESPAPTLVNAGLFFCATDNATVIDLDASVTGTMIMWYDAIDATTPLLSTDLL
IDGQTYFATQTTSSGCESSERTQVMVEIGDAPTPTLAQDGELFCINDNPTLQQLTLNIQE
YAASLNNVIWYDSPTGTNSITLSTVMTIGTTYYAVLIDPLTGCESSVRLAVTVDLSACGN
LTIPDGFSPNGDGVNDVFDIDNLDFLYPNFDIEFYNRYGNLVYSGNINTPRFNGFSNQSG
LLNDGELPVGVYFYILKYNDGTTKPSQGRIYLSR
NT seq
5685 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtcccaaattgttcatgcgcaatgtccaactattccagtaggtacacaaataatttgt
gatgcagctggactagatttcaatgatttagatgcttttgccacaccagcttctggtagt
gacgtacgatggtatctcaatcctactggaggatcgcccttaccagatattcaattagta
cgtgaaggaacctattacgcaggtgatagtagtggtagctgcggcactcgtcctgcttta
gtaattgattttgaagtagatcgaacgcttcaaagtcttgatgctattttttgctcaaac
gagaacccaacaattcaatcctatatcgacgaagcgctagcagtaagcattccatctggt
ggaagcgtgcaaatttatagtgatttcctactcaccactcaattgaatccgagtatgatg
ctttccggaaatgcaaattattttattgtttttatcgattcttcaggatgcagaagtcaa
attcaaacaggaagtacagccgtttttccttcaccagctgttcctatgcctccattagta
cagcagttttgttctgatacgaaccctgtagttaatgatttaaatcctggaacaactgat
aacttcagttggttcagtagtgtcgatggttctaacaatcctattccgccagcttttgca
ggtacagaagctttaatagatggcgctacctattacgtacaagccgataattttttctgt
gacagtgatcctgtggcaatcgttgttgaaatagatgatcctgcaaatgcaggtatgagc
aacacagaggagtattgtgaaaataatgttccaacaactgatattgatttatttccgctt
ttaggacctttggctgacaatggaggagcgtggactggtccacttcctactgcaaatggt
gatcaaggaactatcaacttaactggtcaaggaataggcgtttacaactttgtctataca
gttgccggtcaaggagcttgtccagatgaaaccgcaacgattagcattgaaatactacag
attttatcttctggagtagcttctgctgcaagcccagtgagtttttgtgtggctcaatta
ccgtcttcttatgatttaactttattattagacaatgaagatgctggcggaacttggact
caaggaacaacaagtgcagcaccaattgtcgcatcttctattgatttgactagcttcatg
cctggagtttatgattttacttacgttcaaaacgcgctacctaatccttgtccagaaaat
actactaccgttcaggtcatagttctggaagaccctaatgctggaatggcagtaaccact
caattttgtgaaaatgatttagctgctagttctccttttgatttattcaacagccttgat
ggttcacaggataataacctaggaatatggactgatgcgtctagtgctacgatctcaaat
acaatagacatcactaattttaatgtattagatagcccgtacacttttacttatacgata
gataacggatcttgccaagattcagaaagtattagtatagaaattttagaagctccagaa
tctggtaactatattggaactccgttcacggtttgtgaggatcaaacagctgccaactcg
ccttatgatcttttcaatttactagacggaacacaagatactaatggaacttggtttgaa
ggagctacttctactggaacagcagtaactaatccaattgatttaacaacattaggaaca
ggaactttcgattttacttattctgttcctgccataggaacttgtactgataatgatgtt
acagttacgctagtaataaatccgctacccaatacgggaactcctactccattagttgtt
tgtgaaaatgacttagccgcaaattcaccggtagatctattcaatcaactatctggtcaa
gatgctggcggtatgtggtctgatgatgatggtactggagcattagctggaagtaatgtt
gatattactggatttacgataggtagtttcaacttctcttattccataaccgatgctaat
ggatgtatgaactcttctacagttgtaattacgattgaaccagctccagaatctggtaac
tacgttggaactccgttcacggtttgtgaagatcaaacagctgcaaattcaccttatgat
cttttcaatttacttgacggaacacaagatactaatggaacttggtttgaaggagctact
tctactggaacagcagtaactaatccaattgatttaacaacattaggaacaggaactttc
gattttacttattctgttcctgccataggaacttgtactgataatgatgttacagttacg
ctagtaataaatccgctacccaatacgggaactcctactccattagttgtttgtgaaaat
gacttagccgcaaattcaccggtagatctattcaatcaactatctggtcaagatgctggc
ggtatgtggtctgatgatgatggtactggagcattagctggaagtaatgttgatattact
ggatttacgataggtagtttcaacttctcttattccataaccgatgctaatggatgtatg
aactcttctacagttgtaattacgattgaaccagctccagaatctggtaactacgttgga
actccgttcacggtttgtgaagatcaaacagctgcaaattcaccttatgatcttttcaat
ttacttgacggaacacaggatactaatggaacttggtttgaaggaactacttctactgga
actgcaataaccaatccaattgatttaacaacattaggagcaggaagttttgatttcact
tattccgttcctgccataggaacatgtactgataatgatgtcacagtaaccgtagtaata
aatccgctacccaatacgggaactcctacttcattagttgtttgtgaaaatgacttagca
gcaaattcaccggtagatttattcaatcaactatcaggtcaagatgctggtggtatgtgg
tcggacgaagatgctacaggcgcgctgaatggtagtatagtagatataaccatgctaagt
gtaggtacctttgacttttcctattctattactgactcaattggttgttctagttttacc
atagtaacaataacagtagaacctgctccagaatctggtaactacattggaactccgttc
acggtttgtgaagatcaaacagctgccaactcgccttatgatctttttaatttactagac
ggaacacaagatactaatggaacttggtttgaaggagctacttctaccggaacagcagta
accaatccaattgatttaacaacattaggaacaggaacttttgattttacttactccgtt
ccagcaataggaacttgtaccgataacgatgtcacagtaactgtagttatagatgcattt
gttagtgctggtactgatattccttatgtagtttgtgaaaatgaattaatcaacaattca
cctttagatttattcaatcagttagcagggcaagtttctggaggaagttggtccgatgat
gataatacaggtttactgactggaaataatgtagatttaactggtctagctataggagat
tataattttacgtacaccgtaagcaatggctcttgttcagattctgaaactgtacttgtc
tctgtaattccagctccagacgccgggacggcaactaattttggtatttgtttatctgat
gtaactactaatcaaacgatagatttattcagtcagttagtaggaaatgatctaggagga
atttggtcagatgatgataccactggtgaactgaatggttcggtagtcaacctatctaat
cttaatgccggagttttcaattttacttatacagtgcttccttcagctaattgtagttcg
gatgctgaaacagttcaagttattataaatgatattacgcctcctaccacaacacctgat
caaatcttttgtgatcaagcaacagtaagtgatctagtagcaacaggaaactctattaca
tggtacagtgatgcatcccttacaatgccattaggtcttggtgattctctgattgatgga
gaagattattttgccactcaaatagaccctattacaaattgtgagtcaagtctatcgagt
agtaccttagttactattaatatttctcctaattccggaaatgaaataccaactaccgtt
tgtaatgatcagaatatggtagatcttttcctaagtttagatggtacgcaagattctggt
ggaatatgggttgacactgataacactggagctttaataaacagcatatttgatgcctca
tccgttgctgatggcacctataattttgagtatttggtagctggtattgctccttgtaat
gacgcttccaccttaatatcattgactgtacagtctccagtaaatgcaggaaacgatgca
gtcttagatacatgttcagacgctacagctattgacttatttactttactcgggacatca
gttactaccggtggtatctggagcccagctatgacaagtggtacaggtttatttgaccct
tcagtagatccttcaggatcctatacttacacagtttctaacacctgtaacgtttcaaca
gcaatggttgatgttactgtaaccgaagctcctgatgcaggaaatgacaacttaatcagt
ttgtgtgttatagatggtacattagacttactcacacaattaggaggaactccagatgcc
aatggtgtatggtcacctctattaaatagtgggactaatatttttgatcctgttttagac
ggttcgggaacttacacatatacagtgaccgctactgcagcttgtgtaaacgatgctagt
gctacattaaccatttcagtgggtgaaagtcctgcacctacattagtaaacgcagggctc
ttcttctgtgcgacggataatgcaacggtcattgatcttgatgcctcagttaccggtacg
atgatcatgtggtacgatgccatagacgcaacgacgccacttttatcaacggacctctta
attgatggacagacatattttgcgacacaaactacatcaagcggatgtgaatcaagcgaa
cgaactcaagtcatggtagaaataggagatgctcctactcctactttagcacaagatggt
gagttattttgcattaatgacaatcctacattacaacaattgactctcaatattcaagag
tatgctgctagtttaaataatgttatatggtatgactctccaactggaacaaattcaatt
actttatcaacggtaatgaccataggaactacttattatgctgttttaatcgatccatta
actggatgtgaaagtagtgtaagattagctgtgacagtggatttatctgcttgtggtaat
cttactattccagatggtttttctcctaatggagatggagttaacgatgtttttgacatt
gataatttagactttctctatccaaattttgatatcgaattctataacagatacggcaac
cttgtttatagcggaaatatcaatacacctcgatttaacggttttagcaatcaatcaggt
ctattaaacgatggtgaattaccagtaggtgtttacttctatattctcaagtacaatgat
ggtacaacaaagccttcacaaggaagaatatatttaagtagataa
DBGET
integrated database retrieval system
