Nostoc edaphicum: HUN01_26040
Help
Entry
HUN01_26040 CDS
T07001
Name
(GenBank) FG-GAP repeat protein
Organism
ned
Nostoc edaphicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FG-GAP
HemolysinCabind
Cadherin_5
Big_9
Cadherin_4
FG-GAP_2
FG-GAP_3
Cadherin_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMS90872
UniProt:
A0A7D7LHH4
LinkDB
All DBs
Position
5535088..5540247
Genome browser
AA seq
1719 aa
AA seq
DB search
MANAVLNLSELNGSNGFVINGIAQFDYSGRSVSSAGDINGDGFDDLIIGATGADPNGQSG
AGSSYVVFGSNSGFDAQFNLSTLNGSNGFVINGIAQFDYSGRSVSSAGDINHDGIDDLII
GAGSSYVVFGSNSGFDAQFNPSTLNGSNGFVINGIGSPVSSAGDINGDGFDDLIIGAPNA
DPNGQYNAGSSYVVFGSNSGFDAQFNPSTLNGSNGFVINSIAAYDRLGSSVSSAGDINGD
GFDDLIIGAPNADPNGQYNAGSSYVVFGSNSGFDAQFNLLSLNGSNGFVINGIDGIDRLG
SSVSSAGDINGDGFDDLIIGAPGVSTNGQSGVGSSYVVFGSSSGFAANLNLSTLNGSNGF
VINGIDSDDNSGSSVSSAGDINGDGFDDLIIGAPFADPNGQSGAGSSYVVFGRSSSFGAQ
FNLSSLDGSDGFVINGIPFDRSGSSVSSAGDINGDGFDDLIIGVITASPNGQLYAGSSYV
VFGFASPTPTNKPPIAVNDTATTDEDTAVNIDVLANDSNSLGVTAINGRTVVVGTAITLS
SGALVTLNANGSLTYDPNAQFESLAVGESGSDSFTYTTNNGSLNNTASVNLTINGVNDAP
QVTSFNLSSLNGSNGFVINGIDAFDNSGSSVSSAGDINGDGIDDLIIGATGASPNGQDSA
GESYVVFGSNSGFDAQFNLSSLNGSNGFVINGIDERDYSGVSVSSAGDINGDGFDDLIIG
APDASTNDQYNNVGSSYVVFGSNSGFDDQLNLSTLNGSNGFVINGIDRYDYSGRSVSSAG
DINGDGFDDLIIGAGNASPNGRSTAGSSYVVFGSNSGFDAQLNLSSLNGSNGFVINGITE
SDRLGSSVSSAGDINGDGFDDLIIGARGADPNGQYGEGSSYVVFGSNSGFDAQLNLSTLN
GSNGFVINGIDERDYSGGSVNSAGDINGDGFDDLIIGARGADPNGQYAEGSSYVVFGSNS
GFDAQFNLSTLNGRNGFVINGITESDRSGYSVSSARDINGDGFDDLIIGAPNADPNGQYA
AGSSYVVFGSNSGFDAQINLSTLNGSNGFVINGIAAYDISGRSVSSAGDINGDGFDDLII
GARGADPNGQSGAGSSYVVFGFQTTATTNEDTAVNILASNILRRYTDVDSDTLTISDFTS
PTNGTLSLNDNNTPDNPGDDFFIYTPDANFNGTDSFTFTVSDDNGGTITNTFNLNVKPVN
NAPIAVNDRLTTGFNTAVTILATTLLANDTDIDSSNLSITGVSGATNGTAVLNDNGTPGN
STDDFIVFTPINGFSGDANFNYTISDGSLTSTARVAIAVGANISGGGGNDNISAGEGNDN
ISGGGGNDTIAGNGGDDTISGGAGNDNISGGNGNDLLLGGNGSDTIAGNEGNDNISGGNG
NDFLLGGNGSDTIAGNGGNDTISGGNGNDTFVFRLGDGNDTIADFTGTGIGSNPSATVIS
QLDTLQFIGSGLTARNLQLTQNGDNLELTFLDAASTKVTLQNFQLENLDNLPATGNILFD
GQTSVTDSFDVFNANSTQTNLFNKNTVTFLNDLNNNVAGFNNSNDVINGQGGNDIINGNS
GDDLLRGGSGDDILIGGEGNDTLVGGRGNDILIGGVGADFFLYNSNADFTTTAVGIDAIA
DFNSSEGDKIVLDKTTFSAFPLRVAVGIASAPGTGFSNTNDFQITSSAAASTAKIVYDSV
SGQLFYNQNGSAAGFGSGGLFATLTGAPTLTASDFMLQA
NT seq
5160 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaatgcagttttaaatctatctgagcttaacggcagcaacggctttgtgattaac
ggcattgctcaatttgactactcaggcagatctgtcagcagtgcgggggacatcaacggc
gacggctttgatgacctgattatcggggcaacaggtgccgaccccaacggtcagtctggg
gcagggtcaagctacgtggtgtttggcagcaatagtggctttgatgcccaatttaacctc
tcaaccctcaatggcagcaacggctttgtgattaacggcattgctcaatttgactactca
ggcagatctgtcagcagtgcgggggacatcaaccacgacggcatcgatgacctgattatc
ggggcagggtcaagctacgtggtgtttggcagcaatagtggctttgatgcccaattcaac
ccctcaaccctcaatggcagcaacggctttgtgattaacggcattggcagtcctgtcagc
agtgcgggggacatcaatggcgacggcttcgacgacctgattatcggtgcaccaaatgcc
gaccccaacggtcagtataatgcagggtcaagctatgtggtgtttggcagcaatagtggc
tttgatgcccaattcaacccctcaaccctcaatggcagcaacggctttgtgattaacagc
attgctgcgtatgacagattaggtagttctgtgagcagtgcgggggacatcaacggtgac
ggctttgatgacctgattatcggtgcaccaaatgccgaccccaacggtcagtataatgca
gggtcaagctatgtggtatttggtagcaatagtggctttgacgcccaattcaacctcttg
tcccttaacggcagcaacggctttgtgattaacggcattgatgggattgacagattaggt
agttctgtcagcagtgcgggggacatcaacggcgacggcttcgacgacctgattatcggt
gcaccaggtgtctctaccaacggtcagtctggggtagggtcaagctacgtggtgtttggc
agcagtagtgggtttgcagccaatcttaacctctcaaccctcaatggcagcaacggcttt
gtgattaacggcattgactcagatgacaactcaggcagttctgtcagcagtgcgggggac
atcaatggcgacggcttcgacgacctgattatcggtgcaccttttgccgaccccaacggt
cagtctggggcagggtcgagctacgtggtgtttggtcgcagtagtagctttggtgcccaa
ttcaacctctcgtccctggatggcagtgacggctttgtgattaacggcattccgtttgac
agatcaggcagttctgtgagcagtgcgggggacatcaacggcgacggctttgacgatctg
attattggggtaattactgcctcccccaatggtcagctttatgcagggtcaagctacgta
gtctttggttttgcatctcctacgcctacaaataaacctcctatcgcggttaatgatacg
gctaccaccgacgaagacactgccgttaacatagatgtcttagctaacgacagcaactcc
ctaggggtgacagctattaatggtaggacagttgttgttggcactgccattactctgagt
tctggtgccttagttacccttaatgctaatggcagcttgacctacgacccaaatgctcaa
tttgaaagcttggctgttggtgaaagcggcagtgatagctttacgtacaccaccaacaat
ggcagcttgaataatacagctagtgtcaacttgaccattaacggagtcaatgacgcacct
caggttacttcatttaacctctcgtcccttaacggcagcaacggctttgtgattaacggc
attgatgcgtttgacaactcaggcagttctgtcagcagtgcgggggacatcaacggtgac
ggcatcgatgacctgattatcggggcaacaggtgcctcccccaacggtcaggatagtgca
ggggagagttacgtggtgtttggcagcaatagtggctttgatgcccaattcaacctctcg
tcccttaacggcagcaacggctttgtgattaacggcattgacgagcgtgactactcaggc
gtttctgtcagcagtgcgggggacatcaacggcgacggcttcgatgacctgattatcggt
gcaccagatgcctctactaacgatcagtataataatgtcgggtcaagctacgtggtgttt
ggcagcaatagtggctttgatgaccaacttaacctctcaaccctcaatggcagcaacggc
tttgtgattaacggcattgatagatatgactactcaggcagatctgtcagcagtgcgggg
gatattaacggcgacggcttcgatgacctgattatcggggcaggaaatgcctctcccaac
ggtcggtctacggcagggtcaagctacgtggtgtttggcagcaatagtggctttgatgcc
caacttaacctctcatccctgaatggcagcaacggctttgtgattaacggcattactgag
tctgacagattaggtagttctgtgagcagtgcgggggacatcaacggcgatggcttcgat
gacctgattatcggggcaagaggtgccgaccccaacggtcagtatggggaagggtcaagc
tacgtggtgtttggcagtaatagtggctttgatgcccaacttaacctctcaaccctgaac
ggcagcaacggctttgtgattaacggcattgatgagcgtgactactcaggcggttctgtg
aacagtgcgggggacatcaacggcgatggcttcgatgacctgattatcggtgcaagaggt
gccgaccccaacggtcagtatgcggaagggtcaagctacgtggtatttggcagcaatagt
ggctttgatgcccaattcaacctctcaaccctcaatggcaggaacggctttgtgattaac
ggcattactgagtctgacagatcaggctattctgtcagcagtgcgagggatatcaatggc
gacggcttcgacgacctgattatcggtgcaccaaatgccgaccccaacggtcagtatgcg
gcagggtcaagctacgtggtctttggcagcaatagtggctttgatgcccaaatcaacctc
tcaaccctcaatggcagcaacggctttgtgattaacggcattgctgcgtatgacatctca
ggcaggtctgtcagcagtgcgggggacatcaatggcgacggcttcgatgacttgattatc
ggtgcaagaggtgccgaccccaacggtcagtctggggcagggtcaagctacgtggtcttt
ggctttcaaactacggctaccactaatgaagataccgccgttaacatccttgctagcaat
attctacgtagatacacagatgtcgatagcgatacattaactattagtgacttcaccagc
cccactaacggcacactgtcacttaacgacaacaacactccagacaaccccggtgacgac
ttcttcatctacacccccgatgccaacttcaacggcactgacagcttcactttcactgtc
agcgacgacaatggcggtaccattactaatactttcaacctcaatgtcaagcccgttaac
aatgcacccattgccgtcaacgatcgcctaactactggttttaatactgctgtcaccatc
cttgctactactctgctagctaatgatacagacatcgatagcagtaacctcagcattact
ggggttagtggtgcaaccaatggcactgctgtgctgaatgataacggcactccgggcaac
tcgacagatgatttcatcgtgtttaccccaattaatgggtttagtggtgatgccaatttt
aattacaccattagtgatggtagcctgactagtactgctagagttgcgatcgctgttggt
gctaatatctctggcggtggcggcaacgataacatctctgctggtgagggtaacgataac
atctctggcggtggcggcaacgatacgattgctggcaatggaggcgacgataccatctct
ggtggtgccggcaacgataacatttccggtggcaatggcaatgacttgttgcttggtggc
aatggcagcgatacgattgctggcaatgagggcaacgataacatctccggtggcaatggt
aatgactttttgcttggtggcaatggcagcgatacgattgctggcaatggaggcaacgat
accatctccggtggcaatggcaacgatacttttgtcttccgccttggtgatggaaatgac
actatcgccgattttactggaacaggaattggctcaaatccatcagcaacggtgattagc
caactggatacgttgcaatttattggtagtggtttaactgcccgaaatctgcaactaact
caaaatggtgataacttagaactcacctttttggatgcggcttctacgaaagttaccttg
caaaacttccaattagaaaatctggataacttacctgcaactggtaatatcctgtttgat
ggacaaaccagtgtaactgacagttttgatgtcttcaatgccaactccactcaaactaat
ctctttaacaagaacactgttactttcctcaatgaccttaacaataacgttgcgggtttt
aataactccaatgatgtaattaatggtcaagggggtaacgatatcattaatggtaatagt
ggtgatgaccttttgcggggcgggtcaggcgatgatattctcatcggtggagaaggcaat
gatactcttgtgggtggcagaggcaatgatattctcatcggtggtgtaggtgctgacttt
ttcctttacaacagcaatgctgactttactaccactgctgttggtattgatgcgatcgct
gatttcaacagttctgaaggtgacaaaattgtactggataagactacctttagtgcgttc
ccgcttcgggttgccgtaggcatcgcttctgctccgggaacaggtttcagtaataccaat
gattttcaaatcacttcttcagcagcggctagcacggcaaaaattgtctacgattctgtg
agtgggcaattgttctacaaccaaaatggcagcgcggctggttttggcagtggtggtcta
tttgcaactttaactggtgcgccaactctcacggcatcagattttatgttgcaggcatag
DBGET
integrated database retrieval system
