Nostoc edaphicum: HUN01_30500
Help
Entry
HUN01_30500 CDS
T07001
Name
(GenBank) iron uptake porin
Organism
ned
Nostoc edaphicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OprB
SLH
BBP2
KdgM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMS91717
UniProt:
A0A7D7QBJ2
LinkDB
All DBs
Position
complement(6577537..6579159)
Genome browser
AA seq
540 aa
AA seq
DB search
MQKFCKYLIVSPAVCSVMLFVNTAAFAGETSSNSEINQPQVLANPDTKTQNIAPDQIMGQ
VTSVSQFSDVQPTDWAFQALQSLVERYGCIAGYPNSTYRGNRALTRYEFAAGLNACLDRV
NELIATATGDLVNKEDLATLQKLQEDYSAELATLRGRVDAVEVRTAELEANQFSTTTKLQ
GQVVAVVSDVLSGNTVNGAEITDENTTLGVRARVEFVTSFTGQDTLFTRIQANNILSPNI
GTPEGNLFFAGEDGTTNAAIDALFYRFPLGEKTQVIAIANAGAADDITSTVNIFDGDGAF
GALSTFGTRNPIYSQIGGAGLGVTHEFSDKLALSLGYLSGTANDPTLNNGLFNGAYGALA
QLTVKPSDRISIGLTYINSYNQPLLTGSNAATFQDIAAIQGLPEDQVGFSSNSYGVQASI
GITDNIVLGGWAGYTNSQSLRGTSGDVDIWNYAVTLGFPDLGKKGSLAGIIAGVEPKLTS
SSIAGLDSDPDTSYHLEAFYQYKLSDNITITPGVIWLTSPDHNNSNDDVVIGALRTTFSF
NT seq
1623 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaaattctgtaaatatctgatagttagtccagcagtttgtagcgtaatgctattt
gtgaatactgctgcatttgcaggtgaaacttccagcaattctgaaatcaaccaaccgcaa
gttttagccaatccagatacaaaaactcagaacatagcgccagatcagataatggggcaa
gttacctccgtgtctcaattttctgacgtacaacccaccgactgggcattccaagcattg
cagtcgttagttgagcgctatggctgtattgcaggatacccaaatagcacttatcgcggt
aatcgggcattaacgcgatatgagtttgctgccggtttgaatgcttgtcttgatcgggtt
aacgaactaattgcaacagctacaggcgatttagttaacaaagaagatttagccacatta
caaaagctgcaagaagattattccgcagaactggcgacactgcgaggtcgtgtagatgca
gtagaagtacgcactgctgaattggaggcgaatcagttctcaaccacaaccaaactgcaa
ggacaagttgttgctgtcgttagcgatgttttgtcaggaaatacagtcaacggtgcagaa
attacagacgagaatacaacattaggagtacgggcgcgggtagaatttgtcaccagcttc
acaggacaagatacgctctttaccagaatccaggctaataatattcttagtccgaatatt
ggtacaccagagggtaacttattctttgctggcgaagatggtactactaatgcagcaata
gatgcactcttctacagatttcctttgggcgaaaaaacacaggttatcgcgatcgctaat
gcaggtgcagcagacgatattactagcactgtcaatatctttgacggtgatggtgctttt
ggtgctttgtctacctttggtacacgcaacccaatttatagccaaataggcggcgcgggg
ttgggagtaacgcacgagttcagtgacaaattggcactaagtctagggtatttgagtggt
acagcgaatgatcctaccctcaataatggtttgttcaatggtgcttatggtgcattggca
cagttgacagttaaaccaagcgatcgcatttctatcggtttaacttacatcaattcctac
aaccaaccactactcacaggtagcaatgccgccactttccaggatatagcagctatccag
ggtttaccagaagatcaagtaggattttccagtaattcttacggcgtccaagcatccatt
ggcatcactgataacattgttttgggtggttgggctggatacaccaacagtcaaagttta
agaggaaccagtggagatgttgatatttggaactatgctgtcacccttggcttccctgat
ctcggtaaaaaaggaagtttggctggtattattgctggtgtggaacctaaattaacaagt
tctagtatcgcaggattggatagtgatcctgatacgtcctatcatcttgaagctttctac
cagtataagctgagtgacaatatcaccattactcctggagttatttggttaacatcccca
gatcacaataacagcaatgatgatgttgtgattggtgcattgagaaccacatttagtttc
taa
DBGET
integrated database retrieval system