Nostoc edaphicum: HUN01_33070
Help
Entry
HUN01_33070 CDS
T07001
Name
(GenBank) AMP-binding protein
Organism
ned
Nostoc edaphicum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
Acyl-CoA_dh_1
Acyl-CoA_dh_M
Acyl-CoA_dh_N
PP-binding
AMP-dom_DIP2-like
Acyl-CoA_dh_2
DUF7080
ACOX_C_alpha1
Mug62
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QMS92192
UniProt:
A0A7D7LJ55
LinkDB
All DBs
Position
complement(7247487..7251233)
Genome browser
AA seq
1248 aa
AA seq
DB search
MISRQRENFSIALEEAVTLPDVLQVWIQEQPNSIGFNFLQDRENLTLTYQELEGQARAIA
THLQALNWQKERVLLMYPPGLELIAAIMGCFYAGVIAVPVYPPRRNRNLDRLLAIASDAQ
PSGILTTVALSSSLRETAKETAIATLPIITTDSISLDLADAWQRPSVNADSIAMLQYTSG
STGTPKGVMLSHGNLLHNLAQIYHRFGHSFSSKSVCWLPPYHDMGLIWGIFEPLYGGFPV
TLMAPVVFLQKPIRWLQAISQTRATTSGAPNFAYEMCLHNIRSEECQDLDLSSWEIAFTG
AEPIRAQTLEKFATTFAQYGFRREAFYACYGLAEATLFVTGGDKDKPPTIENLTDQKAIV
GCGCASAEQTVIIVDPESQKPRLEGEEGEIWVRGASVAQGYWGRLEETAATFRATLASVA
GSFLRTGDLGFLRGEELFVTGRIKDVIIIRGQNYYPQDIEASVGQSHEMLNPHWGAAFSV
EISGEERLVVVQEVERSAWRSLDTAAMITAIRGAISREHELQVYAICLLKPSSIPKTSSG
KVQRHACQAGFINQSLDVIYQWEVEDITPPALTRTLPLQRGGLGSGDLVGSKYKTDNLIE
WLRDYANHHINSRLMDERRCIPPHIVLDFGNRGLLGMQVPPSYGGLGLGYTDTIRIIQQL
GAIDSTLALFVGLNNVLGIRPILLHGTSSLKEELLPMLATGRELAAFALTEPGAGANPQA
IASQAIANGNGWRLRGEKIWSGSAAWAGVINVFVQHQHQGISGFAVRRGSPGLRQGKEAL
TMGMRGMVQNTVYLEDVPVTSEQLLGGVGTGMSVAQDAMMYGRLAIAAVCVGGMKRCLQL
MWRYSERRQIATGRLLEHPVVFHRLAELTEAITAVETLVMRICELLDQGITVPVEAYTAC
KISAPEFYWQSADLLVQTLGGRGYIESNLAPQILRDARVFRIFEGPTETLCGFLGARVLK
QSEELQQFLTQTLGAVEVAQRLADAVERISERFTNNITTQRWVFHQLGELASDAILWGAM
AGMIDKSPDIQRAIAWIKNRFEQKLHQALNFAPDNLPLANLQTTANLISEYAQTIGDVEQ
TLAGEEDQLDELLRKSPVSLKNPVSQNLTVPNFPLPRTELRKNGFNSEIQTWLINWLSQK
LHVSISEIDSKKAFADYGIDSVTAVELAQDLQEWLGISQKLEATIAWNFPTIEDLAHYLS
DTFRTQPTNEEAGGENLTSSASLEDLSAAEMAELLAQEIAIARQRIRS
NT seq
3747 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
attatatctcgtcaaagagaaaatttctcaatagctttagaagaagcagttacactcccg
gatgttttgcaggtgtggatacaggagcagcctaactctatcgggttcaattttctacaa
gacagagaaaatcttactctcacatatcaggagttagaagggcaagcacgggcgatcgca
actcatttacaagccctgaattggcaaaaagagcgtgtactgttgatgtacccaccaggg
ctagaattgattgcggcaatcatgggctgtttttatgctggtgtgattgctgttcctgta
tatccaccacgtcgcaatcgtaatttagatcggctattagcgatcgcatctgatgcccaa
ccaagtggaattttgacgacggtggctttgtcaagctcgttgagggaaactgcaaaagaa
acagcgatcgctactctaccgataattactacagatagcatttctttagacttggctgat
gcttggcaacgtccctcagtgaatgccgatagcatcgccatgcttcagtatacctccggt
tcaactggcacacccaagggagtgatgctcagtcatggcaatttactgcataatttggcg
caaatttatcatcgttttggacattcatttagcagtaagtctgtttgttggttgccaccc
tatcatgatatgggtttaatttggggaatttttgagccgctttatggcggttttccggta
acgctaatggctcctgtggtctttctccagaaaccaattcgttggttgcaggcgatttcc
caaacccgtgccacaactagcggcgctcctaattttgcttacgaaatgtgtctgcataat
attcgctcagaggaatgtcaagatttggatttgagtagttgggaaatcgcatttaccgga
gcagagccaattcgggcgcaaactctagaaaaatttgccacaacttttgctcaatatgga
tttcggcgcgaagccttctatgcctgttatgggttagccgaagcaacattatttgttact
ggcggagataaggacaagccaccgactattgagaatttgactgaccaaaaggcgatcgtt
ggttgtggttgcgctagtgctgaacaaacagtgataattgttgatcccgaatcccaaaaa
ccacgtttagaaggagaagaaggggaaatttgggttaggggtgcgagtgtagctcaaggt
tactggggtcgtttagaggagacagcagcaacttttagagcgactttggcatccgttgcg
ggttcgtttttacgaacgggagatttagggtttttgcggggtgaagaattatttgtcact
gggcggataaaagatgttattataatcagagggcaaaattattaccctcaagatattgaa
gctagcgttggtcagagtcatgaaatgcttaatcctcattggggagcggctttcagtgtg
gaaatttctggggaagaacggttagtagttgttcaagaagtagaacgtagtgcttggcga
tctctcgataccgcagccatgattacagccattcggggggcaatttcccgcgaacatgag
ttgcaggtgtatgctatttgcttgctcaaacctagcagtattcctaaaacttctagtggc
aaggtgcaacgccatgcttgtcaggctgggtttattaatcagagtttagatgtaatttat
cagtgggaagttgaagatattaccccacccgcgctaacgcgcaccctccccttgcaaagg
ggagggttggggagtggtgatttagtgggtagtaaatacaaaacagataacttgattgaa
tggttacgagattacgctaaccatcatattaattcgcggttgatggatgaacgacgttgt
attcctccccacattgttttagattttggcaatcggggtttattgggaatgcaagtacca
cctagttatggtgggttaggtttaggatatacggacaccatcagaattatacaacaatta
ggggcaatagattctaccttagcgctgtttgtgggactgaataacgtgttgggaattcgc
ccaattttgttgcatggtacgtcatcgctgaaggaagaattactgccaatgcttgccacg
ggaagggaattagcagcatttgccctcactgaaccgggagcaggtgctaatccccaagcg
atcgcatctcaggcgatcgcaaatggtaatggttggcggttgcggggtgaaaaaatttgg
agtggttctgcggcttgggcgggtgtaattaatgtgtttgtccagcatcaacaccaaggg
attagcggttttgccgtgcgacggggtagccctggattgcgtcagggaaaagaagcgtta
acgatgggaatgcggggaatggtacaaaataccgtttatttagaagatgttcccgtcaca
tctgagcaacttttgggtggtgtgggcactgggatgagtgttgctcaggatgcgatgatg
tatggtagattagcgatcgcagctgtttgtgtgggtgggatgaaacgctgcctccaactg
atgtggcgctacagtgagcgtcggcaaattgctaccggacgattgctagagcatccggtg
gttttccatcggcttgcagaattgacagaggcaattaccgcagttgaaaccttggtaatg
cgaatttgtgagttactcgaccaaggaattaccgtccctgtggaagcgtacacagcttgt
aaaatttctgcacccgaattttactggcaatcagcagatttactggtacaaaccttgggt
ggacgcggctatatcgaaagcaatttagcaccacaaattcttcgggatgcgcgagttttc
aggatatttgaagggccgacagaaaccttatgtggatttttgggtgcgcgtgtgctgaag
cagagcgaagaactgcaacaatttctcactcagactttgggtgcggtggaagtagctcaa
agattagctgatgcagtagaaagaattagcgagcgcttcactaataatataactacccag
cgttgggtattccatcaacttggtgaattggcgagtgatgctatcctttggggagcaatg
gcaggtatgatagataaatcaccggatatccaaagagcgatcgcttggataaagaatcgg
tttgaacaaaaactccaccaagctttaaattttgcacctgataacttgccattagctaat
ctgcaaactacagctaatttgattagtgagtatgcacagacaattggtgatgtagaacaa
actttagcaggtgaagaggatcagctagatgaattgttacgtaaatcaccagtttcctta
aaaaatccagtttctcagaatttaactgttcctaacttccccttaccaagaacagagtta
agaaagaatgggtttaattccgaaatccaaacctggctaattaattggttaagtcagaaa
ttgcacgtttctatctcagaaattgactcaaagaaagcctttgctgactacggcatcgat
tctgtaacggcggtagaattagctcaagatttacaagaatggttgggtatttctcagaaa
ttagaagcaactatcgcctggaattttcccacaattgaagatttagcccattatttgagc
gatacctttagaactcagcccacaaatgaggaagcagggggagaaaatttaacctcatcc
gcctcattagaagatttatcagcagcagaaatggcagaattgctagctcaagaaattgcc
atagcacgacaaaggatacgttcatga
DBGET
integrated database retrieval system
