Nocardia gipuzkoensis: LTT66_31745
Help
Entry
LTT66_31745 CDS
T07945
Name
(GenBank) IPT/TIG domain-containing protein
Organism
ngp
Nocardia gipuzkoensis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TIG
TIG_SUH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UGT67722
LinkDB
All DBs
Position
complement(6950421..6955577)
Genome browser
AA seq
1718 aa
AA seq
DB search
MSSVTPSQGSTAGGTTVTLTGSGLTGVTSVNFGATPATSFTVNSDNQITAVSPPGSGIVS
ITVTGPGGTSNPVTFVYVVVPTITSISPTAGPASGGNSVVITGSGFTGPLTVRFGNNATI
FTVNSPTQITAIAPPGSGTVQVTVTGSGGTSNGVSYTYAGVPSLTSVSPNTAPVTGGTTV
VLTGTGLSTATAVNFGATPATSFVVNSDTQITAVVPAGTGTVQVTVTTAGGTTNGVPLTY
VGVPTLTTAVPNVGPVSGGTTVVLTGTNLTGTTAVNFGATPATSFTVNSATQITAVAPAG
AAGTVQITATGPGGTSNGVGFTYVAVPTLSTVVPNAGPVTGGTTVVLTGTGLTGATAVNF
GATPAASFVVNSDTQITAVTPAGTGTVQVTVTTAGGTSNGVAFTYVAVPTLTTLVPNVGP
VTGGTTVVLTGTGLTGTSAVNFGATPATSFTVNSDTQITAVSPAGTGTVQVTATTPGGTT
NGLAFTYIPVPAITTVVPNAGSATGGTTVVITGSGLTGATAVNFGATPAASFTVNSDTQI
TAVSPAGTGTVQLTVTTAGGTSNGVAYTFIPVPALTSLVPNIGPTTGGTTVVLTGTNLTG
TTAVNFGATPAASFTVDSATQITAVSPAGTGTVQVTATTPGGTSNGLAFTFVAVPTLTTA
VPNVGPVTGGTTVVLTGTGLTGATAVNFGATPATSFTVNSDTQITAVSPAGTGTVQVTAT
TAGGTSNGVGFAYVAVPALTTVVPNAGPVTGGTTVVLTGTGLTGATAVNFGATPATSFTV
NSDTQITAVTPAGTGTVQVTATTAGGTSNGVSFTYVAVPTLTTVVPSAGPVTGGTTVVLT
GTGLTGATAVNFGATPATSFTVDSATQITAVAPAGTGTVQVTATTPGGTTNGVAYTYVAV
PALTTLVPNSGVEAGGTTVVLTGTGLSGATAVNFGAAPATSFTVDSATQITAVSPAGTGT
VQVTATTAGGTTNGLAFTYIPIPTVTTAVPNTGPATGGTTVIITGTGLTGATAVNFGATP
AVSFTVDSATQITAVSPAGTGTVQLTVTTPGGTSSGVAFTFIPVPALTSLAPNVGPAAGG
TTVVLTGTGLTGTTAVNFGATPAASFTVDSATQVTAVAPAGTGTVQVTATSPGGTSNGLA
YTYVPAPTLTTVVPNQGPESGGTIVTLTGTGLSTASAVNFGATPATSFIVDSDTQITAVS
PAGTGTVQVTVTTAGGTSNGVAFTYFATPTLTTAAPTQGSVSGGTTVVLTGTNLTGATAV
SFGATPATSFTVDSATQITAVSPAGTGIVQVTVTTPGGTTGGVPFIFVDVPTLTTAAPNQ
GPEAGGTTVVLTGTALTGVTAVNFGATPATSFTVNSATQVTAVAPAGTGTVQVTVTTAGG
TSNGVAYTYIAAPALTTAAPSTGPAAGGTTVVVTGTDLTGATAVNFGATPAASFTVDSPT
QITAVSPAGTGTVQITTTTAGGTSNGVAFTFIAAPALTTLAPTSGAETGGTTVVVTGTDL
TGATAVNFGATPATSFTVDSPTQITAVSPAGTGTVQVTAVTSGGTSNGLAFTYTPAPALT
TLAPTSGAETGGTTVVVTGTDLTGATAVNFGATPATSFTVDSPTQITAVSPAGTGTVQVT
AVTSGGTSNGLAFTYTPAPALTAAAPNTGPEAGGTTVVITGTDLTGATAVNFGATPATSF
TVDSPTQITAVSPAGTGTVQITTTTPGGTSNGISFIYA
NT seq
5157 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagcagcgtcaccccgagccaagggtccaccgcgggcgggacgacggtcacgctcacc
gggtcgggtctgaccggtgtcacctcggtgaatttcggtgccacaccggcgacttcgttc
acggtcaactcggacaatcagatcaccgcggtctcgcctcccgggtcggggatcgtgtcg
atcaccgtcaccgggccgggcggtaccagcaacccggtcaccttcgtctacgtcgtggtg
ccgaccatcacctcgatctccccgaccgcgggccccgcctcgggtggcaacagcgtcgtc
atcaccggcagcgggttcaccggtccattgacagtgcggttcggcaacaacgcaaccatt
ttcaccgtcaattcccccacccagatcaccgccatcgcgcctccgggatccggcacggtc
caagtcaccgtcaccggctcgggcggaaccagcaacggcgtctcctacacctacgccgga
gttcccagcctgaccagcgtctcgcccaataccgcccccgtgaccggcgggacgacagtg
gtgctcaccggaaccggcttgtccacggccaccgcagtgaacttcggtgccacaccggcg
acgtcgttcgtcgtcaactccgatacgcagatcacggcggtcgttcccgcagggacgggt
accgtgcaggtcaccgttaccaccgccggaggaaccaccaacggcgtccccctcacctac
gtcggggtgcccaccttgacgacagcggtgccgaatgtcggtccggtgagcggcggcacc
acggtcgtgctcaccggaacgaatctgaccggaacgacggcggtcaatttcggtgccaca
ccggcgacatcgttcacggtcaactcggctacccagatcaccgcggtggctccggcaggt
gcggctgggacggtacagatcaccgcaaccggaccaggtggaaccagcaacggcgtcggc
ttcacgtacgtcgcggtccccaccttgtcgacggtggtgcccaacgccgggccggtgacc
ggagggactacggtcgttctcaccggaacaggactcacgggagctacggcagtgaacttc
ggtgccaccccggcagcgtcgttcgtcgtcaactccgacacgcagatcaccgcagtcacc
ccggccgggaccgggacggtgcaggtcaccgtaaccacggcgggcggaaccagcaatggt
gtcgccttcacctatgtcgcggtgcccacactcaccaccctggtgccgaacgtaggaccg
gtgaccggtggcacaaccgtcgtgctcaccggtacgggactgaccggaaccagcgcggtg
aacttcggtgccacgccggcaacatcgttcaccgtcaactccgatacccagatcacggcc
gtgtctccggccgggaccgggacggtgcaggtgaccgccaccacgcccggcggaaccacc
aacggcttggccttcacctacatcccggtaccagccatcaccacggtggtgccgaatgcg
ggctcggcgaccggcggcacgacagtagtgatcaccggatcgggtctgaccggagcaaca
gcggtgaacttcggtgccaccccggcggcctcgttcaccgtcaactccgatactcagatc
acggccgtctcgcccgccgggacgggaaccgtgcaactgacggtgaccactgcgggtgga
accagcaacggcgtcgcgtacaccttcatcccggtgcccgccctcacctcgctggtaccg
aatatcggcccgacaaccggcggcacgacggtcgtcctcaccggaacgaatctgaccgga
accaccgcggtgaacttcggcgcgacaccggcagcgtcgttcaccgtcgactccgccacc
cagatcaccgccgtctccccggccgggacgggaacggtgcaggtcaccgccaccaccccg
ggtggaaccagcaacggcctcgcgttcaccttcgtcgcggtacccaccctgacgacagcg
gtgccgaacgtcgggccggtgaccggcggcacgacggtcgtgctcaccggcaccggtctg
accggagctacagcggtgaacttcggtgccaccccggcaacctcgttcaccgtgaactcc
gacacccagatcaccgccgtctccccggcggggaccggaacggtgcaggtcaccgccacg
acagcgggcggaaccagtaacggcgtcggcttcgcctatgtcgcggtgcccgcactcacc
acggtggtgccgaacgccgggccggtgaccggcggcacgacggtcgtgctcaccggcacc
ggtctgaccggagctacagcggtgaacttcggtgccaccccggcaacctcgttcaccgtg
aactccgacacccagatcaccgcggtcaccccggccgggaccggaaccgttcaggtcacc
gccacgacagcgggcggaaccagcaatggtgtctccttcacctatgtcgcggtgccaacc
ctgaccacagtggttccgagcgcagggccggtgaccggcggcacaaccgtcgtgctcacc
ggcacgggtctgaccggagctacagcggtgaacttcggtgccaccccggcgacctcgttc
accgtcgactcggctacccagatcacagcggtcgcccctgctgggaccgggacggtacag
gtcacggccaccacgcccggaggaaccaccaacggtgtcgcctacacctatgtggcggtg
cccgccctcaccacactggtaccgaattccggcgtggaagcaggtggaacgacggtcgtg
ctcaccggcaccggtctgtccggagctacagcggtgaacttcggtgccgccccggcgacc
tcgttcaccgtcgactccgccacccagatcactgccgtctcccccgctgggaccgggacc
gtgcaggtcaccgccaccaccgcgggcggaacgaccaacggccttgccttcacctacatt
ccgatacccaccgtcaccacggcggtgccgaataccggcccggcaaccggcggcacgaca
gtcatcatcaccggaacgggtctgaccggagccacggcggtcaacttcggcgcgacaccg
gcagtgtcgttcaccgtcgactccgccacccagatcactgccgtctccccggccgggacg
ggaaccgtgcaactcaccgtcaccacaccgggcgggaccagcagcggcgtcgccttcacc
ttcatcccggtaccggccctcacctcgctggcaccgaatgtgggccccgcggcgggcggc
acgacggtcgtcctcacgggcacgggtttgaccggaacaaccgcggtgaacttcggcgcg
acaccggcagcgtcgttcaccgtcgactccgccacccaggtcacggcggtcgcccccgcc
gggacaggaaccgtgcaggtcaccgccacgtcaccgggtggaaccagtaatggcctcgcc
tacacctacgttccggccccaaccctcaccacggtggtaccgaatcagggcccggaatcg
ggcggcacgatagtcactctcaccgggacggggctgtccactgcctccgcggtgaacttc
ggtgccacaccggcgacctcgttcatcgtcgactccgacacccagatcacggccgtctcc
ccggcgggaaccgggaccgtgcaggtcactgtcacgaccgcgggtggaaccagtaacggc
gttgcgttcacttacttcgcgacacccaccctgaccaccgcggcgccgactcagggctcg
gtatcgggcggtacgacagtcgtgctcacgggcacgaacctgacgggagccaccgcggtg
agcttcggtgccactccggctacctcgttcaccgtcgactccgccacccagatcaccgcc
gtctccccggcgggaaccgggatcgtgcaggtcaccgtcaccaccccaggtggaaccacc
ggtggcgtccccttcatcttcgtcgacgtgcccaccctgaccacggcggccccgaatcag
gggccggaagccggcggcacgacagtggtcctcacaggcacggcactgaccggagtaaca
gcggtgaacttcggtgccacaccggccacgtcgttcaccgtcaactccgccacccaggtc
acggcagtcgccccggccgggaccggaaccgtgcaggtcaccgtcaccaccgcgggtgga
accagcaacggcgtcgcgtacacctacatcgcggctcccgccctgaccacggcggcaccc
agcactggcccggcggcaggcggcacgaccgtggtcgtcaccggcaccgacctgaccgga
gccacagcggtgaacttcggtgccacaccggcagcctcgttcaccgtcgactcgcccacc
cagatcaccgccgtctccccggcggggaccgggaccgtgcaaatcaccactacgacagcg
ggtggaaccagcaacggcgtcgcgttcaccttcatcgcggcgcccgcgctcaccacactc
gcacccacctcgggtgcggaaactggcggtacgacagtggtcgtcaccggcaccgacctg
acgggagctacagcggtgaacttcggtgccacaccggcgacctcgttcaccgtcgactcg
cccacccagatcacggcagtctcgcccgccggaactggcactgtgcaagtcaccgccgtc
acttcgggcggaaccagtaacgggttggccttcacctacaccccggcgcccgcgctcacc
acactcgcacccacctcgggtgcggaaactggcggtacgacagtggtcgtcaccggcacc
gacctgacgggagctacagcggtgaacttcggtgccacaccggcgacctcgttcaccgtc
gactcgcccacccagatcacggcagtctcgcccgccggaactggcactgtgcaagtcacc
gccgtcacttcgggcggaaccagtaacgggttggccttcacctacaccccggcgcccgcg
ctcaccgcagcggcacccaacaccggaccggaggccggcggaacaaccgtcgtcatcacc
ggcaccgacctgaccggagctacagcggtgaacttcggtgccacaccggcgacctcgttc
accgtcgactcgcccacccagatcacggcagtctcacccgccgggaccggaaccgtgcaa
atcaccaccacaaccccaggaggaacgagtaacggaatcagcttcatctatgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
