Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_35518
Help
Entry
NAEGRDRAFT_35518 CDS
T01241
Name
(RefSeq) myosin
Organism
ngr
Naegleria gruberi
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Myosin_head
Rod_CreS
CCDC39
Filament
Myosin_N
DUF1664
TPR_MLP1_2
CCDC18_2nd
CCDC18_1st
ODF2_C
FKBP15
DUF8429
Fez1
OVT1
AAA_22
Matrilin_ccoil
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8849554
NCBI-ProteinID:
XP_002680829
JGI:
Naegr1_35518
UniProt:
D2V5C1
LinkDB
All DBs
AA seq
1891 aa
AA seq
DB search
MSSETTTPRRAKKSGGDNKSSFFQRLLEQQKSDQATSNKFKWVPDGEGGFVVGEIIEETA
SEVQFKLDDGRIDKCKPDMVYPMNPQKLDGIPDMAQLSLLNEPSVFYNLKYRYERDQIYT
YSGLFLVAVNPYKNLPIYTDEVIKRHDGKRREDVEPHIYTVSDVAYRQMLQNGENQSMLI
TGESGAGKTVNTKRVIQYLTHVAGKGGSGGQIEQQLIMCNPLLESFGNAKTLRNDNSSRF
GKFIEIQFDKQGYIGGCRIQHYLLETTRVIRQALNERSFHIFYQIFSLDSDKKKELYLTE
PSDFEYINQSNCYVVPGVDDTNDLKLTLQSMKVMKMSDSEIDMIFRIVSFILHIGNVQFK
DNEEEHAQIVSNVKSGSPLDFACDILSVPSDQLTKGFCKPRIILPGEIIEMAVDSRKANF
NRNALVMSTYLRMFDWIVQKINQSMNAKCEIKNFIGVLDIAGFEIFELNSFEQMCINFTN
EKLQQFFNHHMFKKEQEEYLREDIAWNFIDFGLDLQPTIDLIEKPQGVLDILHQKCVVQN
QDEESFVRDLLSKNQKSEKLRKDKFDQKSFIVTHYAGEVKYNVRDWYSKNVDPLNDDCKM
AMQKSQLPFIKKLFVDQQSSGGSGAGVRFQTVGNKYKKQLSDLIQLLSSTEPHFIRCIKP
NNLQKPGIIQAPSVLEQLKCNGVLEGIRISRKGYPGRIKFNEFVKRYELLAKDKKSLDGM
KLEREKCHAIISKITSLDDSKYKLGKTKIFLKSGVEAQLEELREAEIEKVIALAQAACQG
HSARKQYKKLMGRIVYIKLLQRNFRAYLSMKDWDWYQLFVKVRPLVEADRSDKILQQMKD
EIEKLKQEIANQIENNKITEQEKDNLNRNVEQIRSEMAIRESEIEQLQQMMRDMKDKIQN
RESEMENLNGSLKDGESAMNNLRRDLQNKDFEMNQLKTQLDQAKRQLSDKDVEVLQRGKS
VQEMKEELERALNELEDVKTELNITKNTLNSSDYSLDQTRQEMIDKERKLRERDNEIIDY
KRKVQDMEQDLRKNEIDKNELELQSNSMKKQLDTFQQELDKKTREFDQLRKQKLTNDQQS
EQLFGELEEEKRKRNDLEKKSRELAQQLDTERFDKERIESQSKDLSNEIDELKREIASLK
LRISELEDLNERLKRENQAYERDLSDLRLKSENELNKLQSELQREKQRTQDEISNLSQKL
EDTRKRMEETESKLNSSDRDVRNLKKDKTQLEHDKSDLELKVKRLESEVKSSNTDQDNTK
QQLQESENRKRELMNRIRDVELELNNSKEELSREKSKSSTQSSELNQNRDRLTQLESDLT
QLDLLKSKLEKQVRDQQYDLDQEKNQTQKLRSDLEFLRRSETEYKSKSEVLESTLAQREQ
ELKNLRDQLEQLRSQLSDNSNISEEAQKQIKKMKDDLKKQLEQLQESEQRFKDENQKHKQ
TQQVIADRENQLNLSKDENQRLLREISQLRSDLENVRTNLSSNDSETLKLKSELRERDRK
YKDLESEKDEFESQVDKLERDVLEWKSKADQKDQSISQIESENKQLQSDAAKAQQDLDRT
KQDKEREVSTMKQRLDQLQRGDGSSSSTVSSAEISRLRREYDSELIKLKAQLEDQVIQLA
DTEQKRKLTEFELNDFRDKYNQEVKSKKKIESVKLSLETEIEDLRDLAEKAEDLQDELSS
VKQQHNEILSELQSELKKERSERIYNEEEANRWKRDVQNLKVQLELANQKKDEESRRVRA
QYEQELQDLQDLYNKLKNDKKKFSKSSNSLESELRDAQRSLSDSERYRTLAEQKADRLER
ELKMSVLRLETESSNQLLIAQEKSRIESQLQSTRDQVDDLESENTKLKSDLDSERRKFQQ
LMRRLNNSASTSSVRGGASYGDSDSDEEDDE
NT seq
5676 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaagtgaaaccacaactccaagaagagccaagaaatcaggaggtgataataaatca
tccttctttcaacgtttattagaacaacaaaaatcagatcaagcaacttcaaacaaattc
aagtgggtacctgatggtgaaggtggttttgttgttggtgaaattattgaagaaactgca
agtgaagttcaattcaaattagatgatggtagaattgataaatgtaaacctgatatggtt
tatcctatgaatccacaaaaattggatggtattccagatatggcacaattatccttgtta
aatgaaccatctgtattttataatttaaagtacagatatgagagagatcaaatctatact
tatagtggtctatttttggtagcagtgaatccgtataagaatttaccaatttataccgat
gaggttataaagagacatgatggtaagagacgtgaagatgttgaaccacacatttataca
gtttcagatgttgcctatagacaaatgttacagaatggtgagaatcaaagtatgctcatt
acaggtgaatctggtgcaggtaaaactgttaatactaaacgtgttattcaatacttgaca
catgttgctggtaaaggtggtagtggtggtcaaattgaacaacaattgatcatgtgtaat
ccattattagaatcatttggtaatgctaaaacattgagaaatgataattcttcacgtttt
ggtaaatttattgaaattcaatttgataaacagggatatattggtggttgtagaattcaa
cactacttgttagaaacaacaagagttattagacaagcattgaatgagagaagttttcac
attttctatcaaatattttcattagattctgataagaagaaggaattatacttgacagaa
ccatctgattttgaatatattaatcaatcaaattgttatgttgtaccaggtgttgatgat
acaaatgatttgaaattaactttacaatcaatgaaagttatgaaaatgtcagattctgaa
attgatatgatttttagaattgtttccttcattttacatattggtaatgttcaatttaaa
gataatgaagaagaacatgcacaaattgtttcaaatgtaaaatcaggatcaccattagat
tttgcatgtgatattttatcagttccatccgatcaattaacaaaaggtttctgtaaacca
cgtattattttaccaggtgaaattattgaaatggcagttgattctagaaaagctaatttt
aatagaaatgcactagtcatgtcaacttatttgagaatgtttgattggattgttcaaaag
attaatcaatcaatgaatgccaaatgtgaaattaagaattttattggtgttttagatatt
gctggttttgaaatctttgaattgaacagttttgaacaaatgtgtatcaattttacaaat
gaaaaattacaacaatttttcaatcatcacatgttcaagaaggaacaagaagaatatttg
agagaagatattgcttggaatttcattgattttggtttagatttacaaccaactattgat
ttaattgaaaaaccacaaggtgttttagatattttacatcaaaaatgtgttgttcaaaat
caagatgaagaatcattcgtacgtgacttgttgtcaaagaatcaaaaatctgaaaaattg
agaaaggataaatttgatcaaaaatcattcattgtaactcactatgcaggtgaagttaaa
tataatgttcgtgattggtacagtaagaatgttgatccattgaatgatgattgtaaaatg
gctatgcaaaaatcacaacttccattcattaagaaactctttgttgatcaacaatcatct
ggtggttcaggtgcaggtgttcgtttccaaactgttggtaacaagtataagaaacaattg
agtgatttaattcaattattgagttcaactgaacctcatttcattcgttgtatcaaacca
aataatttacaaaaaccaggtattattcaagcaccaagtgttttagaacaattgaaatgt
aatggtgtattggaaggtattagaatttctagaaagggttatccaggtagaattaaattc
aatgaatttgttaagagatatgaattattggccaaagataaaaaatcattggatggaatg
aaattggaacgtgaaaagtgtcatgccatcatttctaaaattacctcactagatgattct
aaatataaattaggtaaaacaaagattttcctcaaatcaggtgttgaagctcaattagaa
gaattgagagaggcagaaattgaaaaagttattgcattagcacaagcagcttgtcaaggt
cattcagcacgtaaacaatataagaaattgatgggtagaattgtttatatcaaattatta
caacgtaatttccgtgcctatttgagtatgaaagattgggattggtatcaattatttgtt
aaagttagaccattagttgaagctgatcgttctgataagattctccaacaaatgaaagat
gaaattgaaaaattgaaacaagaaattgccaatcaaattgaaaataacaaaattacagaa
caagaaaaggataatttgaatagaaatgttgaacaaattagatctgaaatggccattaga
gaatcagaaattgaacaattacaacaaatgatgagagatatgaaagataaaattcaaaat
agagaatctgaaatggaaaatttgaatggatcattaaaagatggtgaaagtgcaatgaat
aatttgagaagagatttacaaaataaggattttgaaatgaatcaattaaagacacaatta
gatcaagctaaaagacaattatctgataaagatgtagaagtattacaacgtggtaaatca
gtacaagaaatgaaagaagaattagaaagagcattaaatgaattagaagatgttaaaact
gaattgaatattacaaagaatactttgaattcatctgattattctctagatcaaacaaga
caagaaatgattgataaggaacgtaaattaagagaacgtgataatgaaattattgattat
aaacgtaaagttcaagatatggaacaagatttgagaaagaatgaaattgataagaatgaa
ttagaattacaatcaaattcaatgaagaaacaattagatacattccaacaagaattagat
aaaaagacacgtgaatttgatcaattgagaaaacaaaaattaaccaatgatcaacaatct
gaacaattatttggtgaattagaagaagaaaagagaaagagaaatgatttagaaaagaaa
tcacgtgaattagcacaacaattagatactgaacgttttgataaggaacgtattgaatct
caatctaaagatttatccaatgaaattgatgaattgaaacgtgaaattgcctcattaaaa
ttgagaatatcagaattagaagatttaaatgaaagattaaagagagaaaatcaagcttat
gaacgtgatttatctgatttgagattaaaatctgaaaatgaattgaacaaattacaatca
gaattacaacgtgaaaaacaacgtacacaagatgaaatttccaatctctctcaaaaatta
gaagatactagaaagagaatggaagaaactgaatctaaattaaattcatctgatagagat
gttagaaatttaaagaaggataaaacacaattagaacatgataaatcagatttagaactt
aaagttaaaagattagaatctgaagttaaatcatcaaatacagatcaagataataccaaa
caacaattacaagaatctgaaaatagaaaacgtgaattaatgaatcgtatcagggatgtt
gaattggaattgaataattcaaaagaagaattatcaagagaaaaatcaaaatcatcaaca
caatcttcagaattgaatcaaaatcgtgatcgtttaacacaattagaatcagatttaaca
caattagatttattaaaatctaaattagaaaaacaagtacgtgatcaacaatatgattta
gatcaggaaaagaatcaaactcaaaaattgagatcagatttagaatttttaagaagatct
gaaactgaatataaatcaaaatctgaagttttagaatcaacactggctcaacgtgaacaa
gaattaaagaatttaagagatcaattagaacaattaagatcacaactttcagataattca
aacatttcagaagaagctcaaaaacaaattaaaaagatgaaagatgatttaaagaaacaa
ttagaacaattacaagaatctgaacaacgtttcaaagatgaaaatcaaaaacacaaacaa
acacaacaagttattgctgatcgtgagaatcaattaaatttatcaaaagatgaaaatcaa
agacttttacgtgaaatttcacaattgagatctgatttggaaaatgttagaacaaattta
tcaagtaatgattctgaaactttgaaattaaaatcagaattaagagaaagagatagaaaa
tacaaagatttagaatctgaaaaggatgaatttgaatcacaagttgataaattagaacgt
gatgtacttgaatggaaatcaaaagcagatcaaaaagatcaatccatttcacaaattgaa
tctgaaaacaaacaattacaatcagatgctgctaaagcacaacaagatttagatcgtaca
aaacaagataaggaacgtgaagtttcaacaatgaaacaacgtttagatcaattacaacgt
ggtgatggttcttcatcatcaacagtttcatctgctgaaatttcaagattgagacgtgaa
tatgattctgaattaattaaattgaaagctcaattagaagatcaagttattcaacttgct
gacactgaacaaaagagaaaattaactgaatttgaattgaatgatttcagagacaagtat
aatcaagaagttaaatcaaagaaaaagattgaatctgttaaattatcattggaaactgaa
attgaagatttgagagatttggcagaaaaggctgaagatttacaagatgaattatcaagt
gttaaacaacaacataatgaaattttaagtgaacttcaatctgaattaaagaaggaaaga
tctgaaagaatttacaatgaagaagaagcaaatagatggaaacgtgatgttcaaaatctt
aaagttcaattagaattagccaatcaaaagaaggatgaagaatcacgtcgtgttcgtgct
caatatgaacaagaattacaagatttacaagatttatataacaagttgaagaatgataag
aagaaattctccaaatcttcaaattcattagaatctgaattacgtgatgctcaacgttca
ttatctgactctgaacgttatagaactttggctgaacaaaaggctgatagattggaacgt
gaattgaaaatgtctgttttgagattggaaactgaatcttcaaatcaattattaattgct
caagaaaagagtagaattgaatctcaattacaatccactagagatcaagttgatgatttg
gaatctgaaaatactaaattgaaatctgatttggattctgagagaagaaaattccaacaa
ttaatgagaagattaaataactctgcttctacttcatctgttagaggtggtgcaagttat
ggtgattctgattctgatgaagaagatgatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system