Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_52233
Help
Entry
NAEGRDRAFT_52233 CDS
T01241
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K19027
zinc finger FYVE domain-containing protein 26
Organism
ngr
Naegleria gruberi
Pathway
ngr04142
Lysosome biogenesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ngr00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04142 Lysosome biogenesis
NAEGRDRAFT_52233
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ngr03400
]
NAEGRDRAFT_52233
DNA repair and recombination proteins [BR:
ngr03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
Other HR factors
NAEGRDRAFT_52233
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_ZFYVE26
DUF3467
TPR_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8860839
NCBI-ProteinID:
XP_002672548
JGI:
Naegr1_52233
UniProt:
D2VTZ0
LinkDB
All DBs
AA seq
1885 aa
AA seq
DB search
MRTCLLNFLATHEYELARALFIDYFKTVSESDTLFILNHCIEELKDPKNPHVTSRFKWFC
YCVYTELQQLTNNSSLKGYNIDVISFETLLDCCVNTFKLSDKFSKELVRHMKYIYSFRLL
SKKKSTTETVITTLSSTGLTFSQNMDSSIMDLIGEMYEKCPFLAFYLERNAFEFINGKSI
LIEKLENLCNDRDYEKASYMLRFISKQITMDSESIYLLKNIFKQLIENKAIALKSRPNNQ
LIDIIYESLFIADISDKEYSDEQFKLTRIFTSLDEELLSKQKLIDIIQASPSSQSFWFHY
MEYIRVTNNHILESGLNLALDLVAKKDYASLNILLDQENFSNMRPLIILLSWDNYKSDIT
ERHNIIQNIWIQGKQKRTPISDPWVEFTCNELAFFLDFSLDASELLLEANRSMNTIEKKH
SRDLIKSVKMKKLAENDFKFTNKKEIANLLIDLAPSQSTLNLLLPWLGNLKENDLVSLLK
KRPQLRETTENERNIDLTLLRAYFAIHEAIQIVRNKSTSILDSLKSIEDSIVNISSESYR
LSTLENIFQIILTKSSHIKGHTDNNSVFVISPNNLHDMLVFLKTATELLQQSSKDERMVF
RIERFVKILDEALWRFSLTRMISEFDRNSLNSSYKQHQFVQMWTASPNTLFVICIKRNLF
SQAKEVITRFNLGESFKNQVIDAEIMYTIHNEHKDKSVGEIIQKFPNFITLFDVLFSLKT
ENKELHGVLIEKIKELKPGIPLLDLFAMYLDSPYQGPIFRVYSKLFNYNREDNIEILRKY
IEVEKTKSTSLKDLCIYDNRGFENEKASKLADLNGIHILSFILESASQSKISKSNDLSIS
LDLAKIISQKSSLVGALSSLYFADYSKMNPQFLEFIESQCQNSEVMNRWMAIKLEPVKDA
IQLSKRLDLSRNLKKYTISSFESDQADSLYLAIIQNLIDADDYNLALEMAEKGLTHFTPD
FLLKLYIENMPDHSECHKYIYNIKDKELAFSLIEIYMDEWDIEVCIELIRSCCSTFRSDK
TKQKIYERASKVLERLHIFKEVLSSELRDNYDSWTEMKEICDHNPYRFISDLITVCEFDL
ARRAAKNLLSTSTPMNIGEGYDSVMIHIEQEYCLYILGEKAITDKIISKVTQALSRLSPE
NALSVCKHVLEKLEIYENKLFVCEFILSVYKEHLKKDQLEQYTASLMGMRVLKLLDEENK
KKYNHLLLKPSLIIENLIINNEMLKVSRILNELPELQNDDLLIEYGMKALSLKNFEQTDT
TKKKSSSRVFTLNNEEHNNNIRINFSFPQAPSILLAKSILDICKNNRKVGDSILTLCDEI
SKTQHISRTNRISLVGQIVRYAKICFSKDTESHERLGLCDTILSHVEILKQIIYHNCAIG
SISLSDLSQQNRARQIRDSLIQLDHLNLALNVATRCQIESDPIWTQWGITLLTLGKYKQA
RDKLKYCLTLTPQQKQQLLNRILAILEGAPSVVAVDQKMGDKLKESVLDSPGNSPSKKRA
SISIEQVEKSQLHTHLDEERMREAQYYIKHFGSSDIYISFLVRNGKLDAAILYLFKKQMS
QSLFVDVIVTYCVKYGLMKFLQNVIKQYDTTFTKCYPYLTATCKYLNQKQALNLLYDFQV
FMDDNIRAGLTKIRLFLKTDDQNQQLSHLEGAKKHFMTGLQNSSTENDVQKQVLKPDEIS
RYVKTINLQTEVTKKFGNVMSPSTPNTKITLFDAVKGKCEITEFLMLQSFDLSFRIASEF
HLPMVKLYIRTLCSLVRKKQIAIIENLLKQIRGTPISDEDWDAIINNIIKLYIKEMNDEK
NAEKFIAKLRNDSKKVRACLLCNRFKAAYLIAVKCDNLDDVKLIFDYCNQVDSKATQTIA
EHCLKYLKDHGVQIVLPTQPTSNSK
NT seq
5658 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaacatgtttactaaactttcttgctactcatgaatatgaattggcaagagcactt
tttattgattactttaaaactgtatcagagtcggatacattgtttattcttaatcactgt
attgaagaattgaaggatcccaaaaatcctcacgtcactagtagatttaagtggttttgt
tattgtgtatataccgagttacaacaactgaccaataattcaagcctaaaaggttataat
attgatgtaatatcttttgaaacattattggattgttgtgtaaatacttttaaattatcg
gataaattttctaaagagcttgtcaggcatatgaaatatatttattcatttaggttatta
tcaaaaaagaagtcaacaacagagactgtaataacaacattatcatcaactgggttaaca
ttttcacaaaatatggatagttctatcatggatttaattggagaaatgtatgaaaaatgt
ccatttctagctttctatttagagaggaatgcatttgagtttattaatggaaaaagtatt
ttaatagaaaagttagaaaatttgtgtaatgatagagattatgaaaaagcttcctatatg
cttcgtttcatatctaaacaaattactatggattcagagtcgatttatttattgaaaaac
atttttaaacaattaattgaaaataaggctatagctctaaagtctagaccaaataatcaa
ttaattgatatcatttacgagtcattatttattgctgatatttcagacaaggaatatagt
gatgaacaattcaaattaactagaattttcacatctttggatgaggagttgttatcaaaa
caaaaattaattgatattatacaagcttctccttcatctcaaagtttttggtttcactat
atggaatatattcgagttactaataatcatattttagaatctgggctcaatttagcactg
gatctcgttgctaagaaagactatgcctcactgaatattcttttggatcaagaaaacttt
tcaaacatgaggcctcttataattttattaagctgggataattacaagtctgacattact
gaacgacataatatcatccaaaatatttggattcaaggaaaacaaaaaagaaccccaatt
tctgatccatgggtagagtttacatgtaatgaacttgcattctttttggacttttctttg
gatgcatctgaacttcttttagaggccaatagatctatgaatactattgaaaagaaacat
agtagagatcttatcaagtcggtcaagatgaagaaattggctgaaaatgactttaagttt
acaaacaagaaagaaattgccaatttattaatagatttggctccaagtcaaagcactctt
aatttacttctgccatggctgggtaatttgaaagaaaatgatttggtttctcttttaaag
aaaagacctcagctgcgtgaaacgacagaaaatgagagaaatatcgatttgactttgttg
agagcttattttgctattcacgaagcaatacaaatagtaagaaacaaatcaacatccatt
ctagactccttgaagagcattgaagacagcattgtaaatatatcaagtgaatcctacagg
ctcagtactttggagaatattttccaaattattttaacaaaatcatcacatatcaagggt
catacagacaataattctgtatttgtcatttcaccaaataatttacatgatatgctggtt
ttcttaaagacagccacagaactattacaacagtcgagtaaagatgagagaatggttttt
agaatcgaaagattcgtcaaaatactcgatgaagcattgtggagatttagtttgacaaga
atgatttccgagtttgatagaaattctctcaatagttcctacaagcaacaccaatttgtg
caaatgtggaccgcttcccctaacacactttttgttatttgcattaagagaaatcttttc
tctcaggcaaaggaagtcattacaagatttaatcttggtgaatcattcaagaatcaagta
atagatgctgaaataatgtataccattcataatgaacataaggataagagtgttggtgag
attattcaaaaattccctaattttataacactttttgatgtgctcttttctttaaagact
gaaaacaaggaactacatggcgtactcatagaaaaaatcaaagagctcaaacctggtatt
cctctacttgatttgtttgcaatgtatttggattcaccatatcaaggaccaatattcaga
gtatattccaaactattcaattacaatcgtgaggataatatcgaaattttgagaaagtac
atagaggtagaaaaaacaaaatcaacctctctaaaagatttatgtatttatgataacaga
ggattcgaaaatgaaaaggcgtcaaagttagctgatctcaatggtattcacattttatca
tttatcttagagtcagcttcacaatctaaaatatcaaaatcgaatgatttgagtatttca
ctagatttagcaaagataatatctcaaaaatcttcgttagtgggagctttgtcctcttta
tactttgctgattactccaagatgaatccacagttcctagagtttatagaaagtcaatgc
cagaatagtgaagtgatgaatagatggatggctattaagctagaacctgtaaaagatgcc
attcaattatctaaacgacttgacctctcaagaaacctcaaaaagtataccatttcaagt
tttgagtcagatcaagcagactcactgtatcttgctatcattcaaaacttgatagatgct
gacgattacaatcttgcattggaaatggctgagaaaggtcttactcactttacacctgat
tttctgttaaaactttatattgaaaatatgcctgaccactctgaatgtcacaagtacatt
tataatatcaaggataaggagcttgcattttctttaattgaaatttatatggatgaatgg
gatattgaagtttgcattgaacttatcagatcatgttgcagtacttttagaagtgataaa
acaaaacaaaaaatctacgaaagagccagtaaggttttggaaaggttacacattttcaag
gaggtcctcagcagtgagctaagagataactatgattcatggactgagatgaaagaaatt
tgcgatcataatccatacagatttatttctgatttgattacagtgtgtgagtttgatctt
gctagaagagctgccaagaatcttctttctacctccaccccaatgaatattggtgagggc
tatgattctgtcatgatacacatagaacaagaatattgtctttatattttgggagaaaaa
gcaattacagacaagattataagcaaagtgacacaagctttatccagactcagtcctgaa
aatgctctttctgtttgcaaacatgttttggaaaagttggaaatttatgagaataagcta
tttgtttgtgaatttattctctcagtatacaaggaacatctcaaaaaggatcaattggaa
caatatactgctagcttgatgggtatgagagttttaaaacttttagatgaggaaaataag
aaaaagtataatcacctacttttgaaaccatcactgataattgaaaatttaattatcaat
aatgaaatgttgaaagtttcaagaatactcaacgaattaccagaacttcaaaacgacgac
ttgctgattgaatatggtatgaaagcattgtccttaaagaattttgaacaaacagatacc
acaaagaagaaatcctcttctcgtgttttcactctcaataatgaggagcacaacaacaat
attagaatcaatttttccttccctcaagctcctagtattctgctagccaagtcaatcttg
gatatttgcaagaataatagaaaggttggagattccatcttgacgctctgtgatgaaatc
agcaaaacccaacatatttcaagaacgaacagaatcagtctggttggtcaaattgtcaga
tatgctaaaatttgtttcagtaaggatacggaatctcatgaaagattaggtttatgtgat
actatcctttctcatgtggaaattttaaagcaaattatttatcataattgtgccattgga
agtatttctctaagtgatttaagtcaacaaaatagagccagacaaattcgtgacagtcta
attcaacttgaccatttgaatttagcattgaatgttgctaccagatgtcaaatcgaatct
gatcctatttggactcaatggggtattacccttttaactttaggaaagtacaaacaagcc
cgagacaaactcaaatattgccttactctcactcctcagcaaaaacaacaacttcttaat
agaatattggctattctcgaaggagctccatctgtagttgcagttgatcagaaaatggga
gacaagttgaaagaatctgtattggactcacctggtaacagtccatcaaagaaaagagcc
tctataagtattgaacaagttgaaaagtcacaacttcacactcatctcgatgaagaaaga
atgagagaggcccagtactatatcaaacactttggttcgagtgatatttacatttcattc
ctggttagaaatggaaaattagatgctgctattctttatcttttcaagaaacaaatgtct
caatctctttttgtggatgtaattgtaacatattgtgttaaatatggattgatgaaattc
ttacaaaatgtaatcaaacaatatgacactacctttacaaagtgttatccatatctcact
gccacttgtaaatatttgaatcaaaaacaagcactcaacttgctctatgatttccaagtt
tttatggatgataacatcagagctggtttgaccaagattagattattcttaaagactgat
gatcaaaatcaacaactctcccacttggaaggtgcaaagaaacatttcatgactgggctt
caaaatagttctacagaaaatgatgttcaaaagcaagtgttaaaacctgatgaaatttca
agatatgtcaaaactatcaatttacaaacagaagtcacaaaaaagtttggaaatgtcatg
agtccatcaactcctaacactaagattactctatttgatgcagttaaaggaaaatgtgaa
ataactgaatttttaatgttgcagtcatttgatttatcatttagaattgcatctgagttc
catttaccaatggtcaagctatatattcgtactctgtgtagtcttgtgagaaagaagcaa
atagcaattatagaaaatttattgaaacaaattagaggaactccaattagtgatgaagat
tgggatgcaatcattaataatattatcaaactttatattaaggaaatgaatgatgaaaag
aatgcagaaaaatttattgcaaaattgagaaacgattccaagaaggttagagcttgtttg
ttgtgtaatagattcaaagcagcttatttgattgctgtgaaatgtgataacttggatgat
gtcaaattaattttcgattattgcaatcaggttgattctaaggcaactcaaacaatagct
gagcactgtctgaaatatttgaaagatcatggagttcaaattgtattgccaactcaacca
acatctaattcaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
