Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_62183
Help
Entry
NAEGRDRAFT_62183 CDS
T01241
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
ngr
Naegleria gruberi
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_TEN
EGF_Teneurin
EGF_2
EGF_PEAR1L
EGF_DL_JAG
JAG1-like_EGF2
EGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8855279
NCBI-ProteinID:
XP_002682217
JGI:
Naegr1_62183
UniProt:
D2V062
LinkDB
All DBs
AA seq
1769 aa
AA seq
DB search
MNNTCSENGICQDYNHCNCSSGFTSSNCSIPICFGSNATDETVCSSHGQCLSPNNCSCSD
GYMHSDCSHPICFGLESTNRNSCSTHGTCISPNSCQCDGNHVGDMCEIPLCFNIPANHNS
TCSSSGKCIGVNLCECYGNFTGMNCSVPICFDENSTSIMSCSSRGRCIGPNLCECQVGYT
GSVCEYPVCYGFYSEDVNSCSGHGECIDYNKCQCENGYVTENCSIPVCFGLNSSDSNVCA
SHGDCLSPNNCSCHEGFTSINCSISICYNSPATDPFACNGKGNCVNPNECACQEGNIGLQ
CEIPLCFGVPSNETQSCSGNGECIQYNECMCHSNFTGLNCSIPICFGINATDQSHVCFSH
GICQEPDQCQCHEGYTGIQCEIPICFNIPATNSSTCASNGVCIDFNNCSCLDGYTSENCS
LPICYELDSGKSMVCSSHGQCLAPNNCTCLERFTFDNCSIPICYNIDASNSSVCSGFGEC
SSPNNCKCHENHIGLQCEIPLCFGIPSNETQSCNGNGQCIQYNECVCNSDYTGIDCSIPI
CFGSNATNLTVCSSHGICQSPDQCQCQEGYTGTNCEIPICFNIPANDSSTCSSNGECIDF
NNCSCHDGYTSENCSIPICFNLNSTDSSVCNSNGICTSPDKCQCQENFTGENCSIPICFG
LAANSSGACSASGSCVYPNTCLCNQGIIGINCEIPSCFGIFQNNSQSCSGNGICIELNKC
SCYLNFTGESCLISACNGIASNDSSVCSGKGKCTAPNLCESCEENYFGEWCEISQCFGIF
SNQSQVCSENGKCESYNNCNCSMGYVGENCNIPVCFKINSTDENVCNSNGICTSPDLCSC
NSKYGGLECSEPKCFGKTTLEGACSSKGNCTQPDSCTCEKGFFGISCELHSCFGIQLNDS
SVICSGHGECKSLDECECDSGYLGESCSIHTCFGITFNESGVCSGNGSCSSLDNCTCYGD
GKFYANCTLIPSDSPIIDSDVPSNHTEISNNSSSYPNCFNISANHSNVCNGNGNCTSENE
CKCREGYFGGECSLFACFGKESADSSVCSSNGICASPNTCKCRPERYGSQCQLVKCFEIL
SNQSNVCSSKGSCQDTNACICNEGYFGPMCNITSCEGILSNNSQVCNGSGQCTHYNTCQC
KEGFIGLNCQFTKCNSTSCRHGSCITTSQCECESGWTSSECNLPICYDLLASDSNVCSTH
GKCIAPNKCNCSTNPLYMGDKCQYLQLDSLQCSINPSLNLIPIEWTISGLDKITFDMSSK
EILVRNSIPYSTSLHSKSKFNYELNIYNTGKRSFNYQINSFCENGISFKQLGISSQFGLL
QEGNNANIKDLQNIGFALFWNDESLKYEDIKCHVELIVNPKDQFDECQHYDSNTETSSKY
NITLILERTNVCQFLKETDLPLTFSSTQLSTMSEIALIDENILSDNDILKIINTFTQKRN
NWQIINKDNSTLQANILLTAQLSNPNNELGLFVPSLICKDERIVDDIEFTTEYLSNQSPF
SISHSLQKIQFQFNVTIKNVSNYVDYGRVRGGKEGMATVLIEDMLLNCSLILLPNPSECW
SNTNRNSTFSKYIISHFTLPIVSGEFSFFQAVRSFEIGIITLTYTCMGIGFASMICTTKV
PRDRKHSLLQLVEFVKEKRRNKLNSTSDDSKPLLENQIDRPYCENCGHHTRKKARYAIRV
ENYDANCEMFICENQVCFEAMISLHNRGYSHHYQCFDLDKEEDCQLMIETPFKTLADNFD
ESDIYESMDIEFPIPSDINDDEEDDSDLF
NT seq
5310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatacctgttctgaaaatggcatttgccaagattacaatcattgtaattgtagc
tctgggtttacttcttcaaattgttcaattcctatttgtttcggttcgaatgccactgac
gaaacagtatgttcctcacatggtcaatgtctttctcctaataattgttcctgcagtgat
ggatacatgcattcagattgttctcatccaatttgtttcgggcttgaatcaactaatcga
aactcttgttctactcatggcacttgcatttcaccaaattcatgtcaatgtgatggcaat
catgtaggtgacatgtgcgaaattccactttgtttcaatatcccggccaatcataactca
acttgcagctcaagtggaaaatgcattggtgtgaatttgtgtgaatgttatggaaatttc
acaggaatgaactgttctgttccaatttgttttgatgagaattcaacttccattatgagt
tgctcgtcgagaggaagatgtattggacccaacctgtgtgaatgtcaagttggatatact
ggtagcgtttgtgagtatcctgtttgttacggtttctattcggaagatgtaaattcatgt
tcaggacatggagaatgtattgactataacaaatgtcaatgtgaaaatgggtacgttact
gagaattgttccattcctgtgtgttttggtttgaatagttcagattccaatgtttgtgct
tcccatggcgattgcttgtcaccaaataattgttcatgccatgaaggatttacatcaatc
aattgttccatttcaatttgttataattcacctgccactgacccatttgcatgcaatgga
aaaggaaattgtgtaaatccaaatgaatgcgcctgtcaagaaggtaacataggattacaa
tgtgagattccactttgttttggcgtgccatcaaatgaaactcagtcttgtagtggtaat
ggagaatgtattcaatataatgaatgtatgtgtcattcaaattttacaggactcaattgt
tccattccaatatgttttggtataaatgccactgatcaaagtcacgtttgtttttcacat
ggtatttgtcaagaaccagatcagtgtcagtgtcatgaaggatatactggaatacaatgt
gaaattccaatttgtttcaatattccagcaaccaattccagtacctgtgcatccaatgga
gtttgcattgatttcaataattgttcttgtcttgatggatacacttcggaaaattgctcc
ctcccaatatgttatgaattggattctggtaaatcaatggtttgttcttcacatggtcaa
tgtttggctccaaataattgtacatgccttgaaagatttacattcgataattgctccatt
ccaatttgttacaatattgatgcttcaaatagttcagtatgtagtggatttggtgaatgt
tcttctccaaataattgcaaatgtcatgaaaatcatattggattacaatgtgaaattcca
ctttgttttggaattccatcaaatgaaactcagtcgtgtaatggtaatggacaatgtatt
caatataatgaatgtgtgtgtaattcagattatacaggaatagactgttcaattccaata
tgttttggaagtaatgccaccaacctaactgtttgttcttcgcatggtatttgtcaatca
ccagatcaatgtcaatgccaagaaggatacacaggtaccaactgtgaaattcccatttgt
ttcaacattccagctaatgattccagtacatgttcatccaatggagagtgcattgatttc
aataattgttcttgtcatgatggatacacttcagaaaattgttcaattccaatatgtttc
aatttgaatagtactgattctagtgtttgtaactctaatggaatttgtacttcccctgac
aagtgtcaatgccaagaaaatttcacaggtgaaaattgctcaattccaatatgtttcgga
ttggcagcaaactcaagcggggcatgctccgcatctggaagttgtgtttatcccaataca
tgcctctgcaaccaaggaatcattggcattaattgtgaaataccttcctgttttggaata
ttccaaaataatagccaatcctgctcaggaaatggaatttgcattgaactgaacaaatgc
tcatgctacctaaacttcacaggtgaatcctgcttaatttctgcatgtaatggtattgcc
tctaatgatagctctgtttgttccggaaaaggaaaatgcacagctccaaatctttgtgaa
tcatgtgaggaaaattactttggagaatggtgtgaaatttcacaatgttttggaatattc
tcgaatcagagtcaagtttgttctgaaaatggaaagtgtgaatcttacaataattgtaat
tgctcaatgggttatgttggggaaaattgtaatattcctgtatgctttaaaattaattca
accgatgaaaatgtttgtaattctaatggaatttgtacttctcctgatttgtgttcatgt
aattccaaatatggaggtttagaatgttcagaaccgaaatgttttggaaaaacaacatta
gaaggtgcatgcagctcgaaaggtaattgcacacaaccagattcatgtacttgtgagaaa
ggtttctttggtatttcatgtgaattgcattcttgttttggaattcaattgaatgattcg
agtgtgatttgttctggacatggtgaatgcaaatctctggacgaatgtgaatgtgacagt
ggttacttaggtgaatcatgctccatccacacctgttttgggattacattcaatgagagt
ggtgtttgcagtggaaatggaagttgctcaagtttggacaactgtacctgttatggagat
ggaaaattctatgcaaattgtactttaattccaagtgattctccaataattgatagtgat
gtaccttcgaatcatacagaaatatccaataattcaagttcttatccaaattgctttaac
atttcggcaaatcattcgaatgtttgcaatggaaatggaaattgcacaagtgaaaatgaa
tgcaaatgcagagagggatattttggtggggaatgttctctatttgcatgttttggaaag
gaatcagctgattcaagtgtttgttcatccaatggaatatgcgcgagtccaaatacttgt
aaatgtcgaccagaaagatatggctctcagtgtcaacttgtcaaatgttttgaaattctt
tctaatcagtccaatgtttgttccagtaagggttcatgtcaagataccaacgcatgcata
tgtaatgagggctatttcggccccatgtgtaatatcacaagttgtgaaggaattttgagt
aataattctcaagtttgtaatggaagtggacaatgcactcattacaacacttgccaatgt
aaggaaggattcattggattgaactgccaattcaccaaatgcaactctacatcgtgtagg
catggaagttgcatcactacctctcagtgtgaatgcgaaagtggatggacaagctcggaa
tgcaatcttcctatttgttacgatttgttggcaagtgactcgaatgtttgttctacacat
ggcaaatgtatagctccaaataagtgtaactgctccacaaatccattgtacatgggtgat
aagtgccaatacttacaattagatagtttgcaatgtagtattaatccatcactcaatttg
ataccaattgagtggacaatttcaggattggataaaataacatttgatatgagctcgaag
gaaatacttgttagaaacagtatcccatacagtacatctctccattccaaatcaaaattc
aactacgagctcaatatttacaacactggaaagcgatctttcaattatcaaattaattca
ttctgtgaaaatggaatttcattcaaacaattgggaatttcttctcaattcggattatta
caagaaggaaacaatgcaaatattaaggatttacaaaatattggatttgctctcttttgg
aatgatgaaagtttgaaatatgaagatattaaatgtcatgtcgaattaatagtcaatccg
aaagatcaattcgatgaatgtcaacactacgattcgaatactgaaacatcctccaaatat
aatattactctcatattggaacgtacaaatgtttgtcaatttttgaaagaaacagattta
ccactgaccttttcaagcactcaattgtcaaccatgagtgaaatagctctaattgatgaa
aatattctttcagataacgatattctcaaaattattaatacattcactcaaaagaggaat
aactggcaaataattaataaggacaacagtactcttcaagctaacatcttgttaactgcc
cagttgagtaatccaaacaatgaattgggactttttgttccatctctgatatgtaaggat
gaaagaattgttgatgacatagaatttaccacagaatatctttccaatcaatctccattc
tccatttctcactctctacaaaagattcaattccaattcaatgttacaattaagaatgtt
tcgaattatgttgattatggtagagtgagaggaggaaaggaaggaatggcaacagttctc
attgaggacatgctccttaattgttctctcattctcctaccaaatccatctgagtgttgg
tccaacacgaatagaaattccacattctccaaatatatcatttcacactttacactgcca
attgtttctggtgaattttcattcttccaagctgtgagatccttcgaaataggtatcatt
acacttacctacacttgtatgggcattggttttgcatccatgatatgcacgaccaaagtt
cctcgagatcgaaaacattctctgctccaacttgtagaatttgtcaaggaaaagagaaga
aacaaactcaactctacatctgatgactccaaaccactcctagagaatcaaattgatagg
ccatactgtgaaaattgtggtcatcacactcggaagaaagctcgttatgccattcgtgtg
gaaaattatgatgctaattgcgaaatgttcatttgtgagaatcaggtatgttttgaagcc
atgatctctctccacaatagaggatactcccatcactatcaatgtttcgacttggataaa
gaagaagattgtcaactcatgattgaaacaccattcaagacacttgctgataattttgat
gagtcggatatttatgaatctatggatattgaatttccaataccttccgatatcaatgat
gatgaagaagatgactctgatttattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
