Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_65369
Help
Entry
NAEGRDRAFT_65369 CDS
T01241
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K03128
transcription initiation factor TFIID subunit 2
Organism
ngr
Naegleria gruberi
Pathway
ngr03022
Basal transcription factors
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ngr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03022 Basal transcription factors
NAEGRDRAFT_65369
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
ngr01002
]
NAEGRDRAFT_65369
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ngr03021
]
NAEGRDRAFT_65369
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ngr03036
]
NAEGRDRAFT_65369
Peptidases and inhibitors [BR:
ngr01002
]
Metallo peptidases
Family M1
NAEGRDRAFT_65369
Transcription machinery [BR:
ngr03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Basal transcription factors
TFIID
NAEGRDRAFT_65369
Coactivators
SAGA/TFTC/STAGA complex
NAEGRDRAFT_65369
Chromosome and associated proteins [BR:
ngr03036
]
Eukaryotic type
Histone modification proteins
HAT complexes
TFTC complex
NAEGRDRAFT_65369
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cyclophil_like
Peptidase_M1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8860000
NCBI-ProteinID:
XP_002679169
JGI:
Naegr1_65369
UniProt:
D2V9A2
LinkDB
All DBs
AA seq
1957 aa
AA seq
DB search
MLASTPAGEHGVVFQPNNNNINFNNQYSVASPSMMNGSESSYQQEQYYTSNINNNNGYPQ
NNIPSQVTSSMKVESSQVDTSKKDQKSEKKKKKKKSTDKKARSAEPRLPYKVLHQKLVLD
VDLYQKALIGYTDIIITPFHNNIDQISLHCLQSNVTGVHALFINKLKSQPIVQQNEDQIQ
QVTHNNIQNQVNHHDLEVSIKEFMLQYDIENEGTLTIKFKTPLLKKTTSSIRIFFDLKNP
LSGVYFVDTTSKNDQSMIDDNELNSNTSTTQTNNNDMIDENLSSLNSTMPHMYTQSQMQG
ARCWFPCVDLLSSFHSFEFEITSHAEAMIICSGDLIKQVENYSGTLKTSYFKTKSIISPS
SVCIAVGPFNISYSSLTLNSYDLILNAFYLPSYSLESIRHTLGFVKRALIFLEDYLEFKY
KDLFNLNTLNIVFIENGYTKQSTFSGICLLDSNQMILEPNIIDTVQDNRMSLVRLITEQF
FGNFIHSKTWSDYWLIEGIAGYLAYQYYESEFGQNAKRFKIMKAGKELLSIENHTQSLYI
ENYCHPSELLTEYLLKKSPLVIYMIDRQISTSNMRNLLNKFLKNAHTLDSKRYNDRLISS
SSFIKTIGKTFATDLKEFSSYWIYGTGIPQFAISFKYDDMRSCVDLKVKQILPFPEIQPF
RGKVTVRILESEGAPNDFIANLDKEENQFEFHINSKPIKKHHKKVQGGQGQPTEAVRVII
PLKWIRFDPEQDWIKVQSFSQTQEMWNYQLNDVKDVVAQYESIKALTFFADTEPVITILN
RILRDNSYYYQIRVCAAHALSKIPQPIEKKEALNVLIGFFKTQFYDEQLTYLKPNNFKNF
ADYFLKKEIPLALTNFKDDKVNNETFPEVVLLLLELIKYNDDSENLFSGNFYIANLIKSI
SLLNTSNPNFNQKIEKILYKYLVIDSDLIPSYHYIKTVTSLESIANLQSSGKSKINLDVF
YRYLDFKKSDHVRFSSWRCVMNILDSILDSSSLNNNNMNGNNLNNNNLNGNNLNEKNIIT
SSGELISECYSNVELLTHVKIIFNRFISLLNDENETSHAKYEITKIITQSIFNCSARMLL
EFNNKKVSLAFIKKVSALGLFLIDIRLSKITNRKLVDLIWNYLHDSKYTQFDFKLRSIIM
NLYKSIWSSNIPLCYDSKFVNSNNFDHAILVAPSLYGITDLKIVQPQQLKSHQYLASEQP
RVVFDSSQLSNFISSPALAPTIFTTSQIDKKKRSSKSSSAALSSLVSSATANNSSSTGSG
SGSSNGNGLSVVTSLSTPTTITISTAGQSTVINSILVKKDSKKKESSSSSKSKSSSKKES
SSSDKKDKDSSESKKKDKDSEKKKSKKDSDKKDKDSEKKRKRDSEKSSPSSSSKKKKEVV
EPVTPTTVKIKLNTPITTPLASSSTSMTTPEQPKKKKPSSKSKSEKLTTPALTSEKSTSS
SASASSSSAIGSSSSSSGSSRGGTSLSIKKEINIDDQLVTPAAAATTIAQTQEIGKNEKE
SIEKKLKNREAKKNQCKATRLILITFDTSEIKVYVELDDDSPTADVIYRSVPLASPLVQS
PGKGIVYFTCEIEHIELEETARSEVKQGEIAFWVSGTAFVLGFGKTVFSLANETRLYQPC
NIFGEMMYPVKSLQKTALQQKVTVSRFPRVYIDLPELDKRIDIDMYDTFKDITNGYIAPR
LPFTRQFMPLFGRILYFNIGHIDTSHLESVSPGFHRDYLYPGEIAYWAGGDSLLLGTGPT
DIKKHNHNSKEIRYNLLENCFIIGKIVSADYNLLPDLIEKYPHTPLYFNRRELVITIDFE
PNLNEQINGEGAVNSLDILIGVSGTMSGDIIFDTCFNGYETRGHEITQPQGDKCGIVGIK
LNPKENPILETLQHEINNATETAKPQEVVLFWDSHTIGFPFSNNPETAPYNLPEMANPFG
SFKQVLNMEMSYYQFINFLQNRKVKQFTITKREIEYN
NT seq
5874 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttagcatcaacaccagcaggtgaacacggtgttgtattccaacctaacaacaacaat
atcaattttaataatcaatattccgtggcatcaccatccatgatgaatggttcagaatct
tcatatcaacaagaacaatactatactagtaatatcaacaataataatggatatccacaa
aataatattccatcacaagttacatcatcaatgaaagttgaaagtagtcaagttgatact
agtaagaaggatcaaaaatcggaaaagaagaaaaagaagaaaaagtctactgataaaaaa
gcaagatctgcagaaccacgtctaccatacaaagtcttacatcaaaagttagttttagat
gtagatttgtatcaaaaggctttgataggttatactgatattattattacacctttccac
aataatattgatcaaatatcattacattgtcttcaatcaaatgtaactggtgttcatgca
ctttttataaacaaacttaaatcacaacctattgtacaacaaaatgaggatcaaattcaa
caagtaactcataataatattcaaaatcaagttaatcatcatgatttggaagtatctatt
aaagaattcatgttacaatatgatattgaaaatgaaggaacattaactattaaatttaaa
acaccattactaaagaaaacaacatcatctattagaattttctttgatttgaaaaatcct
ctaagtggagtctattttgtagatacaacaagtaaaaatgatcagtcaatgatagatgat
aatgaattgaattctaatacttcaactacacaaacaaataataatgatatgattgatgaa
aatttatcatcacttaatagtacaatgccacatatgtatacacaaagtcaaatgcaagga
gcaagatgttggtttccttgtgttgatttattatcatcatttcattcatttgaatttgaa
attacaagtcatgctgaagcaatgataatttgttcaggtgatttgataaaacaagttgaa
aattattcaggtactttaaaaacatcctattttaaaacaaaatccatcatttcaccttca
agtgtttgtattgcagttggaccatttaatatttcatattcaagtttaactctaaattcc
tatgatttaatattaaatgctttttatttaccaagttattcattggaatctattagacat
actttaggatttgtgaaaagagctttaatatttttagaagattatttagaatttaaatat
aaggatttatttaatttaaatacacttaatattgtatttattgaaaatggttatacaaaa
caatcaacatttagtggaatttgtttattagattcaaatcaaatgatattagaaccaaat
attattgatacagtacaagataatagaatgagtcttgttcgtttaataactgaacaattt
tttggtaattttattcattccaaaacatggtcagattattggttaattgaaggtattgca
ggatatttagcctatcaatattatgaaagtgaatttggtcaaaatgctaaaagatttaaa
ataatgaaagcaggaaaggaattactttcaattgaaaatcatacacaatcattatatatt
gaaaattattgtcatccaagtgaacttttaacagaatatttacttaagaaatcaccactt
gttatttatatgattgatagacaaatttcaacttctaatatgagaaatttattgaacaaa
tttttaaaaaatgctcatacacttgatagtaagagatataatgatcgtttaatttcatca
tcaagttttatcaagacaattggtaaaacttttgcaacagatttaaaagaattttcatct
tattggatttatggtactggtattccacaatttgcaatttcatttaaatatgatgatatg
agaagttgtgttgatttaaaagttaaacaaattttaccatttcctgaaattcaacctttt
agaggaaaagtaactgttagaattttagaatctgaaggagcaccaaatgattttattgca
aatttagataaggaagaaaatcaatttgaatttcatattaattctaaacctattaaaaag
catcacaaaaaagttcaaggtggacaaggacaaccaacagaagctgttcgtgttatcatt
ccattaaaatggattagatttgatccagaacaagattggattaaagtacaatcattttca
caaacacaagaaatgtggaattatcaattgaatgatgttaaagatgttgttgcacaatat
gaatcaatcaaagctttaacattctttgcagatactgaacctgttattacaattttaaat
agaattttaagagataattcttattattatcaaatacgtgtttgtgctgcacatgctctt
tctaaaattccacaaccaattgaaaagaaagaagctttaaatgttttaattggatttttt
aaaacacaattctatgatgaacaattaacttatttaaaaccaaataattttaagaatttt
gctgattatttccttaaaaaggaaattccattagctttaacaaattttaaagatgataag
gttaataatgaaacatttccagaagttgttttacttttattagaattaatcaaatataat
gatgattctgagaatttattctctggaaatttctatattgctaatttaatcaaatcaatt
tcacttttaaatacttcaaatcctaattttaatcaaaaaattgaaaaaatactttacaaa
tatttagtaattgattctgatttaattccaagttatcattatatcaaaactgttacttct
ttagaatcaattgcaaatttacaatcatctggtaaatctaaaattaatttggatgttttt
tatagatatttggattttaaaaaatcagatcatgtcagattttcatcatggcgttgtgtt
atgaatattttagattcaattttagattcttcttctttaaataataataatatgaatggt
aataatttaaataacaataatttaaatggtaataatttaaatgaaaagaatataataaca
tcaagtggagaattaatatcagaatgttattcaaatgtagaattattaacacatgttaaa
ataatatttaatagatttatttcattattaaatgatgaaaatgaaacaagtcatgctaaa
tatgaaattactaaaattataacacaatcaatatttaattgttcagcacgtatgctatta
gaatttaataataagaaagtttcattagcatttattaaaaaagtatcagcattgggatta
tttttaattgatataagattatcaaaaataacaaatagaaaattagttgatttaatttgg
aattatttacatgattctaaatatacacaatttgattttaaattaagatcaataattatg
aatttatacaaatctatttggtcttcaaatattccattgtgttatgattctaaatttgtt
aatagtaataattttgatcatgctattttagttgcaccttctttatatggtattactgat
ttgaaaattgttcaacctcaacaattgaaaagtcatcaatatttagcaagtgaacaacca
cgtgttgtatttgattcaagtcaattatcaaattttatttcttcacctgcacttgcacca
actatatttacaacaagtcaaattgataagaagaaacgatcttcaaaatcatcttctgct
gctctttcatcacttgtttcaagtgctacagctaataattcatcatcaactggtagtggt
agtggtagtagtaatggtaatggacttagtgttgttacttcactctctacaccaacaacc
attacaatttctactgcaggtcaatctactgttattaattcaatactagtaaagaaggat
tcaaagaagaaggagtcatcttcctcttccaaatctaaatcgtcctctaagaaagagtcc
tcctcttctgataaaaaggataaagattcctcagagtctaagaagaaggataaagattct
gaaaagaagaaatccaagaaggattccgataagaaggataaggattctgaaaagaagaga
aagagagactctgaaaaatcttcaccttcttcctcatctaaaaagaagaaggaagttgtt
gaacctgttacaccaaccactgtaaaaatcaagttaaatacaccaattacaacaccgtta
gctagcagttcaacttcaatgacaacacctgaacaacctaaaaagaaaaaaccttcttca
aaatccaaatcagaaaagttaactacacctgctttaacaagtgaaaaatcgaccagttca
agtgcttctgcatcctcatcatctgctattggtagtagtagtagtagtagtggtagtagt
agaggtggtacaagtctatcaattaagaaggaaattaatattgatgatcaacttgtaaca
cctgcagcagcagcaacaacaatagcacaaacacaagaaattggtaagaatgaaaaggaa
tctattgaaaagaaattgaaaaatcgtgaagctaaaaagaatcaatgtaaagcaactcga
ttaattttaattacatttgatacaagtgaaattaaagtttatgttgaattggatgatgat
tcaccaacagcagatgtaatttatcgtagtgtaccattagcatcacctctagtacaatca
cctggtaaaggaattgtttattttacatgtgaaattgaacatattgaattagaagaaaca
gcaagatctgaagttaaacaaggtgaaattgcattctgggttagtggtacagcatttgtt
ttgggatttggtaaaacagtattttcacttgctaatgaaacacgtctctatcaaccatgt
aatatatttggtgaaatgatgtatccagttaaatcattacaaaaaacagcattacaacaa
aaagtaactgttagtcgtttccctagagtttatattgatttacctgaacttgataaacgt
atcgatattgatatgtatgatacatttaaagatattacaaatggatatattgcacctaga
ttaccatttactagacaatttatgcctttatttggtagaatattatattttaatattgga
catattgatacatcacatttagaatcagtttcacctggttttcatagagattatttatat
ccaggtgaaattgcttattgggcaggtggtgattcacttttacttggtacaggtccaaca
gatattaagaaacacaatcataattcaaaggaaattagatataatttattggaaaattgt
tttattattggtaaaattgtttcagctgattataatttattacctgatttaatagaaaaa
tatccacacacaccactctattttaatagacgtgaattggttattaccattgattttgaa
ccaaatttaaatgaacaaattaatggtgaaggtgctgttaatagtttggatattttaatt
ggagtttcaggtacaatgagtggagatattatatttgatacttgttttaatggatatgaa
acaagaggtcatgaaattactcaaccacaaggtgataaatgtggtattgttggaattaaa
ttaaatccaaaagaaaatccaattttagaaacacttcaacatgaaattaataatgcaact
gaaactgcaaaaccacaagaagttgttttattttgggattcacatactattggttttcca
ttttcaaataatcctgaaactgctccttataatttacctgaaatggcaaatccatttgga
agttttaaacaagttttaaatatggaaatgagttattatcaatttattaactttttacaa
aacagaaaagttaaacaatttacaattacaaagagagaaattgaatataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
