Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_65627 Help Entry NAEGRDRAFT_65627  CDS       T01241                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K14772   U3 small nucleolar RNA-associated protein 20 Organism ngr  Naegleria gruberi Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ngr00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03009 Ribosome biogenesis [BR:ngr03009]     NAEGRDRAFT_65627 Ribosome biogenesis [BR:ngr03009]  Eukaryotic type   90S particles    U3 small nucleolar RNA-associated proteins     NAEGRDRAFT_65627 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  UTP20 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  8859423 NCBI-ProteinID:  XP_002678942 JGI:  Naegr1_65627 UniProt:  D2V9U0 LinkDB All DBs AA seq 2543 aa AA seqDB search MSSKRSNLLLSKDYQSKKSSKQTTNQNNDDDENLTQEDKINRRVQSVLKTLPSKKDENLI KFKSFYECIKDVKILSEVQFDTYRKEESKNEHDSTTFLYDKMLEWDELNLTKHYIQFRSN IQSFVRTLPEMIHHKETICDIFVNHLRIKDSLAYQPILDLVTIFAKDLRQEFYPLFPRLF YPIVYNINISLWFEKYSKILSHKKWYIRKFAAESFSFLINKLSDEELKIYVEKVFNLLIE KPSQIMYDGVSQMFFESMKGILGNLHSKMSRLLPLLFRQLNWNLNYNGTIKQQLADIGNK FTLIEKYKQTVYTFYRKLMKTIGNEQESNTIVKEFLRFVNDDINYNFDSTVAFLLNFIHT NTTSNSNLDTNLEYTLLSDKNSKFIQIIYNKFIEIISNIKSQQDLIQFSKQSNSLLLLWS ILNILSIYGKKSDQYLKNLYENVYKFLLQFIKLIDQSQYEKKELQLLQIIIAQSLTLLNQ VLHFYNKNFNNLIEIVMEISCKFGSSLQVLISCNQLIDNVDSNLLTNDKFKIIAESLKSN LQSKSDNLRLETLKYLTKFEQDEIQKGIVLNKVETTKCVVLEFLRDSEECGFDWDQSRNR TVLLEKANEFLKRYTIPQIYKTLISNYVFGSYFTKYQIVWEPTSNLASTMMRINFKEFWN LLIPIISNIYQKSRDSKKEDDILLVFNSFYENEFKEYDIEEVVNFITRNPMTGRLEKLLN LISEFNEDFFKKEKSKFIKSVIFRLFSTSTISIQLLSLKCLQKFNLPYLTSKTVKNLQKV ISSNRSVEHLSKLDFINIPKQYKQEYIHLHLKVIEPYLLMFDMTKKRGKNSKDAMIKKWK IRVHQVIEFLGQLPKETLEYFINMLFNRFKSIDNNNGNDSNIDSNIESTNTNNSDGKFAE DLIKANTFQLRWLLDIIEEILTCLTGNYHYFYNQVLDLLITIIELRVDAHEMEVDQEEEE QKLLEQQLLEQEEEEEEDDEQDESSTIKDSDSKSSEKSDKMTDEVDDEDDDQDDDDDEST ATSIQTTSTTKSTIAKSTTSTTTTTTDNNTSYYSSSKQKVSLTLTFKRAVELLELFFDRK QEFDYSIEFTSHVISLFTKFFENINKKSSRIEELPSYFSILFSWFDKPKLYYLIKYYEKE LIFKFIELIDQYNVSNVVFDQVLSIFDKILSNKDEIFMNLNPNFSKITTDIENGLTIGMK IFEPSIINQILIAFYNLFIESNYSSKSINNNNNNNNYKSKNNSYNNNNNNNNNLNKLNDE LNEQSNEKQEFSKKCFKLIDKMKGYFDETSPADIILTFYGTSIRDGSSLNEDEARHKEWI LRDSSSQSLLNIIEIIKFNNEMKEIKRLLILHVKRLSFSDKLLEKSESMLVYSKMIDQFI ELENLKPFSKSLELISNVNYQKKLEGLQIINSILIPIEKCKIQQDYIYQIVPPLIYELMV INDKSIQDLVKQLCIYLVTVLDWNYSHPILNQLVTMMGTYGLKVLSKRKKLALDIICQIV DVFPFDKINDHGFNSSYSYNNRNDNNRYNNRRHESEEPLSNSTVTIEKDTTNDDDDNDAD DNEMIDENEIPKGRRMKRYFMKDFIPKVTKFLWDKKLEIYVMRMQVCFLIIKVLRRCDKT QLDVHLSKMVLDVLGKLKSKDEEQQQVAGKALIDMFKELGTVHSVMLILLNENTYPPLKT FKKRKVSRFDIEKAQDYENQSSIGENSVSLTASDSSSSKHFKSKHENTLFNCFELLGSII DIKKSLSYIINDINFKIRIVHNAEILKRFEFVFKFLLKGLMRNRQVIQSNQSITNTITNN TTTKQSNQSNNNSEMLLNVIKNELYHYRLYKKNFTTITDGEQDRFHSVKTTKDRKEENFL VQKEPGRLGAIDQANDMKMKLLAGLIDNSHIIVQFYLKMFEKCIKRFKIQVDKHLEMMNE IIPLLLKYVSGNHLNVALVSFRILIEICKRTPKVFKILEDSKQLLLNSTFDILTNSGIDS TNLETWETIYTGIKYFLQSDISHKYPLSLGQLDILLDMLKIEISSTRKTYSIQTFQILSN LIDNKVQIPQIYDLMDKSITIMLTTLEMEIQKTIVEMLVNFYLNYPFTNEVLQDKLNYLF KNVLNENMSNESKLSILNLIQTIIKKFPNNFLNDKTELIYYPLILELEKQCKKRVIAGDN KSISSIVSKLRETLQFFIKILNDENLIKIIKITNDWILNEKKLKPIGVNSILILSNVSNG SKLKSSSEFYENMIPQLISIIENSDTNLEKYPSLVLETLECFYSLFSQSIISFQHVDEIW NSLLKIICDENDLRSEIRLESLKIFELFVSKKKKNESKILNHLQYLEQMSISIIELFKSQ YINDTNVIVIVKVLIYLFKLLDSNNGSEILHKLFKSLRKISNQTFDFDTNENITFRRMNI LKLFIGLASKYGNQLQPYLIYMTPLIYRCCEFSNRDKSIVTIELEKFAKESKQLIQQSLT DSNLFVQAYEEGRKLVESKSEKKSKSKEQSIISKPSQYAKKRLESNSKKNDTKKRKLKES FNQPTVQISSSGNVQQVKKKKKK NT seq 7632 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtcatcaaaaagatctaatttattactctctaaagattatcaaagtaaaaaatcatca aaacaaacaacaaatcaaaataatgatgatgatgaaaatctaacacaagaagataaaatt aatagaagagtacaaagtgtattaaaaacacttccatctaaaaaggatgaaaatttaatt aaatttaaatcattctatgaatgtattaaagatgttaaaatactttcggaagtacaattt gatacttatagaaaagaagaatcaaagaatgaacatgattcaactacttttttatatgat aaaatgttagaatgggatgaattgaatttaactaaacattatattcaatttagatcaaat attcaatcatttgttagaacattacctgaaatgatacatcacaaagaaactatttgtgat atttttgttaatcatttaagaattaaggattctcttgcttatcaacctattttagatcta gtaacaatatttgctaaagatttacgacaagaattttatccattatttccacgtttattt tatccaatagtatataatataaatatatcattatggtttgaaaagtatagtaaaatactt tcacataagaaatggtatattagaaaatttgcagctgaaagtttttcatttttaattaac aaactttcagatgaagaattaaaaatttatgttgaaaaagtttttaatttattaattgaa aaaccatcacaaataatgtatgatggtgttagtcaaatgttttttgaatcaatgaaaggt attttaggtaatttacattctaaaatgtcaagattattacctttattatttagacaatta aattggaatttaaattataatggtactattaaacaacaattagctgatattggtaacaaa tttactttaattgaaaaatataaacaaacagtttatactttttatagaaaattaatgaaa acaattggaaatgaacaagaatcaaatacaattgttaaagaatttttaagatttgttaat gatgatattaattataattttgattcaactgttgcttttttattaaattttattcatact aatactactagtaatagtaatttagatacaaatttggaatatactttattatctgataaa aattctaaatttattcaaattatttataacaaatttattgaaattatttcaaatattaaa tcacaacaagatttaattcaattttcaaaacaatcaaattctttattattattatggtct attttaaatattttatctatttatggtaaaaaatcagatcaatatttaaaaaatttatat gaaaatgtttataaatttttattacaatttattaaattaattgatcaaagtcaatatgaa aagaaggaattacaattattacaaattattattgcacaatctttaactttattaaatcaa gttttacatttctataataagaattttaataatttaattgaaattgttatggaaatttca tgtaaatttggttcatcattacaagttttaatttcatgtaatcaattaattgataatgta gattccaatttattaacaaatgataaatttaaaataattgcagaatcattaaaatccaat cttcaaagtaaatctgataatctaagattagaaacattaaaatatttaactaaatttgaa caagatgaaattcaaaaaggaattgttcttaataaggtagaaactactaaatgtgtagtt ttagaatttttaagagattcagaagaatgtggatttgattgggatcaatcacgtaatcgt acagttttattagaaaaggctaatgaatttttaaaacgttacaccattccacaaatttac aaaactttaatttctaattatgtatttggttcatattttacaaaatatcaaattgtatgg gaaccaacaagtaatttagcatcaacaatgatgagaattaattttaaagaattttggaat ttattaataccaattatttcaaatatttatcaaaaatcaagagattctaaaaaagaagat gatatattattagtatttaattccttttatgaaaatgaatttaaagaatatgatattgaa gaagttgttaattttattactagaaatccaatgactggtcgtttagaaaaattattaaat ttaatttcagaatttaatgaagatttctttaaaaaggaaaaatctaaatttatcaaatca gttatttttagattattttcaacttcaacaatatcaattcaattattatctttaaaatgt ttacaaaagtttaatttaccatatttaacaagtaaaactgttaaaaatttacaaaaagta atttcatctaatagaagtgttgaacatttatctaaattagattttattaatattccaaaa caatataaacaagaatatattcatttacatttaaaggttattgaaccttatttattaatg tttgatatgactaaaaagagaggtaaaaattctaaagatgcaatgattaaaaaatggaaa attagagttcatcaagttattgaatttttaggtcaattaccaaaagaaacacttgaatat tttattaacatgttatttaatagatttaaatctattgataataataatggtaatgatagt aatattgatagtaatattgagagtacaaatactaataatagtgatggtaaatttgctgaa gatttaatcaaggcaaatacattccagttacgttggttattagatattattgaagaaatt ttaacatgtttaactggaaattatcattacttttataatcaagtattggatttattaatt actattattgaattgagagttgatgctcatgaaatggaagttgatcaagaagaagaagaa caaaaattacttgaacaacaattacttgaacaagaagaagaagaagaagaagatgatgaa caagatgaatcatccactattaaagattctgatagtaaatcatctgaaaaatcagacaag atgactgatgaagttgatgatgaagatgatgaccaagatgatgatgatgatgaatctact gctacttctattcaaactacttctactactaaatcaactattgctaaatctactacttct accacaactacaacaactgataataatactagctactactcatcatctaaacaaaaagta tcattaacattaacatttaaaagagcagttgaattacttgaattattctttgatagaaaa caagaatttgattatagtattgaatttacatcacacgtaatttcattatttacaaaattc tttgaaaatattaataagaaatcatcaagaattgaagaattaccttcttacttttcaatt ttattttcatggtttgataaacctaaactttattatttaattaaatattatgaaaaggaa ttaatatttaaatttattgaattaattgatcaatataatgtttctaatgttgtatttgat caagttttatctatttttgataaaatattatcaaataaggatgaaatttttatgaattta aatccaaacttttcaaaaattacaacagatattgaaaatggtttaactattggtatgaaa atatttgaaccttcaattattaatcaaattttaattgcattttataatttatttattgaa tctaattattcatctaaatctattaataataataataataataataattataaatctaaa aataatagttataataataataataataataataataatttaaacaaattaaatgatgaa ttaaatgaacaatcaaatgaaaaacaagaattttctaaaaaatgttttaaattaattgat aaaatgaaaggttattttgatgaaacatcacctgctgatattattttaaccttttatgga acatcaattagagatggatcttctttaaatgaagatgaagcacgacataaagaatggata ttacgtgattcatcttcacaatcattattaaatattattgaaattattaaatttaataat gaaatgaaagaaattaaaagattattaattttacatgttaaaagattatcattttcagat aaattattagaaaagagtgaatcaatgttagtttattctaaaatgattgatcaatttatt gaattggaaaatttaaaaccattttcaaaatcattagaattaatttcaaatgttaattat caaaagaaattagaaggtttacaaattattaattctattttaattccaattgaaaaatgt aaaattcaacaagattatatttatcaaattgtacctccactcatttatgaattaatggta attaatgataaatctattcaagatttagttaaacaattatgtatttatttagtaactgtt ttagattggaattattcacatccaattttaaatcaattagttacaatgatgggtacatat ggtttaaaggttttatcaaagagaaagaaattagcattggatattatatgtcaaattgtt gatgtatttccatttgataaaattaatgatcatggttttaatagtagttatagttataat aatagaaatgataataatagatataataatagaagacatgaatcagaagaaccattatca aatagtacagttactattgaaaaggatactacaaatgatgatgatgataatgatgcagac gacaatgaaatgattgatgaaaatgaaattccaaaaggtagaagaatgaagagatatttc atgaaagatttcattccaaaagtaacaaaattcctttgggataagaaattagaaatttat gtcatgcgtatgcaagtttgtttcttaattattaaagtattaagaagatgtgataaaaca caattagatgtacatttatctaaaatggtattagatgtattaggtaaattaaagagtaaa gatgaagaacaacaacaagttgctggtaaagcattaattgacatgtttaaagaattggga actgtacattcagtcatgttaattttattgaatgaaaatacatatccacctttaaaaaca tttaaaaagagaaaagtttcacgttttgatattgaaaaggcacaagattatgaaaatcaa tcatcaataggtgaaaattcagtttcattaactgcatctgatagttcttcatcaaaacat ttcaaatcaaaacatgaaaatactttatttaattgttttgaattattaggttcaattatt gatattaagaagagtttatcatatattattaatgatattaatttcaaaattagaattgta cataatgctgaaattttaaagagatttgaatttgtatttaaatttttattgaaaggttta atgagaaatagacaagttattcaatctaatcaatctattactaatactattactaataat actactactaaacaatctaatcaatctaataataatagtgaaatgttattaaatgtaatt aaaaatgaattatatcattatagattatataaaaagaattttacaacaataacagatgga gaacaagatagatttcattctgttaaaactactaaagatagaaaggaagaaaatttcctt gtacaaaaagaaccaggtagacttggtgcaattgatcaagctaatgatatgaaaatgaaa ttattagcaggattaattgataattcacatattattgtacaattttatttaaaaatgttt gaaaaatgtattaaaagatttaaaattcaagtagataaacatttagaaatgatgaatgaa ataataccattattattaaaatatgttagtggtaatcatttaaatgtagcattggtttca tttagaattttaattgaaatttgtaaacgtacacctaaagtatttaaaatattagaagat tctaaacaattattattaaattctacatttgatatattaacaaattcaggtattgattct acaaatttagaaacatgggaaactatatatacaggtattaaatattttttacaatctgat atttcacataaatatccattatcattaggacaattagatattttattagatatgttaaaa attgaaatttcatcaactagaaaaacctattcaattcaaacatttcaaattttatcaaat ttaattgataataaggtacaaataccacaaatttatgatttaatggataaatcaattaca attatgttaactacacttgaaatggaaatacaaaaaactatagttgaaatgttggttaat ttttatttaaattatccatttacaaatgaagtattacaagacaagttaaattatttattt aaaaatgttttaaatgaaaatatgtcaaatgaatctaaattatcaattttaaatttaatt caaactataattaaaaaatttccaaataatttcctaaatgataaaactgaattaatttat tatcctctaattttagaattagaaaaacaatgtaaaaaacgtgttattgcaggtgataac aaatcaatttcatcaattgtttcaaaattaagagaaactttacaattttttattaaaata ttaaatgatgaaaatttaattaaaattattaaaattacaaatgattggattttaaatgaa aagaaattaaaaccaattggagttaattctattttaattttatcaaatgtatcaaatggt agtaaattaaaatcatcatcagaattttatgaaaatatgatacctcaattaatttctata attgaaaattcagatacaaatttagaaaaatatccaagtttagtattagaaacattggaa tgtttttattcattattttcacaatctattatttcattccaacatgttgatgaaatttgg aattccttattaaaaataatttgtgatgaaaatgatttgagaagtgaaattagattagaa tctttgaaaatctttgaattatttgtttctaaaaagaagaagaatgaatctaaaatttta aatcatttacaatatttagaacaaatgtcaatttcaattatagaattatttaaatcacaa tatattaatgatacaaatgtaattgtaattgttaaagttttaatttatttatttaaatta ttagattctaataatggaagtgaaattttacataaattatttaaatctttacgtaaaatt tcaaatcaaacatttgattttgacaccaatgaaaatattacatttagaagaatgaatatt ttaaagttatttataggtttagcttctaaatatggtaatcaattacaaccttatttaatt tacatgacaccattaatttatagatgttgtgaattttcaaatagagataaatcaattgta acaattgaattggagaaatttgctaaagaatctaaacaattaattcaacaatcattaaca gattcaaatttatttgttcaagcttatgaagaaggtagaaaattagttgaaagtaaaagt gaaaagaaatcaaaatctaaagaacaatcaatcatatcaaaaccatcacaatatgctaaa aagagattggaatcaaattctaaaaagaatgatactaaaaagagaaagttaaaagaatct tttaatcaaccaactgtacaaatatcatcatctggtaatgtacaacaagttaaaaagaag aagaagaagtaa

DBGET integrated database retrieval system