Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_69331
Help
Entry
NAEGRDRAFT_69331 CDS
T01241
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14327
regulator of nonsense transcripts 2
Organism
ngr
Naegleria gruberi
Pathway
ngr03013
Nucleocytoplasmic transport
ngr03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ngr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
NAEGRDRAFT_69331
03015 mRNA surveillance pathway
NAEGRDRAFT_69331
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ngr03019
]
NAEGRDRAFT_69331
Messenger RNA biogenesis [BR:
ngr03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Surveillance factors
Surveillance complex
NAEGRDRAFT_69331
mRNA cycle factors
P-body specific factors
NAEGRDRAFT_69331
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MIF4G
CNOT11
DUF5327
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8852207
NCBI-ProteinID:
XP_002675400
JGI:
Naegr1_69331
UniProt:
D2VKB1
LinkDB
All DBs
AA seq
973 aa
AA seq
DB search
MNEEKKAELRAKNEQALKGKRPDASFFKSLDASIKKNSAFVKKIKSLHELTPDQKVSIVP
DIQKLNLRRFISEIVQGFLEMPLKLEDVDIIVEIASSLHQLYAEFSESFVTSLVKSCKDS
DKKEPNLPRLHVVLLIITKLFITRMHDNFTIVGTVLKGFITINKKTSQSSILMPFLTEFQ
HDFLIGKSYDATKCFITEPEHKLINEQFLSFFETLCERLRSKQKEINEDEQAATTNIDDG
NTENLDKEKKKLKQWKKQYDLAKEAADILQSKIPSDIEDALLKVEDLSAKKEQQDKKDIL
TDNIDKFVNERTRQFYEEIPDINTLINDKNELENIVSMEDLLDKLPKRPPIDKLATTLAI
KYLNQKGNRTKLVKKMFSVNRTSLELLPYYSRLIAILNPLFKDVGKSLVQSLEEEFNKLF
EEQDQIKIETKVKNIRFLGELILFKICPEETGIEFLKKCLSQFHHHNIDVACHFLEVCGR
YLYAQSTSHLLMVELISKMMRIKDIKVLDVKYNTMIDSAYYNTVVNVDQEVEKPRTVFGE
DDELTQYVLHLLLSELNKYNINTVLKQLRKLPYDDFDRIKNIIKSILSHIRECAFGTIHL
MASVLGGLSRYHEEIGVVIIDLLLEEIRYSLQQEYIDNIELGINQNAEYIPSRLRSEQKR
IIDIKFLGEFYNYQLLDINVIMDVLYTLILYPTPLLPHKQDTFRLRLVCTLLDTCGPYFE
TSADRKKLDRFLLYLQRYVLSKQYRLPVDMENMLADTLDTVRPKLKWPKNLKEVVDKIDY
IEQKKPIPLPGQSKSNDPLSLWPINDHEDELSATAAAEEEDVVQDETEDSQNNSKSSTHK
DDDGGELDKELMEMINQSINERKYLTNNNIVKMGTLISKPQEMMTQAITPKIIHHQQPAH
HHHHQQHIQHTQHAQHAQHDSTNTSSSSPPPPMAQKITILSKQGRTNKAQEVFVAANVTK
LLRKDSNNNNTTQ
NT seq
2922 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgaagaaaagaaggctgaactccgagcaaagaatgaacaggccttgaaaggaaaa
agacccgatgcttctttctttaaatcattggatgcttctattaagaagaatagtgctttt
gtaaagaaaattaaatcattacatgaattaactcctgatcaaaaagtatcaattgtacct
gatattcaaaaattaaatcttcgtagatttattagtgaaattgttcaaggctttttagaa
atgccattaaaattggaagatgtagatattattgtagaaattgcatcatcacttcatcaa
ttatatgctgaattttctgaaagttttgttacatcacttgtaaaatcatgtaaagattct
gacaagaaggaacctaacctacctagattacacgttgtattattaattattactaaatta
ttcataactaggatgcacgataattttacaattgtaggaactgttttaaagggatttatt
acaatcaataagaaaacttcacaatcatcaattttaatgccttttttaacagaattccaa
catgactttttaattggaaaatcctatgatgctactaaatgttttatcactgaaccagaa
cacaaacttattaatgaacaattcttgtcattctttgaaacactttgtgaacgtttaaga
tctaaacaaaaggaaattaatgaagatgaacaagcagctacaacaaatattgatgatgga
aatactgaaaatcttgataaggaaaagaaaaagttgaaacaatggaagaaacaatacgat
ttagcaaaagaagctgctgacattcttcaatccaagataccatcagatattgaagatgct
ttacttaaagttgaagatttatcagctaaaaaagaacaacaagataaaaaagatattctc
acagataatattgataaatttgtaaatgaaagaacaagacaattctatgaagaaatacct
gatattaatacattaattaatgataagaatgaattagaaaatatagtttctatggaagat
ttattagataaattacctaaaagaccacctattgataaattagcaacaacattggctata
aaatatcttaatcaaaaaggtaatagaactaaattagttaaaaagatgtttagtgttaat
agaacaagtttagaattattaccatattatagtagattaattgctatattgaatccactt
tttaaagatgttggtaaatcacttgttcaatcattagaagaagaatttaacaaattattt
gaagaacaagatcaaatcaaaattgaaaccaaagttaaaaatattagattcttgggtgaa
ttaattttatttaaaatatgtccagaagagactggtattgaatttttaaagaaatgtctt
tcacaatttcatcatcataatattgatgttgcatgtcattttcttgaagtttgtggaaga
tatttatatgcacaatctacatcacatttattaatggttgaattaatttctaaaatgatg
agaattaaagatattaaagtactagatgtaaaatataataccatgattgatagtgcctat
tataatacagttgtaaatgttgatcaagaagttgaaaaaccaagaacagtatttggtgaa
gatgatgaattaacacaatatgttttacatttacttttatcagaattgaacaagtataat
attaatactgttttaaaacaattgagaaaacttccatacgatgattttgatagaattaaa
aatattatcaagagtattctatcacatataagagaatgtgcatttggtactattcattta
atggcaagtgttttaggaggtttatcaagatatcatgaagaaattggtgttgttattatt
gatcttttattagaggaaattagatattcacttcaacaagaatatattgataatattgaa
ttgggtattaatcaaaatgctgaatatataccatctagattaagatctgaacaaaaaaga
attattgatatcaaattcttgggtgaattttataattatcaattattagatattaatgtc
attatggatgtattgtacacattaattttatatccaacaccactacttccacacaaacaa
gatacttttagattgagattagtttgtactcttctagatacatgtggtccttattttgaa
acatctgccgatagaaagaaattagatagatttttattatatttgcagagatatgtttta
agtaaacagtatcgtttaccagtcgatatggaaaatatgttagcagatactttggataca
gttagacctaaattgaaatggccaaagaatttgaaggaagttgttgataaaattgattat
attgaacaaaagaaaccaattccacttccaggtcaaagtaaatccaatgatccactttca
ctatggccaattaatgatcatgaggatgaactttctgcaactgctgctgctgaagaggaa
gatgttgttcaagatgaaactgaagattctcaaaacaactctaaatcatcaacacataaa
gatgatgatggaggtgaattggataaggaattaatggaaatgattaatcaaagtattaat
gagagaaaatacttgaccaataataatattgtcaagatgggtacattgatttcaaaacca
caagaaatgatgacacaagctattacacctaaaataattcatcatcaacaaccagcacat
catcatcatcaccaacaacacattcaacacactcaacatgctcaacatgctcaacatgat
agtacaaatacatcatcatcatcaccaccaccaccaatggctcaaaagattaccattctc
tctaaacaaggtagaactaataaggcacaagaagtttttgttgctgccaatgttacaaaa
ttattgagaaaagattcaaacaacaataacactactcaatag
DBGET
integrated database retrieval system