Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_70317
Help
Entry
NAEGRDRAFT_70317 CDS
T01241
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
ngr
Naegleria gruberi
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
EGF_2
NHL
PK_Tyr_Ser-Thr
EGF
Pkinase_fungal
ABC1
C8A_B_C6_EGF-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8851320
NCBI-ProteinID:
XP_002674574
JGI:
Naegr1_70317
UniProt:
D2VMZ5
LinkDB
All DBs
AA seq
2271 aa
AA seq
DB search
MFVGSPCQYLLIGVIVLHACLFACCYQPQYDMSVVAGGGSSIGDGLLATQALLSVPSGGI
VSNSDIIFCDTNNHRIRKIDVNGIMSTIAGTGVANYSGDGGAAVNAQLNSPQGIGILSTG
AIVFSDTLNHCIRKIENGIISTLAGNGSPGLTVGSAISAQLNTPTALIVASNDIYFAESG
NHLIRRISSSGMLTIYIGESSGTSGSSDTGTAGASFKMNTPMGIVFHAGNLYFSDSKNYR
ICVTSGALISVFKASLTSEPLGLASYNGNLYIAMKGNKVLQAKNSNTIIDFAGSGTSGYS
GDGGLGTSALLNGPSALAFDSSGNLLISDSFNNRIRKVANGTISTLAGNSNRNFGNGVLG
TLASFSSPNSVYYTGNDDSAGGILISDTNNHVLRRLKDGYIYNVIGNVAIPGNNNGNGVN
VNDATVNSPPFVMKRFGDLIYFLDNNGCALRRIESNNVLTLVVGSCNTANQDYFLSKSFD
ISNDGIIYIADYYNNRIAKFEINNSTLTTLVGRSLKGFLDGIGSNALLNYPESLIIGPDN
MIYFSDRDNNAIRSVSTSSALVTTLAGDRFNGFLGDGGPAKSSRLDSPGPIQLTLGGEII
FMDRGNQRIRKITKYGNIFTIYGNGSTSVFKDANGLTLGGSGEIYIADSGNNLIKMLSAA
KCSNGTFYNSSSFECQCTAGFYGENCLEYDCSGINWRNSSVCSGRGSCIAKEKCSCSANF
TGSNCEEYYCYGVNSVNSSVCSSNGQCTAPDNCTCSFGTFGLNCENAYCQGIVSWNETVC
NSRGKCIGYNKCTCNNGFYGNNCEFYNCFGVKNTDSSICSGNGICSKIDNCTCFDGYFGN
NCSDFNCVGEQYIGKNLCLNNGSCTGPGDCKCLPEWGGNICQHVKCFNKTAVDSNVCSSH
GQCLSFNNCSCDPRWIGSDCGVTTCFGQLSNDSNRVCSSYGQCLNPDQCSCNNGYRGDEC
EYRVCYDLIHTDPNVCSSHGQCESPNNCKCENGFVGENCQYHQVYLDISNALIYSYFDSL
LNISTTIDGGDQVLLSSECQDLFESSELIKLGEADLISCYWTPNYFKIKLGYNHMIEHLS
TLKLNSNFNISLQVNSNSSLILLNQRTFSSSMDTLLLYIPSNQDFIIKSSSDDYYHTFKK
VSKSWTCENCPQPLVNYLTNYENKSMILIPTSLLNSIPLDSSYSKILSLKYSSMNSIQKS
LTSSDKTRIESNKNLPPSFTWHGDNVKDTQFKCVGHNCIIESSLNSMNSSLSFTFSGFFS
LLNSLFSQKQMFRLVNVYNNELVDSEYSSNAQIVGFQLKTYVSTSLSYYFSYSTFDRLDH
VLTNVNRTLSLDDSKFTISIFNQDPFISSFTLPEYFTFNYQFYQINSIDNNLSSSEKTLN
IDVEKLNLSEGMYLVNLTLTVSKSYVTIPYYYFGFIHFYAQSNVPKLTIDQLPAIYPSKK
DLHLKVLIQSSSAIQNYKWKLKEGLVKERKIIGQFLESSQFTQLTSNTYKSEIIINSQYL
LEGEFISFDFSVSNMNGMSNVSLSTRIDESPRFSCEYFNLKNEFTNYAFDSLLSISCFNL
PEEPISSFNFEFHSIYGKRLNIISNTLKKNIITRIPMYSFEEGKINLVVKLVNRYGSVSQ
ISKTISVLPPLTIYNSQNSILSRFNYFKQSFYNLKLNEPLRIDTAHSIYSLMSILIQNET
ISNIKGQLVNELTMDQLSTFNSLLKDMINQLKSIQSLTYKVDEKIIQLTLPIISQIYSIL
DNLSLDESWISDISSWLDWIYSGMSNAKQYYSEILLETVLSTEHYSELKIIQNILSKRYS
NRLDKQELISKYRAQYLMLTKLNESSDDSSFEIYQIDIASQLNGKSITTNINQDIQIQAI
LPSDLTSQVSNIEDNSQLFYSSSLISNDKTLNNILTNRPILELSIFSKDGSLTSVNNLQN
PIQLKFKNLFTDYKIYTNLSCVYFDASSNGWSTNGITAKSTIIKQENGKLYFEMECNTTH
LSLFSVQEYNFISIPVVINSSQPRNEIDTNLGLILGLALGISIPVVLMIVFVIIIIVLSV
FVWKLKTKRTRYDIEMTGTDFPDSSMFLTPLVSVSGSSNESFNPLSRYLDLVRIGQGAFG
SVFKAMDSKTNTMKAIKVMRYQTNEELNGFMKEGTQLMNVSHPNILKVNDFFISQDNLLC
IDMDFYEKGDLVQLTNESFICSEKMLLQIIYQMLNALNYIHNSMKLIHRDIKPSNIFIKS
IDNDNIQIVIADFGLARADQGSAHKSYAGTPLFMVCYLSILWHVNSNIYYC
NT seq
6816 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgttggtagcccatgtcaatacctccttattggggtaattgttttgcatgcatgc
ttgtttgcttgttgctatcaaccacagtatgacatgtctgttgtggcaggtggtggatct
tcaataggtgatggattattagcaacacaagcattgttatcagtaccaagtggtggaatt
gtttcaaattctgatattatattctgtgatactaataatcatagaatacgtaagatagat
gtgaatggtatcatgtcaactattgctggtactggtgttgcaaattattctggagatgga
ggagccgcagttaatgcacaactaaactcacctcaaggaattggaatactatcaactggt
gccattgtattttcagatacattaaaccactgtattagaaagattgaaaatggaattatt
tcaacattagcaggtaatggatcaccaggattgacagttggatcagcaatcagtgctcaa
ttaaacacaccaactgctctaattgttgcaagtaatgacatttattttgctgaaagtgga
aaccatctcattagaagaattagttcttctggcatgttaacaatctacattggagagtca
agtggaacatctggtagttctgatacaggtacagctggagcatcattcaaaatgaataca
ccaatgggaattgttttccatgcaggaaatttatacttttcagattccaagaattataga
atttgtgtaacctctggtgcattgatttctgttttcaaagcatcattgacaagtgaacca
cttggattagctagttataatggtaatctgtatattgccatgaagggaaacaaggtttta
caagcaaagaattcgaatacaatcattgattttgctggaagtggaacgagtggatattca
ggagatggaggattgggtacatctgctttattgaatggtccatctgctttggcttttgat
tcgagtggaaatttgctcatttcagattctttcaataatagaattagaaaagttgcaaat
ggaactatttcaactttggctggaaatagcaatagaaattttggaaatggtgttttggga
acattggcttcattttcctctccaaatagtgtttattatacaggaaatgatgattcagca
ggtggcattttgatttctgacacaaataatcatgttttaagaagattgaaagatggatac
atttataatgtgattggaaatgttgcaattcctggaaacaacaatggaaatggagtgaat
gtcaatgatgcaacagtgaattcacctccatttgtcatgaagagatttggtgatttaatt
tactttttagataataatggatgtgcattgagaagaattgaatcgaataatgttttaaca
cttgtggtaggaagttgcaatactgccaatcaagattatttcctttccaaatcatttgac
atttccaatgatggaattatttatattgctgattattacaataatagaattgccaagttt
gagattaataattccactttgacaacccttgttggacgttccttaaaaggattcttagat
ggaattgggtcgaatgccttactcaactatcctgaaagtcttattattggacctgataat
atgatttacttttcagatcgtgataataatgcaattagatctgtgtccacaagttctgct
ttggttacaactctggccggtgacagatttaatggatttcttggagatggtggtccagct
aaatcatcaagacttgattcaccaggacctattcagttgacattaggtggtgagataatt
ttcatggacagaggaaatcaaagaattagaaagattacaaaatatggaaatatttttact
atttatggaaatggatcaacaagtgtttttaaagatgctaatggtttaacacttggtgga
agtggtgaaatttacattgcagatagtggaaacaatctcatcaaaatgttatctgctgcc
aaatgttcaaatggaactttttacaattcttcatcatttgaatgtcaatgtacagctggt
ttctatggagagaattgcttggaatatgattgctcaggaatcaattggagaaactcgtcc
gtttgttcaggaagaggttcatgtattgcgaaagaaaagtgttcttgctctgccaatttc
acaggaagtaattgtgaagaatactattgttatggagttaattcagtgaatagcagtgtt
tgttcatccaatggtcaatgcacagctccagataattgtacctgttcatttggaacattt
gggttgaattgtgaaaatgcttattgtcaaggaattgtctcttggaatgaaactgtttgt
aattcgagaggaaaatgcattggctacaacaagtgtacatgcaataatggattttatggc
aataattgtgaattttacaattgtttcggagttaaaaacactgacagctcaatatgttca
ggaaatggtatttgttccaaaattgataattgcacttgttttgatggatattttggaaat
aactgctctgatttcaattgtgttggagagcagtatattggaaagaacttgtgtttgaat
aatggctcatgcactggtccaggtgattgtaaatgtttgcctgaatggggtggcaacatt
tgtcaacatgtcaaatgttttaacaagacagctgtcgattcaaatgtttgttcatcacat
ggtcaatgtttgtcttttaataattgttcatgtgatccaagatggattggcagtgattgt
ggcgtgaccacttgttttggtcaattatcaaatgattcgaatagagtttgttcatcatat
ggtcaatgtttaaatccagatcaatgctcttgtaataatggatacagaggtgatgaatgt
gaatatagagtgtgttatgatttaattcacacagatccaaatgtttgctcctcacatggt
caatgtgaatcaccaaataattgtaaatgtgaaaatggttttgttggggagaattgtcaa
tatcaccaagtttatttagacatttcaaatgcattgatttattcatattttgattcactt
ttaaatatttcaacaacaattgatggaggtgatcaagtattgttgagtagtgaatgtcaa
gatttattcgaaagttcagaattgatcaaattgggagaagctgatttgatatcctgttat
tggacaccaaattatttcaaaatcaaattgggatataatcacatgattgaacatttatcc
acattgaaactgaattcaaatttcaatatttcacttcaagtcaattcaaattcttcttta
attttactcaatcagcgaacattttcctcttcaatggatactttacttttatacattcca
tccaatcaagattttatcatcaaatccagcagtgatgattattatcatacatttaagaaa
gtttcaaaaagttggacatgtgaaaactgtcctcagccacttgtcaattatttaacaaat
tatgaaaataagagtatgattttaataccaacttcattgctgaatagcattccattagat
tcttcatattctaaaattctttcacttaaatattcatccatgaattcaattcaaaaatca
ttgacatcaagcgacaagacaagaattgaatctaataagaatttacctccctctttcaca
tggcatggggataatgtaaaggatacacaatttaaatgtgttggacataattgtattatt
gaaagttcattgaattcaatgaatagttcactttcatttacattctctggatttttcagt
ttattgaattcactcttttcacaaaaacaaatgtttagattggtaaatgtttataataat
gaattggtggacagtgaatattcatccaatgcacaaatagttggatttcaattgaaaacc
tatgtttccacttcactttcttattatttctcatattcaacatttgatagattggatcat
gttttgacaaatgtgaatagaactctatctcttgatgattctaaatttacaatttcaata
ttcaatcaagatcctttcatttcaagtttcacattacctgaatatttcacattcaattac
caattttatcaaattaattcaattgacaataatttaagtagtagtgaaaaaacattgaat
atagatgttgaaaaattgaatttatcagaaggaatgtatttagtgaacttgacactaaca
gtttccaagtcatatgtcacaattccatattattattttggatttattcatttttatgct
caatcaaatgttccaaaattaacaattgatcaattacctgctatttatccttccaaaaag
gatttacatttgaaagtattgattcaatcatcaagtgcaattcaaaattataaatggaaa
ttaaaagaaggtttagtgaaagaaaggaaaataattggacaatttttggaaagttcacaa
tttactcaactcacgtctaatacatacaagagtgaaattataattaatagtcaatattta
ttggaaggtgaatttatttcatttgatttttcagtttcaaatatgaatggaatgtcaaat
gtttcattatcaactagaattgatgaatctccaagattttcatgtgaatatttcaattta
aagaatgaatttacaaattatgcatttgattcacttctttccatttcatgtttcaattta
cctgaagaaccaatttcaagttttaattttgaatttcattccatttatggaaagagatta
aatatcatttccaatacattgaaaaagaatatcattacaagaataccaatgtactcattt
gaagaaggtaaaatcaatcttgttgtaaaattagtgaatagatatggctcagtttcacaa
atctcaaaaactatttcagttttacctccattaactatttacaattcacaaaattcaatt
ctatcaagatttaattattttaaacaatctttttataatttgaagttgaatgagccattg
agaattgatactgctcattcaatttattccttaatgagtattctcattcagaacgaaacc
atttcgaatataaaaggacaattagtgaatgaattaacaatggatcaattatcaacattt
aattcattgttgaaagatatgattaatcaattgaaaagtattcaatcgttgacatataag
gttgatgaaaagataattcaattgacacttccaataatttcacaaatttattcgattctg
gataatttatcattggatgaaagttggatttcagatatttcaagttggcttgattggatt
tattctggaatgtcaaatgccaaacaatattattcagaaatattattagaaactgtactt
tccactgaacattattcagaattgaaaattattcaaaatatactttcaaaaagatattct
aatagattggataaacaagaattaatttcaaaatatagagctcaatatttaatgttgact
aaactgaacgaatcatcagatgattcatcttttgaaatttatcaaatagatattgcttct
caattaaatggcaagtcaattacaacaaacatcaatcaagatattcaaattcaagccata
cttccatcagatttaacaagtcaagtgtcaaatattgaagataattcacaattattttac
tcttcatcattaatttcaaatgacaagacattgaataatattttaacaaatagacctatt
ttggaattatcaattttttcaaaagatggttcattgacaagtgtgaataatttacagaat
ccaattcaattgaaattcaaaaatttatttacagattacaaaatctatactaatttatca
tgtgtttattttgatgcttcatcaaatggatggtcaaccaatggaattacagccaaatca
acgataatcaaacaagaaaatggaaaattgtattttgaaatggaatgtaacacaactcac
ttgtctttattctcagttcaagaatataatttcatttcaattccagttgttatcaactca
agtcaacctagaaatgaaatagatacaaatttaggattaattcttggattggcacttggc
atttctattccagttgtgttaatgatagtgtttgttatcattatcattgtgttatctgta
tttgtgtggaaattaaaaactaagagaacacgatatgatattgaaatgacaggaactgat
tttcctgattcgagtatgttcctgacaccacttgttagcgtttcaggaagttcaaatgaa
agtttcaatccactttcaagatatttagatctagttagaattggtcaaggagcatttggc
tcagttttcaaagcaatggattcaaaaacaaatacaatgaaagcaatcaaagtgatgaga
tatcaaaccaatgaagaattgaatggatttatgaaagaaggaactcaattaatgaatgtc
agtcatccaaatattttgaaagtgaatgatttctttattagtcaagataatttattgtgt
attgatatggatttttatgaaaagggtgatttggttcaattgaccaatgaatctttcatt
tgctcagagaagatgttgcttcaaattatttatcaaatgttaaatgcattgaattatatt
cacaactcaatgaaactcattcacagagatatcaaaccatcaaatattttcatcaaatca
atcgataatgataatattcaaattgtaattgctgattttggattggcaagggcagatcaa
ggttctgctcacaaatcatatgctggaactcctttatttatggtatgttatttatcaata
ctttggcatgtcaattctaacatatattactgttaa
DBGET
integrated database retrieval system