Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_73422
Help
Entry
NAEGRDRAFT_73422 CDS
T01241
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K18464
WASH complex subunit strumpellin
Organism
ngr
Naegleria gruberi
Pathway
ngr04144
Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ngr00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04144 Endocytosis
NAEGRDRAFT_73422
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ngr04131
]
NAEGRDRAFT_73422
Membrane trafficking [BR:
ngr04131
]
Protein recycling
Others
WASH complex
NAEGRDRAFT_73422
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Strumpellin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8853765
NCBI-ProteinID:
XP_002671607
JGI:
Naegr1_73422
UniProt:
D2VWL5
LinkDB
All DBs
AA seq
1408 aa
AA seq
DB search
MSSNINFLSETNHCGQTLLQLVAHGNAIIAELLRLSNYIPPVFFLEDKKYQYIIFDFKYL
KNQDAFDNRITSSADLLDLDENFKDSHMPLLERFYTLFKSIYNYYKDFIKFMNDLDQGYY
IQQTLESILVNQDGKQLLAESLYLYGCMLLLLDLKIPGPVRERMLMSYFRYKGAGEIPNI
DDVCKLCRSTGFDSTYYLHLKYFAQQHAHHNTGNNGAIFYDHSNNSSSNNTHDHHSSTHH
SPSSNSSGGGNGSGGSGGITPPQYPESYPCDYFNRFALPDQLVSMIIGRLRSDDIYLQTS
YYPLPEHRSVALSTQAAMLFIILYFKPNMLNSEQAVMREIVDKHFPDNWVLSYYMGFTVD
LTMVWKDFKAANLAIQNIVTLNHVKNLTDNFYNQLLPKLIEQLNQYLIEGVLVEEYVLDN
INRLLSCLRECNVTLRWLLLHRTSKNRKVYELIDQMTNSEDILLLLLNTAQFEFLLKQMF
QEMLDSKEIKWSECKNQAHLRMIELSQYFSGEKALTPIKDEQLQEWFSEMSNRIIELDYH
DSTLAGRRIQQVISALEDVEQFHQIEQSLQVKQYLSDTRLLLKKMIRYVNIRESVLVGIA
IVSDISYAWEIVGDYVKSMQRRIKKDPSLIIKMRSTFLKLSTMLELPLVRISQAKSQDIV
SVSQYYSSELVKFVRFTLEIIPMSMFSILNKIIEVQTNRLEELPTKLPRNELKRFSQLDE
RYDLSRSTYEVSKYTEGILAMERTLMGIVEIDPKQLLEDGIRKELVRQIAMALHSNLIFN
SSQYGFDLLRLSPQQQQQDDITSTNSHSNNSSNNSSSSSYRNSIDQFIDQLVSNNTLNNK
KMESIPLIEYTRLFEDKLGKLHSQLDGMLRSFEYIQDYVHVYGLKLWQEEFSRIIMYNVE
QECNTYLKRKVFDFQSLYQSEVIPIPRFKSIQSQQMIDKQSITILNFMGRLMVELLVQTD
SRRTIYIEQLSGWYDYDSNFLNSSSNSNSNNSNSNSSNSSSNNSNIKKEEIIGLTCFTLL
QQTVSSFGLVGLDLLLSYRIVTLLNQFVKQYLKHLNIDSIKKHLKFFKDFITPPNTLPEQ
LGKIYEQVLNLLPSQIFTHVFLYYVMQVGTCQLLRKHIASQLLFTCKLNANPLFNTLTNL
NHAILKDVEHYFDIHYKNQANQKLSQQRLSKHSILPSSNQSNQSNNMNNNQSNQSNQSNN
MNNISIKSTRQLDGVGYPSENNPIFSELTQYLQTSGMHQPFEKIYITPNLIIQNSGIGIS
TSSKTSKNFNSNININNNNSNGNIGDYISVTMFLFVLNCIERFIYVPSIDCLVSKKKGDI
LDGTPFIVGIYTVLKQFHSSQTHLFLSFIGQYIRANTDQINIEKKGANIPDNVIFMLRFI
QRFCKYGNISQKVLEGHVPSFLFTKLVD
NT seq
4227 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatcaaatataaattttctatctgaaactaatcattgtggacaaacattacttcaa
cttgtagcacatggtaatgctattatagcagaattattaagattaagtaattatatacca
cctgtattctttttagaagataaaaaatatcaatatattatatttgattttaaatattta
aaaaatcaagatgcatttgataatagaataacatcaagtgcagatttattagatttggat
gaaaattttaaagatagtcatatgccattattagaaagattttatacactatttaaatca
atctataattattataaagattttattaaatttatgaatgatttagatcaaggatattat
attcaacaaacattagaatctattcttgttaatcaagatggtaaacaattacttgctgaa
tcattatatttatatggttgtatgttattattattagatttaaaaatacctggacctgtt
agagaacgtatgttaatgtcctattttagatataaaggtgcaggtgaaattcctaacatt
gatgatgtttgtaaattgtgtagatcgacaggctttgattctacctattatttacattta
aaatattttgcacaacaacacgctcatcacaatactggtaataatggcgccattttttac
gatcattctaataatagtagtagtaataatactcatgatcatcattcatctacccatcat
tcaccttcatccaattcaagtggaggaggtaatggcagtggaggcagtggaggaataaca
ccaccacaatatccagaatcttatccatgtgattattttaatagatttgcattaccagat
caattagtgagtatgataattggtagattgagatctgatgatatttatttacaaacaagt
tattatccattacctgaacatcgtagtgttgcattaagtacacaagcagccatgttattt
attattttatattttaaaccaaatatgttaaattcagaacaagcagtaatgagagaaatt
gttgataaacattttccagataattgggtattatcatattatatgggatttacagttgat
ttaacaatggtatggaaagattttaaagcagcaaatttagccatacaaaatatagtaaca
ttgaatcatgttaaaaatttaacagataatttttataatcaattattacctaaattaata
gaacaattaaatcaatatttaatagaaggagtattagtagaagaatatgtattagataat
attaatagattattatcatgtttaagagaatgtaatgtaacattacgttggttattatta
catcgtacttctaaaaatagaaaagtatatgaattaattgatcaaatgacaaattcagaa
gatattttattattattattaaatacagcacaatttgaatttttattaaaacaaatgttt
caagaaatgttagattcaaaagaaattaaatggagtgaatgtaaaaatcaagcacattta
agaatgattgaattatcacaatattttagtggtgaaaaagcattaactccaattaaagat
gaacaattacaagaatggttctctgaaatgtctaatcgtataattgaattagattatcat
gattcaacattggcaggacgtcgcatccaacaagttatttcagcattggaagatgttgaa
caatttcatcaaattgaacaatcacttcaagttaaacaatatttatcagatacaagatta
ttattgaaaaaaatgatacgttatgttaatatacgtgaaagtgttctagttggtattgca
attgttagtgatatttcatatgcatgggaaattgtaggtgattatgttaaatcaatgcag
agaagaattaaaaaagatccatcattgattattaaaatgagatctacatttttaaaatta
tcaacaatgttagaattaccacttgttagaatttcacaagctaaatcacaagatattgtc
agtgtttcacaatattattcaagtgaattagttaaatttgttagatttactttagaaatt
ataccaatgagcatgttttctattttaaataagattattgaagtacaaacaaatagatta
gaagaattaccaactaaattaccaagaaatgaattgaaaagattttcacaattagatgaa
cgttatgatttatcaagatcaacttatgaagtttcaaaatatactgaaggtattttagca
atggaacgtactttaatgggtattgttgaaattgatccaaaacaattattagaagatggt
attagaaaggaattagttagacaaattgcaatggcattacattctaatttaatattcaat
tcttcacaatatggttttgatttattaagattatcacctcaacaacaacaacaagatgat
attacatctactaattctcattctaataattcatctaacaattcatcatcatcatcatat
cgtaatagtattgatcaatttatagatcaattagtttcaaataatactttaaataacaaa
aagatggaatcaataccattaattgaatatacacgtttatttgaagataaattaggtaaa
ttacattcacaattagatggaatgttaagatcatttgaatatattcaagattatgttcat
gtttatggattaaaattatggcaagaagaattttcacgtataataatgtacaatgttgaa
caagaatgtaatacctatttaaaaagaaaagtatttgattttcaatcactttatcaatca
gaagtaataccaataccaagatttaaatcaattcaatcacaacaaatgattgataaacaa
tctattactatattaaattttatgggtagattaatggttgaattattagtacaaactgat
agtagacgtactatatatattgaacaattaagtggatggtatgattatgattctaatttt
ttaaattcaagttcaaattcaaattcaaataattctaattctaattcttctaattcttct
tctaataatagtaatataaaaaaagaagaaattattggattaacatgttttacattatta
caacaaacagtatcatcatttggattagttggattagatttattattaagttatagaatt
gtaacattattaaatcaatttgttaaacaatatttaaaacatttaaatatagattcaatt
aaaaaacatttaaaattctttaaagattttataacaccaccaaatacattacctgaacaa
ttaggtaaaatttatgaacaagttttaaatttattaccatcacaaatatttacacatgta
tttttatattatgtaatgcaagttggaacatgtcaattattgagaaaacatattgcttct
caattattatttacatgtaaattaaatgcaaatcctttatttaatactttaactaattta
aatcatgctattttaaaagatgttgaacattattttgatattcattataaaaatcaagca
aatcaaaaattatcacaacaacgtttatcaaaacattcaattttaccttcatctaatcaa
tcaaatcaatcaaataatatgaataataatcaatcaaatcaatctaatcaatcaaataat
atgaataacatttcaattaaatcaacaagacaattagatggagttggttatccatctgaa
aataatccaatcttttcagaattgacacaatatttacaaacaagtggtatgcatcaacca
tttgaaaagatttatattacaccaaatttaattattcaaaatagtggtattggtatttca
acaagtagtaaaactagtaaaaattttaatagtaatattaatattaataataataatagt
aatggaaatattggagattacatttcagtgacaatgtttttatttgtattaaattgtatt
gaaagatttatctatgtaccatcaattgattgtctagtttctaaaaagaagggagatatt
ttagatggtacaccatttattgttggtatttatacagtattgaaacaattccactcttca
caaacacatttattcttatcttttattggtcaatatattagagctaatactgatcaaatt
aatattgaaaagaagggtgctaatattcctgataatgtcattttcatgttgagatttatt
caaagattttgtaaatatggtaatattagtcaaaaggttttagaaggtcacgttccttct
tttttatttacaaaacttgttgattaa
DBGET
integrated database retrieval system