KEGG   Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_79137
Entry
NAEGRDRAFT_79137  CDS       T01241                                 
Name
(RefSeq) WD40 repeat domain-containing protein
  KO
K14552  NET1-associated nuclear protein 1 (U3 small nucleolar RNA-associated protein 17)
Organism
ngr  Naegleria gruberi
Pathway
ngr03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ngr00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    NAEGRDRAFT_79137
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ngr03009]
    NAEGRDRAFT_79137
Ribosome biogenesis [BR:ngr03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    NAEGRDRAFT_79137
SSDB
Motif
Pfam: Beta-prop_WDR75_1st WD40_Prp19 Beta-prop_WDR75_2nd WD40 WD40_WDHD1_1st Beta-prop_WDR90_POC16_2nd Beta-prop_EML_2 Beta-prop_TEP1_2nd Beta-prop_RIG_2nd WD40_MABP1-WDR62_2nd Beta-prop_VPS8
Other DBs
NCBI-GeneID: 8850563
NCBI-ProteinID: XP_002678935
JGI: Naegr1_79137
LinkDB
AA seq 744 aa
MTTAIVSTPTPHRTSLGGGGSGIVTNKHISNSTTNNNNNTLIIPTSSNNNLKDIKYTCGG
IFNSKPILIDNENIIVIAVSQTIKIYSSNTGKQLNEIIHHTKKITQIIKDDCNENQIYSV
SEDGLLSTGDGHGVISLYFSDGTKSSHHWHPSMVTNLQFSEEGDYLYSSGIEGVVVCWRL
PSLKKDKFLVTDCSISNFMLSSNQDDIFILGKDNIIRKYEFARFNLIYRIYVINEPNSNY
ILMNGTNSLQWFNINDSTIKHYESIQFRDVKYDPSRFINSESKPIKNIIEHLAFNQNANY
LAHVESFNQFKQNLKFWKLDNNNMNMNNMNNSVNGSSDNNDSTNNTNNSGISKKMKPKLI
TVIDNPHSDKITQLLFNNGNNNQCLTSSIDGKIRIWNLTSELFTCQAILEYKNLPCYSFD
ISKDGTLLCAVFGNEITLWDLERFELIESYNYPYQLLDCKFINDDYIAIISDRYISLFSL
LFDNKNLWTIDAGHVQSLITNQNEQFACIVNGSEIIQFSLNNNTINNTNISSYPMVNYHL
DTDHFLQSLFYKNNQLYFLNKQFEIYNIINSNNNTTTNNTSTTTSNVNGSTATATTTTIN
NNKNEKNEEQSIEENGTIKSIYDKKWKSSDRISLMELQRVNTVPFATDIGNRAWKEIFNA
PSHSLISMSSCYSTFMNTFILKSINKNNTFNNSNDNNTTTTTMNHQYATLVPNTQSSSQQ
QQHVEESCVPSADLIRFINNYSKQ
NT seq 2235 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacaacagccatcgtttccacaccaactcctcatcgtacttctctcggtggtggtggt
agtggtattgttactaataaacacatttccaattctacaacaaataataataacaataca
ctcataatacctacttcttctaataacaatttaaaagatataaaatatacttgtggtggt
atatttaatagtaaaccaatattaattgataatgaaaatataattgtaattgcagtttca
caaactataaaaatatattcatctaatacaggtaaacaattgaatgaaattattcatcat
actaaaaagattacacaaataattaaagatgattgtaatgaaaatcaaatatatagtgta
tctgaagatggattattatcaactggagatggacatggtgtcatttctttatatttttca
gatggtacaaaatcatcacatcattggcatccatctatggtaactaatttacaatttagt
gaagaaggtgattatttatattcatctggtattgaaggtgttgttgtttgttggagatta
ccttctcttaaaaaggataaattccttgttactgattgtagtatttctaattttatgtta
tcttcaaatcaagatgatattttcattttaggtaaagataatattattagaaaatatgaa
tttgctagatttaatttaatttatagaatttatgtaattaatgaacctaatagtaattat
attttaatgaatggtacaaattcattacaatggtttaatattaatgattcaactattaaa
cattatgaatctattcaatttagagatgttaaatatgatccatctcgttttattaattct
gaatctaaacctattaaaaatattattgaacatttggcttttaatcaaaatgcaaattat
ttagcacacgttgaaagttttaatcaatttaaacaaaatttaaaattctggaaattagat
aataataatatgaatatgaataatatgaataatagtgttaatggtagtagtgataacaat
gatagtactaataatactaataatagtggtattagtaaaaaaatgaaaccaaaattaatt
acagttattgataatccacattcagataaaattacacaattattatttaataatggtaat
aataatcaatgtttaacatcatctattgatggtaaaattagaatttggaatttaacaagt
gaattatttacatgtcaagcaatattagaatataaaaatttaccatgttattcatttgat
ataagtaaagatggtacattattatgtgctgtatttggtaatgaaattacattatgggat
ttggaaagatttgaattaattgaatcatataattatccatatcaattattagattgtaaa
ttcattaatgatgattatattgctattatttctgatagatatatttctttattctcttta
ttatttgataataagaatttatggactattgatgctggtcatgttcaatctttaattaca
aatcaaaatgaacaatttgcatgtattgttaatggaagtgaaattattcaattttcatta
aataataatactattaataatactaatatatcatcatatccaatggttaattatcattta
gatactgatcactttttacaatctttattttataagaataatcaattatatttcttaaat
aagcaatttgaaatttataatattattaatagtaataataatactactacaaataatact
agtactactacaagtaatgttaatggtagtactgctactgctactactactactattaat
aataataagaatgaaaagaatgaagaacaatccattgaagaaaatggaacaattaaatca
atttatgataagaaatggaaatcttctgatagaatttcattaatggaacttcaaagagtt
aatacagttccatttgcaactgatattggtaatagagcatggaaggaaatatttaatgca
ccttctcattctttaatttcaatgtcatcttgttattctacttttatgaatacttttatt
ttgaaatctattaataagaataatacttttaacaattcaaatgataataatacaacaaca
acaacaatgaatcatcaatatgcaacacttgttccaaatactcaatcatcatctcaacaa
caacaacatgttgaagaaagttgtgttccatctgctgatttaattagatttattaataat
tattcaaaacaataa

DBGET integrated database retrieval system