Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_79601
Help
Entry
NAEGRDRAFT_79601 CDS
T01241
Name
(RefSeq) zf-C3HC4 domain-containing protein
KO
K22377
E3 ubiquitin-protein ligase listerin [EC:
2.3.2.27
]
Organism
ngr
Naegleria gruberi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ngr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ngr03009
]
NAEGRDRAFT_79601
04121 Ubiquitin system [BR:
ngr04121
]
NAEGRDRAFT_79601
Enzymes [BR:
ngr01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.27 RING-type E3 ubiquitin transferase
NAEGRDRAFT_79601
Ribosome biogenesis [BR:
ngr03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Ribosome quality control proteins
NAEGRDRAFT_79601
Ubiquitin system [BR:
ngr04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Single Ring-finger type E3
Other single Ring-finger type E3
NAEGRDRAFT_79601
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ltn1_1st
UBC_like
zf-RING_2
LTN1_E3_ligase_6th
zf-ANAPC11
zf-rbx1
RINGv
FANCL_C
zf-RING-like
C1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8850312
NCBI-ProteinID:
XP_002677748
JGI:
Naegr1_79601
UniProt:
D2VE26
LinkDB
All DBs
AA seq
1580 aa
AA seq
DB search
MGKNTEQRKPKSQKGAISASQAANVLSSKSGSSSSGGLLGSSLMEAFSKKSSLGSSSLDS
SSSSSSSSSLDPTVQSYLKHLNKRDPTTRCKALQSLTQYISEQQPEDQTNTCKNILEHFE
EVFKKIAVIDLDRKVRLNLFILWKLIVQNVGKKLGFHIKKIMPYWLMEMVGIDDRDVSKA
AIAAFHQGFPPEKRDAAILYCDNEIMNNLFENFNQTVESLSLNETEQQSITKEEAEERYS
RFITSSILMLNKMIDLTTQQQQQTSQPATGESYKKIFGSKNFWKFLGIKSYTNIREAMSR
LTITLLKNDLLKKDDPEVVEHIVPFVAPIFIGCFNQQPLERTTLDSLILFLQKFAPECWA
HVNVWKQTFPRFFSFLKDPSNPSINYPIVLPFISMLNTSIYGADKSIKFVSDLFENMWIG
FEKYCSSNNPNVNSATNRQAIKADRDAIIDSICNCIIYIALQTEKYCTEEQKPEILKITR
STLEKITIYYLTNSNTVNYGKYLSAAITKIQSKPELAEYMNQFWSEITNFTLNNINKIDV
VSIEIFISRCVKEKLEHVFKLAHELFDKCMMIGQIDVASAVAFSYPTVLKSTLFEDTLKT
LWQTSQFNEHVQQIVGLYFTQFQDQFEKFEKVLEEEIKEGRAQVPIFPLLRSLYSEEETF
SKTSVSLEKSLLARRDLDSIEYLITHKLYSSKEDLRRLLTDIISNGDDLQERAVEFIIST
PSEYSIDKSVLFALFKGAHYGTLAQLISDKPKQQEDDEEEEQDHDEEEVYTNVITSEMKS
ELLNDITIYLKDIITQDSKITNDIILDQFLKLVELSGSNTLADSVLLNYENDSVWSFIRN
QCASNLKPIVIGNQVIWNSTKDTNVSELEKSVIKYSRLVCVVLSYVEAIHKNQMEIREQK
WEWLVREVLHSFYFEFLFNDFTKNLINKFLAHVNSTEGLNLEFCEYLAHRHELELLKIYI
SMNSDKVSGLDCSKLLFKTEDVNDVISDKNKSNTFYELVQSLFDNDTDLRGLTISNEKVT
EWLLGCISISSTLDNLSESSYDHLNLIKVQAALSIVYCKQFVNTLEDEEEITIDSIIDFA
KEFYEQIKQSNSSTELNQISIIVANLLISVYGTNDTVKIEDNTFVEQFITSNLQELTNNL
ENNFELLDKIIHLSACVAKHKKNIMIVEKLIHTFLLLNRESLNLSNQYPTVMERLISRSS
KYLKPLQLYQNYSEIKLESNYIKEILEIIENSQIANAKIVATDLLLLTNYHQDGEKVLKL
MENMKKHVPEQFNNILQESAVRNKHMTQFVQLYSEYSNDNNNELPYLLSWYYILCLIETD
AISQDQNDNSFDLFTKLKESQAYAPILSLLTCFLYSGEDAMFSMEFREFGDDLMYKFSKV
LPLFVRMWFNNCNDTVTIDWIQKRFSDSYSPAIIRDEISKIKKSDALSKSLGAKISMGNQ
IIAKYEQDEVVLKLTIKIPDLYPLKPLQIESNEHSAVDENKYRKWILKMTTMLFSQVTSN
GVSDVLVLWKENLDKHFQGVEPCPICYSVVSGRDHQIPKVECKICHNKFHGACIYRWFST
SGNQTCPMCRSIGQFVSNHK
NT seq
4743 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaagaatacagagcaaagaaaaccaaaatcacaaaaaggtgctattagtgcttct
caagcagcgaatgtactttctagtaaatctggtagtagttctagtggtggtttattggga
agctcattgatggaagcctttagtaaaaaatcaagccttggctcatcatcattggattca
tcttcatcatcttcatcatcatcatcactcgatccaactgtacaatcctatttaaaacat
ttaaataagagagatccaacaacaagatgtaaagcattacaatctcttacacaatacatt
tccgaacaacaaccagaagatcaaactaatacatgtaaaaacattttagaacattttgaa
gaagtatttaaaaagattgcagtgatagaccttgatagaaaagttagattaaatttattt
attttatggaaattaattgttcaaaatgtaggaaagaaattaggttttcatattaaaaag
attatgccatattggttaatggaaatggttggaattgatgatagagatgtttctaaagct
gctattgctgcatttcatcaaggatttcctccagaaaagagagatgctgctattttatac
tgcgataatgaaattatgaataatttatttgaaaattttaatcaaactgtagaatcttta
agtttaaacgaaactgaacaacaaagtattactaaagaagaagcagaagaaagatattca
agatttattactagttctattctaatgttaaacaaaatgattgatttaactacccaacaa
caacaacaaacaagtcaaccagcaacaggtgaatcctataagaaaatatttggatctaag
aatttttggaagtttttaggtattaaatcttatacaaatattagagaagctatgagtaga
ttgacaattactttactcaagaatgatttattgaaaaaggatgatcctgaagtagttgaa
catattgttccatttgttgctccaatttttattggatgttttaatcaacaacctttagaa
agaacaactttggattctttaattttgtttttacaaaaatttgctcctgaatgttgggct
catgttaatgtttggaaacaaacattccctagattcttttcattccttaaagatccatct
aatccatcaattaactatccaattgtattacctttcatttcaatgttaaatacttctatt
tatggagctgataagtcaatcaaatttgtttctgatttatttgaaaatatgtggattggt
tttgaaaagtattgttcttcaaataatccaaatgtaaattctgctactaatagacaagct
attaaagctgatagagatgcaattattgattctatttgtaattgtattatttacattgct
ttgcaaactgaaaaatattgcactgaagaacaaaaaccagaaattctcaaaattactaga
tctaccttagaaaagattaccatttattatttaacaaattcaaatactgttaattatggt
aaatatctttcagctgcaattacaaagatacaatcaaaaccagaattagcagaatatatg
aatcaattttggagtgaaattacaaactttactttgaataatattaacaagattgatgta
gtttcaattgaaattttcatttctaggtgtgttaaagaaaaattggaacatgtttttaaa
cttgctcatgaattatttgacaagtgtatgatgattggacaaattgatgttgcatccgca
gttgcattctcctatccaactgtattgaaatcaacattatttgaagatactttgaaaact
ttatggcaaacaagtcaattcaatgaacatgttcaacaaattgttggtctctattttact
caattccaagatcaatttgaaaagtttgaaaaagttttagaagaagaaattaaagaagga
agagctcaagttccaattttcccactcctcagatcactctactctgaggaagaaacattc
agcaagactagtgtttcattggaaaagtcattgttggctagaagagatctcgacagtatt
gaatatctcatcactcacaaactctattcatcaaaggaagatttgagaagacttttaact
gatatcatttccaatggagatgatttacaagaaagagctgttgaatttatcatttctaca
ccaagtgaatatagtattgacaagagtgttttgtttgctttattcaagggtgctcattat
ggtactttggctcaattaatttctgataaaccaaagcaacaagaagacgatgaggaggaa
gaacaagatcatgatgaagaggaagtttacaccaatgttattacaagtgaaatgaagagt
gaattgttgaatgatattaccatctatttgaaagatatcattacacaagattccaagatt
accaatgatattattttagatcaattccttaaacttgtagaattatctggtagtaatact
cttgctgattctgttttattgaattatgaaaatgattcagtttggtcttttattagaaat
caatgtgcatccaatcttaaaccaattgttattggtaatcaagttatttggaatagtaca
aaagataccaatgtttctgaattggaaaagtcagttatcaagtatagtcgtttagtttgt
gttgtattgtcctatgttgaagcaattcacaagaatcaaatggaaattagagaacaaaaa
tgggaatggcttgttagagaagttttacattccttctattttgaattcttattcaatgat
tttaccaagaatttaattaacaaattcttagctcatgttaattcaactgaaggtttaaat
cttgaattttgtgaatatttagctcatagacatgaattggaattgttaaagatttacatt
tccatgaattctgataaggtttctggtttagattgtagcaagttattattcaaaacagaa
gatgttaatgatgttatttctgataagaacaaatctaatactttctatgaacttgttcaa
tcattatttgataatgacactgatttgagaggtttaacaatttccaatgaaaaagtaact
gaatggttacttggatgtattagtatttcaagtacattggataatctttcagagagtagc
tatgatcacttaaatttaatcaaagtacaagcagctttatcaattgtctattgtaaacaa
tttgtcaatactttagaagatgaagaagaaattaccattgattctattattgattttgct
aaagaattttatgaacaaatcaaacaatcaaattcttctactgaattgaatcaaattagt
attattgttgctaatttattaattagtgtttatggaactaatgatacagttaaaattgaa
gataatacctttgttgaacaatttattacttcaaacttgcaagaattaacaaataattta
gaaaataatttcgagttacttgataagattattcatttatcagcatgtgtcgctaaacac
aagaagaatattatgattgttgaaaaactcattcatacattcttacttttgaatagagaa
tctttaaatctctcaaatcaatatccaactgttatggagagacttattagtagaagttca
aaatatttgaaaccattacaattatatcaaaattattctgaaattaaattagaaagtaat
tatattaaggaaattttagaaattattgaaaatagtcaaattgccaatgctaaaattgtt
gcaactgatttactgttattaacaaattatcatcaagatggtgaaaaagttttaaaactt
atggaaaatatgaagaaacatgtacctgaacaatttaataatattcttcaagaaagtgca
gttagaaataagcacatgacacaatttgttcaattatattctgaatatagtaatgataat
aataatgagttaccatatttattatcttggtattatattctttgtttaattgaaacagat
gcaatttctcaagatcaaaatgataattcctttgatttatttaccaaacttaaagaaagt
caagcttatgcaccaattttaagtttattaacatgtttcttatatagtggtgaggatgca
atgttttcaatggaatttagagaatttggagatgatttaatgtacaaattttctaaagtt
ttacctttatttgttagaatgtggtttaataattgtaatgatacagttacaattgattgg
attcaaaagagattttctgattcatatagtcctgccattattagagatgaaatttcaaag
attaaaaaatcagatgcactctcaaaatcacttggagctaaaatttcaatgggaaatcaa
attattgccaaatatgaacaagatgaagtagtgttaaaattaacaatcaaaataccagat
ttatatccattgaaaccacttcaaattgaatctaatgaacattcagcagttgatgaaaat
aagtatagaaaatggatattgaaaatgacaaccatgttatttagtcaagtaacaagtaat
ggtgtttcagatgttttagttttatggaaggagaatttagacaaacatttccaaggagtt
gaaccatgtccaatttgttacagtgttgtttctggaagagatcaccaaataccaaaagtt
gaatgtaaaatttgtcataacaaattccatggtgcttgtatttatagatggttctctaca
agtggaaatcaaacttgtccaatgtgtcgtagtattggtcaatttgtttcaaatcataaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
