Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_80150 Help Entry NAEGRDRAFT_80150  CDS       T01241                                  Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K22754   E3 ubiquitin-protein ligase RNF213 [EC:2.3.2.27] Organism ngr  Naegleria gruberi Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ngr00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04121 Ubiquitin system [BR:ngr04121]     NAEGRDRAFT_80150 Enzymes [BR:ngr01000]  2. Transferases   2.3  Acyltransferases    2.3.2  Aminoacyltransferases     2.3.2.27  RING-type E3 ubiquitin transferase      NAEGRDRAFT_80150 Ubiquitin system [BR:ngr04121]  Ubiquitin ligases (E3)   Single Ring-finger type E3    Other single Ring-finger type E3     NAEGRDRAFT_80150 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  ZnF_RZ-type AAA AAA_5 AAA_7 AAA_14 AAA_22 nSTAND3 NTPase_1 Viral_helicase1 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  8853191 NCBI-ProteinID:  XP_002675949 JGI:  Naegr1_80150 UniProt:  D2VJ31 LinkDB All DBs AA seq 3300 aa AA seqDB search MSLESNWIETCKRVEQIISTYSLARMDCLFLDALSTSSPLLQFIKETDQQSIMALVNAVE DLGENFIRQETVADLIEASKLIRPIISQEYRSIQDFCNRLSNIVVDLKLVVKVESSNHSI NGLKNLLDSIANRGELTKETIYNATQSGYFRVSLENVTAYILSLLYNGNDDQVKQVSIAD IQDLRSGALLIINSRKDQSLERNFHDMEMFIEYCDLAFDYLTKINNLKALGNNKDYCSEK IDFDALPDNIQEIETETQNWQTILDNYLGKHFFLNFFAPERFWVLERYFSGNGTVDDVYP LLNFIHPISKNEIKLIQFQQQEQLLDMEHRLERLGKILDKIFHNKVKSDANVSSYFRNTF VVLSVENKELISTILKIFTNSLPKPSTVLFCEYGTTWQPLNAIVSRSFFNNLSGDLYCIA QIEKLSFSLQAQLVDKINRLKELNLEKKSSLCLIDTSGNQTSYVVNQFKRFLQNIPNTTT TKAIQPFSKAYLYSSDVSGVGKTENIRLEALRRRKKLVHLPIMDSVNRAELCNRLKRLNL SHIDCLHIDIRNLSQSNACLLNNLLFEIITFGMVIDDRVMFKIPVNNLDIFIELESQSRF WNFLTIRETYLINKKDIEFRLENLVFNKSLLSRSQVTFNYLKALDNDTIDTEDIIFSGPN ANATVVSDEECRLLIQKYFFKNKKEINYSLMHVFINVLAEQFIKFSQSVFLKTQQITHVT ESQKIRSKLVKVLMDVYSEFSTRSVHGNRKQQQHHVMGSKSDVVLFKESGMVRWEESNHL IVAFHKYDSTITALYRDLSFLQQTHSDIFDTLQSQKVSLPDYSSLNQEALLFELGKMAGS ITEYDGQYAMTADNLLKMMLILLRVEACIPVVISGETGCGKTSLVEFLAKKTGASFNLLN FHAGTTPDIIISFMEAVIEQAYNNPNTKHLVFLDEINTCDYLGLVSEIVTLKSIRGISLP INISVIAACNPYRTRKHIYTSALEKDKASDLAYRVNPLPDCLIDYIWDYGFLSQTDEMSY IQTMLGRLTIQFPKHILCTIICESQAFVRDLEDASSVSLRDVNRFIVLCQYFLETLKKRS EPLKKANQIMWIQENQRDDKYDISSVVLALSVCYYSRLAKLEYRENYLTTVCKHLPRISK EDFVRIVDEEQTSYLRRMEIPPNIAWNRSLKENIFVILVCILNKLPVFVVGKPGCSKSLA IQLLTSNLRGEDSIDKYFKTLPQLIFIAFQGSESSTSEGILKVFDKARGYLKINEKEEKV IPVVILDEIGLAEISAHNPLKALHALLEPKKRDVAVVGISNWRLDAAKMNRAVHVSRPEA DENELKEIAKTILFENNHIEKTDTIELLLDYLSKSYYEFISNKKYNNFHGLRDYYSLVKS VIIEEEENFAVSLCRAIDRNFGGLSASAMNFKKILFEKASITESVPSDLPILELIKENIE DKNARHLMLITNSDSALDIITYYYKEFLNRSPEIIYGSQFNLDKTEEYSYVVLNKIIYCM EEGYTLILKDLDSVYGSLYDMLNQNYTYVAKRRNCRIAIGPHSNPMCHVNENFRCIVLVD QKRLATCDPPFLNRFEKQILNFENISESKVNECVMRLNEWVENITNLDSNVFTVNDMFPS YSSDTLSSLVLANTNSTTSVEHCVEICKEALIATSTFDGIVRLAYSSVSKEECDNWLNRY QLDKHNNLLDYYNNCDGFAHMIMTFSHILTELNFTWLSSIRVREFNTEREFAKKVEDFFN DEENGLLTIHFESHLDGKFVPMVKFIVDHHIQNSDRTDKKVFLILHISRDIYENANEDWK LNFMNGWKQVTIDELSPNFDQTNLLDIHDMFSSEFYNVESILKDIIQATLMKIDYFAVNI EYISTLSSKIIEDAEFLQFIGEILNEELQKVQFDWRKHVALDKKKLAESGCLIDAIKNEM QDLVQRKLLNILKFIEQHSALETFFIADPKLRALWKNITAKYHNNGANNSKIMLIKGLRL PYSKWQCEIYKELKDKLEMLKQNSSIEKGDNQEQQLEPLLLSLIESSECVFGLQDYSEEL LKRDFLTITAQELGLNSEFAQIFENIILGLFEINLVLSPKERLILMVWNNQKTLLAVVEL IKYCCGNSIEIPEDIECLDDLLDIITLSLLQDGTRTPNNEWKDKIATVLPILLEENVSAT LLKILKDFSHYLLEYPYEIQQICTEILCYDCNLEDPKLIENILQILSKSQNLFQSKMVFI SRLELTEELLEVVCRELVEIQDVKYLTQIVYKICVDHIEELEEGNFENLRVLNNLLVNNP YCPLYYVFIDVLEELVSDQELTNEEELRILGNKINSPNSESVPDIERAYYVASIRHHLKN ISSQEDLQTTISGSIISNYLSQDEDAKNYLLKCVKQSFDNWLDFKEFVESDISGSLDVDL TNKSFDTLGYNIFRSLPRYKEAEKAFDEMYYLNNTRDMLELIQEAKSNPKLLYTLMGLIT NNIHFSQITDSTLRLCVEFFASSFQSFSKSVKNLVTRLLRSATVRDCSYVIRISVMCLAV CIPENPISIFIKNPNTVRSTYVVTAEHDILGGILKAINTKDGGHSRYRCNCGYVYLIGNC GQPNGTARCPTCGATLGGEGHKLIQGSRIDEAKRDGTDSSNEKGCTMSAINDDYHTVRQF PPAMFRVWQFFINSIILNGLDINLVSIDEIRGFFIQNQLNNPIDYFNEKAAKDWNILAQI LDQQGENLCFLLQQCIISNLDYLFGNNERLDTEDKRAIFENGLIEYTSRVLGDINLSIRD IKMNSTRSEENSSLQAIIEETCTPNNSQINKFTEFRITSSPSVQGMKALFMSNPENAQLY PFLKAYLTNEKELHHIESLFDLITFSNLLMDKCDNTIERATAEKTEMKYYAETNGLKELY GKVVTEWKAEKAVNYGCKQPKSKKKIDTEMLSFFLIEDQQEPFGLYICAALQGYAEVQNN FIDIAEQNAEKSANLAFLKSINGIIGLPTIPVQKAQKKDLVIINPEYLEDLTITFSYKNY EYGKGTTVGYLFDKIEFALASKYLLGKKRLDFENLRKIKYIGESFGSNADMAARKKIPNP IPLDDSERTKVNILINDLPRLKKIQGSLQKLLEVMNLVNFNPDVTVSTFCYDWKINLNDK EQFFANFTLNKIVNLFEYVEEVIFDFEVNYLSDLYTIELEENIVQRIIRSCQENNVNINN LTTVLKRFIIRFLIPAFYQQTNIGLNFYIIMDSLWPITSQNEIVAIEDGDIIPDSVCLCH TKSLCISLIKHLAEQDRKVREAESFVKLEEYSAQPTLSFKKVEDKKKKPAQAGRRLKINA NT seq 9903 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgagcttagaatcgaattggattgaaacttgtaagcgtgtagagcaaataattagcacc tattctcttgctagaatggactgtctttttctagatgccttgtctacttcttctccactc cttcaattcattaaggagactgatcaacaaagtattatggctttggtaaatgcagttgaa gatttgggagaaaactttataaggcaagaaacagtggcagatttgattgaggccagcaaa ttaatcaggccaatcattagccaggaatatagaagcatccaagatttttgtaaccgttta tcaaatattgttgtagatttaaaattagtagtgaaggtcgaaagctcaaatcattctatt aacggtttgaaaaatctgctagactctattgctaacagaggagagctcacaaaggaaaca atttacaatgccacacaatctggctattttagagtttcattggaaaatgttactgcctat attttatctctgctttacaatggtaatgacgaccaggtaaaacaagtcagtatagctgat atacaagatttacgaagcggagcattgttgattataaattcaagaaaagaccaatctctt gaaagaaatttccatgatatggaaatgtttatagaatattgtgatcttgcttttgattac ttaacaaaaattaacaatttgaaagctttgggaaacaataaggattattgttctgaaaaa atagatttcgatgcattgccagataatatccaagaaattgagacggaaacacaaaactgg caaaccattttggataattatttaggaaaacatttctttttgaatttcttcgctccagag cgattctgggtgttggaaaggtatttttctggaaatggcacagtagatgatgtttatcct ctattaaattttatccatccaatatccaagaatgaaattaaattgatacaattccaacaa caagaacagctattagacatggaacatagattagaaagattgggtaagattttggataaa atctttcacaataaggttaaatctgatgcaaatgtatcatcctactttagaaatactttt gtagtcctatctgtggaaaacaaagagctcattagcacaatcctgaaaattttcactaat agccttcctaaaccctccacagtactattttgtgaatatggtactacttggcagccactt aatgctattgtttcaagatcgttttttaacaatctatctggtgatctatattgcatagca caaatagagaagctttcgttctcacttcaagctcaactagttgataaaattaatagactc aaagaacttaatctagaaaaaaagagctcactgtgcttgatagataccagtggaaaccaa actagctatgttgtaaaccaattcaaacgattcctacaaaatattccaaacacaaccact actaaagctattcaaccattttcaaaagcctatctttactcatcagatgtatctggtgtc ggaaaaacagaaaatattaggcttgaggcactccgtagacgtaaaaaactggttcattta cctattatggattcagtaaacagagcagaattgtgcaatagattaaagaggttgaatctc tcacatatagactgtttacacattgatataagaaatttatcccaatcaaatgcttgcttg ctgaataatcttttgttcgagattataacttttggtatggtgatagatgaccgtgttatg ttcaaaattcctgttaataaccttgatatatttattgaattagagagccaatccagattt tggaacttcttgaccattcgagaaacatatttgattaataagaaagatattgaatttcgt ttagaaaatttagttttcaacaaatcattattatctagaagtcaagtcacatttaattac ctgaaagcgttggataatgacacaatagatacggaagatattatattcagtggcccaaat gcaaatgcaaccgttgtatctgatgaagaatgtagactcttgattcaaaagtactttttt aaaaataagaaggagatcaattactctttaatgcacgtattcattaatgttcttgctgaa caatttatcaaattttctcagtcagttttcttaaaaacccaacaaattacacatgttaca gaatcccaaaaaattagaagcaaactagttaaagtactaatggatgtgtattctgaattt tcaaccagatctgtgcatggaaatagaaaacaacaacaacatcatgtgatgggatcaaaa tcagatgtggtgttgtttaaagaatctggaatggttagatgggaggaaagtaatcacctt attgttgctttccataagtacgattccactatcacagctctatatagagacttgtctttc cttcaacaaacccattccgatatttttgacactttgcaaagccaaaaagtttctcttcca gattactcctctctcaatcaagaagccttgttatttgagttgggaaagatggccggatct attacagagtatgatggtcaatatgccatgactgcagacaatttgttgaaaatgatgtta atactattaagagtagaagcctgtataccagttgtgatatcaggtgaaacaggttgtgga aaaacaagtctggtagagtttttagctaaaaaaacaggtgcctcctttaatttacttaat ttccatgctggaacaacacctgacataattatcagctttatggaagcagttatagaacaa gcttataacaatcctaatacaaagcatttggtattcttggatgaaattaacacatgtgac tatttaggtttggtctcagaaattgtaactttaaagtcaatacgtggaatcagcctacca attaatatctcagttattgctgcatgcaatccatatagaacaaggaagcatatttataca tctgctctagaaaaagataaagcatcagaccttgcttatagagtcaatcctttacctgat tgtttaattgattatatttgggattatggctttttatctcaaactgacgaaatgagttat atccaaacaatgcttggaagattaaccatacaatttccaaaacatattctctgcacaata atttgtgaatcccaagcttttgtaagagatttggaagatgcttctagcgttagtttgcga gacgtcaatagatttattgttttgtgtcagtatttcttagaaacccttaaaaaaagatca gaaccattgaaaaaagcaaaccaaatcatgtggatacaagaaaaccaacgtgatgacaaa tatgatatttctagcgttgtattagcactttctgtttgttattactctagattagcaaag ttagaatatagagaaaattatctaactactgtttgtaaacatttaccaagaatttcaaaa gaagactttgtaaggatagttgatgaagagcagacaagttatctaagaagaatggaaatt ccaccaaatattgcctggaataggtctttgaaagaaaatattttcgtaatattggtgtgc attttgaacaagcttcctgtttttgttgttggtaagccaggttgtagcaaaagtttagct attcaacttttgactagtaatttaagaggagaagattcaatagataaatacttcaaaact ctcccacaactcatcttcattgcattccaaggttcagagtcttctacatcagagggtatt ctcaaggtatttgataaggcaagaggatatttgaaaattaatgaaaaagaagaaaaagtt ataccagtagtaattttggatgaaattggtttagctgaaatttcagcacacaaccctcta aaagctctacacgcattgttagaaccaaagaaaagggatgttgccgtggttggtatctca aactggaggttggacgcagcaaaaatgaacagagcagtccatgtttctagacctgaagct gatgaaaatgagctaaaggaaattgcaaaaacaattttatttgaaaataatcatattgaa aagacagatacaatagaacttctattagattatctttctaagtcctactacgaatttatt tcaaacaaaaaatataacaatttccatggtttgagagattactactcacttgtcaaaagt gttatcattgaagaagaagaaaattttgctgttagtctttgtagagctatagatagaaat tttggaggtctttcagcttcggctatgaatttcaagaaaatattatttgaaaaagcatca attactgaatctgtaccatcagacttgccaatattggaactaatcaaagaaaatattgaa gataagaatgccagacatctaatgttaattactaatagtgattctgcattagatatcatt acgtactattacaaagagttccttaatagaagtcctgaaattatttatggaagtcagttc aatttggacaagacagaagaatacagctatgtggttttgaataagattatttattgtatg gaagaagggtacacattgattttgaaagatttagatagtgtctatggcagcttatacgat atgctgaatcaaaactatacttatgtcgctaaaagaagaaattgtagaattgctattggc ccacatagtaaccctatgtgccacgttaacgagaattttagatgcatagttttagttgac caaaagcgtctggcaacctgtgatcctccttttttgaaccgattcgaaaaacaaattctt aactttgagaatattagtgaatctaaagtgaatgaatgtgtgatgcgtttaaatgaatgg gtagaaaatattactaatttagatagtaacgtttttactgttaacgacatgtttccatcc tattcttcagatacactatcatcactggttcttgcaaatactaattcaactacctcagta gaacactgtgtagaaatttgcaaagaagcactgatcgcaacttcaacctttgatggtata gtcagattggcatattccagcgtatctaaggaagaatgtgacaactggttgaatagatac caattagacaaacataataatctattagactactacaacaattgtgatggttttgctcac atgattatgaccttttcacatattttgacagaattaaactttacctggttatcctccatt agggtaagagagtttaatacagagagggaatttgctaaaaaagtcgaagatttctttaat gatgaagaaaatgggctgttgaccatacactttgaatctcatttggatggtaaatttgta ccgatggtaaaatttattgtagatcatcatattcaaaactctgacaggactgacaagaag gtattcctcattttacacatctccagagatatttatgagaatgcaaatgaagattggaaa ttaaatttcatgaatgggtggaaacaagtgactattgacgagttgtcccctaattttgac cagaccaacttattagatatccatgatatgttctcgagtgaattttacaatgttgaaagt atcttgaaagatatcattcaggcaacattaatgaagatagactactttgccgtaaatatt gaatacataagtacattatcttccaagataattgaagatgccgaatttttacaatttatt ggagaaattcttaatgaagaattgcaaaaggttcagtttgattggaggaaacatgttgcc cttgacaagaaaaagcttgcagaatctggttgtctgatagatgctatcaaaaacgaaatg caagaccttgttcaacgaaaattgctcaatattttgaaattcattgaacaacattcagct cttgagacctttttcattgcagatccgaagttgagagctttatggaagaatatcactgct aaataccacaataatggagctaataattctaaaattatgttgataaagggcttgagactt ccatatagtaagtggcaatgtgaaatctataaggaactcaaagacaagttggaaatgtta aaacaaaattccagtattgaaaaaggtgataatcaagaacaacagttagagcctctactt ctttctttgatagagtcatctgaatgcgtttttggcctgcaagattactcagaagaactt cttaaaagagattttttgacaatcactgctcaagaactggggctgaactcagaattcgct caaatattcgaaaatatcatacttggtttattcgagatcaacttagtactctctccaaaa gaaagattaatactaatggtttggaataaccaaaaaacattacttgctgttgtagaatta atcaagtattgttgtggaaattctattgagatacctgaggatattgaatgcttggatgat ttacttgatataatcaccttatctctgcttcaagacggaactagaacccctaacaatgaa tggaaagacaaaatagcaacagttttgccaatattgttggaagagaatgtttcagctact ttgttaaaaattttgaaagatttctctcactatttactggaatacccatatgaaatccaa caaatatgtacagagattctctgctatgattgcaatcttgaagatccaaaattaatagaa aacatattgcaaattttatcaaagtcccaaaacctattccaatccaagatggtatttatt tcaagactagagcttacagaagagttattggaggtagtatgtagagaacttgttgaaatc caagatgttaaatatttgacgcaaattgtctataagatttgtgttgatcatatagaagag ttagaggagggaaattttgagaacctgagggttctaaacaatcttcttgtgaataaccca tattgccctctttactatgtgtttatagatgtacttgaagaactggtttcagaccaagaa ttgaccaatgaagaagaattaagaatattaggtaacaaaatcaattctcctaatagtgag tcagttccagatattgaaagagcctactacgttgcatcaattagacaccatttgaaaaat atttcaagtcaagaagaccttcaaaccactatttctggatcaataatttccaattattta tctcaagacgaagacgcaaaaaattatcttctcaaatgtgtgaaacaatctttcgataat tggttagattttaaagaatttgtggagtctgatatctctggatcattagatgttgattta acaaacaaatcgttcgacacacttggttataacatatttaggtcactacctagatacaaa gaagcagaaaaagcttttgatgaaatgtactacttgaataatacaagagatatgttggaa cttattcaagaggcaaagtccaatccaaagttgttgtacacattgatgggattgattact aacaatattcacttttcacaaattaccgattcaacattacgtctctgtgtggaattcttt gcaagcagcttccaaagcttttcaaaatctgtaaaaaaccttgtgacacgcttacttaga tcagcaactgtaagggattgcagttatgttattagaattagtgttatgtgtcttgctgta tgcataccagaaaaccctatttccatcttcatcaaaaatccaaatacagtccgttccaca tacgtagttacagcagaacacgatattttaggtggtattttgaaggctatcaacaccaaa gatggaggtcacagtagatacagatgtaattgtggttatgtatatttgattggaaattgt ggacaacctaatggtactgctagatgcccaacatgtggagcaacacttggaggagaaggt cacaaacttattcaaggaagtagaattgatgaagctaaaagagacggaaccgattcatcc aacgaaaaaggatgtacaatgtctgcaattaatgatgattatcataccgtaagacaattc cctccagcaatgttcagagtttggcaattctttattaattcaattatcctcaatggctta gatatcaatttagttagcatagatgaaattagaggtttcttcatccagaatcaacttaat aaccctattgattactttaatgaaaaagctgctaaggattggaatatattggcccaaatt ttagatcaacaaggtgaaaatttgtgcttcctattgcagcaatgtattatttcaaatttg gattatttatttggaaataatgaaaggttagatacagaggacaagagagccattttcgaa aatggattgatagaatatacctccagagttctgggagacattaacctctcaatcagagat ataaaaatgaattctaccaggtccgaagaaaacagtagtctccaagcaatcattgaagaa acatgtacgccaaataattcccaaattaacaaatttacagaatttagaattacatcatct ccttctgtccaaggcatgaaggcattattcatgtctaatccagagaatgcacaattgtat cctttcctgaaagcctacttgactaatgaaaaagagctacatcacatcgaaagccttttc gaccttatcactttttccaatttattgatggataaatgtgataacactattgaacgagca actgctgaaaaaacagaaatgaagtattatgcagaaactaatggcttgaaagaactctat ggaaaggtagttacagaatggaaagcagaaaaagctgtaaattatggatgtaaacaacct aaatcaaagaaaaagattgacacagaaatgctatcattcttcttgatagaagatcagcaa gagccatttgggttgtatatttgtgctgccttgcaaggctatgctgaagtacaaaataat tttatagatattgcagaacaaaatgctgagaaatcagcaaatcttgcctttttgaaatct attaatggtatcatagggttacctactattccagtacaaaaagctcaaaagaaagatctg gtaattattaacccagaatacttggaagatttaaccattactttttcatacaaaaattat gaatatggaaaaggtacaacagttggatacctttttgataagattgaatttgctttggcc tcaaagtatttattaggaaaaaagcgattggattttgaaaacttgagaaaaatcaagtac attggtgaatcttttggtagcaatgcagatatggccgccagaaagaaaattccaaatcca atacctctggacgactctgaaagaaccaaagtgaatatactaatcaacgacttgccaaga ttgaaaaaaatccaaggttccttacaaaaactattggaagtcatgaatttggtgaacttt aatcctgatgttacagtctctacattttgctatgattggaaaatcaacttgaatgacaag gaacagtttttcgctaattttactctcaacaagattgtcaacttgtttgaatatgtagaa gaagttatctttgattttgaagttaattatctcagtgacttgtatactatagagttggaa gaaaatattgtgcaaagaattattagatcatgccaagaaaacaatgtcaatatcaataac cttacaacagttctcaaaagatttattataaggttcttgattcctgctttctaccaacaa acaaatattgggttgaatttctatattattatggatagtctgtggcctattacttctcaa aatgaaattgttgccatagaagatggagatattatccctgattctgtttgtttatgtcat accaaaagtctatgtatatcactcatcaaacatttagcagaacaagatcgtaaggttaga gaagcagagagttttgtaaagctagaagaatattcagcacaaccaaccctaagtttcaaa aaggtagaagacaagaagaaaaaaccagcccaagccggtagaagactcaagattaatgct taa

DBGET integrated database retrieval system