Neoarius graeffei (lesser salmon catfish): 132873115
Help
Entry
132873115 CDS
T10798
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
ngra Neoarius graeffei (lesser salmon catfish)
Pathway
ngra04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ngra00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
132873115
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
132873115
NCBI-ProteinID:
XP_060764353
LinkDB
All DBs
Position
25:35896929..36067160
Genome browser
AA seq
2885 aa
AA seq
DB search
MCCKRNWRCLAACLALLGALLGNLAGEMPGRSQFQVERSAQQAAQTRIRRRGKQESLRGP
NVCGSRLHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGEGYCSRPNMCTCPTGQIAPSCTAKSS
QQCSIRCMNGGVCEGDRCQCQKGYTGNYCGQPVCEKKCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQ
CERDYRTGPCFSQVVNKMCQSQVSGIVCTKMLCCATIGRAWGHPCEECPAQPQPCRRGFI
PNIRTGACQDVDECQAVPGLCQGGKCMNTVGSFECKCPAGHRLNDGTNKCEDVDECSTIP
HVCEGGQCTNSVGSFSCACPSGYVLSADKTRCFGQHTGACFVAVLSGRCAHELSGRYTKV
QCCCDRGHCWARGTVPEICPTRRSDEYHRMCLEGGYPDVDPGIRGDRVPQQPHGHDGQPL
YPTNGNGPIYPEFPQSFPQIPHIPINGHGNGNGQRPQGPVVSLNQTTNKCLLIPNLCLNG
RCVPVGFGHRCECNTGYQVDGQTECSDLDECASNPCANGDCVNTAGSYYCKCHTGFHRPP
GKQACFDTDECLHNGVLCQNGRCLNMVGSFRCICNVGFQLTSDGRNCMDHDECSITNMCL
NGMCINEDGSFKCVCKPGFTLASSGRYCSDIDECLTPGICINGRCINTEGSYRCECLAGL
AVGPDGRSCVDTHMRSTCYGAIKKGVCVHPFHGAVTKSVCCCASTDYSFGEPCQPCPALN
SAEFSALCQSGIGFSVDGADINECALDPDICPNGVCENLRGSYRCVCNTGYETDQSGRAC
FDVDECLVNRLLCDNGLCRNIPGSYTCTCPLGYVFRQDTDTCEDVNECESSPCINGVCKN
NAGSFSCVCSPGSTLDRTDLICIDSLKATCWMNIQEGRCEMNINGATLRSECCATLGAAW
GSPCEPCERDLICQRGFTRPRGTICEDVNECEVFPGVCLNGRCVNTQGSFKCHCPEGLTL
DATGRLCIDIRSELCYLTYDEDVCGQPVPGRFRLDVCCCTVGAAWGKECEACPDPGTREY
EMLCPRGPGFANRGDILTGRPVYKDINECRVFPSICTHGICRNTIGSFRCRCNSGFTLDM
DGRNCTDIEECQISPDLCGHGTCVNTPGSFECDCLPGYESGFMMMKNCMDIDECERNPAL
CRGGSCENTEGSYQCVCPPGHQLSEDGEACEDVNECELSATLCPNGECINVAGTYHCSCF
SGYQSIPDRKGCTDIDECTIENGGCDFHCTNSEGSYTCSCGQGYALMPDQRTCTDVDECE
EEPDICDGGQCTNVPGEYHCDCYDGYMSSMITKTCIDVNECELSANICVFGECENTKGSF
ICHCEVGYSVKKGSSGCTDVDECKINAHDCAVHATCVNTPGSFQCSCKEGWVGNGVKCTD
VDECNNQTHRCSPNAECMNTPGSYRCACSEGFIGDGFTCQDIDECTENTELCENGQCLNI
PGGYRCDCEMGFTPTPDSRACQDIDECSFQQLCVFGICKNLPGLFRCICDEGYELDRSGG
NCTDVDECLDPINCVNGHCVNTPGSYECNCPTDYELNPTGVGCVDPRVGTCFLEVVNRGR
TGLACSVELGVGVSRSSCCCSLGRAWGNPCELCPPVNSSDYNTLCPGGEGFRPNLITIIL
EDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCDCPNGYYLNTNSRICEDIDECLANPGICGPGTC
YNTLGNYTCVCPQDYMQANGGNKCMDMRKSLCFRNYNGTTCENELAFNITHHICCCGYNM
GKAWNKPCQACPIPGTEDFHTLCGNIAPGFEINIETGKPVDIDECREIPGICANGVCINH
IGSFHCECPRGFIYNDLLLICEDNDECSGSEILCQRNADCINSPGSYRCECSDGFKLSPV
GACIDRNECLETPNLCSHGKCVDIQGGYMCTCHPGFMATPNGKMCMDIDECVSQPCKNGT
CKNTVGSYNCLCHPGFELTLNNQCTDIDECSTVYGQLCRNGHCINSIGSFQCLCEDGYDL
TQDGKNCVDVNECIMLPGICAPGTCQNLDGSFHCICPPGYVVQNNHCVDENECEEDPNIC
LFGSCYNNPGSFECVCKPGFVLSESGRRCYDTRESFCFTRFENGKCSNPQAFNTTKDKCC
CSTMSNEGWGYPCELCPKEHDAGFQDLCPFGYGIIPGIGDTIIDLNECVENPGICHNGHC
INTDGSFRCECSTGYTLNYTGMHCIDVDECAVGNPCGNGTCTNAMGSFECNCEEGFEPGP
MMTCEDINECAQNPLLCAFRCINTFGGYECSCPSGYTLRDDGRMCQDLDECAEGLHDCDT
RGMNCKNLIGTFMCMCPPGLVRKLDDEVCYDENECRTKPGICENGRCVNTIGSYTCECGE
GFQPDSTHTQCLDYRKGFCFTEVLQTMCQMSSSSRIPCTKSQCCCNSGRGWGNQCELCPL
PGTIKYKKLCPHGSGYATDGTDIDECKVLPDACKNGQCINTMGSFKCHCNPGYTATIAGT
TCVDLDECKMSPKPCNFICKNTEGSYMCSCPRGYILQEDGRTCKDLDECQLKRHNCQFMC
VNTIGGFACKCPPGFTQHHTACMDNNECAAEPSLCGVKGICQNSPGSFSCECQHGFSLDS
TGLHCEDVDECKSNHRCQYGCDNMLGGYRCSCPQGYTQHYQWNQCVDENECSTPGTCGTA
SCYNTLGSFKCACPAGFNFEQLSSSCQDVDECTSFKNPCSYGCSNTQGGYKCGCPPGYYR
VGQGHCVSGVGFGKGQLGSVSAAGTAEDNSLSLEGCYDCDVKSPHKRGIRKRHTIQPKDP
EDAPVSLDSVDMEQPLLLVLNISQCAHKEPILELVPALRPLIHHVTYNITEGNQDEIFQL
RQHEELSYLHCMPEKAFPGFYILTISSSPLYDHAELLQLEDKRDRDYLSGELGDNLHMQL
HITLQ
NT seq
8658 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgctgtaagaggaactggaggtgtttggctgcgtgtctggctctgctgggcgctctg
ctggggaatttagccggagagatgcccgggagaagccagtttcaggtggagcgcagcgca
cagcaagccgcccagacccgcatcaggagacgcggcaagcaggagtccctcagagggcca
aatgtgtgtggatctcgtttgcactcctactgctgtccaggttggaagactttgcccggg
ggcaaccagtgtattgtgcctatatgccgtaacagctgtggtgaaggctactgttccaga
cccaacatgtgcacatgccccactggtcaaattgctccttcttgtactgccaaatcatct
cagcagtgtagcatcagatgtatgaatggaggtgtgtgtgagggggatcgctgccagtgt
cagaagggttacacaggaaactactgtgggcaacccgtgtgtgaaaagaagtgccagaat
ggagggcgttgtattggacccaaccggtgtgcatgtgtgtatgggttcacaggtccacag
tgtgaaagagattaccgaacgggtccatgcttctcccaggttgtcaacaagatgtgccag
agccaggtgagtggcattgtgtgcactaagatgctatgctgtgccaccattggccgagcc
tggggtcacccgtgtgaggagtgccctgctcaaccacaaccctgccgcagaggcttcatc
cccaacatccgcaccggagcctgccaagatgttgatgaatgccaggctgtgccaggtctc
tgccaaggaggaaagtgcatgaacacagtgggctcatttgagtgcaagtgtcctgctggg
catcgcctgaatgacggcacaaataagtgtgaagatgtggacgaatgctccaccattcca
catgtatgtgaaggaggacagtgcaccaactcggtcggcagcttctcctgcgcgtgtcca
tctggatatgtgctgtctgcagacaagacccgatgctttggccagcacacaggtgcctgt
tttgtagctgtgttaagtgggcgctgtgctcacgagctgtctgggcgctacactaaagtg
cagtgctgttgcgacagaggccactgctgggcccgagggacagtgccagagatatgtcct
acccgcagatctgatgaataccacaggatgtgtttggagggaggatatccagatgttgat
cctggcattagaggggacagagttcctcagcagccccatggacacgatggccaaccactt
tatccaacaaatgggaacggtcctatatatccagagtttccacagagtttccctcaaatc
cctcatattcccattaatggacatggaaatggcaacggacaaagaccacaaggacctgtt
gttagtttgaatcagacgacaaacaaatgcctgctgatacctaacttgtgtcttaatggc
cgctgtgtcccagtggggtttggtcaccgctgtgagtgtaacactggctaccaagtggat
ggtcaaacagagtgctcagatctagatgaatgtgcttctaatccatgtgcaaatggagac
tgtgtgaacactgctggctcttactactgcaagtgtcatacaggctttcacaggcctcca
ggcaagcaggcctgcttcgacactgatgaatgcctgcataatggagtgctttgtcagaat
ggccgctgtctgaacatggtgggtagcttccggtgcatctgcaatgtaggcttccagcta
acatctgatggcaggaactgtatggaccatgacgaatgttccataacaaacatgtgttta
aatggcatgtgcatcaatgaagacggcagctttaaatgtgtatgcaaacctggtttcaca
cttgcctctagtggtcgctactgctcagatattgatgagtgcttgacccctggtatctgc
ataaatgggcggtgtataaacacagaggggtcgtacaggtgtgagtgcttggcaggactg
gctgttgggcctgacggacgctcatgtgtagacacacacatgcgtagtacctgctatgga
gctattaaaaagggtgtgtgtgttcaccctttccatggagcagtcaccaaatcggtgtgc
tgctgtgcgagcacagactacagctttggggagccctgccaaccgtgccctgccctgaac
tcagcggaattcagtgctttgtgtcaaagtgggattggattttcagttgacggagcagat
attaatgagtgtgcactggaccctgacatctgccctaatggagtatgtgagaatctgaga
ggaagctatcgctgtgtctgcaacacaggctacgagactgaccagagcggccgggcctgt
tttgatgttgatgagtgcctggtgaacagactgctctgtgataatggattgtgcaggaac
attccaggaagctacacctgtacatgtcccctgggttatgtcttcagacaggacacagat
acgtgcgaagacgtgaatgaatgcgagagcagtccatgtattaatggagtgtgtaagaac
aatgcaggctctttctcatgtgtatgttctcccggcagcacacttgatcggacggatcta
atttgcatcgactctctgaaggcgacatgctggatgaacatccaagaaggccgctgtgag
atgaatataaacggtgccacgttgagatctgagtgctgtgccacactgggagctgcatgg
gggagtccctgcgagccctgtgagagggatctgatctgtcaaagaggcttcacacgacca
agagggaccatttgtgaagatgttaatgaatgtgaggtgtttcctggtgtgtgtctgaat
ggacgctgtgtgaacacacaaggctcctttaagtgccactgtccagaaggactgacactg
gatgccactggacgtctctgtattgacattcgctcagagctttgctacctgacctatgat
gaggacgtgtgtggtcagccagtgcctggaagattcaggctggatgtatgctgctgcacg
gttggagctgcgtgggggaaggagtgtgaggcgtgccctgaccctggcacacgcgagtat
gaaatgctgtgtcccagaggacctggctttgccaaccgtggggacatacttacgggcaga
cctgtgtataaagacattaacgaatgtagagtgttccccagcatttgtacacacggaata
tgccggaacacaatcgggagcttcagatgtcgctgtaatagcgggtttactctggatatg
gatggacgtaactgcacagacattgaggagtgtcagatctcccctgacctgtgtggacac
gggacgtgtgtaaacacgccaggcagttttgagtgtgactgcttgccaggttatgagagc
ggcttcatgatgatgaagaactgtatggatattgacgagtgtgaacggaatcctgccctg
tgtcgcggaggctcatgtgagaacacagaaggtagttaccagtgtgtgtgtccacctggg
catcagttatctgaggatggggaggcttgtgaagatgttaacgagtgtgaactaagtgcc
actctgtgccccaatggggagtgtataaatgtggctggcacttaccactgctcctgtttt
tctggataccagtcaatcccagacagaaaggggtgcacagacatagatgagtgcaccatt
gagaatggaggctgtgacttccactgcactaactcagagggcagctacacctgcagctgt
ggtcaaggctatgccctaatgccagatcagagaacctgtacagatgtggatgaatgcgaa
gaagagcctgatatatgtgatggtggtcagtgtactaacgttcctggagaataccactgt
gactgttatgatggatacatgtcatccatgatcacaaaaacttgtatagatgtgaacgag
tgtgagctcagtgccaacatctgcgtgtttggagagtgcgagaacacgaagggttcattc
atctgccattgtgaggtcggctactctgtgaagaagggttcctcaggctgcacagatgtt
gatgagtgtaagatcaatgcccacgactgtgccgtacatgccacctgtgtcaacacgcct
ggaagcttccagtgctcctgcaaagagggatgggtaggcaatggagtaaaatgtactgat
gtggatgagtgcaacaatcagacccacaggtgcagtcctaatgctgagtgcatgaacaca
cccggctcttaccgctgtgcctgctcagagggttttataggagatggctttacatgccaa
gacatagatgagtgcactgagaatactgaactgtgtgagaacggacagtgtctaaacatc
ccaggaggctatcgctgtgactgcgagatgggcttcactccaacccctgacagcagagct
tgccaagatatcgatgagtgctcctttcagcaactttgcgtgtttggtatatgtaaaaac
ctccctggcttgttccgctgcatctgtgacgaaggctatgagttagacagatcagggggc
aactgcacagatgttgatgaatgcttggaccctataaactgtgtgaatggacactgtgtg
aacacaccaggctcttatgaatgtaactgccctacagactatgaacttaacccaactgga
gtcggctgtgttgacccacgtgtagggacctgtttcctggaggtggtgaaccgtgggcgc
actggcctagcctgcagtgtggagctgggcgttggggtcagtcgctcatcctgctgctgc
tccctgggccgagcctggggaaacccctgtgaactctgccctcctgtcaactcctcggac
tataacacactgtgtccaggaggagagggattcaggcccaacctaattaccattatattg
gaggacatagatgagtgccaggagcttcctggtctgtgccagggcggaaactgtatcaac
acctttggcagcttccagtgtgactgtccaaatggctactacctcaatacaaacagccgt
atttgtgaggatattgatgagtgtttagcaaatcctgggatctgtggtccaggcacatgc
tacaacacactcggcaattacacttgtgtgtgtcctcaggattacatgcaggctaatgga
ggcaacaagtgcatggacatgaggaaaagcctttgctttcgcaattacaatggcaccaca
tgtgagaacgagctggccttcaacattacacaccacatttgctgttgtggttacaacatg
ggcaaagcctggaacaaaccctgtcaggcatgtcccataccaggcactgaggactttcac
actctttgtggaaatattgcaccagggtttgaaattaacattgaaactggaaaaccagtg
gatattgatgagtgtcgagagattccagggatctgtgccaacggtgtatgcatcaaccat
attggaagctttcactgtgaatgtccaagaggattcatctacaatgatttgctacttata
tgtgaagacaatgatgagtgtagtggttcggagatcttgtgccagaggaatgcagactgt
attaacagccctggcagctatcgctgcgagtgctcggacggcttcaagctctcacccgtc
ggagcctgtatagaccgaaacgagtgtttggaaacccccaacctttgcagtcatggcaag
tgtgtggacatccaaggtggctatatgtgtacatgccatcctggcttcatggccaccccc
aatggaaagatgtgcatggacattgacgagtgtgtgtcacagccctgtaagaatggtaca
tgtaagaatactgtgggatcctacaactgcctctgccaccctggctttgagctcactcta
aacaaccagtgcacagatattgatgaatgttctacagtatatggtcagctgtgcagaaat
ggacattgcattaacagtattggctccttccagtgcctctgtgaggatggctatgatctc
acccaggatgggaagaactgtgttgatgtgaatgaatgtataatgctgcctggaatatgc
gctcctggaacatgccagaacttggacggctcttttcactgtatctgtccacctggttat
gttgtacagaacaatcactgtgtagatgagaacgagtgtgaggaggaccctaacatctgt
ctgtttggctcgtgctacaataacccaggcagcttcgagtgtgtgtgcaaaccaggcttt
gttctctcagaaagtggacgtcgctgttatgacacaagagagagcttttgctttacccgc
tttgagaatggaaaatgctccaaccctcaggcattcaacaccaccaaagacaagtgctgc
tgtagcaccatgtccaatgagggctggggctacccctgtgagctctgccccaaagagcat
gatgctggatttcaggacctgtgtccttttggttatggaatcattccagggattggggac
acaatcattgatctgaatgaatgtgtggagaacccaggcatttgtcacaatggccactgc
atcaacactgatggctccttccgctgcgagtgttctacaggctacacactcaattacact
ggaatgcattgtattgatgttgatgagtgtgcagtggggaatccatgtggaaatggtact
tgcactaatgcgatgggaagctttgagtgcaactgcgaggaagggtttgagccagggccc
atgatgacatgtgaagatataaatgaatgtgcacagaaccctctgctctgtgcatttcgc
tgcatcaatacgtttgggggatacgagtgctcctgtccatctggctacacactccgagat
gatgggagaatgtgtcaggacctggatgagtgtgcagagggtttacatgactgtgacacc
agaggtatgaactgcaagaacctcatcggaaccttcatgtgcatgtgtcctcctggactg
gtgcgcaagcttgatgacgaagtgtgttatgatgagaacgagtgccgcactaagccaggt
atttgtgagaatggccgctgtgtgaacactataggaagttacacgtgcgagtgtggagaa
ggcttccagcctgactctacacacacccagtgccttgactacagaaaaggcttctgtttc
actgaagtgctgcagaccatgtgtcagatgtcctctagcagcagaataccctgcaccaaa
tcccagtgctgctgcaacagtgggcgtggctgggggaaccagtgcgagctctgtcctctg
ccgggcaccatcaagtacaagaaactgtgtccacatgggtctggctatgccacagatggc
acagatatagatgagtgtaaggtccttccagatgcgtgtaagaacggccagtgtatcaac
actatgggttcctttaaatgtcactgtaacccaggctacacagccaccattgcaggcact
acttgtgttgacttggatgagtgtaaaatgtccccaaagccatgcaactttatctgcaag
aacacagagggcagttacatgtgctcctgtccacgtggctatatcttgcaagaggatgga
agaacatgtaaagatttggacgaatgccagttaaagaggcacaactgccagtttatgtgt
gttaacactattggtggcttcgcttgcaaatgtcctccgggttttacacaacaccacact
gcctgtatggataataacgagtgtgctgcagagcccagtctgtgtggagttaagggcatc
tgccagaattcaccaggcagctttagttgtgaatgccaacacggatttagcctggactct
actggcctgcactgtgaagatgtcgatgagtgtaaaagcaatcatagatgtcagtatggc
tgtgacaacatgttaggggggtaccgctgcagctgccctcaaggctacacccagcactac
cagtggaaccagtgtgttgatgagaacgagtgctccactcccggcacctgcggcactgct
tcatgttacaacacattaggcagcttcaagtgtgcctgtcccgctggattcaacttcgag
cagctctccagcagctgccaggatgtggatgagtgcacctccttcaaaaacccctgcagc
tacggctgctccaacacccaaggaggctacaagtgcggctgtcctcctggatactacaga
gtcggccaagggcactgtgtgtcaggtgtgggctttgggaagggtcagctaggatctgtc
agtgcagctggaacagcggaggataacagtctctctcttgaaggctgctatgattgcgat
gtcaagagtccacataagagaggaatccggaagaggcacaccatccaaccaaaagatcca
gaggatgctccagtcagcctggacagtgtggatatggagcagcccctgctactggtactc
aacatatcccaatgcgcccacaaagagcccatcctggagctggtgcctgccctcaggcct
ctcattcatcacgtcacttataacatcacagagggcaatcaggacgaaatattccaactc
cggcagcatgaggagctcagctacctgcactgcatgcctgagaaagcttttccagggttt
tatattttaacgatcagcagttctccactctatgatcacgcagagctgctgcagttagag
gacaaaagggacagagactacctctcaggtgagctaggagacaacctgcacatgcagctg
cacattacactacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
