Candidatus Nitrosopumilus sediminis: NSED_00030
Help
Entry
NSED_00030 CDS
T02303
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09118
uncharacterized protein
Organism
nir
Candidatus Nitrosopumilus sediminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nir00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
NSED_00030
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UPF0182
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFS81822
UniProt:
K0B9S5
LinkDB
All DBs
Position
7602..10457
Genome browser
AA seq
951 aa
AA seq
DB search
MYSASTDKQAPPPDAGKYIRLGIVAIIGIVIFAMVGNQAVILSMNFTEFGDQFTKPLYYT
LISAIILSAIALVRVNIAARSSIFWYAISTGIGFLGGGGQQPISNTLKSFRDYKLSSPQF
VIWQMTKILLFGAFFANIMFGFAAMSFIDGNTLGLENLPSLFTLPFVTPDNNPNYASENV
VPMIPALVILIPPLLAAIGLRLVLYVGIHRIINVITSYLQDSNEGKPRYLNYVSTIEGII
GIGIIWAGINLFFTDQIDYNTRYVIGGTLVIGFALIAFSIIDRIRARVLTHMFKRDVYIR
FLTIVAIAIIVTGVVSVNNSIADAKKIEYLGPYTAQQIGVNRYLGELNDVQENTHDVQLT
SVSANNIKNYVKQNSDVLDVIRVWDWEAAFAKLKPEIGLIPYVDFEDNDILRFNNTLYWT
ASMKPILPTSVSLENRWYNEHLVYTHVPDGFLTLEATDGQIVDSGEFFKQREIYYGEGGL
FEQTWSGYPKSRGDTSAELGGVSYSGLGGLDVPPPLSWIFEPNFLLSFPGEPVHIMRYKD
VHDRMETLYPYFLYDLFGKELDSLPVTDGENSYWLIPLIIGFDTGDVPWSVGNPYLRLVG
YALVDSYNGDIQLLKTGDDFFTEMFASQYSEQFKPMPAWLEEQIRYPVELFNWKTEMYNI
YHVTNVETFIQANEFYEIPRGLDTYYVEAKPPGFDQTEFIGLLSLELRGSQGRNLAGYMV
VENDLTNLGDMQFYEVPLNSTTKLIGPTAVREALDRDPEFAQLKTLLRNPRIGDNILYRV
GDHDIYFIPVYTAGAGGVVAQLGTIAAVGAAFNGEYFVGLGETQEKAFEAYLKKVSGVAS
TTTTADDNYVELIRSDRIDIIKSLFETNGISVSEPTSIQIPLSFNEGEIFFFTESDRADA
EEFLLEFIDDFVKPRSDRVFMWQEDTNLNIGTVFVKDGLPEIHYVSIEVGN
NT seq
2856 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtatagcgcctctactgacaagcaagctccacctcctgatgctggaaaatacatcaga
ttgggtattgttgcaattattggaattgtaattttcgctatggtaggcaatcaggcagtt
attttatccatgaatttcactgaatttggcgatcaatttaccaagcctctctactacaca
ctaatttctgcaataatactatctgcgattgctctagttcgagtaaacattgcagcaagg
tcttcaatcttctggtatgcaattagtactggaattggatttctaggtggtggaggacaa
caaccaatttcaaataccctaaaaagttttagagattacaaactatcatcaccacaattt
gtaatatggcaaatgaccaagatccttcttttcggagctttctttgcaaatattatgttt
ggatttgcagcaatgtcatttattgatgggaacactttgggattagagaatttaccttcg
ttgtttactctaccctttgtaactcctgataacaatccaaactatgcatcagaaaacgtc
gttcctatgattcctgccttagtaattttgattccaccattacttgcagcaattggactt
cgtctagttttgtatgttggaattcacagaataattaatgtaattacatcttatctccaa
gattctaatgaaggcaagccacgatatctaaattatgtttcaaccattgaaggaataatt
ggtataggtatcatttgggccggaattaatttattttttactgatcaaattgattacaat
acacgatatgtaattggcggtactcttgttattggttttgcattaattgcattttcaata
attgatagaattagagcacgtgtactaactcatatgtttaaacgagatgtgtatattaga
tttttaacaattgttgcaattgcaattatagttacaggagttgtatcagtaaacaatagt
attgcagatgcaaagaagattgaatatttgggaccatacacggctcaacaaataggagta
aatcgttatttaggtgaattaaatgatgttcaagaaaatactcatgatgttcaattaaca
tcagtttctgcaaataatattaaaaattatgtaaaacaaaatagtgatgtccttgatgtc
attcgagtttgggactgggaagcagcttttgcaaaattaaaacctgagataggtctaatt
ccatatgtagactttgaagataatgatattcttcgttttaacaatactttgtattggaca
gcctcaatgaagccaattttaccaacctctgtcagccttgaaaatagatggtataatgaa
catctagtatacactcacgtacctgatggatttcttactttagaagcaactgatggacaa
attgtcgatagtggcgaattcttcaaacaaagagaaatttactatggtgagggtggatta
tttgagcaaacttggtctggttatcctaaatcacgaggtgatactagtgcagagcttgga
ggagtatcttattcaggattaggtggattagatgttccaccaccattgagctggatattt
gagccaaactttttgctttcatttccaggcgaaccagtacatatcatgagatacaaagat
gtccatgacagaatggaaactctgtatccatactttctatatgatttgtttggaaaagaa
ttggattcactccctgtaactgatggagaaaattcttattggttaattccattaattatt
ggatttgataccggtgatgttccatggtctgttggaaatccatatttgcgtttggtaggt
tatgcactggttgattcttacaatggtgatattcaattattaaaaactggagatgatttc
tttactgaaatgtttgctagtcaatattctgaacaattcaaacctatgccggcatggtta
gaagaacaaatacgatatcctgttgaactgttcaattggaaaaccgagatgtataacatc
taccatgtaactaatgtagagacatttattcaagctaacgaattttatgaaatacctcgt
ggacttgacacctattatgttgaagcaaaacctcctggatttgatcaaacagaattcata
ggattgctctcattggaattacgaggttctcaaggtagaaatcttgcaggatatatggta
gtagagaatgatcttactaatctcggagacatgcaattttatgaagttccattaaactct
acaactaaattaattggccctacagcagttagagaagcccttgatagagatccagaattt
gctcaactaaagaccctcttgagaaatccaagaatcggtgataatattttataccgtgta
ggtgatcatgatatttactttattcctgtttatactgcaggtgctggtggagttgttgct
caattaggaacaattgcagcagttggtgctgcatttaatggagaatatttcgttggatta
ggtgaaactcaagaaaaagcatttgaagcgtatttgaagaaggtttctggtgtagcatct
acaacaactacagctgatgataattatgtagaattaattagaagtgacagaattgatatt
atcaagtcattatttgaaacaaacggaatttctgtttctgaacccacatccattcaaatt
ccactttcatttaatgaaggagaaatatttttctttactgaaagtgatcgtgcagatgcc
gaagaattcttgcttgaatttatagatgactttgtgaaaccacgtagtgatagagtcttc
atgtggcaagaggatacaaatctcaatattggaactgtgtttgtaaaagatggacttcct
gagatacattatgtctcaattgaggtaggcaactaa
DBGET
integrated database retrieval system