Candidatus Njordibacter sp. Uisw_002: ABXT42_02540
Help
Entry
ABXT42_02540 CDS
T11338
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
njo Candidatus Njordibacter sp. Uisw_002
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_17
TPR_16
TPR_19
TPR_2
TPR_1
TPR_CcmH_CycH
TPR_11
TPR_8
TPR_9
ANAPC3
TPR_12
TPR_Slam
DUF488-N3i
HAT_PRP39_C
Suf
ARM_TT21_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XOJ99857
LinkDB
All DBs
Position
complement(520090..521844)
Genome browser
AA seq
584 aa
AA seq
DB search
MSGLPSLYLFFNIHWGARLVGVVIACVMVISCSSTSNSAIKIGNIETEQNLPSPKHNLTT
AQLSKLLIGELSLQRGDYKTSTTQLIEAAKSTQDLNTAIRATYSAQLSQTPDLLIQASFL
WSQLAPQDPLPWQYIAQAQSLNQQFEKTIDALEKELKRGGGGEGLVRVANLSTDVSQKGL
QHQFQLWLGTYPSHKKIYYALAILAKKLDQTDQAIAHIETSLSFDERYLEAQFFYGDLLI
QSNDLDGADRYLSQYTRPLEQAPSVLINQHAQTFTLMRRPVLAYEYFKELTRRQPNHFYF
QYSAGLLAYENNDYSATISYLKKAIELDPTKHSAFYYMALSALREELPNQAIGFLSQINQ
GPDRVNALNLLVELEAPNTLSRASYFLQMRDQNQDLSPHIFALEISYLQQAQDFEATTQT
YQKALHKHPNNISLLYAYALFADSLHQFDITEQMLQRIIDIEPNHVNALNALGYSYAERN
IKLKEAQALILKALALDPKNPAIMDSLGWVKYRLGHLRQSLNLLSQAYDIMPIAEMAAHL
GVVKWALGDTQGAFNTWNLALEKEPDNALIKQAILDAQNEFQKD
NT seq
1755 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtcgggattgccatcactttacttattcttcaacattcactggggtgcccgccttgta
ggtgttgtcattgcctgcgttatggttataagttgtagcagcacaagtaatagtgcaatc
aaaattggcaacatagaaactgagcaaaatttaccaagccctaagcataacctcactact
gcgcagctatctaagcttttaataggtgaactatcattacaaagaggcgattacaaaacc
tcaacaacacaactgattgaagctgccaaatcaacccaagacctaaacaccgccatacga
gccacatattcagcacagctttctcaaacaccagaccttctcattcaagctagtttttta
tggagccagcttgcaccccaagacccacttccctggcaatacatcgctcaggcacaaagc
cttaaccaacaatttgaaaaaaccatagatgctttagaaaaagagcttaaacgtggtggt
ggtggtgaaggattggttcgtgtagcgaacttaagtactgacgtaagtcaaaaaggttta
cagcatcaattccagttatggctaggcacctacccaagtcacaaaaagatttattacgca
ctggctattttggcaaaaaaattagaccaaactgatcaggctatagcgcatatagaaaca
tcactatcatttgatgaaaggtaccttgaagcgcaatttttttatggggatttattaatt
caaagtaatgatctggacggtgcagatcgttatttgtcccaatatactagaccactggag
caggctcctagcgtgttgattaatcagcatgctcaaacatttacgctaatgcgtcgccct
gttttggcatatgaatatttcaaagagctaacaaggcgccagcccaatcacttttacttt
caatattcagcgggccttttagcctatgaaaataatgattattcagcaacgatttcttat
ttaaaaaaagctatagagcttgacccaaccaagcacagcgcattctactatatggcccta
agtgcccttcgtgaagagctgcccaatcaagctatcggttttttaagtcagataaaccaa
ggccctgatcgagtcaacgccctcaacttgctggttgaactagaggcccccaacacactt
tcaagggcttcatattttctccagatgcgcgatcaaaaccaagatttaagcccacatatt
tttgctttagaaataagctatctacaacaagcacaagactttgaagcaactacacagacc
taccaaaaagcattacataaacaccccaataatatttcacttttatatgcctacgcctta
tttgccgattcacttcatcaatttgatatcaccgaacaaatgttacagcgcattatcgac
atagaacctaatcacgttaacgcacttaatgccttgggctattcctatgcagaacgcaat
ataaagcttaaagaagcccaagcattgattctcaaagcactcgccctagatcctaaaaac
cctgccattatggatagcctaggctgggtgaaatatcggctaggacatttgagacaatcc
ctaaatttactctctcaagcctatgatataatgcccatagcagaaatggcagctcacttg
ggtgttgtaaaatgggctcttggagacactcaaggtgcttttaatacatggaaccttgca
cttgaaaaagagcctgataatgcgcttattaaacaagccatcttggatgcacaaaatgaa
ttccaaaaggattag
DBGET
integrated database retrieval system