Candidatus Njordibacter sp. Uisw_002: ABXT42_07710
Help
Entry
ABXT42_07710 CDS
T11338
Name
(GenBank) TRAP transporter large permease subunit
KO
K11690
TRAP-type transport system large permease protein
Organism
njo Candidatus Njordibacter sp. Uisw_002
Pathway
njo02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
njo00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
ABXT42_07710
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
njo02000
]
ABXT42_07710
Transporters [BR:
njo02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
ABXT42_07710
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DctM
DctQ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XOJ98613
LinkDB
All DBs
Position
complement(1614791..1617124)
Genome browser
AA seq
777 aa
AA seq
DB search
MATQTTDIGELEITDELIAERRAEKPGETPEDMTSWQRPITAFIDVLNLWMGRIICLAII
PLVAVMVTEVFSRGMFALLVSYDLGDLARAVNLGPTTWVYDISRMLGGVIFMAASGYALM
RGVHIRADFIFRNWHERTQATVDAVLYMMFYFPAMLFFFWSALGFAGDSLGFNGWGEEWG
IWEDASADSTWAPYLWPARIFMPIGAGLLFLQGFPELFRAFHQMGKQREAKFLSFFPFYL
IGLACVFVSVFYPDVLPLGDWIASALGDVNISKPMIGMLMLAAMLFSIFIGFPISFTLIF
LGFVFASIAGSSKLAFFLLTLQVNSTMLNDQLVAVPLFIFMGIMMEQAGLMERLFNAVQM
MMSRTRGALFVAVLFVSMIFAAATGIVGASVTILGIMAAKTMNRSNYDVRLSAGAITAGG
TLGILIPPSIMLIVMGPVLEVPVTDLFRAAVLPGVLLASLYMIYTIGRCMINPDLGPILP
EEDQPETSPYYGLEVILVMSGLGMFVFLCVLATKGAISFFPLAGLVIPLLWVGFMFWAFK
WARAVRPKGFYFSDLWYEFFMGLVPPTVLIAFSLGSIVAGLATPAEAAACGAFGSLILSI
GYKKFSVVGTYDALIKTLEITVLIMFLVAASNFFGAVFSNLGTPQMLTELLLSFDMSSWA
MLFFILALIFLLGWPLEWVPIVLIIVPILLPVVETLDFGLSQADLLIWFAILVAVNLQTA
WLSPPVALSAYFLKGVVPEWDLKDIYLGMMQFMVIQLIGLLLIIFFPQIALWLPNYW
NT seq
2334 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgacacaaacaacagacattggtgaacttgaaatcaccgatgaattaattgcagag
cggcgcgctgaaaaacctggtgaaacaccagaggacatgacgtcttggcagcggcccata
acagctttcattgatgtgctgaacttgtggatggggcgcatcatttgtttggctattatt
cccttagtggctgtaatggttactgaagtattttctcgcggtatgtttgctctactggtt
tcttatgacttgggagaccttgctcgggctgtgaatttggggcctaccacttgggtgtat
gacatcagtcgaatgcttggaggtgtcatatttatggctgcatcaggctatgccttgatg
cgtggtgtgcatattcgcgctgattttatcttccgcaattggcatgagagaacgcaagcc
actgtggatgcagtgttatatatgatgttctatttccctgccatgttgttcttcttttgg
agcgcactaggttttgctggtgactctttaggatttaatggctggggtgaagagtggggt
atttgggaagacgctagtgctgactcgacatgggcaccttacttatggcctgcgcgcata
tttatgcctatcggtgcaggattgctatttttacaaggtttccctgagctattccgtgct
ttccatcaaatgggcaagcagcgagaagcgaagtttttaagcttttttccattctattta
attggtttggcgtgtgtttttgtatccgtgttttatcctgatgtattacccttaggtgat
tggatagcaagtgcactaggtgatgtaaatatttcaaaacctatgattggtatgcttatg
ttggcagccatgttgttttctattttcattggtttccctatttcctttaccttgattttt
cttgggtttgtgtttgcttccatagcaggtagtagcaagttagctttcttcttgcttacc
cttcaagttaactccaccatgcttaacgatcagcttgtagcggtgcctttgtttatcttt
atgggcattatgatggagcaagcagggctaatggagcgcctgtttaacgctgtacaaatg
atgatgtctcgcacacgtggtgcgctatttgtagccgtattgtttgtatctatgatcttt
gcagcagctaccggcatcgtgggcgcctcggtgactattttgggcatcatggcagctaaa
accatgaatcgctctaattatgatgtgcgtctatctgcaggtgcgattacggcaggtggt
accttaggtattttaataccgccatccatcatgttgattgtaatgggcccagtattagaa
gtgcccgtaacagatttattccgtgcggcagtgctgcctggggtgttattggctagtttg
tatatgatttacactattggtcgatgcatgattaaccctgatcttgggcctatcttgcct
gaagaagatcagccagaaacctcaccttactatggcctagaagtcatacttgtcatgtct
ggtttgggcatgtttgtattcttatgtgtattggctactaaaggcgccatatcattcttc
ccacttgcagggctagtgattccattattatgggttggctttatgttttgggcgtttaaa
tgggctcgtgcagtgagacctaaagggttctatttctctgatttgtggtatgaattcttt
atggggctagtgccacccacagtgctgattgccttttctttaggctctattgtggcaggc
cttgcaactccagcagaagcagctgcgtgtggtgcttttggatcgttaattctatctatc
ggttataaaaagtttagtgttgttggtacgtatgatgccttgattaaaactttagaaatt
actgtgttgatcatgttcttggtggcagcatcaaacttctttggtgcggtcttctctaac
ttaggcacgccgcaaatgctaaccgaattacttttgtcctttgatatgtcgtcatgggct
atgctgtttttcatcttggcattgattttcttgctaggctggcccctagagtgggtgcct
attgtattgatcatcgtacctattttattgcctgtggtagaaacactagactttggcttg
agtcaggcagacttattaatttggtttgccatactggtcgcagtgaacctgcaaacggct
tggttaagtcctcctgtggctctatctgcctacttcttaaaaggagtagtgccggagtgg
gacttaaaagatatttatttgggtatgatgcagtttatggtaattcagctaatcggtttg
ctgttgatcatattcttcccacaaattgcattgtggttgccgaattactggtag
DBGET
integrated database retrieval system