Neptunomonas japonica: NEJAP_2011
Help
Entry
NEJAP_2011 CDS
T07060
Name
(GenBank) signal transduction protein
KO
K20966
c-di-GMP phosphodiesterase [EC:
3.1.4.52
]
Organism
njp
Neptunomonas japonica
Brite
Enzymes [BR:
njp01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.4 Phosphoric-diester hydrolases
3.1.4.52 cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase
NEJAP_2011
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBB29961
UniProt:
A0A7R6PIZ2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2219144..2221459)
Genome browser
AA seq
771 aa
AA seq
DB search
MTLNKRISLLILPVLIIGYLVAVVGVYNTQKQSIIDLEERTLDLQVTELTALFEKYTNVA
ESFIDSLLYNSSLQNYFSSQDKLFKALALEKGLENSIKELNTLSSDYFSVALIRPQGKVE
YYYENSLDPFSEISRYQVEMVRDAFEAKQAEWADMHGPLGESHMLFVRIIDQNTFKAPIN
FSTSSSIAIVVEVSPTLFDKKIKEQISKGLVYQWFGQGHVGAHHAEESLVVHAPVAFGSL
SLGVSEPLLAQKFNKLKLSLFISFVLIAVLSYFSLIYLIQRYVTGPIHQLEKELSSVNVE
DGSGFVASVSQDEIGGLSRTFSHLYDSLDQSYRLTKELAEKDTLTKLYNRRMFHNAVEKM
IKRSEFSGTKTALFYIDIDNFKFVNDTYGHTMGDLLLKVFAERLSLVVRATDQIIPRYDI
DNASSARLAGDEFAVVICGLSDELHASGLADRILAICHNGLECDEGTFPVSLSIGVAVFP
DDALTKEDLVNNADAAMYEAKKAGKNRISFYSEELAAKSRRKYAVELELKHLDTAELELV
YIPAFNVDMFESICSVEALIRWQSPVLGAVLPSEFLSIAEGSSQYEKIDAWVIERVFRDS
KAIIKHFGGALRISFKVSAVQLVSKSFIATISKLIVKYQINPQYFEIEITEIFDMDKMKD
DIGLLFLLKDLGFNLALVDFGAGYTSIMQLIEYPVDVVKLDKTFVASLFIQARRDKALSL
IEFCKAQGFEVTAKGVESDEQATVLKQAGCRRLQGVYYAEPMSLNKILSQY
NT seq
2316 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgacgctcaataaacgtataagtttattgattttgcccgtattaattatcggttacttg
gttgctgttgtcggtgtatataacactcaaaaacaatcgattattgatttagaggagcgc
acgctcgatctgcaagtcactgagcttacggcactgtttgaaaagtatacaaacgtggct
gaaagttttattgattcactattatataatagtagtctgcagaactatttttctagtcaa
gacaagttgtttaaagcgctggctcttgaaaaggggttagaaaactctatcaaagagctt
aatacgctttcatccgactacttttcagtggcgcttatcaggccccaaggaaaagttgaa
tactattacgaaaacagcctagatcctttttctgagattagccgttatcaagtagaaatg
gttagagatgcttttgaagcaaagcaagcagaatgggccgatatgcatggtcctttaggc
gagtctcatatgttatttgttcgaataattgatcaaaatactttcaaggcacctatcaat
ttttctacgagctcatctatcgctattgttgtagaggtgagtccgaccttgtttgataaa
aaaatcaaggagcaaatttctaaaggccttgtttatcagtggtttgggcaggggcatgtt
ggtgcccatcatgctgaagagtctttagttgtgcatgccccggtggcttttggctcatta
tcgctaggcgtatctgagccgttattagcgcaaaagtttaacaagcttaaactaagcctt
tttattagctttgttttgatagctgttttgagttatttttcgcttatctacctgattcag
cgttacgttacaggtcctatccatcaacttgaaaaagagctatcgagtgtgaatgttgaa
gatggaagtggttttgtcgcttctgtttcacaagatgagataggcgggctaagccgaaca
tttagtcacttgtatgactctcttgaccagtcttatcgtttaactaaagaattggcagaa
aaagacacacttaccaagttatataatcggcgtatgtttcataatgccgttgaaaaaatg
ataaaaaggtctgaatttagtggtacaaaaacagcgctcttttatatagatattgataac
tttaagtttgtgaacgatacctatgggcataccatgggagatttgctgcttaaagtattt
gcagagcgattaagtttagtcgttagagcaacggatcaaattattcctcgttatgatatt
gacaatgcatcttcagctaggctggcgggcgatgagtttgcagtggttatttgtggtttg
agtgacgagcttcatgcgagtggtttagcagataggatactcgctatctgccataatggt
cttgagtgtgatgaaggtacgttccctgtttcgttgagtattggcgtagctgtttttcca
gatgatgctttaaccaaagaagacctagtaaataatgctgatgctgcaatgtatgaagca
aagaaagcgggtaaaaatcgtatctctttttactctgaagaattagctgcaaaatcccgc
cgaaaatatgctgttgagctcgaactgaagcaccttgatacggctgagttagagcttgta
tatatacccgcttttaatgtcgatatgtttgaatctatctgcagcgttgaagcactaatt
cgctggcagtctcctgtattgggtgcagtgttgccttctgagtttttatctattgcagag
gggagtagtcaatatgagaaaattgatgcctgggtgattgagcgtgtttttcgagactcc
aaagccattattaagcactttgggggggcattgcgaattagctttaaagtttctgctgtt
caattggtttctaaatcttttatagcaacaatatccaagttgatagtgaagtatcagatt
aacccacagtattttgaaatagaaattactgaaatatttgatatggataaaatgaaagat
gacataggcttattgtttttgcttaaagaccttggttttaatcttgccctagtagacttt
ggtgctggatatacgtcaattatgcagttaattgaatatccagttgacgtcgtcaagttg
gataaaacttttgttgcaagcttgtttatccaagcgcgtagggataaagctctttctctt
atcgagttttgtaaagctcaaggctttgaagtaacagctaagggtgttgagagtgatgag
caagcaacagttcttaagcaggctggttgccggcgtttacagggggtgtattatgctgag
ccaatgtcccttaataaaatcttatctcaatattga
DBGET
integrated database retrieval system