Candidatus Nitronauta litoralis: G3M70_12800
Help
Entry
G3M70_12800 CDS
T07016
Name
(GenBank) collagen-like protein
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
nli
Candidatus Nitronauta litoralis
Pathway
nli04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nli00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
G3M70_12800
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
nli00536
]
G3M70_12800
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
nli00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
G3M70_12800
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPJ62707
UniProt:
A0A7T0BYB2
LinkDB
All DBs
Position
2813167..2815425
Genome browser
AA seq
752 aa
AA seq
DB search
MFKRIISTIFVLMLLATSGPAFATGGGWGGGGWNGGGHGSGGWGGGGQGGGWGGGSHGDD
DDDGHGGGGGHGDDDDDGHGGGGGHGDDDDDGHGGGGGGGGGGGGGCTPQGSNGNGHGGG
GGSGGGGGHGGGHGCHQGPPGPQGPPGPPGPAGPAGPPGPEGPQGPQGNTGPAGPQGPQG
DTGPAGPQGPQGPAGADGADGATGPAGPQGPQGDTGPAGPQGPAGADGADGATGPAGPQG
PQGDTGPAGPQGPAGADGADGATGPAGPIGPAGPQGPAGADGADGATGPAGPQGPQGPAG
ADGADGATGPAGPQGPQGPAGADGADGATGPAGPQGPQGDTGPAGPQGPAGADGADGATG
PAGPIGPAGPQGPAGPIGPAGPQGPAGADGADGATGPAGPQGPQGDAGPAGPIGPAGPQG
PAGADGADGATGPAGPQGPQGDAGPAGPIGPAGPQGPAGADGADGATGPAGPQGPQGDAG
PAGPIGPAGPIGPAGPQGPAGADGADGADGATGPAGPQGPQGDAGPAGPIGPAGPQGPAG
ADGADGADGATGPAGPQGPQGPEGQEGEPGPEGPVGPVGPVGPAGPAGPEGPPGPGLDGI
RWTNIPPTDFTSANFDAVLITSLASAFSGEDGGVEAILGPFNIPHGAVIKSFKVDVTNTT
QTSEVMVYRLWRFELGSATPATPLAEISSNATGTLSIAVPAGAPVNNERYAYQVEVFHPS
SVAVPDGSIPVEDFELHLAAIAYEFPPPAPQP
NT seq
2259 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaaagaataatttccacaatatttgtgttgatgctgctggcgacctcaggtccc
gcattcgccaccggtggaggctggggcggaggtggttggaatggcggcggtcacggtagt
ggcggctggggaggcggtggtcagggtggtggctggggaggcggcagtcacggcgatgac
gacgatgatgggcatggcggtggtggaggccacggcgatgacgacgatgatggacatggc
ggtggtggaggccacggcgatgatgatgacgatggtcacggcggcggaggcggtggcggt
ggcggaggcggcggtggttgtaccccgcaaggaagtaacggaaatggtcacggcggtggc
ggtggcagtggcggcggtggcggccatggcggtggtcatgggtgtcatcaaggaccccct
ggccctcaaggccctccaggtcctccaggcccggcgggcccagcgggccctccaggtcct
gaaggtccacaaggtccccagggtaacactggtcccgcaggcccccaaggtccgcaaggt
gataccggtcccgcaggtccccaaggtccgcagggtccggcaggtgctgatggtgccgat
ggcgctaccggtccggcaggtccacaaggtccgcaaggtgacactggtccagcaggtcca
caaggtccggcaggtgctgatggtgccgatggcgctaccggtccggcaggcccacaaggt
ccgcaaggtgacactggtccagcaggtccacaaggtccggcaggtgctgatggtgccgat
ggcgctactggtccagcaggcccaataggtcccgcaggtccacagggtccagcaggtgct
gatggtgccgatggcgctaccggtccggcaggtccacaaggtccacagggtccggcaggt
gctgatggtgccgatggtgctaccggtccggcaggtccacaaggtccacagggtccggca
ggtgctgatggtgccgatggcgctactggtccggcaggcccccaaggtccgcaaggtgac
actggtccagcaggtccacagggtccggcaggtgctgatggtgccgatggcgctactggt
ccagcaggcccaataggtcccgcaggtccacagggtccagcaggcccaataggtcccgca
ggtccacagggtccagcaggtgctgatggtgccgatggcgctaccggtccggcaggtcca
caaggtcctcaaggtgacgctggtccagcaggtccaataggtccagcaggtccacagggt
ccggcaggtgctgatggtgccgatggtgctaccggtccggcaggtccacaaggtccacag
ggtgacgctggtccagcaggtccaataggtcccgcaggtccacagggtccagcaggtgct
gatggtgccgatggcgctaccggtccggcaggtccacaaggtcctcaaggtgacgctggt
ccagcaggtccaataggtcccgcaggtccaataggtcccgcaggtccacagggtccggca
ggtgctgatggtgctgatggtgccgatggcgctaccggtccggcaggtccacaaggtcct
caaggtgacgctggtccagcaggtccaataggtccagcaggtccacagggtccagcaggt
gctgatggtgctgatggtgctgatggtgctactggtccggcaggtccacaaggtccacag
ggtcctgagggtcaggaaggtgaacctggtcctgaaggtccggtaggtccggtaggtcca
gttggtcctgcaggcccggcaggtccggaaggtcctcctggtcctggtcttgacggtatt
cgctggaccaacattcctccaactgatttcacttccgctaattttgatgcagtgctcatc
acgagcctggccagcgcttttagtggtgaagatggaggagtggaagctattcttggaccg
ttcaacatcccgcatggagctgtgatcaaaagcttcaaagtggatgtaacaaacactact
caaaccagtgaggtaatggtttaccgtttgtggcggtttgagttgggaagcgcaacacct
gcgacaccgctggctgaaatttccagcaatgcgaccggaactttgagtattgcggttcca
gcaggcgcgcctgtgaacaatgaacggtatgcctatcaggttgaggtcttccacccgtca
tctgttgcagttccagatggttctattccggtagaagatttcgagttgcatctggcagca
atagcttatgaatttcctccaccggcacctcagccttag
DBGET
integrated database retrieval system
