Neisseria lisongii: PJU73_06330
Help
Entry
PJU73_06330 CDS
T09339
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
nls
Neisseria lisongii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pertactin
Autotransporter
AC_1
DUF4573
Bflower
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCL70976
LinkDB
All DBs
Position
complement(1385010..1387754)
Genome browser
AA seq
914 aa
AA seq
DB search
MKQITPKTSLSLIAAAVAALSNSAWAVDLTCQHRNGCRLLNTLEKPNEWSLYQGGRIERK
GSDSSLSLIIPAGKYENQKVISLSDGNESPDWTWSNSIFYVNRKNTNVTLQSGVSATLED
QRDDEGRGDPVIIETNAAYNKIEQGVTLSVNKSYFEKKNLPADEGGHDSGHAITINGDNG
NGKIITLENSADLILNGSSAVGIDENGGGVQIHSSNHKIELNGNDTYGIELSGTSSLMME
NVHISGGGKKTAAVAMYSNGGQAPTVAVNNSTIRLDGINSTLFVVADGGNLTANNIKAEV
SVGVYYTISGEDEYSATQNIHLKDSSIRGRDALLFIKHDSDSSKPRVNLTADNSTLYGIS
RIDEKRPENNGKISFTLNNQSQWIYNGNSEIDELILNQSSVTSTVSEQSNQFNTLTINGN
LSGSGHFTLNTDLASQQGDKIAVKGQAEGRHTITVNNTKNEPKAANGKLTLVETGGGNGV
FSLTNNNGGNYVDAGAFRYSFKKEGTNWVLAHQGMPSEKPAEPVKPAEPVKPAEPVKPAE
PVKPVEPVKPVEPVKPVEPVKPVEPVKPVEPVKPVEPVKPAEPVKPTEPVKPTEPVKPAE
PVKPAEPVKPAEPVKPTEPVQPNMASKVLSNYANAPLGYLQAASFLIQQQQNIVGQRQTD
LHRQGRLSGLWLQSDYGRSRHDAQNVGNNARRNGFKMNSRGFQIGYDYGFGAGYIGVLAG
RSNSDLQYGGDYYNTDLTADSIGLYGGGHSENGWFADSTYRYTRFKAKTNGEQTRLHTNS
LNVQIGKIIALNPTWQLVPNAGLTVSRLSATENVPAVTLLHSRAGADLQTEYNVGSVKLQ
PQIGVYYLGEHKRSHVNINGYRFDTPSNGNRAAIKVGMNADFGANGRLNVNVQREHGSRT
RRHLATEIGYRFTW
NT seq
2745 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacagattacaccgaaaacttctctgagtctgattgccgcagctgtggctgcttta
tccaattcggcatgggcggtggatttgacctgccaacatcggaatggatgtcggcttttg
aatactctagagaagccaaatgaatggtcattgtaccaaggtgggcggattgaacgaaaa
gggagtgattcatctctttctctgatcatacctgccggaaaatatgaaaatcagaaagtt
atcagtttgtcagatggaaatgagtcacctgattggacttggagcaatagtatattttat
gtcaataggaagaataccaatgtaactcttcaatccggtgtttcggcaacactagaagat
caaagagatgatgaagggcgaggcgatccggtcattatcgagaccaatgcagcttataat
aaaatcgaacaaggggtaacgttgtcagttaacaaaagttattttgaaaagaaaaatctg
cctgctgatgagggggggcatgattcaggtcatgccatcactattaatggtgacaacggt
aacggaaaaattatcacattggaaaattcggcagatttgattttaaatggttctagtgca
gtaggtatcgatgaaaatggcggtggtgttcaaattcacagcagcaatcataaaatcgaa
ttaaacggtaacgatacttacggtattgagttgtcaggcacctccagtttaatgatggaa
aatgtacatatcagcgggggaggtaaaaaaaccgctgctgtagctatgtattctaatgga
ggacaagcgccaactgttgctgtcaataacagtacaattcggctggacggaatcaacagt
accctctttgtcgtcgcagatggcggtaatttaacggcaaataatatcaaggcggaggtt
tcggtaggtgtttattatacgatttcgggtgaggatgaatattctgcaacgcaaaatatc
catttgaaagacagcagtatccgtggcagagatgcactgttatttattaaacatgatagc
gatagttctaaacctagagttaatctgacggcagataacagtacattgtacggtatcagt
cggatagatgaaaaacgcccagaaaacaatggaaaaatcagctttactttaaataatcaa
agccagtggatttataacggaaatagcgaaattgatgagttgatattgaatcaatcgtcc
gtaacttccacagtttcagagcagtcgaatcagttcaacaccctgaccatcaacggtaat
ctgagcggcagcggccattttacgctgaataccgatttggcttcccagcagggcgataaa
attgcggtcaaagggcaggcggaaggtcggcacacgattaccgtcaacaatactaaaaat
gagccgaaagctgctaatggcaagctgactttggtagaaaccggcggtggcaatggggtg
ttttcattgaccaacaacaatggtggaaattatgtcgatgcgggtgcgttccgctacagt
tttaaaaaagaaggcacaaactgggtactggcacatcagggtatgccgtctgaaaaacca
gcagagccagtgaaaccggcagagccagtgaaaccggcagagccagtgaaaccggcagag
ccagtgaaaccggtagagccagtgaaaccggtagagccagtgaaaccggtagagccagtg
aaaccggtagagccagtgaaaccggtagagccagtgaaaccggtagagccagtgaaaccg
gcagagccagtgaaaccgacagagccagtgaaaccgacagagccagtgaaaccagcagag
ccagtgaaaccggcagagccagtgaaaccggcagagccagtgaaaccgacagagccggta
caaccaaatatggctagtaaggtgttgagcaattatgctaatgcgccattgggttattta
caggctgcttcgttcttgattcaacagcagcaaaacattgtcggtcaacgccaaaccgat
ttacaccgtcaaggccgtctgagcggtttgtggctgcaaagcgattacggacgtagccgt
catgatgcccaaaatgttggcaataatgcccgccgtaacggttttaaaatgaatagccgt
ggttttcaaatcggctatgattacggtttcggtgcaggctatatcggcgtattggcaggc
cgaagtaacagtgatttgcaatatggcggagattattacaataccgatctgactgccgac
agtatcggtttgtatggcggtggacacagtgaaaacggctggtttgctgattctacttat
cgttatacccgcttcaaagccaaaaccaatggcgaacagacacgtttgcacacgaacagc
ctgaatgttcaaattggcaaaatcattgcattaaatccaacttggcagcttgtgccgaat
gcaggattgacggtcagccgtttatcggcaactgaaaatgtccctgccgttacgctgctg
catagtcgggccggtgcagacctgcagactgaatataatgtcggtagcgtgaaattgcag
ccgcaaatcggtgtttattatctcggagagcataaacgcagccatgttaatatcaatggc
taccgatttgatacgccaagcaatggtaaccgtgctgcaatcaaagtcggtatgaatgct
gattttggtgcaaacggccgcttgaatgttaatgttcaaagagaacacggaagccgaacc
cgccgtcatttggcaaccgaaatcggctaccgctttacgtggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
