Nomia melanderi (Alkali bee): 116429306
Help
Entry
116429306 CDS
T07404
Name
(RefSeq) putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12 isoform X1
KO
K18409
ATP-dependent RNA helicase TDRD12 [EC:
5.6.2.5
]
Organism
nmea
Nomia melanderi (Alkali bee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nmea00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
nmea03036
]
116429306
Enzymes [BR:
nmea01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.5 RNA 5'-3' helicase
116429306
Chromosome and associated proteins [BR:
nmea03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
piRNA pathway
116429306
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
TUDOR
Helicase_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116429306
NCBI-ProteinID:
XP_031837949
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1011 aa
AA seq
DB search
MKTEMINNEGNILPSTAISIKVTNILTPYIIRILKQKDYKKKLNLINKKLMLLEKKGMLN
IDVERVEPKIGNVVIVHDKLDKDLDLPAWLCRGIINSILDDMKNIYNVFLPDYGIAVELQ
RNDFCMSSTDLILDEYLTYTVGLYDILPAALKYNSPAQGESSLLVSEEWNALAIQYIKDL
MVASSTIYFDHLASDERGKQYGEFYLNIGGIIISLSEALVLNNTAIYLREGMMKFLQNLV
KCEKLENDIINDEIILYNISKEYKKSEETNAQKESFIKRMNKFKGRKQLYDKVRKGKEKV
LIYGKIKFECLQTISDLKFPAEIHKAWKSLIKSFSPKKLQSYILPAIKSGLDVIAIGAAQ
SGKTLGYTFAICGLLASKLDLPRGVNPVALILCSSSSKVLEVHSLFTEFLQRYKTIESVA
AINGKSERSLVAEMFNGCQILISTPRFLTGFIDQNRKLLKFESLQYLILDDGDVILDKYF
DSISKLFKKHKIIHNRELRNTNGTLQIIITAKHWTPQLKKMAAVLMDCPYMCIASFIEAT
IFKSVYPKMYIVNSKTKDRKLLDLLSNEFSKLRTVIICTNSAEAEKVHKFLKQSIKDILL
AHEDMNLIHLQGIKQCWDACVSDSYPVLICTDEVLSDLDITNATWLIHYSISLRFKTQFN
FRFSTLFDNLQEEKSTCKVTILVDENNDIQFLSIIEIMQRINVVIPQSLSENIEHIRTAL
EKKKDNYPLCNNIKLWGFCYKNHSCTLRHKIISELDAPIIDIRMKDKVKFRIISIHNVTQ
ISARIISYIKFDTSEEIELSNVQYMEIIIKIQEFYSSVDNRRNCESIYVGCICGLEEPVD
CYKRVQILHIDEEDEMDKPKYADVRCIDNGVILKKVNIYRLLHMPEELIKYPAQVVDVFL
TDIAPHDDEYVWNRCAIDTVFQWFKDNVDGRSYVIGTVNLHLKNTIWVNTLEIGTKLIGY
KDIVGSSLKTELIKNDHAVENPEHLQQMYQLCKDAGLLELNGYNLNVLMNK
NT seq
3036 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactgaaatgattaataatgaaggtaatattttaccttccacagcaatatcaatt
aaagtaacaaatattttgacaccatacatcataagaattttaaaacaaaaagattacaag
aaaaaattaaatttaattaacaaaaagttaatgttgttggagaaaaaaggaatgttaaat
attgatgtagaacgtgtagaaccaaaaattggaaatgtggttatagtacatgataagtta
gataaagatttagatcttccagcttggttgtgcagagggattattaacagtattctagat
gatatgaaaaatatatataatgtatttttaccagattatggaatagcagttgaattacag
agaaatgatttttgtatgtcttcaactgacttaattttagatgagtatttaacttatact
gttggtttatatgacattttacctgctgccttaaagtataactcaccggcacaaggagaa
agttcacttttggtttcagaggaatggaatgcattagcaattcaatatataaaagattta
atggtagcatctagcacaatttattttgatcatttagcatctgatgagcgaggtaaacaa
tatggtgaattttaccttaatattggaggtattataataagtttaagtgaggctttagtt
cttaataatactgccatttatttacgagaaggtatgatgaaatttttacaaaatttggta
aaatgtgagaaactggaaaatgatataatcaacgatgaaataatactttataatatttca
aaagagtacaagaaaagtgaagaaactaatgcacaaaaggaaagttttataaaaagaatg
aacaagttcaaagggagaaagcaattatatgataaagtaagaaagggtaaagaaaaagta
ttaatttatgggaaaattaaatttgagtgcttgcaaacaatttcagacttaaagtttcct
gctgaaatacataaggcttggaaatcattaataaagtcatttagtccaaaaaaacttcaa
tcatatattttaccagcaataaaaagtggtttagatgtaatagcaattggagcagcacag
tctggtaaaactcttggatatacatttgctatttgtggacttttggcttcgaaattagat
cttccccgaggtgtgaatccagttgcattgatactgtgttcatcatcgtccaaagtgtta
gaagttcattccttgttcacggaatttttacaaaggtacaagactattgaatctgttgct
gctattaatggtaaatcagaaagatctttagtggctgaaatgtttaacggatgtcagatt
ttaatatctacaccaagatttttaactggttttatagaccagaacagaaaattattgaaa
ttcgaaagtctccaatatttaattttagatgatggtgacgttattttggataaatatttt
gactctataagcaaactatttaagaagcataaaattattcataacagagaattaagaaat
acaaatggaacattacaaatcataataactgcaaaacattggacaccacagcttaaaaaa
atggcagctgttttaatggactgtccatacatgtgtatagcatcttttatagaagctaca
atttttaaatctgtgtacccaaagatgtacatagtaaattcaaagactaaagatagaaag
cttttagatttactaagcaacgaattttctaaactgagaactgtaataatttgcacaaat
agtgctgaggctgaaaaggtgcataagtttttaaaacaaagtattaaagatatactttta
gctcatgaagatatgaatctcattcacttgcaaggtattaaacaatgttgggatgcttgt
gtaagcgattcttatccagttttaatatgtacagacgaagttttgtcagatctagatatt
acaaatgctacttggttaatacattattccatttctctacggtttaaaactcaatttaac
tttcggttttcaacgctcttcgacaacttgcaagaagaaaaatccacatgcaaagtaact
attttggtagacgaaaataatgatatacagtttttaagtataatagaaataatgcaacgc
ataaacgttgtaattccgcaaagtttatcagagaacattgagcatataagaacagcttta
gagaaaaaaaaagataactatcctttgtgtaacaacataaagttatggggattttgttac
aaaaatcattcttgtacattaagacacaagataatttcagaattggatgcaccgattata
gatattcgaatgaaggacaaagtaaaatttagaataatcagcatacacaatgttactcaa
atttctgctaggattatatcgtatattaaatttgatacgtcggaagaaatagaactttca
aatgtacaatacatggaaattattataaaaattcaagaattttattcatctgtcgacaac
agaagaaattgcgaatcaatatatgtaggatgtatatgtggtctggaagaaccagtagac
tgctataaaagagtacaaattttacacattgatgaagaagacgaaatggataaaccaaaa
tacgcagatgttagatgtattgataatggggtgattttgaagaaagtgaatatatataga
ttgttacatatgccagaagaattgataaaatatccagcacaagtagtggatgtatttctt
accgatatagctccgcatgacgatgaatacgtttggaatagatgtgctatcgatactgta
tttcaatggttcaaagataatgtcgatggaaggtcttatgtgataggaacggtaaatcta
catctaaaaaacacaatatgggttaacactttggaaattgggaccaaattaattggatac
aaagatatagttggatcttctttaaaaacagaattaataaaaaatgatcatgctgttgaa
aatcctgaacatttacaacaaatgtatcaactttgtaaagatgctggtttattagaactt
aatgggtacaatttaaatgttttaatgaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
