Nonlabens marinus: NMS_0304
Help
Entry
NMS_0304 CDS
T09770
Name
(GenBank) glycosyl hydrolase, BNR repeat precursor
Organism
nmf
Nonlabens marinus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sortilin-Vps10
BNR
DUF6242_C
BNR_2
BNR_6
Izumo-Ig
LigD_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAO54313
UniProt:
W8VU57
LinkDB
All DBs
Position
312286..315477
Genome browser
AA seq
1063 aa
AA seq
DB search
MIQSPFTIFKDQICVFMKINYLIAVLCFFAFAKANSQQLPDPPEAQKYYESQEFRLLGPF
RGGRSAAVTGVPGKPNLFYFGSTGGGVWKTTDGGRTWSNISDGYFGGSIGAVSVAPSDHN
VIYVGGGEKTVRGNVSSGYGIWKSVDAGKSWKPAGLPNSRHVPRISIDPNDHNIVYAAVL
GNIYKESKDRGVYKSTDGGKSWKKTLFANDLAGAVDLIIDPSNPRNLYASTWRIQRTPYS
LSSGGDGSALWKSTDYGETWSEISKNGGFAKGTLGIMGITVSPVNSDKLYAIVENKDQGG
VYRSNDAGMTWTKTNDDRNLRQRAWYYTRIYADTQDEDAVYVVNVSYHKSTDGGHNFSSN
RAPHGDHHDLWIAPEDPKRMIMGDDGGAQVTYDGGETWSTYYNQPTAQYYRVTTDNSFPY
RIYVAQQDNGTIRIPHRTTGGSITETDWEGTAGGESAHIAVDPNDNDIVYGGSYGGFLTR
YNHKTKSQRGINVWPDNPMGHGAEDMKYRFQWNFPIFISSHGDNKLYSFSNHVHVTSNEG
QSWETISPDLTRNDPTKLVSSGGPITQDNTSVEYYGTIFAAAESPLNEGELWVGSDDGLV
HLSRDSGKNWSDITPMDLPEWAQINSIEASRFDPAVAYLAATRYKLGDFAPYLYRTTDYG
KSWKKIVSGIPDEHFTRVVREDEEQKGLLYAGTETGLYISNDDGATWKSFQMNLPIVPIT
DLAVKQNNLVIATQGRSLWIHDDLSMVRQGLKAAAAYPKSKKGASTEKVMLFQPKESYRM
EGRGGRSSLTAGTNHPSGVQINYFLPELKEKDSVALRFMDNSNKLIKEYATYSKKDILKP
EAGANSFSWDTSYEGAEELDGMILWWADLSGPKAVPGSYTVELEVNGVKQTQPITIKRTP
ISEATEADMKSQFEFVTDVNSTVDKAHASIKNIRDFNKKLTAFKSVYGDRKEDGIKEMLV
LADSMKTKFSEVEKALYQTQNRSGQDPLNFPIKLTNKLAHLNALVTMGDFGPTAQDIAVK
NELTAQINQELSKFNQVLDTDIKEFNNKFNALKLDYLVIETED
NT seq
3192 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcaatcgccatttactatctttaaagaccaaatttgtgtatttatgaaaatcaat
tacttgatagccgttctatgttttttcgctttcgcgaaagcgaactcacaacaacttccc
gatccaccagaagctcaaaaatattacgagtctcaagaattccgcttattgggcccattc
cgtggtgggagaagtgcggcggtgactggagtgccaggaaaaccaaatctattttatttt
ggtagtacaggcggtggcgtgtggaaaacgacagacggcggccgtacctggagcaatatt
tctgatgggtattttggtggtagtattggtgccgtgagcgttgcacctagcgatcataat
gtgatctacgtaggcggtggtgaaaaaaccgtgagaggaaatgtctcaagtggttatggt
atatggaaatctgtagatgctggtaagtcctggaagccagcaggtttgcctaatagtcga
catgtgccacgcatttcaatagaccccaatgatcacaacatcgtttatgccgctgtacta
ggaaacatctataaggagtctaaagatagaggtgtctataaatctacagatggaggtaaa
agctggaaaaagacgttattcgcaaatgatctcgctggagcggtagatcttatcattgat
ccttccaatcctcgcaacttatatgcctctacctggcgcattcaacgtactccttatagc
ttaagtagtggtggtgacggcagcgcgctatggaaaagtacagattatggtgagacttgg
tctgaaatttctaaaaatggaggctttgctaaggggacattagggattatgggaatcacc
gtttctccagtgaattcagacaaactctatgctattgtagaaaacaaagatcaaggtggt
gtgtatcgcagtaatgatgcagggatgacttggactaaaaccaatgacgaccgcaacttg
cgacaacgcgcctggtactacactcgtatttatgcagatacccaggatgaagacgcggta
tatgttgtcaatgtttcctaccacaagtctacagacggtggtcataatttctcaagtaat
agagcaccccatggcgatcaccacgatttatggatcgcaccagaagatccaaaacgtatg
atcatgggagatgatggtggcgcacaagtcacgtatgatggcggtgaaacctggtcaacc
tactacaatcagcctaccgcacaatactatagagtaactactgacaattcattcccatat
agaatttatgtggcgcagcaggataatggaacgatcaggattcctcatagaaccactgga
ggatcgataaccgagaccgactgggaaggaaccgcaggtggagaaagcgctcatattgct
gtggatcctaatgataacgatattgtgtacggtggtagttatgggggtttcctcacccgt
tacaatcataaaacaaaatcccaacgtgggattaatgtatggccagacaatcctatggga
catggtgctgaggacatgaaatacaggttccagtggaatttccccatctttatttctagc
catggtgacaataaactatactctttctcaaatcatgtacatgtgaccagcaatgaaggt
caaagctgggaaacgatttctccagacctaacccgtaacgatcccactaaattagtttcc
agtgggggacctatcactcaagacaatactagtgtggagtattatggaaccattttcgca
gctgcagagtctccactcaatgaaggagaattatgggtaggtagtgatgatggtttagta
cacctatcaagagacagtgggaaaaactggagtgatataactcctatggaccttccagaa
tgggctcaaatcaatagtatagaagcaagtaggtttgacccagctgtagcttatctagca
gctactaggtacaaattaggagactttgctccctatttatacaggactacagattacgga
aaatcatggaagaaaatagtatctggcatacctgatgagcatttcacaagagtcgtgaga
gaagatgaagagcagaaaggtttgctatatgcaggaactgaaacagggctttatataagc
aatgatgatggagccacctggaaatccttccaaatgaatttgcctatagtacctataaca
gatcttgctgtaaagcagaataatctagtcattgcaacccaaggacgcagcttatggatt
cacgatgatttatctatggtaagacaaggcttgaaagcagctgctgcttatccgaaatct
aaaaagggagcgtccactgagaaagtgatgttgtttcaacctaaggaatcttatcgcatg
gaaggccgcggtggtcgcagttcattaacagcaggaactaatcacccgtcaggtgtgcaa
atcaattatttcctaccagaattgaaagagaaagatagtgtcgcactacgattcatggat
aacagtaataagttgatcaaggaatatgctacttattctaaaaaggacatactaaagcct
gaggcaggagcaaactcattcagctgggacactagttatgaaggtgcagaagaattggat
ggtatgatcctttggtgggcagatctttcaggacctaaagcagttcctggatcctacact
gtagagttggaagttaatggagtgaagcaaacacagcctattactattaaaagaactcct
ataagtgaagctactgaagcggacatgaagtctcaatttgaatttgtgactgacgttaat
agtacagtagataaagcacatgcttcgattaaaaacattcgagatttcaataagaaattg
acagctttcaaatcggtttatggagatcgtaaagaagatggaatcaaggaaatgcttgtc
ctggcagacagcatgaaaactaagtttagtgaagtggaaaaagcattgtaccaaactcaa
aaccgcagcggtcaagatcctttaaacttccccattaaattgacgaataaattggctcac
cttaatgcgttggttactatgggtgattttgggcctacagcacaggatatagctgttaaa
aacgaattgacagcccaaattaatcaggagcttagcaaattcaatcaggttcttgacaca
gacatcaaggaattcaacaacaagtttaatgctctaaaactggactacctggttattgaa
acagaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system