Candidatus Nitrospira neomarina: PQG83_10955
Help
Entry
PQG83_10955 CDS
T09428
Name
(GenBank) right-handed parallel beta-helix repeat-containing protein
Organism
nneo
Candidatus Nitrospira neomarina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta_helix
NosD
DUF1565
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNM60281
UniProt:
A0AA96GML1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2528560..2530794)
Genome browser
AA seq
744 aa
AA seq
DB search
MSISRYRWFLKLCFCVLIMSGNISEAKATNYYVAASNGNDGNSGTLSAPFKTLERGVSVL
IPGDTLFVRGGTYEGSHNLAKIPNGNSWDQPITIKKYATEKVVITAESFRSALYFSNGSH
HIIIDGFVFDAKGGASGIQFFPGNHHIRILNSEIMNSRQQGILATQPANDLEFIRLKIHD
NGSHAGQDHGIYIAGSNHLIEGCEIYRNGAMGISIFSTSYTSENIVMRNNKVYNNGTLGT
SGDGIGVYTGKNHGIYNNLVWGNNMGIVVWGGVSNAKVLNNTVHANSVYGIWVAVNSQNA
HIKNNIASSNGSNGIIITKGSGSPQIFNNLVAATNSSTGLKNWEGNATVKGNVAGSINDI
KYANHQNRDFHIQQGSLAIAAGVVLSEVKNDFDYASRNSNAYDIGAFAFNGTPPPASSTP
PPSTSTPPPSTSTPPPSTSTPPPSSSPTSSSLSISNLTVASGQAYVVSASGLQTGARAYI
DRSYTFTSVPSIVSGARFIQTANNDKAATSSTFLRFTVNEPVLVYVAHGDRISSKPSWLS
TFTNTGAKLVTSDATFSLYVRSFPAGTVTLGGNASGGCCSMYSVVVTPQSGTTTSSPPPS
SSTSSSSFSISNLTVASGQAYVVPTSGLQAGARVYIDRAYTFKTVPSNVQGGTYIQTANN
DKAGTSSTFLRFTVNQAVSVYVAHGDRISSKPSWLSAFTDTGADLVTSDATFSLYVRSFP
AGTITLGGNASGGCCSMYSVIVKQ
NT seq
2235 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtatttcacgctatcgatggtttttgaagctttgcttttgtgtgttaatcatgagt
ggcaatataagcgaagccaaggcaacaaattattatgtggctgcaagcaatggaaatgat
ggcaatagtggaacattgagcgcgccgtttaaaactcttgaaaggggagtcagcgtgtta
atcccaggagatacgttgtttgtgagaggtggtacctatgaggggtcccacaatcttgcg
aaaattcccaatgggaattcttgggatcaacccattactattaaaaaatacgcaactgaa
aaagtcgtgattacagcggagagtttccgttctgcattgtatttttccaatgggagccat
cacattattatcgacgggtttgtttttgatgccaaaggcggcgctagtgggattcaattt
tttccaggaaaccatcatatacgtatcctcaatagtgaaataatgaattctcgtcaacag
gggattcttgctacacagccagcaaatgatctggaatttattcgcttaaaaatccatgat
aatggttcccacgcaggccaagatcacgggatttacatcgcaggttcaaaccatcttata
gaaggttgtgaaatctatagaaatggtgcgatgggaatatcgatattcagcacttcttat
acgtctgaaaatattgtgatgagaaacaataaagtctacaacaatggtactttaggtaca
tcgggagatggaattggagtttatacaggaaagaatcatgggatttacaataatcttgtt
tggggaaataatatgggcatagtggtttgggggggagtatcaaatgccaaagttttaaac
aatacggtacatgctaattccgtctatggcatatgggtagcagtgaatagtcaaaacgcc
catattaagaacaatattgccagttcgaatgggtcgaacgggataatcattactaaggga
agcggaagtccgcagattttcaataacctggttgctgcaacgaattcaagcaccggactg
aaaaattgggagggtaatgcaaccgttaaggggaatgtggccggatcaatcaatgacata
aaatatgccaatcatcaaaaccgggactttcacattcaacaaggaagtcttgccattgcc
gccggtgtggttctttccgaagtcaaaaatgattttgattatgcttcaaggaactccaat
gcatatgatattggagcttttgcttttaatgggacgccgccccccgccagttcaaccccg
ccaccgtcgactagtactccgccaccgtcgactagtactccgccaccgtcgactagtact
ccgcccccatcctcctctcctacctcatcctctctcagtatttcgaacttgacggttgcc
agtgggcaagcctatgtggtgtccgcctccggactccaaaccggggccagggcctatatc
gatcgtagctatacgtttaccagcgttccctccatcgtgagtggagccaggtttatccaa
acggccaataatgataaagcggcgaccagttccaccttcctcagatttacggtcaatgaa
ccggtattggtatacgtggcccatggcgatcgtatttcctcgaaaccctcgtggttgagc
accttcacgaataccggcgcgaagctggtgacctcggatgcgaccttcagcctttatgtg
cggtctttccctgctgggaccgtcacccttgggggcaatgccagcggtggatgttgcagc
atgtactccgtggtggtcacaccgcagagcgggactaccacgtcgtcgcctcccccttcc
tcttccacctcctcctcctccttcagtatttcgaatctgacggttgccagtgggcaagcc
tatgtggtgcccacctccggtctccaagccggggcccgcgtttatatcgaccgtgcctat
acgtttaagaccgttccttccaatgtgcagggaggcacgtatatccaaacggctaataat
gacaaagcggggaccagttccaccttcctcaggtttacggttaatcaagcggtatcggtg
tatgtcgctcatggcgatcgtatttcctcgaaaccctcgtggttgagcgcctttacagat
accggcgcggatctggtgacctcggatgcgaccttcagcctttatgtgcggtctttccct
gcagggaccattacccttggaggtaatgccagcggtggatgttgcagtatgtattccgtc
atcgttaagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
