Nestor notabilis (Kea): 104407119
Help
Entry
104407119 CDS
T08494
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
nnt
Nestor notabilis (Kea)
Pathway
nnt04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nnt00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
104407119
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
nnt00536
]
104407119
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
nnt00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
104407119
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
EGF_3
TB
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104407119
NCBI-ProteinID:
XP_010014608
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1750 aa
AA seq
DB search
IDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSPTREECIDVNECSLSDNLCRNGKCVN
MVGAYQCSCNSGYQATPDRQGCIDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSDGYALMPDV
RTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCVDVNECDLNSNICIF
GECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMHASCVNIPGSFKCSCREG
WVGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTGDGLTCSDVDECAENIH
LCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPASDSKSCQDINECAFQNICVFGTCNNLPGMFHCICD
DGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPSDFQLNPTGVGCVDNRVGN
CYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVNSTEYNTLCPGGEG
FRPNPVTIILEDIDECQELPGLCQGGNCINAFGSFQCECPKGYYLSEETRICEDIDECVA
HPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYNGTSCENELPFNVT
KRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPNPGTGEFKNICGNIPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIPGI
CANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPGSYRCEC
AAGFKLSPNGACVDRNECLEIPNACSHGLCVDTQGSYQCICHNGFKASQDQTMCMDVDEC
ERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDTDECSSFFGQVCRNGRCFNEIGSFK
CLCNEGYELTLDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVKSESCIDIN
ECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTNFENGKCSVPKA
FNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPGIDDTREDVNECLES
PGICLNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCIDTDECSIGNPCGNGTCTNVIGSFECN
CHEGFEPGSMMICEDINECAQNPLLCAFRCINTYGSYECTCPVGYVLREDQKMCKDLDEC
AEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMIRRIDGEGCTDENECRTKPGVCENGRCMNII
GSYRCECNEGFLSSPSGIECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLVTKSECCCDGGRGW
GNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKVMLNLCRNGQCINTMGSFRCFCKV
GYTTDISGTSCNDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLDECQT
KQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECASQPSLCGSKGICQNTPGSFICE
CQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNTLGGYRCGCPQGYIQHYQWNQCVDENEC
SSPNVCGSASCYNTLGSYKCACPSGFSYDQFSSACHDVNECSSTKNPCNYGCSNTEGGYL
CGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPLDGDADEDNALSPEACYECKINGYSKKDNRKK
RSANYTIEQISLESLDMDSPFKMRVNISRLDNKQHVLELMPAIKPLTNHVRYVISHGNDD
GIFRIHQRDGLSYLHTVKKKSLPGTHTLEIISIPLYKKKEQKKLEDSNEDNYLLEELGET
LRMRLWIDLY
NT seq
5255 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atattgatgaatgtgaacgcaaccctctgctgtgtagaggcggcacatgtgtgaataccg
aagggagttttcagtgtgactgtcctttgggacatgagctgtcaccaacacgtgaggaat
gcatagatgtaaatgagtgctcattaagcgacaatctctgcagaaatggcaagtgtgtga
acatggttggagcataccagtgttcctgtaactctgggtaccaggctactcctgacagac
aaggctgcatagatattgatgaatgtatgataatgaatggaggctgtgacacccactgca
ctaactcagaaggcagctatgaatgtagctgcagtgatggctatgctctcatgccagatg
tcaggacatgtgcagatattgatgaatgtgaaaacaatccagatatctgtgatggtggac
aatgtactaatattccaggggaatatcgctgtctctgttatgatggatttatggcttcta
tggatatgaaaacttgtgttgatgtgaatgaatgtgatttgaattccaacatctgtatat
ttggggagtgtgaaaacactaaaggttccttcatttgtcactgtcagctaggatattcag
tcaagaaaggaactactggatgcacagatgtggatgagtgcgaaattggtgctcacaact
gtgacatgcatgcctcatgtgtcaatataccaggaagttttaaatgtagttgcagagaag
gatgggttggaaatggcattaaatgtattgatcttgatgagtgctccaatgggacccacc
agtgcagtgtgaatgctcagtgtgtaaacaccccggggtcataccgctgtgcctgtgcag
aggggttcactggggatggattgacttgttctgatgttgatgaatgtgcagaaaatattc
atctgtgtgaaaatggacagtgtttgaatgtccctggtgcctaccgttgcgagtgtgaga
tgggattcactcctgcctcggacagcaagtcatgccaagatatcaatgaatgtgccttcc
agaacatatgtgtatttggtacctgtaataatctaccaggaatgtttcattgtatctgtg
atgatggctatgaactagaccgaactgggggaaactgtacagatattgatgaatgtgccg
atcccattaattgtgttaatggtctttgtgtaaatactcctggaaggtatgagtgtaatt
gcccttcggacttccagctgaatcctactggagtgggttgtgtagataatcgtgttggca
attgctaccttaagtatggaccacgaggggatggcagcctatcctgcaacactgaaattg
gggttggagtcagtcgttcctcatgctgctgctccctgggaaaagcttggggaaacccct
gtgagacatgtccccccgtaaacagcacggaatataatactctctgtccaggcggagaag
gattcagaccaaatcccgttactattattttagaagacattgatgaatgtcaggaactgc
caggtctctgccaaggtggaaattgcatcaatgcttttggcagcttccagtgtgaatgtc
caaaaggctactacctcagtgaagagacaagaatctgtgaagatattgatgagtgtgttg
cacaccctggtgtctgtggtcctggtacctgctacaataccttggggaactacacctgca
tttgcccaccagaatatatgcaggtgaacggaggacataattgcatggacatgaggaaaa
gcttttgctacagaagctataatggaacctcctgtgagaatgagctgcccttcaatgtga
ccaaaaggatgtgttgctgcacatacaatgttgggaaagcctggaacaaaccttgtgaac
catgtccaaacccaggaacaggtgaattcaagaacatatgtgggaatattcctggcttca
cttttgacattcatactggaaaagctgttgacattgatgaatgtaaggaaatcccaggaa
tctgtgcaaatggtgtttgcatcaatcagatcggcagcttccgctgtgaatgccccactg
gatttagctacaatgacctgctcttggtctgtgaagatattgatgagtgcagcaatggag
acaatctctgtcagagaaatgcagactgtatcaacagtcctggtagttaccgctgtgaat
gtgctgctggttttaaactttcacccaatggtgcctgtgttgatcgcaatgaatgtctgg
aaattcctaatgcttgcagtcatggtttatgtgtggacacgcaaggaagttaccagtgca
tatgtcacaatggttttaaggcatcccaagaccagactatgtgcatggatgttgatgaat
gcgaacgccatccatgtggaaatggaacttgtaaaaacacggttggatcatataactgcc
tgtgttatccaggatttgaattaactcataataatgattgtatggataccgatgagtgca
gctccttctttggtcaggtgtgcagaaatggacggtgcttcaatgagattggttccttca
aatgtttgtgtaacgaaggatatgaacttactctagatggcaagaactgcattgatacta
atgagtgtgtggcactacctggttcctgctctcctggtacttgtcaaaatttggaaggat
cattcagatgcatctgtccaccaggatatgaagtaaaaagtgaaagttgtattgatatta
atgagtgtaatgaggaccccaacatctgtctctttggctcttgtacgaacactccaggag
gtttccagtgtatctgtcctacaggttttgtgctgtctgataatggacggagatgttttg
atactcgccagagtttctgtttcactaacttcgagaatgggaaatgctcagtgccaaagg
ctttcaacaccacaaaggcaaagtgttgctgcagtaaaatgccaggagaaggatggggtg
atccctgtgagctctgtccaaaagaagaagaagttgcttttcaggacctgtgtccatatg
gtcatggaactattcctggcattgatgatacacgtgaagatgtcaatgaatgccttgaaa
gtccagggatttgcttaaatggacactgcatcaataccgatggatcgttccgctgcgagt
gccccatgggatacaacttagattacactggagtacactgcatcgatactgatgaatgtt
ccattggcaacccatgtggaaatggtacgtgcactaacgtcattggcagttttgagtgca
actgtcatgaaggatttgagccaggctcgatgatgatttgtgaagatataaatgagtgtg
ctcagaatcccttgctgtgtgcttttcgttgtatcaacacttatggttcctatgaatgta
cgtgtccagttggctatgtactaagagaagaccaaaagatgtgcaaagatctagatgagt
gtgcagaaggtctccatgactgtgaatcaagaggcatgatgtgcaaaaatttgattggta
ccttcatgtgtatttgtcctcctggaatgatccgaagaattgatggagaaggctgcacag
atgaaaatgaatgccgaaccaagccaggtgtctgtgaaaatggtcgttgcatgaacatta
ttgggagctaccgatgtgaatgtaatgaaggattcctgtcaagtccgtcaggcattgagt
gtcttgataatcgccaagggttctgctttgctgaagttttacagacaatgtgtcagatgg
cttcaagcagccggaatcttgtcactaaatctgaatgctgctgcgatggaggccgtggct
ggggtaaccagtgtgagctctgtcctcttcccggaaccacccagtataagaaactctgtc
cacatggaccaggctatactacagatggaagagatattgatgaatgtaaggtcatgctaa
acctatgtagaaatggacagtgtattaatactatgggctctttccgatgcttttgcaaag
ttggctataccactgacataagcggcacatcttgtaatgatcttgatgagtgctcccagt
ctcctaaaccatgcaatttcatctgcaagaactcagaggggagctatcagtgctcatgtc
ctcggggctacattcttcaagaagatggaaagacatgtaaagatcttgatgaatgtcaaa
ccaaacaacacaattgtcagtttctctgtgtcaacactcttggaggcttcacatgcaaat
gtccacctggttttacacaacatcatacagcttgtattgataacaatgaatgtgcttctc
agccatcactttgtggatcaaaaggaatttgccaaaacacccctggaagttttatctgtg
aatgtcaaaggggattttctctggattctactggactaaactgtgaagatgtggatgaat
gtgatggaaaccataggtgccagcatggctgccaaaacaccctgggtggatacagatgtg
gatgtccacaaggatatattcagcattaccagtggaatcaatgtgttgatgaaaatgaat
gctccagtcctaatgtgtgtggctctgcttcttgctacaacacacttggaagctacaagt
gtgcctgcccatctggattttcatatgaccaattctctagtgcatgccatgatgtgaatg
agtgttcttctaccaagaacccctgcaattatggttgttccaacactgaaggtggttatc
tttgcggctgtccacctggctattacagagttggacaaggccactgtgtctcagggatgg
gatttaacaaaggccagtacctgccactggatggagatgctgatgaagataatgctttgt
cccctgaagcatgttacgaatgcaaaatcaatggctattccaaaaaagacaacaggaaga
agagaagtgctaattacactattgagcagattagcttggaaagtctggacatggatagtc
ctttcaagatgagagtcaacatttctagacttgacaacaagcagcacgtcctagaactca
tgccagccattaagccccttaccaaccatgtgcgctacgtcatctcacatggcaatgatg
atggcatctttcgaatccatcagagggatggattgagttatttgcacacagttaagaaaa
agtcactgcctggaactcacacactggaaatcattagcattcctctatataagaaaaagg
aacaaaagaaactggaagacagcaatgaggataactacctcctagaagagctgggggaaa
ctctcagaatgaggctgtggatagacctctactag
DBGET
integrated database retrieval system