Nelumbo nucifera (sacred lotus): 104594198
Help
Entry
104594198 CDS
T04131
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
nnu
Nelumbo nucifera (sacred lotus)
Pathway
nnu03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nnu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
104594198
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
nnu03019
]
104594198
Messenger RNA biogenesis [BR:
nnu03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
104594198
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Nup35_RRM_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104594198
NCBI-ProteinID:
XP_010252687
UniProt:
A0A1U7ZUN2
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
477 aa
AA seq
DB search
MESDLGKLFIGGISWDTNEDRLKEYFKSYGEVVEAVIMKDRTTGRARGFGFVVFADPTVA
ERVVMEKHTIDGRTVEAKKAVPRDDQHILNRNNASIHGSPGPARTKKIFVGGLASTVTES
DFKKYFEQFGTITDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYDSEDAVEKVLVKTFHELNGKMVEVKR
AVPKELSPGPSRSPLGGYNYGLSRVNSFLNGYTQGYNPSSVGGYGVRMDGRFSPVAGSRS
GYPSFGPPGYGMGGMNFEPGLSPSYGASFGTNIGYGRGLSPYYSGNTSRFGSPIGYNGSN
GGSGSLLSSSSRNVWGNGGLGYVSNSTSSSAYMGSGSGTIGGAFGNSAANWGSSPISAQS
GGSSSGFASGNLGYGSGDSSYGLGGGGYGRNSGTNAATASSYAASSGGYDGAYGDFYGGG
SVYGDPTWRSATSELEESGSFGYGLGSAASDVTAKSSVGYVGGYSVANRQSNRGIAA
NT seq
1434 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcggatctcggaaaactcttcataggtggaatctcctgggacacaaatgaagat
cgtctcaaggagtatttcaaatcttatggagaagtagtggaagctgtgatcatgaaggat
aggaccacaggtcgtgcccgtggttttggctttgttgtctttgccgacccaactgtggca
gaaagagttgttatggagaagcatactatagatggtagaacggttgaagcgaagaaggct
gttccaagggatgatcagcacattctgaatagaaacaatgctagcattcatggatcaccg
ggtcctgcccgcactaaaaagatatttgtaggaggtttagcatccacagtcaccgagagt
gacttcaagaagtactttgagcagtttgggacaatcacagatgttgtggtaatgtatgat
cacaacactcaaaggccaaggggctttggatttatcacttatgattcagaagatgcagta
gagaaagtgttagttaaaacattccatgaactgaatggtaaaatggttgaggtcaagagg
gctgtccctaaagagttatctccagggcccagcaggagccccttaggtggatataattat
ggcctgagcagggtcaatagctttcttaatggctatactcaaggatataatccgagttca
gttggaggctatggagttagaatggatggtagatttagtccagttgctggtagtcggagt
ggatatccatcatttggtcctcctggttatggaatgggcggcatgaattttgagccagga
ctgagcccaagttatggggcaagctttggtactaatataggttatggacggggattgagc
ccttactacagtgggaacacaagtaggtttggtagtcctattgggtacaatggaagtaat
ggagggagcggttctcttttaagctcaagtagccggaatgtgtggggaaatggggggctt
ggttatgtctcaaactctacaagttctagtgcttacatgggctctggtagtgggactatt
ggaggtgcttttggcaatagtgcagcaaattggggttcttctcctatttcggctcaaagt
ggagggagttcttctggctttgccagcgggaatcttggttatggaagtggtgatagcagt
tatgggttgggtggaggagggtatggaagaaacagtggaactaatgctgctacagcgtca
tcatatgctgcatcaagtggtggttatgatggagcttatggagacttctatggtggtggt
tcagtttatggtgaccctacttggcggtctgcaacttcagagctagaggagtctggctca
tttgggtatggtctcggcagtgcagcttcagatgttacagctaaaagttctgtgggttat
gttggtggttatagtgttgccaatagacaatcaaatagaggaattgctgcgtag
DBGET
integrated database retrieval system
