Nelumbo nucifera (sacred lotus): 104600945
Help
Entry
104600945 CDS
T04131
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
nnu
Nelumbo nucifera (sacred lotus)
Pathway
nnu03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nnu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
104600945
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
nnu03019
]
104600945
Messenger RNA biogenesis [BR:
nnu03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
104600945
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104600945
NCBI-ProteinID:
XP_010262417
UniProt:
A0A1U8A5E9
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
461 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFVGGISWDTSEEKLKEYFGNYGEVVQTVIMRDKVTGRPRGFGFVVFADPSIL
DRVLQDKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSRSGNPNAGRNLGGAGNIKTKKIFVGGLPPTL
TEEGFRQYFETYGHVTDVVVMYDQTTQRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKTFHELNGKLVE
VKRALPKEANPGSGGRQMGGGSYQGYGGSGGNANTYDSRVDAARYMPPQTAGGGFPAYGS
SGYGAPGYGYGAASNGVGYGGYGVGGYGSANAGYSGPAGAYANPNAPNAGYVSGPGAPRS
PWNSQAPTGYGSAGYGANAGYGSAAHWNSPSGAAGAGNAVSAPTGQSPSGAANYGNHGYG
YGGYGGGDGSYGNPSSYGAVGGRAGSAPNSNSGAGEQQGAGGGYMGSGYGDANGYPNAVW
RSDASQAGSYGTAHANGPPSGQVGYGGGYGGGAQSRQAQQQ
NT seq
1386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaagggaagctgttcgttggcgggatatcatgggatacatctgaagag
aagcttaaggaatattttggtaactatggcgaggttgtgcagactgtgatcatgcgtgac
aaggtcactggaaggccgagaggttttgggtttgtcgtgtttgcagatccttccattctc
gatagggttcttcaggataagcacaccatcgacggaagaacggtggaagctaaaagggct
ttatcaagagaggaacagcagacttctagatcgggaaaccctaatgcaggcagaaacctt
ggaggtgcaggaaatattaagaccaagaagatttttgtaggaggattgcctcccactttg
acagaagaaggattccgtcagtattttgaaacctatggtcatgtaactgatgtagtagtt
atgtatgaccagactacccagcgtcctcgtggatttggattcatctcctttgatactgaa
gaagcagttgatagagtcctacacaagactttccatgaattgaatggtaaacttgtggag
gtcaaacgtgctcttccaaaagaagcaaaccctggaagtggtggccgtcaaatgggaggt
gggagttatcagggatatggtggttcaggtggcaatgcaaatacatatgatagtcgggtg
gatgctgccaggtacatgccacctcaaactgctggaggtggttttccagcttatggttct
tctggctatggtgcacctggttatggttatggtgcagctagtaatggtgttggctatggt
ggctatggcgttggtggctatggtagtgccaatgctggatacagtgggcctgctggggcc
tatgcgaaccctaatgctccaaatgctgggtatgtaagtggtcctggtgcccctagaagc
ccatggaacagtcaagctcctactggatatggttctgcaggttatggtgcaaatgcaggt
tatgggtctgctgctcattggaattctcccagtggtgctgctggtgctggtaatgctgtt
tctgctccaacaggtcagtccccgagtggggctgccaattatgggaatcatggttatggg
tatggtggttatggtgggggtgatggatcttatggtaatccaagcagctatggtgctgtt
ggagggcgtgctggcagtgccccaaatagcaattctggtgctggagagcaacagggagca
ggtggtggctacatgggaagtggctatggtgatgctaatgggtatccaaatgcagtctgg
agatctgatgcttcacaagctgggagttatgggactgcccatgcaaatggacctccatct
ggacaggtgggatatggtggtgggtatggtggtggtgctcaatccaggcaggcacaacag
cagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
