Nelumbo nucifera (sacred lotus): 104602525
Help
Entry
104602525 CDS
T04131
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
nnu
Nelumbo nucifera (sacred lotus)
Pathway
nnu03015
mRNA surveillance pathway
nnu03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nnu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
104602525
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
104602525
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
nnu03041
]
104602525
Spliceosome [BR:
nnu03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
104602525
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
RRM_MARF1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104602525
NCBI-ProteinID:
XP_010264552
UniProt:
A0A1U8ANX6
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
508 aa
AA seq
DB search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NT seq
1527 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgggatgtatggtcctgggggcgacgaatctgctccacctcccagaggtggtggt
ggtggctatggcggtggcagtgctggtggaggctatggatctggcagtgctggaaactat
ggaactggcggtggtagtggctatacaggtgcttctagcgggggctatggaggtagcggc
ggcgacgggggttacggaggcagcggtggcggtggtggaggctatggaggtggtgggggt
tatgggagtggcggtggaggtagaggtggcggtgggggtggatatggcgggggcggaggc
ggaggctatagtggtagcggtggtggaaactacggtggtggtggcggtggagggggaaga
ggaggaggaggatacggagggaattcacaaaatcgaggcggtggtggcggataccaagga
ggggatcgcggcagtagaggtggaggtggtggtaacagaggcggcggtcgtggcggtagc
ggtagagaaggagattggctctgtcccaacccaagttgtgggaatctgaactttgcaaga
agagttgaatgcaataaatgtggtgcgccctctccaactggagcaggcgatcatggtggt
agtggcggtggttataacagaggaggaagcggagccggacacggtgggcaccgtggtggt
agaaacggtggttatggtggtagagacggtggtggaagaggtggctcttatgctggtggt
caaggaagagaagatggtaattatggtcagatggctccgcctgcatcgggatcctatggt
ggtggtagtggaaattatcctcctcaaccgaattcttatggtggaaatagtaattatgga
acggaggcagttcctcctcctaccagctacactggtggtcctaattcgtatcccccatcc
tatggtgcccctccaaatagttatggtggcgatgccccagttgatacacgcggaagtggt
cgcggaggtccaccaggtgcgtatgatggtggatatggtggtggcccccgacactcaggt
ggtggctatggtggtgctccagctgaacctccagctaagatcaagcaatgtgatgagaat
tgtggggattcctgcgacaactcaagaatctacatctccaatctgccaccggatgtgact
actgaagagctaagagagctttttggggggattggccaggttggtagaatcaagcaaaag
cgaggatataaggatcaatggccttggaacataaagatatacacagatgaccatgggaac
agcaaaggagatgcagttctgtcttatgaagatccctctgctgcccattctgcagggggc
ttttataataattatgatatgcggggttataaaatcagtgttgcaatggcagagaaatct
gcaccaagggctcaaccagcctatggtcatgggaacagtggtggtggtagaggtggatat
ggcaatggtggggacagacgcagggatggtggaggttctggtccagataggcattatcat
ggtgggcagcgctcacgtccatattga
DBGET
integrated database retrieval system
