Nonlabens sp. MB-3u-79: CW736_10055
Help
Entry
CW736_10055 CDS
T05253
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
Organism
nob
Nonlabens sp. MB-3u-79
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
PKD_4
PKD
PKD_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUC79684
LinkDB
All DBs
Position
complement(2279577..2284295)
Genome browser
AA seq
1572 aa
AA seq
DB search
MKKLFLLSFIFIPIIAFAQLEAAWWFFGTNASVDFNTGAPLAAPAGSLDTDEGCSSISDS
CGVLQMYSDGTTIWNRNGLPMPNGTGLSGNSSSAQSAIIIPDLGSTSRYFVVTIGGFQGL
RYSIVDMTLNAGLGDVLPGRRDILIQQNTQEKVTAALSDNGNFYWIVTFENGVYSSYPAA
GGIILPSRGVNSTVAGTNGLTDARGYIRLSPNASKISNTSIGNAGTAWLADFNNITGVVS
NPVALTTPGTRDRFYGTEFSPNSQLVYLNANSNDTGNGCGATNTREILQYNINSGGGWNS
SPVALAATGANSGRGALQLGIDGKIYHARVCQNWLGVIRSPDIVGAGAAYTDDGVALNNN
SREGLPPFITSFFEPSFSSFVAGSASGGSINQVNFCDQTPVQFEASTADFCVTSTVTWDF
GDGSPSSTLQDPIHTFPGPGVYTVTLVVRNGGFRFTATSDITIYPNPIYNIVADVFLCDS
DGDGIESRDLDLVETPQVLNMQTNPSYLVAYFLTQNQADNNVGAITLPYDFPLGTTTVYT
RITNNLNAISRLCFDTGSFDVIVASGAGATRPMDLNNCDNDNDGFSTFDLTSTETEVLNG
LPASAFTVSYHNTAAEAGTGMNPIPNPATYTNGTVTTERVFIRLEDNSPSGCTSTTEVDL
FVWDTPIANPVMDSSVCDAGNDSSEIILLTDFDSEVLAAQTNPDYVTTYHLNQADADAGA
NDQVSPFDLTATTTFFVRIDNLNNEPCFDTISFIVTLDTQPVANPVATYRLCDDPSNNNS
EVFDLVSRNPEILLTQNPGDFNIEYFTSQADADLGSIGGATPVSNLYSSAGQIMYVRIEN
NTNTDCFDTTSFDIIVDDIPLATAPADLIICDDVSNDGTEDIALSQFDASILNGQTTPTF
VVSYHLNQADADADTPGLMSPFTITTGTTTIIARIDNSDNPTCFDTTPINIILNEQAIAN
NVAEYRICDDASNDGLEDFDLSTQDNQVLGTQNAANFSIEYFTSQADADLGSVGGATPLP
TSYNSGSTTVFVRIQTNANTSCYDTAVFDLFVDPLPLAGTPADIIVCDDPSNDGTEDVNL
SQFDNAILNGQTNPSFNVTYHASQADADANANPLSSPYAVSSTTPSLFARIDNADNDSCY
TTSTFRFVISPTPTANPVVDMITCDDPGNDGSEVFDLSMANSQVLNGQNSSDFNISFHPS
QNDADMNTGALATSYASNTTTPETIFVRIEAISNPVCFDTTSFTLTVSEQPTAGTGTDVV
GCDDISNDGFEEFDFSTQDAAIYNGQNTTDFNVTYHSSLTDANNDINALSFPYTNTSRSQ
TIYARIENAANQDCYDLSTFRIEVFARPLIADQGPYTICAGVAETIDAGPGFSSYLWSTG
ETTQTIDVASGGDYTVTVTNSDGCDSMATVTVVASDVAIIERIDVGQFEVNTNTLTAIVT
GSGDYEFSLDDFVYQDSQRFNNLYPGFYTIYVRDKNGCGTVSMDAVIIGGPPYFTPNQDG
YHDTWQVIAIETIPDASIYIFDRHGKLLKQVSATGQGWDGTYNGAPMPSSDYWYLVELAD
GRSFKGHFALKR
NT seq
4719 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaactattccttctaagttttatatttattcccataatagcctttgcccagcta
gaagccgcttggtggtttttcgggactaatgccagcgtagattttaatactggcgctcct
ttagctgcccctgctggtagcttagatacagatgaaggttgtagttctatatcagactct
tgtggagtcctacaaatgtattctgatggaaccacgatttggaatcgaaatggcttgcct
atgcctaatggtaccgggctctccggaaattcatctagtgctcaatctgctattattatt
ccagatttaggtagtaccagtaggtattttgtagtcacaattggtggatttcaaggtctg
agatacagtattgttgatatgactttaaacgcagggcttggtgatgttttaccaggccga
cgagacatccttatacaacaaaacactcaagaaaaagtgaccgcagccttgagtgataac
ggtaatttttattggattgtaacttttgaaaatggggtatacagttcctatcccgctgct
ggtggtatcatacttccatccagaggtgtcaattcaactgttgcaggaacaaatggatta
actgatgcaagaggttatattcgattgtcaccaaatgcaagtaaaatatcaaacacctct
attggtaatgccggaaccgcatggctggctgattttaacaatataactggtgtcgttagc
aatcctgtcgcgttaaccacacctggtactcgtgatcgattttatggtacggagttctct
ccaaactcgcaattggtttatttaaatgccaattcaaatgatactggaaatggttgtgga
gcaacaaacaccagagagatactacaatacaacatcaatagtggtggtggatggaactct
tcgcctgttgcgcttgccgcaactggagcaaatagtggtcgtggtgccttgcaattaggg
attgacggtaaaatttaccacgctcgagtatgtcaaaactggctaggagtgataagaagt
cctgacatagtcggtgctggagctgcttataccgatgatggagttgccctgaacaataat
tctcgagagggattaccgccgtttatcacttcgttttttgaaccttcatttagttcattt
gttgctggaagtgctagtggtggatccatcaaccaagtgaacttttgtgatcaaactcct
gtgcaatttgaagcctctactgcagatttctgtgttacttcaacagtgacttgggatttt
ggtgatggtagtccatctagtacattacaggatccaattcatacctttcctggccctgga
gtttataccgttaccttagttgtacgtaatggtggttttagatttacagcaacctcagat
attaccatttaccccaaccctatttacaatatagtggctgatgtttttctatgtgatagc
gatggagatggaatagaaagtagagatcttgacctagtagaaactcctcaagtactcaac
atgcaaaccaaccctagctatttagttgcttatttcttaactcagaatcaagcagacaat
aacgtaggtgctattactttaccttatgattttcctttaggtactacaaccgtatacaca
aggattacgaataatttaaatgctatttctagattgtgttttgataccgggtcctttgat
gtaatagttgccagtggtgctggagccacgagacctatggacttaaataattgtgacaat
gacaatgatggtttctctacttttgatttaacatctacagaaacagaggttcttaatgga
ctacctgccagtgcctttactgtttcttatcacaatactgccgctgaagcaggaactgga
atgaatcctatccctaatccagcaacttacactaacggtacggtaactaccgaaagagtt
tttattagacttgaagataatagtcctagtggttgtacttccactactgaggtagattta
tttgtttgggatactcccattgcaaatccagtaatggatagctctgtatgtgatgcagga
aatgacagctctgaaatcatccttctaactgactttgatagcgaggtccttgcggctcaa
acaaatcctgattatgtaactacctatcacttaaatcaagcagatgcagatgctggtgca
aatgatcaagtgtccccatttgaccttactgcaacaacaactttctttgttcgtattgat
aacctcaataacgagccttgttttgataccatttcatttatagtgaccttagatacacaa
ccagtagctaacccagtggcgacctacaggttatgtgatgatccatctaacaataattct
gaagtctttgatctggtttctagaaatccagaaattcttctcactcaaaatccaggagat
tttaatatcgaatactttacctctcaagcagatgcagatttaggatctataggtggagcg
actcctgtgagcaacctttacagtagtgctggtcaaatcatgtatgtgcgtatagaaaac
aatactaataccgactgctttgatactacatcatttgatatcattgtagatgatatccca
ctagcaacagctccagcagatttaattatttgtgatgatgttagtaatgacgggaccgaa
gatattgcgctgtcacaatttgatgctagcattttaaatgggcaaacgactcctactttt
gtagtatcctatcatttaaatcaagcagatgcagatgctgatactcctggacttatgagt
ccatttaccattaccactggtacaacaaccatcattgcaagaatagataatagtgataat
ccaacttgttttgataccacacctatcaatatcattctcaacgagcaagcaatagctaat
aacgttgccgaataccgtatttgtgatgatgccagtaacgacgggctagaagattttgac
ctgagtactcaagacaatcaagttttaggaactcaaaacgcagctaactttagcattgaa
tactttacttcacaagcagatgctgatttaggatctgtaggtggagcaacgccattacct
actagttacaatagtggttctacaacagtttttgtaagaattcaaaccaatgccaatacc
agctgttacgacactgctgtatttgatctgtttgtagatccattaccacttgcaggaact
ccagcagatattattgtgtgtgatgatccgtctaacgatggaacagaagacgtgaactta
tctcagtttgataatgcgatcctcaatggacagaccaatcctagttttaatgtgacctat
cacgcctctcaagcagatgctgatgctaatgcaaatccattgtccagcccttatgcagtg
agcagtaccacacctagtttatttgccagaatcgataacgctgataatgatagctgttac
acgacctctacttttagatttgtgatcagtcctactccaacggcaaatccagttgtggat
atgattacttgtgatgatcctggaaatgacggttctgaggtatttgatttaagcatggcc
aatagccaagtattaaatggacaaaactccagtgatttcaatatcagctttcacccatca
caaaatgatgccgacatgaatactggtgcgttagctacttcttatgctagtaacacgacg
actccagaaactatctttgtaagaatagaagcgatctcaaatccggtttgttttgatacg
accagttttaccttaaccgtaagtgaacagcctacggcaggaactggaactgacgtggta
ggttgtgatgacatcagcaacgatggttttgaagaatttgatttcagcacacaagatgct
gcgatctataacggtcaaaacactacagacttcaatgtgacttatcacagcagtctaaca
gatgctaacaatgatatcaatgccttgagttttccttataccaatacttctagatcacaa
acgatctacgcaagaatagagaatgctgctaatcaagattgttatgacctatctactttt
agaatagaagtatttgcacgacctcttattgctgaccaaggaccttatactatttgtgca
ggcgttgctgaaactattgacgcaggtccaggattctctagctacctgtggtctactgga
gaaacgacacagactattgatgttgcctctggtggcgattatacggtaacggtaaccaac
agcgatggttgtgatagtatggcaacagtaactgttgtagcctctgatgtagccataatt
gaacgcatcgatgtaggacagtttgaagtaaacaccaacacactgacagcaattgtcact
ggaagtggtgattacgaattctcattagatgactttgtgtatcaagacagtcagcgattt
aataatctgtatccaggattctacacgatttatgtacgagataaaaacggttgtggaact
gtatcaatggatgctgtcatcataggtggtcctccttattttactcctaatcaagatggg
tatcacgatacttggcaagtcattgcaatagaaaccattcctgatgcgagtatttatatt
tttgaccgtcacggtaaattattgaaacaagtaagcgctacgggtcaaggatgggatgga
acttataatggagctcctatgccatccagtgattactggtacttggtagaattagctgac
gggcgtagttttaaaggccactttgctttaaagcgataa
DBGET
integrated database retrieval system
